Heatmap: Cluster_42 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.75 -0.14 0.04 -0.14 -0.04 -0.42 0.2 0.04 -0.51 -0.32 -1.05 -1.19 -0.91 0.27 0.48 0.39 0.75 1.07 0.58 0.79 -3.82 1.01 -0.89 -0.7 -0.68 -0.07
-1.69 -1.34 -0.6 -0.61 -0.32 0.17 0.21 0.05 0.27 -0.11 -0.62 -0.84 -1.43 0.91 0.75 1.14 0.58 1.05 0.53 0.51 -1.78 0.18 -0.76 -0.8 -0.8 -0.32
-1.72 -1.15 -0.68 -0.34 -0.52 -0.86 0.19 -0.15 0.06 0.14 -0.25 -0.38 -1.44 0.81 0.49 1.06 0.68 1.06 0.28 0.29 -1.5 0.04 0.01 -0.31 -0.49 0.2
-1.77 -1.21 -0.67 -0.37 -0.27 -0.15 0.24 -0.07 0.1 -0.05 -0.76 -1.0 -1.93 0.86 0.69 0.8 0.53 1.28 0.67 0.61 -1.74 -0.5 -0.18 -0.4 -0.21 -0.07
-2.38 -1.19 -0.79 -0.6 -0.22 0.34 0.14 -0.18 0.17 -0.03 -0.8 -0.82 -2.07 1.11 0.74 1.35 0.81 0.81 0.63 0.46 -2.5 -0.81 -0.65 -0.49 -0.42 -0.15
-1.42 -1.12 -0.52 -0.57 -0.23 -0.21 0.08 -0.26 -0.13 -0.21 -0.74 -0.8 -1.26 1.0 0.78 0.96 0.58 0.85 0.6 0.44 -1.71 0.63 -0.73 -0.46 -0.42 0.08
-1.87 -1.43 -0.74 -0.5 -0.26 -0.26 0.28 -0.05 0.17 0.09 -0.39 -0.62 -1.85 0.89 0.57 1.08 0.66 0.98 0.4 0.61 -1.64 -0.87 -0.31 -0.21 -0.06 -0.06
-3.64 -1.61 -0.71 -0.63 0.11 0.54 0.24 -0.18 0.15 -0.07 -0.49 -0.72 -2.7 0.39 1.05 0.66 0.54 1.04 1.0 0.42 -3.33 0.17 -0.54 -0.12 -0.55 -0.22
-1.35 -0.69 -0.46 -0.25 0.02 -0.0 0.16 0.03 -0.03 0.02 -0.18 -0.3 -1.25 0.7 0.47 0.85 0.25 0.32 0.58 0.14 -1.28 0.19 -0.14 0.01 -0.35 0.1
-1.6 -1.46 -0.83 -0.34 -0.23 0.13 0.5 0.38 0.54 0.24 -0.2 -0.31 -1.38 0.54 0.28 0.82 0.03 0.95 0.28 0.16 -1.95 0.5 -0.03 -0.91 -0.11 -0.36
-1.66 -1.35 -0.92 -0.67 -0.4 -0.4 0.23 0.18 0.41 0.11 -0.45 -0.7 -1.71 1.35 0.51 1.25 0.68 0.92 0.39 0.64 -2.75 -0.12 -1.74 -0.85 -0.92 0.12
-2.78 -1.95 -0.92 -0.7 -0.22 0.27 0.47 -0.01 0.22 -0.03 -0.86 -1.26 -2.74 0.95 0.59 0.99 0.59 1.51 0.99 0.79 -1.83 -2.53 -1.15 -0.6 -0.46 -0.07
-2.48 -1.56 -0.81 -0.76 -0.56 -0.15 0.24 -0.04 0.06 -0.11 -0.97 -1.24 -2.56 0.85 0.76 0.91 0.68 1.38 0.88 0.88 -1.0 -1.11 -0.34 -0.38 -0.66 0.13
-2.6 -1.42 -0.72 -0.62 -0.52 -0.38 0.13 -0.1 0.1 -0.06 -0.64 -0.77 -2.52 1.01 0.61 1.14 0.57 1.0 0.55 0.5 -1.92 0.5 0.09 -0.62 -0.13 -0.22
-1.7 -1.29 -0.55 -0.05 0.39 0.42 0.5 0.35 0.22 0.16 -0.27 -0.34 -1.2 -0.08 0.35 0.44 0.04 0.93 0.68 0.2 -2.62 0.2 -0.26 -0.41 -0.11 -0.2
-1.22 -0.54 -0.21 -0.24 0.12 0.05 0.39 0.15 0.19 0.0 -0.41 -0.5 -1.22 0.61 0.38 0.83 0.19 0.78 0.26 0.14 -2.12 0.28 -0.21 -0.64 -0.02 -0.12
