Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.6 0.84 -0.0 -0.84 -0.22 -1.02 -0.59 -0.81 -1.92 -1.23 -2.39 -0.46 -3.04 0.41 -0.24 0.42 0.05 -0.4 0.28 0.66 0.16 0.45 0.48 -0.06 -0.45 0.26 0.79 0.72 0.01 -0.25 0.37 -0.11 0.25 0.08 0.4 -0.04 0.94 0.06 1.41 -1.47 -1.03 -0.87 -1.42 -0.55 -0.86 1.01 -0.16 -1.14
AT1G07420 (ATSMO2)
-0.12 -0.32 0.52 0.44 0.25 0.43 0.46 -1.59 -2.82 -3.94 -4.33 -3.08 -5.7 0.26 -0.35 0.25 0.75 0.59 -1.22 -0.02 0.67 0.14 0.36 -0.23 -0.83 -0.13 0.23 -0.01 -0.74 -1.22 0.26 -0.59 -1.57 -0.25 0.43 0.62 0.1 0.09 -0.95 -4.01 -10.06 0.29 1.42 0.02 0.77 2.04 -0.03 0.28
AT1G08070 (OTP82)
2.59 0.36 1.14 0.54 0.41 -1.52 0.34 -3.03 -3.73 -2.31 -4.5 2.15 -0.35 -0.09 -0.2 0.36 -0.72 -0.86 -1.16 0.83 0.24 0.95 1.02 -0.71 -0.76 -0.77 -1.16 1.21 -1.13 -0.26 0.14 0.14 -0.96 -0.94 0.56 -1.33 -0.03 -0.15 -0.8 -2.74 -2.62 -2.63 -1.71 0.52 -0.81 - - -0.73
0.37 0.08 0.1 -0.25 0.42 0.7 0.31 0.16 -0.33 -1.3 -0.45 -1.47 -1.62 0.16 0.07 -0.49 0.38 0.15 -0.99 -0.47 0.16 -0.89 -0.64 -0.31 -2.24 -0.34 0.14 -1.41 1.42 -2.71 -0.51 -0.13 -0.99 0.34 -0.95 0.36 0.57 -0.09 -0.44 -3.3 -2.08 1.02 1.55 0.62 0.47 1.12 -0.27 0.38
-1.18 0.62 0.32 0.3 0.03 0.09 0.06 0.99 0.34 -1.55 -1.07 - -2.02 -0.19 0.52 -0.12 -0.4 -0.51 -0.36 0.4 -0.27 -0.03 0.24 -0.28 0.43 0.09 -0.15 0.44 -0.26 0.65 0.17 -0.18 0.25 -0.1 -0.13 -0.19 0.42 -0.09 1.02 -0.81 -3.88 0.17 0.24 0.26 -0.12 -0.14 0.54 -0.37
AT1G26120 (ICME-LIKE1)
0.35 -0.3 0.82 0.84 0.42 -0.05 0.86 -0.84 -0.71 -0.33 -0.37 -7.01 -0.84 0.01 -0.93 0.17 0.26 -0.34 0.35 -0.13 -0.04 -0.24 -0.27 -0.18 -1.59 0.21 0.42 -0.89 0.64 -2.07 -0.14 -0.0 -0.79 -0.25 -0.61 -0.4 0.26 -0.17 -0.19 -2.1 -2.1 0.42 0.46 0.25 0.24 2.16 -0.04 -0.45
0.66 0.72 0.42 0.3 0.36 -0.87 0.03 -2.25 -2.26 -2.71 -2.82 -3.96 -2.72 0.16 0.92 -0.46 0.09 -0.43 -0.6 0.53 0.14 -0.31 0.12 -0.25 -0.76 -0.48 0.16 0.4 1.01 -0.72 0.42 0.02 -0.38 -0.3 0.24 -0.18 0.14 -0.06 0.08 -1.43 -0.45 -0.04 0.03 0.49 0.12 1.87 0.28 -0.01
AT1G32340 (NHL8)
