1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G04940 (TIC20)
 0.41 0.38 0.32 0.47 0.31 0.21 0.53 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.38 0.17 0.61 0.17 0.25 0.13 0.38 0.27 1.0 0.64 0.39 0.02 0.47 0.12 0.94 0.12 0.03 0.17 0.42 0.42 0.36 0.24 0.22 0.13 0.44 0.22 0.16 0.0 0.1 0.18 0.27 0.06 0.18 0.23 0.16
0.15 0.43 0.78 0.41 0.37 0.07 0.34 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.33 0.22 0.27 0.21 0.28 0.2 0.54 0.33 0.55 0.77 0.33 0.04 0.26 0.08 1.0 0.24 0.03 0.57 0.56 0.36 0.31 0.8 0.32 0.27 0.4 0.29 0.02 0.0 0.21 0.16 0.81 0.46 0.0 0.53 0.58
0.16 0.17 0.52 0.63 0.4 0.16 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.13 0.17 0.08 0.1 0.07 0.25 0.12 0.43 0.42 0.15 0.06 0.1 0.1 1.0 0.05 0.04 0.18 0.51 0.27 0.26 0.38 0.2 0.18 0.29 0.17 0.18 0.07 0.09 0.18 0.89 0.52 0.19 0.23 0.73
AT1G22940 (TH1)
 0.37 0.33 0.55 0.49 0.39 0.18 0.57 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.28 0.47 0.48 0.41 0.28 0.12 0.41 0.3 0.4 0.32 0.35 0.17 0.48 0.17 0.47 0.13 0.13 0.29 0.32 0.35 0.27 0.29 0.34 0.51 0.38 0.43 0.18 0.09 0.19 0.23 0.33 0.21 0.2 1.0 0.19
0.53 0.4 0.73 0.75 0.49 0.16 0.62 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.4 0.29 0.37 0.22 0.27 0.18 0.49 0.41 0.51 0.66 0.3 0.09 0.3 0.15 1.0 0.22 0.06 0.51 0.63 0.37 0.3 0.62 0.31 0.34 0.41 0.24 0.12 0.03 0.21 0.3 0.92 0.61 0.44 0.23 0.72
0.43 0.39 0.23 0.24 0.13 0.02 0.19 0.01 0.01 0.01 0.01 0.14 0.02 0.35 0.22 0.39 0.06 0.09 0.09 0.42 0.24 0.94 0.91 0.23 0.17 0.18 0.09 1.0 0.14 0.16 0.33 0.68 0.28 0.16 0.54 0.16 0.26 0.27 0.19 0.09 0.19 0.06 0.05 0.5 0.16 0.0 0.64 0.25
AT1G31180 (IMD3)
 0.31 0.36 0.36 0.31 0.28 0.12 0.28 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.32 0.38 0.27 0.2 0.19 0.09 0.42 0.3 0.57 0.65 0.26 0.07 0.19 0.17 1.0 0.09 0.05 0.32 0.45 0.33 0.21 0.36 0.18 0.17 0.34 0.14 0.06 0.02 0.09 0.19 0.74 0.41 0.01 0.08 0.53
0.71 0.47 0.19 0.1 0.16 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.49 0.52 0.77 0.28 0.36 0.12 0.49 0.39 1.0 0.84 0.53 0.36 0.74 0.69 0.56 0.07 0.44 0.28 0.65 0.53 0.49 0.38 0.29 0.61 0.5 0.41 0.03 0.01 0.11 0.08 0.13 0.05 0.0 0.72 0.07
0.4 0.62 0.67 0.62 0.49 0.04 0.59 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.41 0.38 0.54 0.16 0.15 0.12 0.72 0.34 1.0 0.85 0.46 0.2 0.51 0.14 0.69 0.2 0.28 0.4 0.73 0.39 0.32 0.51 0.28 0.46 0.53 0.32 0.32 0.04 0.05 0.11 0.8 0.2 0.04 0.0 0.34
AT1G66520 (pde194)
