1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.87 0.1 0.14 0.2 0.19 0.24 0.15 1.0 0.52 0.11 0.15 0.0 0.06 0.06 0.09 0.05 0.07 0.04 0.25 0.07 0.09 0.03 0.04 0.14 0.03 0.08 0.09 0.1 0.18 0.04 0.11 0.02 0.01 0.01 0.03 0.07 0.11 0.05 0.05 0.02 0.12 0.01 0.01 0.02 0.02 0.13 0.12 0.01
AT1G06040 (STO)
 0.13 0.62 0.04 0.08 0.15 0.15 0.1 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.54 0.53 0.37 0.15 0.24 0.1 0.45 0.36 0.41 0.3 0.36 0.06 0.4 0.68 0.47 0.09 0.02 0.26 0.32 0.72 0.18 0.21 0.46 0.93 0.48 1.0 0.07 0.1 0.41 0.5 0.19 0.01 0.11 0.22 0.27
0.15 0.16 0.01 0.03 0.07 0.06 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.06 0.35 0.17 0.19 0.09 0.49 0.53 0.51 0.47 0.4 0.11 0.42 1.0 0.26 0.07 0.03 0.57 0.63 0.25 0.11 0.38 0.63 0.96 0.28 0.43 0.03 0.11 0.18 0.22 0.09 0.01 0.02 0.06 0.17
AT1G09350 (GolS3)
 0.01 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.52 0.1 0.0 0.0 0.04 0.02 0.08 0.0 0.0 0.04 0.1 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.31 0.23 0.3 0.02 0.22 0.21 0.15 0.62 0.0 0.0 1.0 0.34 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02
AT1G18300 (NUDT4)
 0.06 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.23 0.34 0.25 0.58 0.09 0.01 0.04 0.18 0.09 0.03 0.2 0.1 0.01 0.08 0.07 0.08 0.02 0.12 0.02 0.05 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.32 1.0 0.02 0.4 0.12 0.03 0.06 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.06 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.07 0.11 0.02 0.01 0.13 0.51 0.03 0.46 1.0 0.21 0.09 0.22 0.46 0.43 0.3 0.08 0.36 0.23 0.08 0.08 0.84 0.11 0.13 0.4 0.09 0.09 0.0 0.11 0.07 0.19 0.04 0.0 0.44 0.06
AT1G25250 (IDD16)
 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.23 0.1 0.43 1.0 0.17 0.1 0.01 0.26 0.12 0.16 0.01 0.2 0.03 0.05 0.0 0.0 0.06 0.04 0.04 0.02 0.24 0.54 0.09 0.21 0.06 0.0 0.0 0.02 0.13 0.07 0.06 0.0 0.0 0.07
0.2 0.05 0.05 0.04 0.03 0.03 0.01 0.34 0.81 0.31 0.43 0.03 0.01 0.06 0.07 0.4 0.31 0.22 0.45 0.12 0.09 0.18 0.11 0.17 0.12 0.24 0.16 0.04 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03 0.03 0.02 0.3 1.0 0.05 0.29 0.02 0.03 0.05 0.01 0.02 0.02 0.0 0.17 0.01
0.42 0.28 0.27 0.33 0.32 0.31 0.35 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.3 0.47 0.25 0.34 0.48 0.13 0.34 0.45 0.27 0.41 0.29 0.23 0.26 0.16 0.2 0.11 0.3 0.41 0.28 0.15 0.23 0.39 0.39 0.32 0.32 0.15 0.03 0.05 0.38 0.31 0.29 0.42 1.0 0.43 0.28
0.12 0.72 0.02 0.01 0.04 0.11 0.01 0.14 0.11 0.05 0.06 0.0 0.11 0.21 0.27 0.07 1.0 0.22 0.15 0.34 0.1 0.39 0.19 0.13 0.01 0.09 0.02 0.36 0.01 0.0 0.22 0.07 0.15 0.07 0.34 0.12 0.01 0.18 0.04 0.1 0.03 0.04 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
0.61 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.17 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 0.09 0.02 0.05 0.52 0.1 0.09 0.0 0.01 1.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.0 0.76 0.51 0.08 0.73 0.27 0.05 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.04 0.25 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.4 0.21 0.29 0.39 0.46 0.34 0.08 0.32 0.55 0.22 0.01 0.14 0.11 0.0 0.03 0.01 0.33 0.39 0.14 1.0 0.64 0.72 0.17 0.43 0.07 0.01 0.05 0.36 0.42 0.28 0.21 0.03 0.0 0.22