0.54 -0.05 0.79 1.15 0.98 0.63 0.96 -2.77 -3.6 -5.24 -4.52 -11.72 -1.9 0.03 0.06 0.2 0.14 -0.45 -0.7 0.09 -0.29 -0.9 -0.85 -0.33 -0.81 -0.36 0.89 -0.29 1.11 -1.36 0.01 -0.02 -0.65 0.36 -0.31 -0.0 1.44 0.02 0.58 -2.8 -0.33 0.79 -0.45 -0.92 0.07 -6.63 1.72 -1.32
AT1G51690 (B ALPHA)
0.38 0.34 0.68 0.74 0.49 0.25 0.68 -0.15 -0.85 -2.73 -2.11 -6.56 -2.04 0.3 0.34 -0.16 0.73 0.11 -1.38 0.26 0.25 -0.14 0.24 -0.26 -1.85 -0.08 -0.02 0.29 -0.05 -2.54 -0.05 0.01 -0.33 -0.0 -0.07 0.14 0.42 0.03 -0.01 -1.32 -1.14 0.33 0.81 0.39 0.57 0.94 -0.55 0.07
0.7 0.91 0.62 0.62 0.42 0.32 0.57 -0.6 -1.13 -2.61 -1.93 -6.0 -4.44 0.37 -0.08 -0.5 -1.09 -0.77 -1.87 0.69 0.11 -0.38 0.17 -0.21 -2.84 -0.6 -1.71 -0.1 0.36 -2.68 0.78 -0.2 -0.9 -0.2 0.28 0.04 -0.4 0.23 -0.21 -4.23 -3.64 0.9 1.44 0.81 0.9 -5.28 1.89 0.52
AT1G54360 (TAF6B)
1.52 1.1 0.08 0.12 0.09 -0.92 0.24 -6.79 -5.23 -6.06 -5.53 -5.6 -5.03 0.33 -1.03 0.24 -0.56 -0.87 -1.51 0.85 -0.21 0.35 0.58 0.29 -2.32 0.3 -0.41 1.38 0.5 -2.81 0.63 0.0 0.07 0.25 0.21 0.25 0.38 0.81 0.5 -0.92 -1.06 0.64 0.4 1.01 0.37 -7.17 -0.7 0.02
-0.47 0.32 0.35 1.1 0.65 0.77 1.03 -1.73 -1.88 -5.26 -4.28 - -5.93 0.12 0.28 -0.21 0.45 0.12 -1.91 0.31 -0.04 -0.07 0.24 -0.3 -3.25 -0.19 -0.31 -0.14 -1.42 -4.86 0.08 -0.08 -0.84 -0.37 -0.01 0.52 0.63 0.05 -0.92 -3.67 -6.23 0.42 1.52 1.04 0.9 1.66 -0.22 0.46
AT1G58350 (ZW18)
-0.36 1.11 0.18 0.17 0.4 0.65 0.2 0.53 -0.21 -2.15 -1.01 -8.37 -0.32 0.61 0.86 -0.0 0.12 0.34 -1.59 0.25 0.12 -0.2 -0.13 -0.4 -3.91 -0.15 -1.45 -1.22 -1.06 -4.63 -0.24 0.26 -0.31 -0.09 -0.81 0.43 -0.96 0.02 0.03 -2.99 -4.1 -0.37 1.21 0.52 0.22 1.16 1.76 0.06
AT1G59720 (CRR28)
0.92 0.93 -3.68 -1.81 -1.89 -5.88 -1.93 -6.37 -4.68 - - - - 0.87 1.23 1.29 -1.54 -1.53 -0.62 1.32 0.41 2.09 1.9 0.27 -1.67 0.74 -0.33 1.16 0.61 -1.87 0.38 1.7 0.77 0.59 0.57 -0.39 0.44 0.33 -0.22 -0.62 -0.84 -3.54 -2.34 -2.28 -3.03 - - -2.88
1.02 0.16 0.53 0.71 0.39 -0.39 0.65 -2.36 -3.39 -4.48 -4.66 -3.5 -3.61 0.11 -0.98 -0.36 0.01 -0.18 -1.63 0.01 -0.16 -0.3 -0.2 -0.05 -0.91 -0.17 0.14 0.0 1.31 -0.89 0.04 0.03 -0.62 0.16 -0.4 0.28 0.58 -0.08 0.31 -1.45 -0.22 -0.01 0.79 0.36 0.26 2.25 -1.7 -0.08