 0.29 0.47 0.65 0.52 0.53 0.14 0.46 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.41 0.07 0.42 0.23 0.22 0.07 0.53 0.41 1.0 0.97 0.28 0.08 0.3 0.04 0.83 0.06 0.05 0.36 0.68 0.19 0.25 0.33 0.28 0.16 0.39 0.19 0.04 0.05 0.08 0.18 0.82 0.25 0.12 0.28 0.45
AT2G01290 (RPI2)
 0.04 0.21 0.05 0.06 0.04 0.02 0.04 0.07 0.07 0.07 0.04 0.0 0.03 0.2 0.17 0.22 0.04 0.08 0.14 0.16 0.08 0.22 0.21 0.17 0.05 0.25 0.4 0.32 0.12 0.03 0.1 0.19 0.25 0.09 0.21 0.13 0.25 0.21 0.19 0.0 0.05 0.01 0.01 0.14 0.04 0.0 1.0 0.08
AT2G02740 (WHY3)
 0.34 0.26 0.44 0.4 0.26 0.03 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.31 0.12 0.29 0.08 0.09 0.07 0.31 0.2 0.89 0.9 0.23 0.22 0.15 0.03 1.0 0.08 0.19 0.26 0.82 0.14 0.13 0.35 0.12 0.11 0.28 0.09 0.03 0.04 0.03 0.08 0.47 0.18 0.0 0.18 0.24
0.37 0.54 0.06 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.19 0.55 0.13 0.13 0.12 0.59 0.38 1.0 0.9 0.44 0.48 0.47 0.12 0.83 0.04 0.46 0.54 0.88 0.32 0.22 0.72 0.3 0.22 0.35 0.12 0.02 0.01 0.05 0.02 0.14 0.11 0.0 0.18 0.07
0.62 0.53 0.95 0.78 0.67 0.33 0.75 0.08 0.06 0.02 0.04 0.0 0.0 0.48 0.58 0.59 0.58 0.72 0.24 0.56 0.47 0.77 0.83 0.48 0.06 0.48 0.11 1.0 0.51 0.05 0.47 0.58 0.6 0.45 0.49 0.45 0.32 0.51 0.25 0.15 0.15 0.27 0.42 0.79 0.51 0.44 0.75 0.64
0.09 0.37 0.14 0.3 0.14 0.09 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.62 0.64 0.52 0.57 0.15 0.46 0.85 0.86 0.65 0.48 0.14 0.59 0.3 0.33 0.35 0.07 0.43 0.52 0.53 0.22 0.41 0.43 0.44 0.32 0.25 0.02 0.02 0.1 0.13 0.22 0.25 0.59 1.0 0.15
AT2G22870 (EMB2001)
 0.28 0.41 0.49 0.41 0.26 0.02 0.34 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.43 0.26 0.46 0.2 0.21 0.18 0.53 0.45 1.0 1.0 0.34 0.17 0.29 0.08 0.75 0.25 0.13 0.42 0.65 0.24 0.2 0.51 0.29 0.27 0.37 0.15 0.05 0.0 0.07 0.11 0.57 0.22 0.0 0.23 0.27
0.21 0.33 0.45 0.38 0.27 0.05 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.3 0.26 0.22 0.26 0.1 0.45 0.18 0.58 0.7 0.26 0.17 0.21 0.09 1.0 0.11 0.11 0.36 0.5 0.36 0.24 0.48 0.19 0.28 0.39 0.25 0.04 0.02 0.11 0.17 0.81 0.59 0.03 0.2 0.66
0.14 0.61 0.56 0.46 0.49 0.23 0.48 0.06 0.05 0.02 0.04 0.46 0.07 0.6 0.33 0.94 0.57 0.35 0.19 0.65 0.78 1.0 0.75 0.68 0.01 0.85 0.19 0.68 0.27 0.0 0.37 0.39 0.38 0.3 0.36 0.59 0.23 0.58 0.3 0.22 0.0 0.13 0.21 0.4 0.15 0.0 0.57 0.17
0.32 0.46 0.24 0.32 0.2 0.03 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.47 0.42 0.23 0.36 0.16 0.45 0.48 1.0 0.94 0.43 0.04 0.37 0.08 0.9 0.04 0.04 0.52 0.79 0.42 0.25 0.6 0.22 0.07 0.36 0.13 0.0 0.06 0.06 0.08 0.27 0.16 0.0 0.63 0.21
