Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT1G07600 (MT1)
-0.81 2.76 - - - - - - - - - -6.54 - 3.14 - - - - - - - - - -3.0 - - - - - - - - 1.54 3.76 - - - 3.91 - - - - - - - - - -2.06
AT1G07610 (MT1C)
1.07 -0.91 - - - - - - - - - - - -2.4 - - - - - - - - - -6.66 - - - - - - - - 2.34 5.25 - - - -1.92 - - - - - - - - - 0.79
2.36 - 2.69 2.81 3.07 1.37 4.12 - - -1.52 - - - - - - - - -1.79 - - - - - - - - - -1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.55 -0.43 1.39 2.41 2.44 -2.64 1.32 -1.24 -3.53 -2.41 -3.25 1.98 0.78 -3.37 - -4.07 - -1.62 -1.93 0.55 - -1.52 1.19 -2.66 - -4.19 - 2.1 -0.98 -4.96 -2.6 -2.6 -2.67 -5.15 -0.18 - -0.89 -1.51 -4.36 - - -2.16 - 0.1 -3.07 2.95 - -1.21
AT1G18220 (PUP9)
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.97 2.46 - - 0.16 4.23 - 1.37 0.39 -0.83 - 2.64 1.06 - - - - - -0.86 - - - - -0.38 - - - - 2.61 - - - - - - - - -1.29 - - - - - - - - - -
5.33 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.94 - - - - - - - - - -
5.51 - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.06 - - - - - - - - - - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 2.38 - - - - - - - - -
4.52 4.61 - - - - - - - - - -0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT1G55330 (AGP21)
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.39 - - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.81 -2.35 2.03 3.01 1.92 -0.68 2.45 -0.2 1.11 -0.6 0.41 3.45 -0.35 - - -0.85 - - 1.16 -3.33 - -0.73 - -4.01 - -1.66 -2.01 -1.77 - - -3.4 - - - - -1.89 1.87 -4.45 -4.52 - - - - - - - - -
5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.47 - - - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-6.33 - - - - - - - - -1.38 - -5.09 - 3.22 - - - - - - - - - -2.14 - - - - - - - - 2.99 1.1 - - - 4.75 -0.12 - - - - - - - - -
2.29 - - - - - - - - - - 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.45 - - - - - - - - - - -1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.52 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.57 - - - - - - - - - - -0.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.33 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.49 - - - - - - - - - - 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.43 2.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.57 - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.49 - - - - - - - - - - -0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.17 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.2 - - - - 1.15 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.56 - - - - - - - - - - -0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.69 - - - - - - - - - - 5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.22 - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - -
5.53 - - - - - - - - - - -0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.11 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.48 - - - - - - - - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.42 - - - - - - - - - - 2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.43 2.21 - - - - - - - - - -2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.12 - - - - - - - - - -
5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - - -
5.53 - - - - - - - - - - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.26 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.85 -0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - 1.94 - - - - - - - - - 2.54
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.47 - - - - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.01 5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.13 - - - - - - - - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT3G25717 (DVL6)
2.88 5.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - -
- 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - 3.39
5.2 - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.55 5.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.58
2.88 - - - - - - - - - - 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.67 - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.92 - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.21 2.65 - - - - - - - - - 4.85 - 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - -
3.33 -0.44 - - - - - - - - - 5.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.78 3.74 - - - - - - - - - -3.14 - 1.45 - - - - - - - - - -0.94 - - - - - - - - -1.59 3.06 - - - 0.64 - - - - - - - - - 2.88
