Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-6.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.54 -3.08 - - 4.39 - 3.39 - 1.21 3.78 - - - - - -5.55 - -1.74 - - - - - - - - - - -
1.75 3.96 - -2.71 -4.2 - -2.12 - - - - - - -1.45 1.03 -4.98 - - -5.35 2.6 - - - 2.01 - 1.34 - -0.3 2.36 - 2.92 - - - - - - -7.12 - - - - - - - - - -
- -2.76 4.56 2.57 3.45 - -0.55 - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - -6.15 - - - - -1.98 - - - - - - - - -2.17 - - - - - - - - - -
- -5.4 - - - - - - - - - - - 0.26 - - - - - - - - - 3.85 - 1.95 - -1.39 4.55 - 2.26 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.01 -4.21 - 2.62 - - 3.99 - 0.86 - - - - -2.57 - - - - - - - - - 2.48 - 1.46 - - 3.7 -2.59 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.95 - - - 1.63 - - - - 3.47 - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -2.79 -2.63 -0.22 - - -3.11 - -4.11 - - - - - - - - -1.13 - - - - 1.8 - 0.33 - -2.48 5.35 - -2.41 - - - - - - - - - - - - - -2.5 - - -
-4.04 -6.6 - - - - - -4.76 - - - - -0.74 - - -3.65 - - - -7.04 - - - 4.22 -3.48 3.42 - 1.92 3.78 -3.75 -4.32 - -5.63 -4.24 -6.4 - -4.39 -5.67 - - - - - - - - - -
-0.4 1.75 - - - - - - - -1.98 - -2.67 0.19 - - - - - - 0.93 - - - 3.73 - 3.23 - - 4.0 - 0.15 - - - - - - - - - - - - - -0.55 - - -
- 0.59 - - - - - - - - - - - 0.22 - - 2.2 - 1.33 0.1 1.92 - 1.25 2.53 - 1.06 - - 0.0 - 2.4 0.21 -0.99 -0.0 -1.33 3.08 - 2.03 - - - - - - 0.37 - - -
- -3.13 - -0.77 - - - - - - - - - -3.5 - - - - - -5.34 - - - 1.16 - -0.24 - -0.05 5.33 - -1.36 -2.34 - -3.74 - - - - - - - -0.75 -1.66 - - - 0.57 -
- -3.23 - - - - - - - - - -1.98 - - - - - - - -3.64 - - - 3.29 - 2.36 - 0.58 4.96 - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.36 -4.04 1.79 1.29 0.06 -1.03 0.89 - - - - - - -2.26 - - - - -1.17 -2.9 -1.9 - - 2.94 -1.81 2.12 - 0.89 4.02 -3.32 -3.93 - -1.23 - - - 0.06 -3.71 -4.38 2.23 - - - - - - - -
- -7.37 0.71 0.72 -1.17 -2.41 -0.88 - - - - - - -4.84 - - - - -0.68 -6.17 - - - 2.79 - 2.31 - 0.87 4.82 - -3.23 -2.32 -6.52 -5.27 -7.81 - - -7.31 -7.89 - - -0.79 - - - - - -
- - - -0.14 - - 1.37 - - - - -2.29 - - - - - - -1.07 - - - - 2.85 - 1.69 - - 5.01 - -1.56 - - - - - -0.3 - - - - - - - - - - -
- -5.53 -3.28 - -2.83 -3.61 - 3.01 2.71 2.4 2.65 - 0.7 -4.17 -0.58 - - - 2.72 -5.15 - - - 1.91 - 0.87 - -1.53 2.7 - - -5.23 - - -7.12 - - - - - - - - - - - - -
- -3.2 - - - - -1.02 -1.72 -3.43 - -2.13 - - -4.09 - - - - - -4.59 - - - 2.88 - 1.81 - -0.13 5.11 - -1.99 - - - -2.96 - - -7.95 -6.84 - - - - - - - - -
