Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G12260 (VND4)
0.06 1.9 0.09 0.0 0.0 0.34 0.0 6.45 0.29 12.35 0.58 0.03 3.2 2.16 8.85 2.46 3.7 1.69 0.8 1.2 8.37 1.32 1.32 1.93 0.0 1.95 0.04 0.09 0.04 0.02 0.65 2.24 2.5 3.24 1.1 5.2 0.6 3.26 0.37 0.0 0.0 8.41 6.16 0.84 4.11 160.47 0.0 1.02
AT1G20850 (XCP2)
1.74 17.09 0.17 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 22.32 100.62 50.13 89.76 59.34 0.91 13.68 75.3 44.6 36.58 51.44 0.08 67.68 0.45 0.0 0.39 0.09 5.83 35.03 45.21 70.39 23.26 164.53 15.15 91.3 8.87 5.42 0.0 152.83 61.58 0.44 90.39 1981.9 0.0 3.21
0.05 0.19 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.26 0.68 0.02 1.13 3.97 1.11 0.12 1.43 0.0 0.02 0.37 0.0 0.26 0.04 0.19 10.96 0.0 0.27 1.98 0.66 3.6 0.01 0.1 0.48 0.3 0.11 0.0 0.0 20.96 11.38 4.86 2.49 239.99 0.0 2.55
0.0 0.01 0.16 0.18 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.69 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.03 0.0 0.04
0.0 0.06 0.15 0.0 0.36 0.03 0.61 0.17 0.28 0.06 0.19 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.04 0.04 0.21 0.06 0.06 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 5.81 0.0 0.0
0.31 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.31 0.97 0.19 0.07 0.17 0.11 0.11 2.14 11.75 10.81 15.5 2.69 0.0 1.56 0.0 4.39 4.07 0.0 0.69 4.62 3.36 15.01 0.88 17.76 1.57 6.49 0.73 0.05 0.0 1.2 14.19 8.8 18.43 675.92 0.0 7.34
0.0 0.47 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.64 0.54 1.84 3.31 6.31 0.17 1.34 0.03 1.4 2.15 2.94 0.06 3.49 0.06 0.0 0.08 0.0 0.06 1.97 1.36 1.86 0.43 4.1 0.46 1.47 0.24 0.0 0.0 10.16 4.59 0.68 9.28 527.38 0.0 0.7
AT1G62700 (VND5)
0.08 1.64 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 3.06 2.57 0.57 0.5 0.44 0.09 1.6 1.47 1.93 1.98 0.72 0.0 0.71 0.02 1.0 0.06 0.08 0.27 0.52 0.85 1.08 0.9 6.54 0.98 3.73 0.33 0.02 0.0 2.4 1.98 0.68 2.34 60.71 0.0 0.61
0.22 0.56 3.41 1.91 2.38 1.5 1.39 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.71 0.52 0.42 0.33 0.41 0.08 0.38 1.51 0.72 1.32 0.62 0.02 0.46 0.0 0.09 0.15 0.0 0.16 0.5 0.4 0.6 0.33 3.92 0.12 1.18 0.08 0.0 0.0 2.69 1.84 0.21 1.51 99.12 0.0 0.21
1.79 17.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 19.35 7.31 8.29 1.37 0.58 2.0 15.17 5.43 11.54 25.81 10.66 0.25 7.65 0.2 8.6 4.72 0.05 8.39 7.75 9.27 11.87 14.13 45.47 2.72 33.41 3.43 0.09 0.03 16.86 26.41 8.16 16.01 1014.83 0.02 6.82
AT1G71930 (VND7)
0.05 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.14 1.2 0.79 1.64 1.01 0.02 0.41 1.53 0.81 0.79 0.74 0.0 0.74 0.0 0.31 0.05 0.0 0.08 0.5 0.86 1.52 0.58 2.26 2.06 1.63 0.21 0.24 0.0 4.82 2.99 0.45 2.1 309.87 0.0 0.37