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-5.75 -2.02 - - - - -1.33 - - - - - - -0.6 - - - - - - - - - -1.08 - -1.29 -2.24 - 1.91 -2.53 - 1.78 0.08 0.6 - 1.1 - -0.11 - - - 3.76 -1.28 - 4.22 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.17 - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - -2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.69 - - - - - - - - - - 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.75 - - - - - - - - - - 5.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.28 5.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
- 1.82 - - - -19.28 - -11.34 - -8.49 -16.38 -0.22 -6.84 -0.47 - 0.95 2.37 - -12.45 0.72 - 2.62 - 1.72 0.57 2.2 0.85 - 3.15 -0.99 1.13 - 1.45 -0.26 0.49 - - -1.59 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G25380 (SAP10)
3.41 -2.73 - -4.0 - -2.4 - -5.6 - -3.68 - 0.82 1.11 -3.28 -1.69 -0.51 3.34 0.73 -0.26 -1.39 -1.63 -5.52 -1.37 -0.75 -0.94 0.15 1.77 -4.97 2.56 -3.86 -2.63 -2.54 -5.42 -1.49 -2.63 -3.08 -0.24 -2.68 -0.74 -4.89 - 1.04 -1.69 -1.24 -2.0 -2.66 -2.93 -1.01
-0.82 1.53 - - - - - -1.07 2.36 1.47 - - 2.81 1.6 0.54 - 0.39 - - -1.69 - - - -2.81 - - 1.6 - 2.17 -0.21 -1.91 - -0.79 1.91 -2.01 - - 1.69 0.19 1.63 - - - 1.14 - - - -
2.99 4.67 - - - - - - - - - 0.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.69 - - - - - - - - - -
4.33 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - -
3.14 - - - - - - - - - - 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.55 -0.18 - - - - - - - - - -3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.12 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.33 2.57 2.34 0.21 0.44 1.44 -0.78 - - - - - - -2.85 - -1.84 - -0.28 -1.76 0.8 - - 0.74 -1.51 - -2.86 - -0.7 3.26 -1.64 1.41 -3.01 - -1.98 -0.19 -0.81 - -3.12 -4.43 - - - -0.76 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.31 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.02 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.29 - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.56 4.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.37 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.25 - - - - - - - 3.14 - - 0.18 - - - - - - - - -
-1.77 - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 5.37 - - - 1.03 - - - - - - - - - -
4.59 3.02 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.64 4.07 - - - - - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 - - - - - - - - - -
- 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.52 - - - - - - - - - -
4.43 2.55 - - - - - -0.84 1.9 - 0.57 - - -0.09 -9.15 - - - -3.06 0.31 - - - -4.33 - - - - - - 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.63 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 0.44 - - - - - - - 4.08 - - - 2.27 - - - - - 1.09 0.18 - - - - - - - - -
- -1.79 0.54 - -0.82 0.96 - -0.73 2.43 - 1.71 - - 1.8 - - - - 0.38 -0.12 - 0.35 - -0.35 - -1.25 1.91 1.49 - -1.99 -0.08 - -2.05 0.88 - - 2.63 -1.94 1.44 1.82 - 0.78 - - -0.12 - 0.16 -
4.0 -1.94 -0.32 2.41 1.68 - - 1.68 - -1.38 -0.23 3.35 2.22 - - - - - -0.02 -1.63 - - - - - - - - 0.55 -1.96 - - - - - - - -4.6 - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT5G56795 (MT1B)
-2.91 -1.22 - - - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - - - -3.1 - - - - - - - - 4.15 3.9 - - - 1.7 -2.56 - - - - - - - - -
0.59 - - - - - - - - - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.09 - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.46 - - - - - - - - - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.15 - - - - - - - - - -
ATCG00080 (PSBI)
5.11 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - -
ATCG00210 (YCF6)
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ATCG00220 (PSBM)
5.58 - - - - - - - - - - -2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ATCG00550 (PSBJ)
5.51 -0.47 - - - - - - - - - -4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.69 - - - - - - - - - -
ATCG00560 (PSBL)
5.56 -0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.74 - - - - - - - - - -
ATCG00590 (ORF31)
5.54 - - - - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ATCG00600 (PETG)
5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - -
ATCG00760 (RPL36)
5.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.35 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.