Heatmap: Cluster_100 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002079 (GRMZM2G174917)
0.11 0.01 0.13 0.6 0.78 0.42 0.18 0.37 0.15 0.13 0.47 0.5 0.26 0.52 0.55 0.56 0.42 0.21 0.23 0.0 0.28 0.16 0.53 1.0 0.37 0.08 0.1 0.09 0.92 0.03 0.13 0.39 0.03 0.08 0.2 0.53 0.48
Zm00001d002405 (GRMZM2G071907)
0.11 0.04 0.06 0.38 0.45 0.32 0.18 0.24 0.19 0.11 0.31 0.2 0.18 0.43 0.12 0.43 0.37 0.28 0.13 0.0 0.78 0.27 1.0 0.71 0.34 0.04 0.05 0.21 0.45 0.22 0.4 0.4 0.07 0.06 0.08 0.22 0.24
Zm00001d002520 (GRMZM2G322817)
0.08 0.03 0.05 0.17 0.7 0.04 0.15 0.37 0.06 0.07 0.13 0.36 0.12 0.15 0.37 0.22 0.14 0.22 0.1 0.0 0.84 0.33 0.23 0.78 1.0 0.28 0.12 0.2 0.18 0.31 0.06 0.06 0.13 0.23 0.09 0.69 0.2
Zm00001d003041 (GRMZM2G082670)
0.21 0.05 0.04 0.06 0.29 0.33 0.28 0.36 0.23 0.2 0.16 0.27 0.15 0.18 0.34 0.2 0.09 0.3 1.0 0.01 0.44 0.4 0.18 0.36 0.13 0.04 0.26 0.07 0.29 0.01 0.11 0.5 0.09 0.02 0.14 0.28 0.14
Zm00001d003624 (GRMZM2G361100)
0.33 0.06 0.04 0.16 0.29 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.17 0.04 0.05 0.11 0.07 0.14 0.12 0.0 0.29 0.41 0.17 1.0 0.41 0.18 0.04 0.13 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.04 0.05
Zm00001d003743 (GRMZM2G369742)
0.02 0.0 0.0 0.08 0.16 0.42 0.16 0.33 0.06 0.04 0.11 0.2 0.03 0.08 0.09 0.18 0.02 0.06 0.27 0.0 0.39 0.03 0.4 1.0 0.07 0.03 0.03 0.24 0.13 0.2 0.44 0.09 0.01 0.03 0.03 0.14 0.1
Zm00001d006489 (GRMZM2G479045)
0.05 0.0 0.01 0.01 0.17 0.25 0.37 0.24 0.03 0.02 0.17 0.18 0.02 0.03 0.05 0.06 0.06 0.08 0.05 0.02 0.3 0.19 0.14 0.53 0.22 0.08 0.02 0.04 1.0 0.04 0.14 0.25 0.02 0.02 0.02 0.16 0.23
Zm00001d007274 (GRMZM2G025783)
0.01 0.01 0.03 0.42 0.37 0.33 0.2 0.2 0.22 0.13 0.34 0.49 0.2 0.91 0.3 0.17 0.09 0.13 0.29 0.0 0.45 0.11 0.24 1.0 0.25 0.2 0.04 0.16 0.44 0.43 0.17 0.14 0.05 0.14 0.19 0.31 0.44
Zm00001d008812 (GRMZM2G173124)
0.0 0.01 0.02 0.06 0.2 0.03 0.04 0.29 0.02 0.01 0.01 0.22 0.05 0.25 0.17 0.24 0.21 0.11 0.35 0.0 1.0 0.31 0.05 0.96 0.19 0.19 0.12 0.14 0.38 0.5 0.89 0.09 0.03 0.13 0.03 0.53 0.37
0.18 0.11 0.16 0.82 1.0 0.16 0.08 0.12 0.25 0.3 0.06 0.53 0.36 0.93 0.57 0.17 0.08 0.06 0.32 0.0 0.31 0.12 0.17 0.17 0.1 0.14 0.06 0.14 0.01 0.92 0.07 0.15 0.01 0.04 0.01 0.37 0.35
Zm00001d009701 (GRMZM2G128726)
0.03 0.0 0.25 0.0 0.54 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.26 0.12 0.25 0.04 0.02 0.72 0.87 0.0 1.0 0.46 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