0.33 0.49 0.63 0.78 0.47 0.2 0.65 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.45 0.59 0.5 0.51 0.64 0.2 0.65 0.58 0.64 0.83 0.4 0.21 0.35 0.26 0.9 0.65 0.17 0.7 0.63 0.46 0.32 0.83 0.31 0.34 0.53 0.3 0.03 0.04 0.33 0.38 1.0 0.65 0.26 0.7 0.86
AT2G44050 (COS1)
 0.26 0.42 0.64 0.63 0.6 0.36 0.63 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.34 0.26 0.47 0.31 0.4 0.11 0.51 0.38 0.76 0.77 0.42 0.12 0.4 0.05 1.0 0.15 0.09 0.51 0.81 0.54 0.44 0.66 0.45 0.26 0.39 0.23 0.1 0.0 0.2 0.35 0.73 0.63 0.29 0.17 0.71
0.46 0.3 0.52 0.63 0.33 0.05 0.56 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.36 0.21 0.33 0.07 0.1 0.07 0.41 0.19 0.73 0.67 0.22 0.02 0.19 0.01 1.0 0.07 0.01 0.28 0.41 0.29 0.3 0.4 0.14 0.07 0.31 0.09 0.12 0.0 0.03 0.06 0.36 0.12 0.0 0.0 0.18
0.11 0.67 0.03 0.03 0.08 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.42 0.45 0.25 0.22 0.05 0.68 0.21 0.65 0.94 0.44 0.05 0.6 0.18 0.46 0.21 0.04 0.33 0.23 0.33 0.31 0.82 1.0 0.93 0.7 0.42 0.06 0.01 0.19 0.14 0.36 0.17 0.0 0.84 0.2
0.16 0.55 0.53 0.32 0.34 0.14 0.47 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.49 0.44 0.97 0.26 0.18 0.12 0.5 0.37 1.0 0.66 0.56 0.19 0.69 0.16 0.75 0.16 0.23 0.29 0.86 0.69 0.6 0.32 0.34 0.5 0.51 0.47 0.16 0.0 0.1 0.08 0.25 0.1 0.0 0.54 0.1
AT3G07430 (emb1990)
 0.15 0.28 0.36 0.27 0.28 0.09 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.12 0.38 0.15 0.27 0.09 0.35 0.3 0.95 0.75 0.27 0.12 0.23 0.08 1.0 0.06 0.09 0.32 0.58 0.52 0.41 0.47 0.23 0.17 0.29 0.2 0.0 0.0 0.07 0.1 0.36 0.24 0.0 0.01 0.38
0.3 0.33 0.7 0.73 0.49 0.13 0.65 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.28 0.26 0.24 0.18 0.18 0.1 0.42 0.23 0.56 0.7 0.23 0.05 0.15 0.07 1.0 0.11 0.02 0.41 0.51 0.25 0.16 0.59 0.22 0.14 0.29 0.13 0.03 0.01 0.08 0.16 0.99 0.5 0.08 0.01 0.72
0.19 0.17 0.75 0.72 0.42 0.1 0.58 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.17 0.18 0.12 0.14 0.09 0.24 0.14 0.41 0.44 0.14 0.08 0.08 0.01 1.0 0.31 0.07 0.23 0.37 0.24 0.14 0.37 0.12 0.1 0.17 0.07 0.01 0.0 0.06 0.15 0.96 0.51 0.0 0.08 0.61
0.19 0.4 0.57 0.61 0.35 0.22 0.54 0.11 0.1 0.09 0.06 0.0 0.12 0.31 0.28 0.31 0.26 0.27 0.23 0.45 0.29 0.5 0.6 0.3 0.07 0.26 0.12 1.0 0.25 0.07 0.48 0.39 0.33 0.29 0.65 0.36 0.23 0.34 0.16 0.08 0.39 0.35 0.28 0.72 0.41 0.27 0.36 0.45