AT1G68100 (IAR1)
1.05 0.4 0.58 0.39 0.3 -0.65 0.37 -5.04 -5.07 -6.73 -5.05 -4.74 -1.17 0.05 -0.3 -0.14 -0.04 0.02 -1.8 0.37 -0.25 -0.43 0.0 -0.1 -2.22 -0.2 -0.84 -0.04 0.23 -2.51 0.27 -0.02 -0.47 0.51 -0.0 0.18 0.55 0.55 0.25 -3.11 -2.69 1.14 1.36 0.96 0.84 1.68 -1.72 0.5
AT2G01470 (STL2P)
0.31 -0.2 0.42 0.45 0.31 0.15 0.43 -1.32 -2.13 -4.81 -4.05 -8.48 -3.23 -0.21 0.18 -0.35 0.25 -0.17 -1.34 0.05 0.46 -0.48 -0.11 -0.07 -0.73 -0.12 0.45 -0.14 1.02 -1.16 -0.16 0.13 -0.87 -0.15 -0.68 0.01 0.59 -0.1 -0.07 -0.68 0.09 -0.1 0.98 0.44 0.54 1.88 0.24 0.47
0.04 0.31 0.82 1.15 0.15 -0.62 0.87 -1.74 -2.62 -5.63 -4.05 -8.02 -3.48 -0.08 -0.3 -0.19 0.41 -0.35 -0.64 0.29 -0.01 -0.73 -0.45 -0.19 -0.19 -0.4 0.99 -0.42 1.5 -0.59 0.2 0.47 -1.06 -0.23 -0.54 -0.41 0.48 -0.35 0.15 -1.09 0.82 1.02 0.59 0.57 0.06 -4.13 0.89 0.09
0.54 0.07 0.77 0.81 0.61 0.89 1.03 0.25 0.17 -0.96 -0.08 -5.61 -3.94 -0.44 -1.41 -0.8 -0.18 -0.06 -0.82 0.29 -0.1 -0.92 -0.67 -0.35 -2.15 -0.61 -0.77 -0.79 0.21 -2.48 0.02 -0.26 -1.25 -0.14 -0.52 -0.19 -0.09 -0.36 0.03 -1.8 -2.84 -0.33 0.86 0.3 0.14 2.62 0.26 0.0
-0.73 0.23 0.03 0.4 0.27 -0.58 0.55 -6.38 -5.38 -6.26 -6.92 -10.1 -6.98 0.34 0.31 0.03 -0.52 0.05 -1.66 0.34 -0.31 0.68 0.69 -0.18 -0.02 0.13 -1.65 1.49 -0.58 0.32 -0.08 0.77 0.42 0.54 0.95 0.07 0.57 0.61 -0.55 -2.7 -5.08 0.14 0.1 0.81 0.17 0.27 0.78 0.42
1.99 1.37 -0.16 - 0.46 0.67 -4.78 -1.58 - -0.79 -4.11 -2.38 -0.96 0.35 -0.75 -0.98 -0.5 -1.21 -0.05 0.6 0.75 -0.84 -1.0 -0.92 -1.69 -1.37 -0.7 0.94 -1.29 -2.15 0.2 -1.2 -1.55 -1.29 -0.03 -1.02 -0.61 -0.26 -0.96 -0.39 -3.4 0.26 -1.05 -0.34 -2.42 3.68 -5.5 -0.77
-1.86 0.51 -2.59 -5.07 -3.94 -1.12 -4.21 -3.73 -4.17 - - - - 1.13 0.33 0.69 1.44 0.66 -1.16 0.68 0.27 0.33 0.52 0.03 0.04 0.37 1.76 -1.24 -3.06 -0.68 0.84 1.07 -1.43 0.59 0.35 0.11 0.39 0.27 0.31 - -3.64 0.84 1.69 0.78 1.4 - - -0.18