Zm00001d009960 (GRMZM2G060210)
0.42 0.03 0.34 0.32 0.58 0.06 0.03 0.23 0.07 0.06 0.05 0.13 0.35 0.6 0.27 0.5 0.34 0.51 0.58 0.0 0.59 0.09 0.07 1.0 0.15 0.21 0.09 0.38 0.24 0.25 0.49 0.04 0.18 0.14 0.02 0.38 0.23
Zm00001d010360 (GRMZM2G359924)
0.0 0.0 0.09 0.08 0.38 0.04 0.03 0.12 0.04 0.03 0.01 0.03 0.0 0.03 0.02 0.08 0.26 0.08 0.01 0.0 1.0 0.22 0.02 0.46 0.57 0.0 0.02 0.01 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.05
Zm00001d010543 (GRMZM2G178815)
0.46 0.1 1.0 0.65 0.58 0.03 0.15 0.11 0.1 0.0 0.0 0.07 0.16 0.06 0.06 0.44 0.76 0.36 0.01 0.01 0.49 0.72 0.08 0.75 0.67 0.0 0.09 0.07 0.39 0.09 0.07 0.6 0.01 0.09 0.04 0.08 0.05
Zm00001d012712 (GRMZM2G031724)
0.01 0.02 0.09 0.05 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.25 0.08 0.14 0.02 0.7 0.13 0.0 0.0 0.94 0.56 0.04 1.0 0.46 0.08 0.03 0.09 0.0 0.05 0.06 0.02 0.03 0.06 0.29 0.09 0.1
Zm00001d016748 (GRMZM2G346837)
0.04 0.01 0.04 0.87 0.61 0.18 0.15 0.06 0.13 0.05 0.06 0.26 0.03 0.16 0.24 0.12 0.06 0.06 0.13 0.0 0.3 0.22 0.53 0.37 0.09 0.08 0.11 0.13 1.0 0.1 0.18 0.13 0.03 0.05 0.07 0.24 0.18
0.17 0.06 0.02 0.25 0.22 0.24 0.17 0.06 0.04 0.03 0.01 0.21 0.27 0.44 0.17 0.4 0.08 0.19 0.16 0.02 0.53 0.13 0.35 1.0 0.09 0.05 0.18 0.27 0.0 0.18 0.06 0.0 0.03 0.06 0.02 0.12 0.07
Zm00001d017616 (GRMZM2G058292)
0.21 0.13 0.26 0.45 0.59 0.19 0.15 0.32 0.2 0.22 0.02 0.26 0.4 0.71 0.33 0.4 0.52 0.45 0.63 0.0 0.65 0.52 0.28 1.0 0.25 0.28 0.48 0.4 0.0 0.77 0.29 0.29 0.17 0.17 0.23 0.36 0.38
Zm00001d017653 (GRMZM2G375153)
0.06 0.01 0.0 0.14 0.17 0.05 0.08 0.11 0.07 0.05 0.03 0.19 0.11 0.14 0.09 0.12 0.31 0.24 0.07 0.0 0.69 0.1 0.8 1.0 0.25 0.2 0.07 0.09 0.21 0.02 0.21 0.88 0.03 0.04 0.06 0.12 0.18
Zm00001d018017 (GRMZM2G351832)
0.22 0.01 0.0 0.69 1.0 0.2 0.1 0.17 0.06 0.16 0.32 0.54 0.1 0.53 0.19 0.57 0.34 0.19 0.38 0.03 0.95 0.6 0.09 0.97 0.41 0.49 0.05 0.19 0.65 0.47 0.89 0.42 0.21 0.04 0.11 0.39 0.17
0.05 0.1 0.17 0.28 0.51 0.44 0.17 0.31 0.21 0.12 0.15 0.45 0.0 0.03 0.21 0.02 0.02 0.26 0.11 0.0 0.11 0.01 0.81 0.75 0.07 0.25 0.09 0.03 1.0 0.02 1.0 0.21 0.02 0.05 0.05 0.17 0.05
Zm00001d020042 (GRMZM2G091857)
0.05 0.01 0.02 0.17 0.24 0.47 0.35 0.46 0.09 0.07 0.26 0.21 0.01 0.17 0.27 0.15 0.04 0.08 0.14 0.07 0.1 0.01 1.0 0.36 0.03 0.06 0.02 0.03 0.42 0.08 0.18 0.08 0.01 0.02 0.21 0.27 0.36