- -5.92 - - - - - - - - - - - 0.07 -1.01 -1.23 -0.36 - -4.44 -5.87 -3.02 - - 3.06 -3.93 2.3 - 0.04 4.58 - -3.52 -0.85 2.07 -3.08 -4.85 - -0.97 -1.82 -0.08 - - - - - - - - -
- - - - - - 3.29 - - 0.91 - - 1.55 - - - - - - - - - - 0.06 - 1.17 - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.41 -4.22 - -0.72 0.41 - - - - - - - - -2.18 - - - - -0.89 -3.39 - - - 3.44 - 3.27 - 1.73 4.3 - 0.3 - - - - - - - -2.43 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 0.59 - - - - - - - - - - 2.97 - 1.26 - - 5.17 - -2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.51 - 1.13 - -0.24 - -1.11 - -2.44 - - 1.29 -2.58 - - -1.06 - - - - - - 3.67 - 3.42 - 0.84 3.78 - -1.73 - - - -3.7 - 0.75 - -4.9 - - - - - - - - -
- -1.21 - -1.11 - 0.52 -0.06 - - - - -0.63 -1.95 -0.52 - - - - - -3.69 - - - 3.62 - 2.34 - 0.6 4.43 - -0.22 -3.29 - -2.01 -4.77 - -1.27 -1.43 -2.89 - - - - - - - - -1.15
- -5.23 0.57 - -3.27 -1.56 -0.62 -0.23 0.22 -1.62 - - - -4.14 - -3.69 - - -1.56 -3.86 - - - 3.38 - 2.97 - 2.03 4.32 -4.44 -3.53 -4.67 - - -6.08 - - -6.87 - - - - - - - - - -
-0.03 2.0 -6.22 - - - - -4.55 - - - -4.62 -6.87 -4.96 -0.93 -7.19 - - -5.17 1.14 - -5.6 - 2.26 - 1.44 - 0.59 4.85 - 1.06 -8.36 -7.03 -5.91 -8.3 -6.17 - -7.24 -8.66 - - - - -4.5 -6.08 - -6.59 -
- -3.87 3.42 -0.01 2.6 - 1.23 - - -1.04 -1.04 -0.71 -3.29 -2.97 - -3.5 - - 2.34 -3.81 -2.71 - - 2.48 - 1.5 - 0.7 3.25 - -0.48 - - - - - - -3.16 -6.23 - - - - - -2.49 - - -3.59
AT2G47430 (CKI1)
- 1.92 0.25 1.47 1.96 - -2.1 - - - - - - 1.07 -1.07 - - -2.46 -0.05 1.08 - - -2.16 1.09 - 0.35 - 1.68 3.18 1.07 2.28 - -4.0 -2.65 - -2.13 -2.31 -5.41 -1.01 2.45 - - -0.47 - - - - -3.23
- - - - - -3.58 - - - - - -3.74 - -5.14 - - - - - - - - - 1.44 - -0.85 - - 5.45 - -0.44 - - - - - - -4.36 - - - - - - - - - -
AT3G04943 (LCR41)
- - - -1.66 - - - - - - - -4.22 - -3.77 - -2.32 - - - - - - - 4.5 - 3.59 - 0.51 3.42 -5.1 -1.34 -5.73 - -5.3 - -3.29 -3.19 - - - - - - - - - - -
- -8.08 - - - - - -4.23 0.48 -6.16 -0.1 - - -5.23 - -6.72 - - -6.29 - -5.83 - - 3.08 - 1.54 - -1.42 5.08 - -7.12 - - - -8.1 - - -10.03 - - - - - - - - - -
- -5.51 - - - -5.54 - - - - -5.83 - - - - -5.28 - - - - - - - 4.58 -5.53 3.47 - 1.36 3.33 -5.03 -2.9 -5.09 - - -5.95 - - - - - - - - - -5.17 - - -
- -4.45 2.99 3.19 2.44 - 1.98 - - -3.72 - - - -3.89 - - - - 1.36 -3.98 - - - 1.76 - 0.25 - -1.08 3.77 - -4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.78 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.47 - -0.13 - - 4.84 - 1.88 - - - - - - - - - - - - - - 3.35 - -
- - - - - - - - - - - -0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -4.49 1.13 0.54 0.93 - 0.43 - - -2.12 - - - - - - - - 0.11 -4.5 - - - 4.13 - 2.93 - -0.66 3.78 - -3.58 - - - -6.83 - - - - - - - - - - - - -