-1.06 0.61 0.84 0.82 0.57 -0.03 0.95 -2.86 -3.54 -5.39 -4.84 -4.25 -6.77 0.25 0.4 -0.27 0.17 -0.37 -1.29 0.46 0.04 -0.36 -0.2 -0.13 -0.21 -0.08 0.11 -0.63 0.36 -0.07 0.17 -0.12 -0.39 0.2 -0.6 -0.06 0.65 0.09 0.39 -2.06 -1.67 0.64 1.01 0.58 0.47 1.61 -0.24 -0.15
0.67 0.66 0.56 1.03 0.74 0.99 1.32 -0.26 -0.72 -2.68 -2.28 -3.55 -0.93 0.11 0.36 -0.39 0.06 -0.63 -1.18 0.75 -0.03 -0.7 -0.19 -0.43 -0.75 -0.45 -0.07 0.09 -0.09 -0.62 0.23 -0.07 -1.2 -0.29 -0.08 -0.37 0.54 0.03 0.92 -1.27 -4.07 0.23 0.81 0.67 0.02 -0.84 -0.82 0.08
AT3G04940 (CYSD1)
-3.33 0.69 -3.16 -3.93 -3.3 -4.28 -3.4 -10.16 -9.24 -11.49 - - - 1.0 1.36 -0.09 0.49 0.41 -1.61 0.87 0.0 0.69 1.14 0.3 -4.74 0.43 -4.38 0.82 -0.26 -5.56 0.5 0.51 0.71 0.51 1.3 1.48 0.35 0.85 -0.18 -1.05 -5.92 0.93 1.2 -0.24 -0.27 1.6 -13.59 -0.21
AT3G05710 (SYP43)
-2.49 0.33 0.3 0.86 0.83 1.16 1.08 -0.13 0.35 -0.4 0.32 -5.27 -1.49 -0.17 0.46 -0.76 0.01 -0.58 -1.22 -0.08 -0.49 -0.55 -0.2 -0.54 -3.48 -0.25 -0.27 -0.91 0.4 -5.1 -0.81 -0.7 -0.55 -0.33 -0.7 -0.02 -0.24 -0.12 -0.82 -1.09 -0.64 0.15 1.1 0.05 0.18 2.42 -0.31 0.05
-0.8 0.72 -0.5 0.09 -0.12 -0.87 -0.05 -2.79 -2.67 -4.82 -2.99 -1.63 -2.39 0.74 0.22 0.21 -0.07 -0.69 -1.17 0.59 0.12 -0.35 -0.01 0.39 -0.33 0.35 0.88 -0.01 0.48 0.22 0.47 -0.26 -0.15 0.04 -0.38 0.11 1.29 0.37 1.1 -1.59 -1.89 0.37 -0.52 -0.42 -0.43 1.62 0.98 -1.14
1.3 0.78 0.6 0.58 0.57 0.73 0.59 -0.03 -0.82 -1.68 -1.22 0.82 -1.45 0.39 1.14 -0.44 0.1 -1.02 -1.23 0.59 -0.18 0.05 0.51 0.04 -3.48 0.25 -0.74 0.3 -0.61 -4.23 0.16 -0.54 -0.27 -0.78 0.38 0.76 0.04 0.14 -0.95 -3.06 -3.81 -0.73 -0.0 0.77 -0.6 0.27 -0.12 -0.55
-0.23 1.09 0.87 0.71 0.31 -0.09 0.57 -2.26 -3.2 -4.42 -4.06 -0.56 -2.17 0.53 0.24 0.13 0.31 -0.16 -0.74 1.15 0.46 0.05 0.4 0.19 -0.75 0.19 -0.09 1.02 0.69 -0.73 0.71 -0.2 -0.31 -0.26 0.57 -0.09 0.69 0.37 0.21 -2.58 -3.19 -0.38 -0.16 0.36 -0.47 -1.75 -1.05 -0.43
-1.74 0.12 -1.74 -0.72 0.37 1.82 -0.01 0.78 -0.2 -3.58 -3.51 -4.44 -5.25 0.24 0.03 -0.17 0.53 0.48 -1.22 0.23 0.06 -0.53 -0.38 -0.17 -2.91 -0.15 -0.27 -1.31 0.44 -3.43 -0.39 -0.39 -0.7 0.28 -0.15 0.31 0.02 0.12 -0.24 -2.45 -1.95 0.14 1.08 0.36 0.36 2.13 1.1 0.33