Zm00001d020787 (GRMZM2G165234)
0.01 0.0 0.02 0.22 0.23 0.1 0.14 0.11 0.03 0.01 0.17 0.14 0.04 0.12 0.05 0.15 0.11 0.06 0.19 0.0 0.3 0.14 1.0 0.5 0.13 0.12 0.01 0.07 0.92 0.07 0.23 0.34 0.02 0.02 0.02 0.11 0.11
0.58 0.03 0.07 0.78 1.0 0.19 0.17 0.08 0.19 0.18 0.08 0.41 0.1 0.68 0.38 0.33 0.12 0.15 0.2 0.07 0.35 0.15 0.96 0.39 0.25 0.15 0.16 0.3 0.82 0.23 0.08 0.24 0.05 0.14 0.52 0.41 0.32
Zm00001d021730 (GRMZM5G890190)
0.18 0.13 0.22 0.36 0.32 0.18 0.19 0.31 0.21 0.24 0.08 0.32 0.41 0.31 0.33 0.28 0.35 0.32 0.36 0.0 0.6 0.53 0.29 0.68 0.37 0.32 0.28 0.28 0.07 1.0 0.28 0.08 0.22 0.14 0.32 0.33 0.35
Zm00001d023269 (GRMZM2G180262)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.09 0.04 0.06 0.03 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.01 0.09 0.06 0.02 0.0 0.1 0.09 0.1 0.24 0.08 0.13 0.05 0.05 1.0 0.0 0.31 0.12 0.01 0.05 0.07 0.02 0.06
Zm00001d025133 (GRMZM2G176537)
0.03 0.0 0.28 0.06 0.39 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.04 0.03 0.36 0.19 0.11 0.3 0.24 0.1 0.01 0.04 0.1 0.18 0.39 1.0 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 0.11 0.08
0.12 0.02 0.05 0.18 0.34 0.03 0.03 0.2 0.04 0.04 0.04 0.17 0.1 0.07 0.26 0.09 0.33 0.17 0.09 0.0 0.38 0.55 0.03 1.0 0.55 0.1 0.23 0.1 0.07 0.13 0.14 0.04 0.09 0.2 0.22 0.14 0.05
Zm00001d026252 (GRMZM2G091331)
0.2 0.06 0.16 0.56 0.64 0.17 0.12 0.23 0.11 0.05 0.15 0.17 0.16 0.25 0.21 0.4 0.36 0.26 0.27 0.03 0.9 0.34 0.53 1.0 0.31 0.06 0.11 0.2 0.35 0.27 0.29 0.51 0.07 0.07 0.06 0.27 0.36
Zm00001d027341 (GRMZM2G144197)
0.0 0.0 0.0 0.16 0.43 0.37 0.67 0.04 0.27 0.21 0.32 0.31 0.01 0.01 0.15 0.02 0.16 0.2 0.09 0.0 0.57 0.14 1.0 0.61 0.2 0.01 0.23 0.12 0.0 0.0 0.1 0.16 0.01 0.02 0.07 0.3 0.15
Zm00001d028968 (GRMZM2G144997)
0.0 0.0 0.01 0.03 0.66 0.73 0.15 0.12 0.05 0.04 0.26 0.36 0.0 0.7 0.04 0.33 0.07 0.02 0.05 0.0 1.0 0.02 0.77 0.29 0.08 0.02 0.01 0.06 0.77 0.01 0.68 0.28 0.1 0.03 0.08 0.21 0.32
Zm00001d029669 (GRMZM2G395950)
0.04 0.0 0.0 0.34 0.25 0.06 0.38 0.38 0.17 0.06 0.02 0.12 0.02 0.0 0.27 0.06 0.01 0.15 0.14 0.0 0.03 0.03 0.05 1.0 0.22 0.03 0.04 0.06 0.62 0.03 0.47 0.47 0.02 0.04 0.0 0.1 0.11
0.15 0.02 0.15 0.29 0.2 0.24 0.17 0.39 0.17 0.1 0.08 0.15 0.17 0.78 0.24 0.22 0.23 0.29 0.09 0.02 0.66 1.0 0.36 0.98 0.5 0.3 0.17 0.22 0.97 0.29 0.35 0.3 0.02 0.19 0.08 0.2 0.26
Zm00001d032030 (GRMZM2G303149)