2.62 1.08 3.29 2.9 2.02 0.15 2.26 0.34 0.18 0.46 0.74 0.07 8.24 22.26 5.12 10.51 4.27 7.61 16.34 0.63 0.24 1.1 0.74 11.71 10.29 18.76 159.24 0.32 4.25 0.73 0.7 7.62 3.53 6.38 2.04 5.21 18.91 5.6 13.09 0.46 3.16 2.04 1.13 0.16 4.53 1171.39 115.11 0.07
0.0 0.03 0.17 0.47 0.22 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 4.2 0.37 3.48 33.94 0.0 1.34
2.63 11.19 1.73 0.89 1.36 0.64 1.05 0.0 0.0 0.02 0.06 0.05 0.0 8.85 5.16 6.0 3.38 4.18 1.03 8.26 14.1 9.89 12.37 12.41 0.73 12.75 0.6 4.36 20.18 0.65 5.06 5.3 7.91 9.1 7.89 36.78 4.24 20.02 3.11 0.27 0.0 18.51 24.77 7.54 11.5 478.23 0.0 8.02
0.13 0.09 0.18 0.14 0.32 0.24 0.32 0.13 0.0 0.0 0.0 0.27 0.03 0.03 0.2 0.1 0.08 0.07 0.15 0.11 0.04 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.26 0.35 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.01 0.0 0.09 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.0 10.5 0.41 0.0
0.59 3.48 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.05 0.35 0.0 2.64 2.01 3.08 0.49 0.26 0.65 1.79 0.24 1.76 1.45 0.98 0.02 1.28 0.1 2.72 0.49 0.01 0.87 3.74 8.14 2.42 1.62 2.54 0.65 2.18 0.91 0.78 0.0 0.72 10.46 4.0 2.92 224.33 0.0 4.58
0.01 0.59 0.24 0.01 0.27 0.0 0.1 0.05 0.05 0.65 0.04 27.11 5.79 0.57 0.42 0.7 0.6 0.64 0.14 0.52 1.74 1.14 1.2 1.01 0.0 0.69 0.0 0.07 0.01 0.0 0.07 1.22 0.65 1.58 1.07 8.23 0.38 2.23 0.21 0.0 0.0 10.74 5.22 0.1 3.19 135.73 0.0 0.29
AT3G08500 (MYB83)
0.04 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 1.78 0.55 0.63 0.71 0.01 0.4 1.82 1.46 1.3 1.86 0.0 1.96 0.0 0.0 0.01 0.0 0.23 0.68 0.66 1.06 0.53 5.35 0.12 1.17 0.11 0.0 0.0 4.15 2.0 0.0 1.03 57.5 0.0 0.08
0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.16 0.0 0.08 0.05 1.0 0.01 0.09 0.41 0.36 3.09 0.0 0.76 0.55 0.87 0.03 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 8.5 1.1 4.79 7.41 250.78 0.0 0.89
0.06 1.61 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.96 1.08 1.06 1.56 1.79 0.14 0.73 1.11 1.19 1.39 0.68 0.05 0.73 0.16 0.0 0.14 0.0 1.4 0.7 0.4 0.91 1.19 2.71 0.14 1.03 0.1 0.0 0.0 1.19 1.25 0.44 1.48 40.84 0.0 0.41
1.0 12.37 0.58 0.08 0.51 0.27 0.08 0.14 0.03 0.22 0.1 0.27 0.37 2.93 2.34 2.14 2.26 2.94 0.57 7.22 9.27 2.38 2.13 3.97 1.72 4.22 6.51 0.45 0.67 0.81 13.45 2.51 6.6 12.97 2.11 4.0 5.63 5.03 3.37 0.04 0.0 37.65 10.45 1.18 15.22 265.88 0.0 1.75
AT3G22830 (HSFA6B)
0.55 0.24 0.17 0.02 0.12 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.79 0.12 0.21 0.99 1.01 0.08 0.9 0.12 0.23 0.3 2.68 0.48 3.52 2.02 5.7 2.35 0.03 0.41 3.06 0.26 1.63 1.46 0.22 4.78 4.37 0.03 1.4 0.15 63.98 9.89 1.41 0.94 1519.69 59.54 0.84