-2.8 0.48 1.27 1.2 1.45 1.29 0.91 -2.17 -3.06 -4.65 -4.56 -8.6 -0.92 -0.02 0.2 -0.28 -0.5 -1.1 -1.71 0.4 -1.09 -0.46 -0.11 -0.04 -1.08 -0.07 1.62 -0.56 0.09 -2.02 0.26 -0.4 -0.59 0.44 -0.66 0.12 1.12 -0.14 0.86 -4.98 -4.75 1.25 0.32 -0.61 -0.04 1.06 -10.25 -1.41
-1.2 0.85 -4.77 -2.43 -3.38 -5.26 -3.06 -9.06 -9.18 -8.78 -8.9 -8.25 - 0.69 1.33 0.49 0.43 1.28 -1.58 0.77 -0.35 0.03 0.84 0.85 -6.58 0.68 -2.23 -3.93 -0.52 -6.35 1.3 0.08 0.46 1.04 0.82 1.3 0.53 0.4 -0.37 -7.03 - 2.13 1.05 -0.11 1.4 - -4.42 0.2
AT3G22590 (PHP)
-0.37 0.52 0.5 0.83 0.43 -0.6 0.6 -3.67 -3.66 -5.12 -4.83 -2.23 -3.29 -0.08 0.1 -0.43 0.15 -0.09 -1.17 0.66 0.02 -0.03 0.49 -0.04 -1.78 -0.42 -1.09 0.6 2.41 -2.05 0.31 0.25 -0.73 -0.57 0.36 -0.29 -0.42 -0.16 -1.36 -4.78 -4.22 -0.49 0.07 0.86 0.03 1.52 1.06 0.34
AT3G26320 (CYP71B36)
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AT3G46820 (TOPP5)
-1.05 0.07 0.38 0.49 0.5 1.46 0.81 1.37 0.65 -1.45 -0.48 -5.65 -1.42 0.39 0.67 0.1 0.53 0.54 -0.37 -0.12 0.21 -0.39 -0.26 -0.15 -2.64 0.14 0.53 -0.7 1.03 -5.46 -0.21 0.06 -0.32 0.27 -0.64 -0.28 -0.07 -0.29 0.3 -2.04 -1.67 -0.17 0.18 -0.94 0.03 -0.11 -0.98 -0.63
AT3G47390 (PHS1)
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AT3G55030 (PGPS2)
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AT3G57560 (NAGK)
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AT4G08320 (TPR8)
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AT4G27040 (VPS22)
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AT4G31670 (UBP18)
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AT5G05980 (DFB)
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0.27 0.61 0.52 0.52 0.26 -0.75 0.38 -3.11 -5.81 -5.35 -5.82 -1.35 -2.03 0.52 0.47 0.59 0.35 0.58 -1.26 0.17 0.48 0.49 0.25 0.75 -1.44 1.29 0.79 0.67 -0.43 -1.53 0.37 0.37 -0.26 -0.36 0.19 0.28 -0.25 0.58 0.01 -0.85 -2.59 -0.34 0.11 0.8 -0.66 -6.86 0.19 -0.05

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Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.