0.45 0.6 0.34 0.33 0.31 0.22 0.34 0.13 0.08 0.06 0.07 0.03 0.08 0.51 0.65 0.75 0.44 0.51 0.33 0.69 0.4 0.72 0.59 0.63 0.22 0.81 0.62 1.0 0.54 0.16 0.61 0.48 0.65 0.46 0.62 0.55 0.64 0.67 0.6 0.13 0.21 0.36 0.25 0.35 0.28 0.4 0.47 0.22
0.23 0.26 0.5 0.54 0.29 0.07 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.3 0.2 0.11 0.14 0.09 0.33 0.14 0.44 0.52 0.15 0.1 0.13 0.08 1.0 0.07 0.06 0.31 0.35 0.43 0.32 0.45 0.15 0.2 0.28 0.19 0.12 0.0 0.1 0.21 0.8 0.53 0.24 0.22 0.78
0.17 0.67 0.07 0.06 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.69 0.74 0.54 0.4 0.13 0.62 0.53 0.71 0.65 0.73 0.2 0.94 0.49 0.38 0.09 0.16 0.58 0.45 0.36 0.19 0.38 0.73 0.49 0.48 0.23 0.01 0.02 0.24 0.22 0.29 0.16 0.03 1.0 0.17
0.21 0.41 0.82 0.73 0.4 0.05 0.52 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.13 0.42 0.44 0.53 0.32 0.52 0.21 0.52 0.41 0.97 1.0 0.5 0.09 0.49 0.32 0.77 0.16 0.06 0.57 0.89 0.52 0.37 0.73 0.43 0.31 0.44 0.3 0.01 0.02 0.24 0.23 0.58 0.3 0.0 0.87 0.4
0.42 0.41 0.45 0.48 0.32 0.1 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.17 0.47 0.28 0.41 0.14 0.52 0.43 1.0 0.97 0.36 0.08 0.23 0.27 0.97 0.05 0.04 0.58 0.67 0.32 0.19 0.68 0.29 0.15 0.38 0.13 0.03 0.01 0.07 0.15 0.57 0.33 0.03 0.16 0.39
0.62 0.47 0.17 0.13 0.15 0.04 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.24 0.51 0.08 0.06 0.05 0.41 0.19 1.0 0.63 0.24 0.05 0.28 0.01 0.43 0.06 0.04 0.2 0.37 0.34 0.16 0.23 0.21 0.11 0.3 0.11 0.14 0.0 0.2 0.07 0.37 0.11 0.0 0.73 0.15
0.12 0.47 0.19 0.21 0.18 0.1 0.19 0.14 0.07 0.05 0.05 0.01 0.05 0.4 0.49 0.7 0.27 0.17 0.17 0.47 0.34 0.83 0.52 0.49 0.05 0.78 0.37 0.56 0.25 0.04 0.3 0.73 0.65 0.43 0.3 0.26 0.24 0.39 0.29 0.49 0.17 0.14 0.1 0.16 0.07 0.01 1.0 0.08
AT4G25910 (NFU3)
 0.1 0.96 0.09 0.06 0.12 0.09 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.65 0.57 0.81 0.26 0.22 0.08 0.61 0.34 0.88 0.4 0.68 0.04 1.0 0.59 0.31 0.17 0.0 0.36 0.18 0.78 0.21 0.19 0.38 0.86 0.62 1.0 0.76 0.04 0.13 0.05 0.06 0.03 0.0 0.63 0.02
AT4G33680 (AGD2)
 0.2 0.29 0.63 0.85 0.5 0.23 0.71 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.31 0.17 0.31 0.24 0.31 0.18 0.33 0.29 0.53 0.63 0.28 0.04 0.25 0.09 1.0 0.14 0.03 0.37 0.46 0.3 0.22 0.46 0.19 0.11 0.3 0.11 0.06 0.22 0.15 0.19 0.6 0.43 0.09 0.08 0.55
0.3 0.42 0.41 0.39 0.29 0.04 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.11 0.35 0.04 0.07 0.1 0.42 0.29 0.96 0.79 0.27 0.09 0.2 0.06 1.0 0.04 0.12 0.39 0.59 0.36 0.23 0.46 0.1 0.1 0.29 0.11 0.01 0.0 0.01 0.02 0.19 0.1 0.01 0.15 0.12