0.12 0.33 0.08 0.03 0.05 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.29 0.32 0.31 0.35 0.15 0.45 0.28 0.45 0.56 0.27 0.15 0.3 0.57 0.3 0.1 0.11 0.35 0.35 0.13 0.26 0.69 0.57 1.0 0.49 0.21 0.0 0.06 0.46 0.27 0.3 0.4 0.03 0.2 0.18
0.0 0.15 0.02 0.05 0.09 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.37 0.71 0.38 0.02 0.19 0.36 0.08 0.4 0.09 0.11 0.26 0.14 0.23 0.08 0.01 0.34 0.01 1.0 0.3 0.44 0.02 0.09 0.0 0.37 0.07 0.03 0.06 0.35 0.03 0.08 0.02 0.0 0.0 0.05
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.11 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.07 0.04 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.22 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
AT1G73540 (NUDT21)
 0.08 0.03 0.08 0.06 0.06 0.08 0.08 0.19 0.25 0.1 0.17 0.4 0.24 0.03 0.38 0.45 0.39 0.11 0.41 0.2 0.02 0.19 0.2 0.24 0.05 0.31 0.1 0.05 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.58 1.0 0.03 0.43 0.04 0.01 0.03 0.02 0.01 0.04 0.08 0.25 0.01
AT2G22190 (TPPE)
 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.39 0.34 0.24 0.07 0.09 0.05 0.15 0.23 0.3 0.0 0.3 0.01 0.03 0.03 0.0 0.06 0.1 0.2 0.02 0.1 0.23 1.0 0.18 0.23 0.04 0.0 0.17 0.01 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
AT2G28900 (OEP16)
 0.03 0.29 0.47 0.34 0.45 0.31 0.36 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.29 0.69 1.0 0.24 0.24 0.19 0.39 0.45 0.85 0.78 0.9 0.06 0.8 0.12 0.04 0.06 0.07 0.38 0.39 0.34 0.16 0.38 0.74 0.37 0.51 0.28 0.02 0.02 0.04 0.01 0.08 0.03 0.0 0.43 0.04
AT2G35960 (NHL12)
 0.0 0.09 0.1 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.33 0.52 1.0 0.08 0.09 0.12 0.4 0.22 0.24 0.0 0.33 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.19 0.02 0.06 0.53 0.06 0.16 0.14 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01
AT2G42530 (COR15B)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.51 1.0 0.33 0.06 0.04 0.03 0.08 0.61 0.2 0.13 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.03 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G42540 (COR15)
 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.63 1.0 0.14 0.05 0.11 0.01 0.07 0.16 0.04 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.01 0.04 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.25 0.02 0.25 1.0 0.3 0.03 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.14 0.03 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.3 0.51 0.04 0.01 0.03 0.01 0.02 0.4 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
AT3G05660 (RLP33)
 0.96 0.49 0.22 0.32 0.26 0.11 0.35 0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.02 0.1 0.22 0.37 0.0 0.02 0.03 0.35 0.07 0.35 0.47 0.09 0.03 0.1 0.14 0.04 0.19 0.03 0.06 0.26 0.18 0.33 0.28 0.13 0.37 0.39 1.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
AT3G05800 (AIF1)