-1.62 -1.01 -0.6 -0.52 -0.01 0.09 0.31 -0.11 -0.16 -0.41 -1.02 -1.17 -1.72 0.4 0.8 0.79 0.58 0.65 0.86 0.49 -1.29 -0.22 -0.07 0.21 -0.02 0.33
-2.24 -1.47 -0.95 -0.72 -0.44 -0.8 0.1 -0.22 0.07 0.13 -0.45 -0.33 -2.26 0.82 0.42 0.97 0.41 0.64 0.22 0.58 -1.11 0.91 0.05 0.42 -0.37 0.11
-1.29 -1.06 -0.4 -0.42 0.01 0.49 0.25 -0.0 0.22 0.17 -0.38 -0.71 -1.23 0.93 0.76 0.96 0.45 0.5 0.66 0.49 -2.48 -0.39 -0.7 -0.63 -0.7 -0.37
-1.57 -1.23 -0.65 -0.6 -0.35 -0.57 0.14 -0.32 -0.12 -0.01 -0.76 -0.93 -1.54 1.2 0.92 1.26 0.85 1.08 0.68 0.82 -2.79 -0.74 -0.82 -0.52 -1.14 -0.2
-2.73 -2.53 -1.04 -0.84 -0.79 -0.04 0.4 0.44 0.56 0.15 -0.68 -1.22 -2.48 0.68 0.61 1.12 0.53 1.27 0.54 0.51 -2.35 -0.2 -0.37 -1.13 0.28 0.05
-1.42 -0.92 -0.31 -0.28 -0.22 -0.4 0.14 0.0 -0.11 0.0 -0.34 -0.68 -1.67 0.75 0.52 0.89 0.35 0.83 0.33 0.33 -1.12 0.07 0.34 -0.29 -0.1 0.04
-1.36 -0.88 -0.25 -0.26 0.05 0.37 0.09 -0.09 0.1 -0.01 -0.43 -0.66 -1.58 0.81 0.67 0.94 0.43 0.59 0.48 0.46 -1.71 -0.25 0.1 -0.41 -0.61 -0.35
-1.85 -1.28 -0.64 -0.31 -0.02 -0.02 0.46 0.27 0.38 0.4 -0.06 -0.43 -1.23 0.55 0.26 0.75 0.26 0.94 0.41 0.3 -2.81 -0.42 0.13 -0.42 -0.14 -0.16
-1.43 -0.81 -0.48 -0.44 -0.05 0.21 0.04 -0.33 -0.09 0.04 -0.31 -0.52 -1.34 0.69 0.95 0.98 0.8 0.69 0.73 0.46 -2.02 -0.96 0.04 0.0 -1.3 -0.52
-1.85 -1.33 -0.72 -0.45 -0.4 -0.14 0.33 0.17 0.41 0.17 -0.5 -0.76 -1.68 0.94 0.4 1.16 0.43 1.26 0.31 0.33 -2.22 -0.39 -0.19 -0.93 -0.15 -0.2
-1.83 -1.19 -0.6 -0.5 -0.3 0.17 0.24 -0.2 0.27 0.07 -0.67 -0.58 -2.18 0.85 0.51 1.14 0.24 0.74 0.56 0.11 -1.15 0.01 -0.04 0.09 -0.29 -0.01
-1.91 -0.97 -0.22 -0.21 -0.06 0.05 0.52 0.18 0.26 -0.05 -0.44 -0.63 -2.0 0.86 0.66 0.93 0.69 0.77 0.54 0.65 -2.01 -2.23 -0.37 -0.84 -0.54 0.04
-1.48 -0.84 -0.43 -0.54 -0.25 -0.21 0.01 -0.23 -0.17 -0.29 -0.66 -0.75 -1.6 0.72 0.77 0.87 0.56 1.19 0.83 0.47 -1.77 -0.76 -0.13 -0.05 -0.23 0.17
-1.74 -1.01 -0.59 -0.49 -0.33 -0.17 0.17 -0.03 0.17 0.16 -0.41 -0.63 -1.75 1.03 0.67 0.98 0.56 0.77 0.48 0.61 -2.46 -0.2 -0.66 -0.29 -0.24 0.06
-1.77 -1.12 -0.52 -0.42 -0.26 -0.2 0.27 0.03 0.1 0.1 -0.39 -0.49 -1.7 0.7 0.51 0.97 0.57 0.73 0.46 0.37 -1.96 0.06 -0.07 -0.29 0.03 0.05
-1.84 -0.95 -0.49 -0.47 -0.35 -0.47 0.26 -0.05 -0.05 0.02 -0.7 -0.92 -1.8 0.99 0.73 1.27 0.73 0.99 0.81 0.73 -2.17 -1.35 -0.94 -0.5 -0.66 0.12
-2.86 -0.57 -0.42 -0.46 -0.45 -0.79 0.12 -0.38 -0.27 -0.05 -0.65 -0.59 -2.97 1.12 1.01 0.99 1.05 1.01 0.8 0.56 -2.45 0.06 -1.2 -0.29 -1.39 0.0
