Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.4 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.78 0.12 0.53 0.05 1.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.91 0.26 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0
0.21 0.09 0.39 0.08 0.63 0.56 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 0.28 0.01 0.09 0.27 0.02 0.07 0.02 0.07 0.06 0.17 0.4 0.9 0.27 0.03 0.04 0.44 0.1 0.07 0.09 0.05 1.0 0.04 0.19 0.85 0.09 0.07 0.35 0.27 0.0 0.0 0.01 0.02
0.09 0.05 0.24 0.3 1.0 0.61 0.2 0.02 0.09 0.01 0.11 0.0 0.01 0.21 0.0 0.12 0.0 0.1 0.21 0.29 0.13 0.13 0.22 0.12 0.39 0.06 0.11 0.58 0.54 0.12 0.16 0.46 0.14 0.13 0.3 0.58 0.58 0.16 0.12 0.2 0.0 0.46 0.13 0.0 0.66 0.6 0.03 0.1
0.09 0.05 0.24 0.3 1.0 0.61 0.2 0.02 0.09 0.01 0.11 0.0 0.01 0.21 0.0 0.12 0.0 0.1 0.21 0.29 0.13 0.13 0.22 0.12 0.39 0.06 0.11 0.58 0.54 0.12 0.16 0.46 0.14 0.13 0.3 0.58 0.58 0.16 0.12 0.2 0.0 0.46 0.13 0.0 0.66 0.6 0.03 0.1
0.09 0.05 0.24 0.3 1.0 0.61 0.2 0.02 0.09 0.01 0.11 0.0 0.01 0.21 0.0 0.12 0.0 0.1 0.21 0.29 0.13 0.13 0.22 0.12 0.39 0.06 0.11 0.58 0.54 0.12 0.16 0.46 0.14 0.13 0.3 0.58 0.58 0.16 0.12 0.2 0.0 0.46 0.13 0.0 0.66 0.6 0.03 0.1
0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.53 0.07 0.37 1.0 0.01 0.07 0.04 0.36 0.09 0.47 0.01 0.72 0.06 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.66 0.63 0.0 0.26 0.0 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.24 0.07 0.13 0.31 0.02 0.2 0.05 0.48 0.34 0.64 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.62 0.69 0.01 0.46 0.01 0.34 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.07 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.56 0.05 0.14 0.33 0.01 0.11 0.1 0.22 0.1 0.49 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.44 0.53 0.0 0.41 0.01 0.18 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.0 0.22 0.82 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.16 0.03 0.16 1.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.35 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0
0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.33 0.06 0.14 0.37 0.18 0.0 0.03 0.01 0.03 0.29 0.03 0.18 0.0 0.26 0.34 0.0 0.01 0.03 0.04 1.0 0.27 0.42 0.0 0.2 0.22 0.11 0.09 0.0 0.0 0.39 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.54 0.5 0.63 0.0 0.17 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.15 0.12 0.0 1.0 0.0 0.02 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.12 0.22 0.18 0.0 0.04 0.42 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.01 0.51 1.0 0.44 0.04 0.77 0.0 0.02 0.0 0.13 0.05 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.1 0.3 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.08 0.03 0.03 0.0 0.01 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.21 0.0 0.11 0.03 0.09 0.0 0.61 0.08 0.01
0.1 0.01 0.0 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.31 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.41 0.33 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.79 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04
AT2G36870 (XTH32)
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.56 1.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.15 0.19 0.51 0.54 0.97 0.05 0.36 0.05 0.05 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G37678 (FRY1)
0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.22 0.65 0.57 0.03 0.26 0.14 0.27 0.25 0.13 0.04 0.13 0.2 0.07 0.02 0.02 0.06 0.19 0.2 0.65 0.16 0.28 0.19 0.24 0.12 0.06 0.06 0.28 0.47 0.17 0.28 0.21 0.03 0.18
0.0 0.1 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.29 0.0 0.04 0.26 0.02 0.04 0.0 0.2 0.22 0.26 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.4 0.59 0.2 1.0 0.0 0.44 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.23 0.0 0.01 0.15 0.01 0.01 0.01 0.09 0.04 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.38 1.0 0.03 0.92 0.0 0.24 0.03 0.11 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.24 0.01 0.15 0.95 0.01 0.01 0.03 0.15 0.1 0.35 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.49 1.0 0.05 0.77 0.0 0.38 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.35 0.04 0.08 0.6 0.0 0.04 0.09 0.18 0.09 0.48 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.49 1.0 0.0 0.51 0.0 0.35 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT3G22840 (ELIP)
0.04 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.24 0.06 1.0 0.11 0.25 0.04 0.5 0.01 0.02 0.05 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.05 0.06 0.84 0.01 0.26 0.01 0.0 0.01 0.08 0.01 0.02 0.17 0.37 0.42 0.05 0.0 0.2 0.66 0.12
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.9 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.34 0.01 0.02 0.0 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.38 0.0 0.49 0.0 0.0 0.01
AT3G49700 (ETO3)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.0 0.05 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.29 0.03 0.91 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.04 0.0 0.45 0.02 0.0 0.2 0.03 0.18 0.0 0.02 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.27 0.8 0.0 0.13 0.16 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.63 0.0 0.04 0.06 0.31 1.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.02 0.9 0.0 0.0 0.06
AT4G14690 (ELIP2)
0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.04 0.02 1.0 0.16 0.0 0.02 0.34 0.02 0.27 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.07 0.01 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0 0.09 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.0 0.09 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.03 0.07 0.51 0.0 0.04 0.14 0.34 0.07 0.43 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.55 1.0 0.01 0.21 0.0 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.09 0.02 0.12 0.33 0.0 0.06 0.21 0.27 0.19 0.5 0.0 0.84 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.43 1.0 0.01 0.28 0.0 0.18 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.18 1.0 0.0 0.03 0.09 0.34 0.11 0.2 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.21 0.82 0.0 0.08 0.0 0.11 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.05 0.12 0.33 0.0 0.04 0.06 0.26 0.17 0.29 0.0 0.54 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.26 1.0 0.01 0.23 0.01 0.13 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.06 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.13 0.06 0.29 1.0 0.04 0.03 0.15 0.19 0.05 0.39 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.27 0.53 0.0 0.31 0.02 0.18 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.4 0.01 0.01 0.01 0.01 0.39 0.08 0.28 0.09 0.01 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0 0.37 0.27 1.0 0.44 0.0 0.53 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)