AT3G26270 (CYP71B25)
- -3.84 -1.02 - -3.29 - - - - - - - - -2.42 -1.75 -3.85 - -0.38 -4.77 -6.3 - - -2.84 2.77 - 1.36 -2.95 -1.12 4.99 - -2.27 - - - -3.78 - 1.81 -5.56 -3.01 - - - - - -2.74 - - -
AT3G27840 (RPL12-B)
- -1.36 - - - - - - - - - -0.5 - - - - - - -2.18 -3.76 - - - 0.24 - -0.03 - - 5.47 -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.5 1.65 -2.45 -0.37 -1.71 - -1.25 - - - - - - -2.29 - -4.85 - - -1.73 0.5 -4.19 - - 4.06 -4.1 2.34 - -0.91 3.8 - 1.76 -5.03 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.59 - - 4.9 - 3.32 - 0.98 2.48 - - - - -1.64 - - - -6.23 - - - - - - - - - -
- - - -1.47 - - - - - - - - - -2.91 - -2.48 - - -0.51 - - - - 1.28 - 1.37 - -0.34 5.2 - -1.84 -3.1 - -2.45 -4.63 - - -3.68 - - - 1.54 - - -1.37 - - -
3.65 1.41 -1.66 -0.73 -2.64 -6.17 -0.82 -6.3 - - -5.83 -5.38 -6.64 -0.24 -0.47 -5.8 -5.86 - -1.62 0.27 -4.4 -6.22 - 2.3 -6.05 0.49 -5.66 -1.76 4.09 - 2.03 -7.79 - - -8.24 -4.78 - -8.63 - - - - - - -5.7 - - -
- - - - - - -1.34 - - - - - - - - - - - - - -2.56 - - 1.51 - 1.26 - - 5.39 - - - - -3.42 - - - -4.55 - - - - - - - - - -
1.2 -1.93 - 1.47 0.31 - 0.77 - -0.42 -1.72 - - - - - - 1.38 - - - - - - 3.28 - 2.35 - 0.03 3.7 - -1.53 - - -2.14 -4.02 - - -1.99 - 1.95 - - - - - 1.34 - -
- -0.49 - - - - - - - - - - - -1.16 1.61 - - - 0.81 1.09 - - 0.61 3.27 - 2.4 - -0.34 4.4 - -2.91 - -0.79 -2.7 - - - -2.5 -1.1 - - - - - - - - -
- -4.19 -0.56 -0.39 - - - - - - - -1.04 -0.21 - - - - - - - - - - 2.07 - 1.63 - 1.34 5.01 - - - - - - 0.64 0.62 -4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.41 - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - 2.53 - 1.87 - 0.9 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -5.39 -2.21 2.68 0.22 -0.81 2.92 - 0.8 - 0.24 - - -1.26 - - - - -3.63 - - - - 2.89 - 1.7 - 0.2 3.95 -3.81 -0.18 -1.46 - -4.24 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.68 - -0.01 - - 0.14 - -0.3 - - - - - - - -1.67 - - - - 1.56 - 0.58 - - 5.07 - -2.19 - - - - - - -4.16 - - - - - - - - - -
- -6.11 - - - - - - - - - - -4.7 -4.79 - -3.87 - - -5.47 -5.74 - - - 3.95 -4.11 3.18 - 0.08 4.44 - -3.1 -5.49 -4.11 -5.84 -6.68 -3.85 -3.02 -6.04 - - - - - - -3.75 - - -
- -2.42 1.51 1.19 1.54 -1.33 1.82 - -3.09 -5.08 - - - - -2.67 -3.14 - - -3.04 -1.8 -3.87 -2.25 0.0 1.84 - 1.41 - 0.96 4.65 - -3.84 -4.74 - -5.5 -2.82 -2.74 - -3.85 -6.26 - - - - - - - - -
- -5.66 2.01 1.06 2.55 1.19 1.63 - - -3.26 - - - - - -3.72 - - -2.36 -6.57 - - - 0.51 - -0.14 - -2.61 4.79 - -6.25 - - - - - - -4.56 -7.59 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 0.88 - - - - -0.91 -1.31 - - - 4.21 - 2.33 - 3.64 2.64 - 1.1 - -0.55 - - - - -2.51 - - - - - - - - - -