0.11 0.03 0.15 0.06 0.21 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.05 0.26 0.62 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.06 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 12.37 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.07 0.0 0.77 2.75 0.01 0.02 0.0 1.44 0.77 0.42 0.0 0.13 0.0 2.27 0.29 0.0 0.0 1.32 3.47 7.83 0.19 2.63 0.0 1.94 0.39 0.0 0.0 0.19 8.71 11.59 6.69 514.97 0.0 6.56
0.36 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.59 0.88 0.84 1.21 1.12 0.08 0.65 2.47 1.79 1.47 0.91 0.01 0.52 0.0 0.01 0.02 0.0 0.15 2.48 1.46 3.33 0.74 2.75 0.04 1.56 0.22 0.0 0.0 7.25 11.3 7.9 11.03 1051.12 0.0 9.97
0.0 0.01 0.0 0.22 0.01 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.15 0.0 0.01 0.0 0.01 0.1 0.02 0.01 0.0 2.22 0.4 0.94 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.5 6.39 17.33 10.21 108.39 0.0 9.88
0.0 0.35 0.0 0.21 0.0 0.0 0.18 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.27 0.08 0.02 0.02 0.08 0.68 0.0 0.52 1.06 0.05 0.02 0.05 0.02 1.0 0.32 0.0 0.03 0.5 0.51 0.57 1.03 1.08 0.49 1.19 0.08 0.0 0.0 0.67 2.64 1.1 1.88 41.32 0.0 0.97
0.35 0.0 0.04 0.04 0.18 0.29 0.09 1.44 0.1 0.05 0.0 0.0 0.14 0.05 0.26 0.01 0.0 0.0 0.4 0.04 0.05 0.02 0.06 0.03 0.0 0.01 0.06 0.14 0.06 0.04 0.01 1.48 1.8 10.25 0.0 0.12 0.15 0.03 0.1 0.0 0.0 66.05 75.29 3.81 31.19 456.49 0.02 9.21
AT4G14940 (AO1)
0.15 1.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.94 2.14 0.46 0.3 0.25 1.35 0.83 1.48 2.18 1.13 1.15 0.02 0.69 0.16 0.0 0.29 0.01 0.15 2.79 2.56 4.6 0.48 7.73 0.14 2.68 0.29 0.23 0.15 12.69 10.58 1.63 12.54 318.1 0.0 6.18
0.2 0.0 0.43 3.09 0.38 0.0 2.28 0.02 0.03 0.03 0.05 0.48 0.08 0.02 0.0 0.0 0.07 0.02 0.84 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 2.53 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.2 0.13 0.03 0.02 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.07 46.81 0.0 0.02
AT4G26890 (MAPKKK16)
4.13 1.07 0.25 0.39 0.26 1.71 0.67 0.05 0.03 0.01 0.0 0.1 1.46 0.45 0.78 0.49 3.11 2.62 0.1 0.98 0.02 0.3 0.31 1.0 0.03 0.86 0.12 0.46 3.05 0.02 1.37 0.87 0.54 2.77 0.07 0.64 0.31 0.29 0.69 0.0 0.64 5.7 4.23 0.71 6.91 214.38 0.0 1.42
AT4G35350 (XCP1)
0.31 8.9 0.18 0.0 0.12 0.15 0.15 0.05 0.11 0.12 0.0 0.07 0.0 9.87 45.43 20.73 34.11 26.36 0.12 4.72 42.5 19.04 19.06 16.1 0.02 16.36 0.36 0.1 0.38 0.24 1.98 21.92 20.73 52.71 8.05 63.56 4.15 33.72 3.33 0.05 0.0 140.5 70.27 0.81 100.49 2029.68 0.0 3.14
AT4G36160 (VND2)