0.3 0.49 0.3 0.46 0.24 0.03 0.33 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.43 0.21 0.33 0.14 0.28 0.13 0.49 0.24 0.96 0.95 0.31 0.19 0.27 0.07 1.0 0.19 0.16 0.5 0.85 0.41 0.47 0.71 0.2 0.23 0.41 0.23 0.06 0.01 0.04 0.1 0.26 0.17 0.0 0.01 0.24
0.25 0.36 0.57 0.43 0.45 0.14 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.35 0.21 0.15 0.3 0.14 0.49 0.4 0.51 0.79 0.32 0.06 0.26 0.08 1.0 0.08 0.04 0.48 0.48 0.3 0.22 0.66 0.27 0.26 0.33 0.1 0.04 0.0 0.11 0.18 0.78 0.49 0.31 0.1 0.55
0.45 0.49 0.35 0.31 0.28 0.1 0.29 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.48 0.51 0.63 0.25 0.3 0.14 0.44 0.42 1.0 0.8 0.41 0.07 0.46 0.1 1.0 0.22 0.05 0.31 0.55 0.54 0.34 0.42 0.21 0.19 0.46 0.21 0.39 0.01 0.07 0.12 0.34 0.12 0.2 0.58 0.2
0.54 0.41 0.83 0.68 0.5 0.16 0.55 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.42 0.28 0.4 0.41 0.41 0.14 0.44 0.42 0.62 0.71 0.35 0.05 0.31 0.08 0.81 0.31 0.05 0.54 0.59 0.38 0.29 0.66 0.29 0.28 0.38 0.12 0.08 0.0 0.27 0.37 1.0 0.85 0.02 0.25 0.85
0.2 0.35 1.0 0.87 0.48 0.07 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.25 0.13 0.34 0.14 0.21 0.1 0.41 0.17 0.53 0.75 0.25 0.05 0.26 0.09 0.94 0.18 0.04 0.4 0.62 0.22 0.2 0.7 0.28 0.11 0.35 0.17 0.01 0.01 0.31 0.34 0.92 0.71 0.14 0.68 0.81
AT5G20040 (IPT9)
 0.3 0.4 0.72 0.72 0.53 0.12 0.55 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.01 0.39 0.32 0.4 0.2 0.18 0.09 0.41 0.32 0.76 0.66 0.29 0.11 0.26 0.1 1.0 0.11 0.09 0.34 0.7 0.4 0.43 0.38 0.23 0.29 0.38 0.33 0.18 0.03 0.12 0.21 0.76 0.29 0.01 0.07 0.45
0.11 0.38 0.26 0.22 0.23 0.18 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.24 0.85 0.42 0.35 0.1 0.42 0.41 1.0 0.73 0.4 0.06 0.55 0.11 0.33 0.04 0.05 0.2 0.48 0.3 0.3 0.33 0.44 0.21 0.37 0.17 0.05 0.0 0.08 0.06 0.13 0.06 0.0 0.4 0.08
AT5G63890 (HDH)
 0.28 0.47 0.59 0.51 0.43 0.18 0.5 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.43 0.53 0.61 0.67 0.65 0.18 0.55 0.5 0.77 0.73 0.5 0.12 0.52 0.23 1.0 0.13 0.09 0.46 0.78 0.47 0.36 0.52 0.4 0.3 0.5 0.27 0.05 0.02 0.46 0.53 0.8 0.61 0.07 0.23 0.7
0.28 0.39 0.89 0.47 0.69 0.39 0.47 0.05 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.33 0.42 0.71 0.3 0.32 0.18 0.44 0.4 0.88 0.71 0.59 0.04 0.8 0.06 1.0 0.17 0.03 0.28 0.47 0.59 0.33 0.43 0.29 0.1 0.59 0.19 0.21 0.0 0.26 0.27 0.64 0.38 0.15 0.9 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)