-3.22 -6.94 - -4.23 - - - - - - - - -5.17 -5.77 - -3.75 - - -5.09 - - - -4.25 4.04 - 3.01 - 0.26 4.45 - -5.18 -4.86 - - -6.95 - -4.49 - - - - - - - - - - -
- -9.11 - -7.08 -6.38 - -5.83 -6.01 - -4.36 -6.62 3.93 1.31 -4.26 - -8.3 - - -4.24 -9.43 - - - 0.93 - -0.71 -7.18 -2.61 2.34 -8.8 -1.82 -3.29 -4.97 -4.6 -10.79 - -7.22 -9.77 - - - 3.09 3.25 -5.38 1.86 - - -2.81
2.95 2.88 - -1.95 -3.61 - -2.15 - - - - - - -2.04 -1.45 -4.54 -3.72 - -3.74 2.04 0.28 -1.69 -0.87 2.13 - 1.24 - 0.84 3.22 -4.32 2.37 -4.71 - -4.42 -5.81 - -3.41 -5.13 -3.75 0.92 - - - - - - - -4.62
- - - - - - - 2.71 - - - - - -2.26 - -1.58 - - -1.25 - - - - 3.54 - 3.01 - 1.56 4.07 - - - - - - -0.55 - -1.23 - - - - - - - - - -
- -6.54 - - - - -1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.15 - 0.57 - 0.31 5.34 - -4.68 - - - - - - - - - - - - - - - -4.26 -
AT5G24440 (CID13)
-4.5 -4.76 - - - - - - - - - - - -3.47 - -3.75 - - -4.36 - - - - 3.45 - 2.43 - -0.3 4.93 - - -4.74 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.48 - - - 0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - 4.11 - 1.4 1.91 - -2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - 3.09 - - 4.2 - -3.29 - - - - - - - - - - - - - -0.83 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 - 2.3 - 1.48 4.98 - - - - - -6.78 - -2.9 - - - - - - - - - - -
- -4.72 - - - - - - - - - - - -1.7 - - - - - -5.72 - - - 3.62 - 1.61 - 2.37 4.65 - -0.14 - - - -4.18 -3.03 -1.93 -0.76 - - - - - - - - - -
AT5G38317 (LCR58)
- -0.8 - - - - - - - - - - 4.38 - - - - - - -0.99 3.72 - - 1.56 - - - - 3.2 - - - - - - - - -0.24 - - - - - - - - - -
- -0.75 -0.6 - -1.96 1.88 0.8 - - -2.87 - - - - - - -1.55 - 0.16 -3.09 - -1.31 -1.28 4.17 - 2.71 - 0.35 3.39 - -3.73 - -3.76 -3.12 - 0.24 - -2.57 - - - - - -0.68 - - - -
- -3.9 0.84 4.16 - - 3.73 - - -4.42 -1.83 -1.32 - -2.36 - - - -3.11 1.18 -5.09 - - - 1.86 - 1.33 - -0.35 2.14 - -1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.08 1.91 - - - - - - - - - - - -2.49 - - - - - 0.65 - - - 3.75 - 2.7 - 0.31 4.21 - 0.89 - - - - - - -6.94 - - - - - - - - - -
- - 1.01 - 3.33 3.08 - 2.73 - 0.41 - -3.65 0.31 -4.74 -1.64 - - - -2.28 - - - - 2.39 -2.97 1.42 - -1.0 3.18 - -4.11 - - - - - - -7.04 - - - - - - - - - -
- 0.01 -0.28 -1.87 -0.98 - -1.97 - - - - - - -0.24 -3.12 - - - 0.24 -1.92 - - - 1.9 - 0.35 - 0.1 4.97 - 1.61 -4.32 -4.14 -0.81 - - - -1.89 - - - -1.19 -0.94 - -2.51 - - -4.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.