0.03 0.01 0.01 0.02 0.31 0.09 0.04 0.23 0.03 0.02 0.02 0.12 0.29 0.16 0.03 0.09 0.33 0.15 0.21 0.0 0.87 0.15 0.09 1.0 0.24 0.09 0.07 0.26 0.19 0.55 0.53 0.28 0.21 0.04 0.08 0.06 0.12
Zm00001d032324 (GRMZM2G097342)
0.07 0.08 0.11 0.6 0.86 0.31 0.17 0.13 0.15 0.12 0.31 0.37 0.06 0.18 0.28 0.19 0.31 0.16 0.15 0.0 0.31 0.1 0.63 1.0 0.13 0.04 0.07 0.16 0.63 0.15 0.2 0.09 0.12 0.08 0.1 0.23 0.43
Zm00001d032654 (GRMZM2G091320)
0.26 0.2 0.04 0.2 1.0 0.16 0.08 0.04 0.12 0.07 0.04 0.13 0.06 0.0 0.31 0.08 0.02 0.2 0.04 0.03 0.0 0.03 0.27 0.62 0.36 0.01 0.09 0.06 0.0 0.0 0.06 0.19 0.01 0.1 0.05 0.16 0.19
Zm00001d035440 (GRMZM2G448607)
0.04 0.02 0.03 0.14 0.27 0.19 0.11 0.17 0.06 0.05 0.04 0.18 0.05 0.07 0.06 0.11 0.08 0.09 0.13 0.0 0.17 0.04 0.06 0.61 0.06 0.03 0.05 0.06 0.18 0.09 0.14 0.06 0.1 0.02 0.05 0.25 1.0
Zm00001d037632 (GRMZM2G323888)
0.01 0.01 0.0 0.09 0.14 0.02 0.02 0.59 0.01 0.0 0.02 0.14 0.01 0.0 0.13 0.12 0.11 0.11 1.0 0.04 0.46 0.12 0.4 0.62 0.16 0.02 0.03 0.03 0.14 0.46 0.08 0.12 0.04 0.01 0.02 0.29 0.24
Zm00001d038755 (GRMZM2G101457)
0.19 0.12 0.28 0.62 0.66 0.35 0.36 0.36 0.31 0.23 0.24 0.47 0.25 0.31 0.42 0.42 0.43 0.41 1.0 0.0 0.58 0.52 0.47 0.64 0.49 0.28 0.51 0.26 0.99 0.4 0.19 0.24 0.08 0.21 0.19 0.36 0.28
Zm00001d039011 (GRMZM2G318180)
0.03 0.0 0.04 0.18 1.0 0.19 0.16 0.49 0.07 0.11 0.37 0.4 0.0 0.73 0.06 0.34 0.03 0.03 0.35 0.0 0.7 0.0 0.87 0.36 0.09 0.01 0.01 0.41 0.56 0.12 0.72 0.17 0.48 0.12 0.02 0.12 0.13
Zm00001d039408 (GRMZM2G346457)
0.01 0.0 0.01 0.39 0.23 0.15 0.09 0.06 0.06 0.02 0.13 0.1 0.01 0.03 0.05 0.08 0.03 0.16 0.15 0.01 0.3 0.13 0.16 0.32 0.17 0.38 0.01 0.04 1.0 0.05 0.12 0.14 0.03 0.01 0.09 0.07 0.09
Zm00001d039932 (GRMZM2G437097)
0.01 0.02 0.0 0.11 0.09 0.18 0.24 0.26 0.07 0.05 0.2 0.08 0.02 0.04 0.09 0.22 0.22 0.38 0.03 0.03 0.56 0.24 0.12 1.0 0.51 0.05 0.11 0.36 0.0 0.15 0.03 0.07 0.07 0.26 0.07 0.51 0.02
Zm00001d041410 (GRMZM2G022629)
0.08 0.02 0.03 0.7 0.24 0.32 0.24 0.21 0.15 0.13 0.23 0.19 0.1 0.72 0.24 0.33 0.18 0.17 0.34 0.02 0.6 0.09 1.0 0.97 0.1 0.23 0.1 0.15 0.54 0.13 0.46 0.15 0.03 0.1 0.11 0.25 0.08
Zm00001d041604 (GRMZM2G160902)
0.13 0.06 0.07 0.44 0.56 0.04 0.05 0.06 0.05 0.04 0.01 0.07 0.07 0.17 0.07 0.1 0.22 0.2 0.16 0.0 0.33 0.12 0.05 1.0 0.2 0.08 0.26 0.25 0.23 0.32 0.1 0.24 0.05 0.07 0.03 0.11 0.09
Zm00001d042519 (GRMZM2G041930)