 0.02 0.15 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.32 0.1 0.4 0.0 0.03 0.13 0.33 0.07 0.95 1.0 0.1 0.21 0.09 0.52 0.61 0.13 0.0 0.2 0.05 0.09 0.0 0.0 0.19 0.69 0.66 0.42 0.34 0.45 0.0 0.26 0.13 0.01 0.0 0.52 0.87 0.01 0.29 0.07 0.0 0.09
0.62 0.04 0.03 0.02 0.09 0.07 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.1 0.15 0.2 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.06 0.04 0.01 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.39 0.29 0.16 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.09 0.08 0.04 0.6 0.23 0.01 0.03 0.02 0.34 0.52 0.04 0.03 0.06 0.03 0.07 0.03 0.07 0.01 0.13 0.15 0.17 0.18 0.46 0.09 0.23 0.07 0.01 0.02 1.0 0.1 0.02 0.14 0.0 0.0 0.01
0.33 0.14 0.4 0.39 0.33 0.22 0.29 0.05 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.14 0.01 0.01 0.0 0.12 0.13 0.03 0.03 0.02 0.07 0.07 0.05 0.08 0.1 0.25 0.05 0.04 0.04 0.16 0.03 0.01 0.04 0.28 0.06 1.0 0.63 0.17 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.16 0.01
0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.06 1.0 0.07 0.02 0.11 0.11 0.15 0.06 0.18 0.09 0.17 0.0 0.13 0.01 0.03 0.13 0.02 0.11 0.03 0.11 0.08 0.0 0.1 0.03 0.0 0.01 0.43 0.49 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02
1.0 0.19 0.62 0.45 0.37 0.1 0.36 0.06 0.07 0.04 0.05 0.64 0.05 0.03 0.13 0.02 0.03 0.01 0.11 0.21 0.05 0.05 0.03 0.06 0.02 0.03 0.17 0.14 0.17 0.0 0.13 0.03 0.06 0.0 0.12 0.03 0.05 0.02 0.04 0.56 0.0 0.0 0.01 0.12 0.07 0.0 0.05 0.06
0.45 0.35 0.16 0.23 0.22 0.16 0.21 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.22 0.86 0.91 0.38 0.31 0.34 0.6 0.54 0.91 0.92 0.24 0.03 0.36 0.09 0.33 0.72 0.03 0.18 0.17 0.2 0.07 0.36 0.34 0.38 0.33 0.24 0.02 0.03 0.06 0.06 0.43 0.13 0.0 1.0 0.13
1.0 0.37 0.1 0.11 0.05 0.03 0.08 0.03 0.02 0.01 0.01 0.08 0.0 0.34 0.46 0.46 0.38 0.45 0.09 0.41 0.36 0.43 0.39 0.32 0.1 0.43 0.12 0.29 0.15 0.11 0.26 0.22 0.35 0.25 0.27 0.39 0.55 0.31 0.32 0.18 0.04 0.15 0.22 0.25 0.18 0.19 0.19 0.12
AT4G15130 (CCT2)
 0.11 0.17 0.08 0.13 0.14 0.27 0.13 0.8 1.0 0.5 0.94 1.0 0.38 0.16 0.38 0.14 0.14 0.1 0.36 0.19 0.13 0.14 0.17 0.15 0.06 0.12 0.12 0.21 0.22 0.07 0.16 0.18 0.13 0.12 0.15 0.16 0.19 0.15 0.18 0.17 0.47 0.22 0.12 0.09 0.1 0.01 0.24 0.07
AT4G17090 (BMY8)
 0.08 0.16 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.85 1.0 0.03 0.01 0.12 0.62 0.08 0.52 0.36 0.5 0.03 0.95 0.51 0.03 0.17 0.0 0.15 0.09 0.41 0.01 0.22 0.73 0.95 0.41 0.79 0.61 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
AT4G25470 (FTQ4)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.1 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.08 0.02 0.01 0.12 0.0 0.06 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.44 0.55 0.01 0.64 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.44 0.07 0.0
AT4G25480 (CBF3)
 0.02 0.03 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.19 0.1 0.09 0.02 0.03 0.07 0.01 0.13 0.09 0.01 0.0 0.01 0.0 0.41 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.31 0.44 0.03 0.04 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
AT4G25490 (CBF1)