1.03 2.41 0.0 0.0 0.03 0.18 0.0 0.39 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 2.17 4.15 2.18 0.81 0.39 0.28 2.36 8.96 2.54 3.11 1.32 0.0 1.12 0.04 0.67 0.06 0.0 0.78 0.96 1.02 1.13 0.82 3.94 0.68 2.58 0.31 2.36 0.0 3.82 4.44 0.71 1.27 415.98 0.0 1.01
0.25 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.43 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.15 0.06 0.35 0.28 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.08 0.0 0.14 0.07 0.21 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.69 0.07 0.22 0.0 205.98 0.0 0.16
0.12 0.59 0.29 0.24 0.4 0.04 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 1.4 0.26 0.56 0.55 0.06 0.45 0.15 0.75 0.86 0.53 0.0 0.31 0.0 0.31 0.88 0.0 0.46 0.78 0.38 0.49 0.45 4.44 0.09 0.79 0.07 0.0 0.0 3.24 7.25 1.52 2.28 238.01 0.0 1.23
0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.41 0.59 0.49 0.46 0.58 0.06 0.45 1.77 1.13 0.85 9.29 0.12 8.91 0.43 0.61 0.35 0.51 0.27 1.67 2.48 4.76 0.26 23.2 26.1 9.84 0.99 0.0 0.0 17.92 17.76 6.37 10.73 505.93 0.0 5.21
AT5G23860 (TUB8)
72.41 57.95 18.05 35.37 16.62 8.95 29.43 0.84 1.93 0.36 1.53 1.2 0.29 35.32 71.95 30.97 171.02 307.56 13.28 66.31 15.3 66.83 98.2 133.65 0.8 155.28 2.4 33.55 20.4 0.21 42.28 34.06 47.01 101.0 44.84 248.95 6.69 100.42 16.59 2.99 0.09 43.03 152.94 56.76 145.64 4190.38 0.15 87.29
0.32 4.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.7 0.81 8.07 9.06 11.12 0.24 3.46 17.7 8.88 5.57 8.77 0.0 7.15 0.43 0.0 1.33 0.0 0.84 6.5 6.25 9.25 4.13 84.89 3.94 23.33 1.77 0.25 0.0 56.93 22.84 0.09 16.02 523.12 0.0 2.43
0.0 0.03 0.0 0.27 0.06 0.05 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.48 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.18 0.09 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 0.0 0.13 0.07 0.1 0.0 7.55 0.02 0.0
1.17 0.41 1.55 2.29 1.71 0.55 3.14 0.01 0.02 0.0 0.03 0.1 0.02 0.16 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.06 0.03 0.12 0.07 0.08 0.02 0.1 0.02 0.1 0.27 0.01 0.03 0.06 0.03 0.05 0.04 0.08 0.09 0.18 0.03 0.3 0.0 1.01 0.04 0.03 0.12 28.36 0.0 0.01
0.11 1.67 0.13 0.26 0.09 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 2.25 1.07 1.78 4.73 0.15 0.76 0.25 2.19 2.12 0.71 0.0 0.73 0.03 0.09 0.09 0.01 1.1 0.85 0.69 1.41 1.65 4.01 0.39 0.84 0.16 0.0 0.0 2.37 2.61 0.99 2.13 61.03 0.0 0.71
0.08 0.42 0.25 0.36 0.09 0.04 0.23 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.03 0.03 0.06 0.1 0.03 0.3 0.03 0.08 0.31 0.06 0.83 0.07 0.16 0.87 0.54 0.29 0.17 0.36 0.21 0.86 0.54 1.98 3.73 0.47 0.19 0.76 0.0 1.0 0.85 1.42 1.15 77.42 0.17 0.52

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)