0.17 0.19 0.12 0.04 0.23 0.15 0.04 0.41 0.16 0.19 0.07 0.2 0.4 0.01 0.23 0.18 0.52 0.37 0.1 0.0 0.02 0.3 0.46 1.0 0.31 0.18 0.21 0.38 0.39 0.05 0.26 0.74 0.26 0.32 0.03 0.53 0.37
Zm00001d046696 (GRMZM2G033480)
0.68 0.24 0.08 0.34 0.39 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.01 0.09 0.36 0.23 0.01 0.0 0.18 0.19 0.0 1.0 0.19 0.03 0.18 0.03 0.0 0.11 0.11 0.04 0.01 0.03 0.04 0.02 0.07
Zm00001d048230 (GRMZM2G400784)
0.07 0.06 0.02 1.0 0.38 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.01 0.11 0.13 0.02 0.05 0.03 0.21 0.08 0.0 0.38 0.09 0.01 0.06 0.12 0.28 0.07 0.1 0.01 0.0 0.03 0.01 0.04 0.04
Zm00001d048960 (GRMZM2G358791)
1.0 0.03 0.18 0.23 0.67 0.03 0.0 0.18 0.01 0.0 0.03 0.08 0.34 0.54 0.03 0.51 1.0 0.22 0.12 0.06 0.58 0.48 0.1 0.84 0.64 0.14 0.06 0.08 0.0 0.06 0.13 0.08 0.02 0.11 0.03 0.1 0.11
Zm00001d049176 (GRMZM2G009387)
0.01 0.0 0.01 0.19 0.25 0.08 0.13 0.08 0.08 0.01 0.14 0.13 0.01 0.28 0.11 0.16 0.05 0.07 0.11 0.0 1.0 0.18 0.3 0.33 0.17 0.08 0.01 0.03 0.23 0.05 0.12 0.19 0.02 0.05 0.08 0.08 0.11
Zm00001d049647 (GRMZM2G170262)
0.27 0.5 0.17 0.27 0.34 0.05 0.05 0.19 0.05 0.05 0.14 0.25 0.2 0.24 0.14 0.22 0.5 0.71 0.5 0.04 0.64 0.59 0.03 1.0 0.56 0.26 0.51 0.29 0.26 0.69 0.47 0.38 0.34 0.24 0.12 0.4 0.07
Zm00001d050195 (GRMZM2G148561)
0.01 0.0 0.03 0.93 0.6 0.25 0.04 0.21 0.1 0.06 0.16 0.12 0.08 0.27 0.12 0.29 0.14 0.16 0.05 0.0 0.55 0.13 0.56 1.0 0.12 0.03 0.03 0.12 0.92 0.02 0.55 0.97 0.08 0.01 0.01 0.21 0.32
Zm00001d051461 (GRMZM2G028438)
0.01 0.0 0.01 0.11 0.29 0.02 0.04 0.09 0.02 0.01 0.08 0.11 0.1 0.49 0.13 0.12 0.17 0.16 0.1 0.0 0.41 0.38 0.22 1.0 0.32 0.14 0.06 0.15 0.88 0.48 0.16 0.23 0.02 0.07 0.02 0.08 0.05
Zm00001d052482 (GRMZM5G891282)
0.01 0.0 0.0 1.0 0.07 0.07 0.05 0.12 0.04 0.01 0.02 0.07 0.02 0.1 0.05 0.07 0.04 0.06 0.03 0.0 0.29 0.12 0.03 0.4 0.06 0.03 0.24 0.06 0.45 0.09 0.12 0.12 0.02 0.02 0.01 0.03 0.04
0.0 0.0 0.02 0.06 0.44 0.07 0.03 0.12 0.01 0.01 0.07 0.18 0.0 0.2 0.02 0.15 0.17 0.03 0.17 0.01 0.42 0.09 0.1 0.45 0.1 0.04 0.0 0.06 0.47 0.19 0.68 1.0 0.1 0.03 0.05 0.05 0.06
Zm00001d053910 (GRMZM2G042602)
0.02 0.04 0.03 0.24 0.26 0.53 0.35 0.23 0.21 0.15 0.19 0.27 0.03 0.04 0.13 0.24 0.25 0.13 0.21 0.01 0.62 0.09 0.98 1.0 0.21 0.03 0.03 0.08 0.59 0.25 0.4 0.66 0.13 0.05 0.24 0.21 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)