 0.16 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.64 0.29 0.03 0.02 0.35 0.01 0.24 0.25 0.08 0.0 0.13 0.0 0.91 0.07 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.79 0.53 0.02 0.75 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0
0.1 0.13 0.11 0.07 0.11 0.07 0.05 0.04 0.07 0.02 0.03 0.0 0.02 0.19 0.29 0.02 0.02 0.01 0.1 0.15 0.03 0.09 0.07 0.09 0.02 0.06 0.23 0.08 0.12 0.0 0.13 0.05 0.37 0.28 0.03 0.1 0.49 0.11 1.0 0.05 0.01 0.02 0.04 0.05 0.02 0.09 0.0 0.02
0.11 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.52 0.18 0.19 0.52 0.11 0.63 0.68 0.74 1.0 0.17 0.01 0.15 0.1 0.0 0.04 0.0 0.14 0.09 0.08 0.02 0.78 0.69 0.18 0.45 0.1 0.05 0.02 0.07 0.01 0.01 0.04 0.0 0.05 0.03
0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.47 0.58 0.63 0.41 0.26 0.27 0.77 0.79 0.99 0.19 0.01 0.22 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.07 0.07 0.33 1.0 0.12 0.45 0.03 0.0 0.01 0.03 0.08 0.01 0.1 0.0 0.01 0.06
0.49 0.31 0.04 0.07 0.11 0.04 0.03 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.02 0.19 0.23 0.03 0.04 0.03 0.09 0.12 0.02 0.09 0.14 0.15 0.01 0.09 0.03 0.08 1.0 0.01 0.09 0.1 0.12 0.08 0.08 0.72 0.4 0.45 0.08 0.3 0.0 0.34 0.11 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0
0.25 0.41 0.25 0.33 0.23 0.15 0.27 0.1 0.07 0.01 0.02 0.0 0.03 0.35 1.0 0.34 0.15 0.15 0.22 0.35 0.23 0.37 0.36 0.32 0.1 0.42 0.62 0.41 0.32 0.08 0.25 0.21 0.52 0.24 0.22 0.24 0.28 0.21 0.41 0.65 0.31 0.1 0.03 0.09 0.06 0.0 0.12 0.04
AT4G34650 (SQS2)
 0.0 0.11 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.26 0.23 0.38 1.0 0.0 0.09 0.03 0.55 0.46 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.65 0.53 0.02 0.7 0.03 0.22 0.17 0.07 0.0 0.1 0.02 0.0 0.03 0.03 0.0 0.01
0.02 0.06 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.01 0.03 0.01 0.04 0.08 0.03 0.03 0.04 0.04 0.06 0.01 0.1 0.28 0.08 0.0 0.08 0.2 0.09 1.0 0.32 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.13 0.08 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.04 0.1 0.01 0.09 0.08 0.05 0.13 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
AT5G43860 (CLH2)
 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.36 0.11 0.07 0.12 0.33 0.08 0.05 0.19 0.1 0.22 0.32 0.23 0.05 0.29 1.0 0.43 0.03 0.29 0.17 0.08 0.03 0.22 0.09 0.36 0.15 0.08 0.65 0.1 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.29 0.0 0.1 0.01 0.07 0.07 0.29 0.21 0.24 0.03 0.36 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.55 1.0 0.18 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G52310 (RD29A)
 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.88 0.51 0.19 0.1 0.07 0.04 0.12 0.29 0.13 0.07 0.02 0.11 0.0 0.02 0.02 0.04 0.01 0.19 0.07 0.14 0.01 1.0 0.77 0.51 0.3 0.06 0.08 0.15 0.02 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0
0.25 0.08 0.17 0.18 0.31 0.6 0.23 1.0 0.59 0.04 0.16 0.01 0.02 0.05 0.2 0.03 0.03 0.03 0.17 0.07 0.02 0.06 0.07 0.1 0.06 0.09 0.43 0.11 0.44 0.0 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.16 0.63 0.04 0.58 0.0 0.05 0.04 0.03 0.05 0.01 0.65 0.03 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)