-1.94 -1.75 -0.87 -0.36 -0.47 0.11 0.19 0.22 0.43 0.13 -0.26 -0.32 -2.21 1.14 0.09 1.01 0.17 0.89 0.24 0.23 -1.95 0.6 -0.61 -0.76 -0.0 0.1
-2.14 -1.27 -0.65 -0.43 -0.2 -0.34 0.26 -0.36 -0.07 -0.0 -0.26 -0.52 -1.88 1.1 0.78 0.8 0.7 0.58 0.55 0.45 -1.21 -0.04 -0.15 -0.1 -0.13 -0.17
-1.08 -0.45 -0.37 -0.06 0.16 0.23 0.29 0.09 -0.02 -0.14 -0.49 -0.77 -1.25 0.48 0.51 0.62 0.27 0.68 0.54 0.28 -1.13 0.34 -0.4 -0.37 -0.31 -0.07
-1.02 -0.62 -0.29 0.03 0.09 0.21 0.82 0.58 0.57 0.19 -0.26 -0.81 -1.16 0.07 -0.39 0.34 -0.34 1.0 0.42 0.24 -1.93 -0.72 -0.01 -0.08 -0.05 -0.14
-2.41 -1.46 -0.61 -0.72 -0.22 -0.24 0.28 -0.03 0.34 0.12 -0.65 -0.73 -2.13 1.02 0.72 1.17 0.54 1.14 0.42 0.48 -2.28 -0.14 -0.33 -1.0 -0.2 -0.17
-2.04 -1.47 -0.68 -0.48 -0.42 -0.02 0.49 0.24 0.37 0.24 -0.66 -1.0 -2.08 0.92 0.57 1.06 0.62 1.28 0.78 0.74 -1.98 -1.6 -0.78 -1.18 -0.69 -0.23
-2.46 -1.2 -0.62 -0.35 -0.04 0.05 0.29 0.04 0.17 -0.06 -0.43 -0.62 -2.47 0.65 0.56 0.76 0.35 0.61 0.39 0.26 -0.91 0.19 0.03 0.02 0.2 0.19
-1.43 -1.06 -0.72 -0.48 -0.32 -0.49 0.09 -0.09 -0.14 0.08 -0.44 -0.63 -1.17 0.95 0.43 1.12 0.5 0.61 0.25 0.42 -1.46 0.59 -0.42 -0.36 -0.02 0.29
-2.55 -1.27 -0.69 -0.09 -0.03 0.15 0.48 0.45 0.73 0.29 -0.28 -0.64 -2.41 0.54 0.11 0.68 0.17 0.93 0.37 0.21 -1.4 0.05 -0.06 -0.81 0.15 -0.32
-2.71 -1.27 -0.59 -0.42 -0.29 -0.34 0.46 0.32 0.35 0.24 -0.46 -0.72 -2.56 0.78 0.46 0.92 0.46 1.38 0.47 0.56 -1.65 -0.39 -0.38 -0.82 -0.46 -0.23
-1.72 -1.14 -0.52 -0.14 -0.15 -0.21 0.39 0.4 0.53 0.3 -0.26 -0.51 -1.6 0.42 0.19 0.7 0.16 1.29 0.25 0.15 -2.31 -0.13 -0.19 -0.54 0.17 -0.08
-2.12 -1.52 -1.09 -0.77 -0.54 -0.6 0.29 0.0 0.1 0.2 -0.44 -0.82 -2.26 1.01 0.7 1.16 0.74 1.12 0.58 0.64 -1.53 -0.15 -0.25 -0.45 -0.55 -0.32
-1.74 -0.7 -0.33 -0.22 -0.02 0.22 0.28 0.04 0.06 -0.12 -0.39 -0.49 -1.68 0.75 0.6 0.74 0.33 0.67 0.49 0.29 -1.28 0.06 -0.32 -0.34 -0.19 0.06
-2.37 -1.19 -0.7 -0.72 0.03 0.36 0.12 -0.58 -0.1 -0.12 -0.55 -0.77 -2.23 0.84 1.0 1.03 0.77 0.6 0.8 0.5 -1.78 -1.55 0.16 -0.03 -0.46 0.13
-1.34 -0.87 -0.69 -0.62 0.02 0.53 0.18 -0.06 0.07 0.06 -0.15 -0.29 -1.14 0.52 0.78 0.46 0.38 0.48 0.62 0.24 -1.64 0.14 -0.04 -0.23 -0.44 0.08
-3.09 -2.2 -1.64 -1.02 -0.54 -0.39 0.38 0.23 0.43 0.52 0.21 -0.33 -2.92 0.65 0.38 1.05 0.65 1.11 0.84 0.2 -3.11 0.01 -0.26 -0.21 -0.06 -0.55
-1.91 -0.69 -0.44 -0.24 -0.21 -0.34 0.25 -0.02 0.17 0.08 -0.42 -0.54 -2.05 0.74 0.46 0.8 0.38 0.94 0.56 0.35 -2.49 -0.15 -0.17 -0.01 0.2 -0.03
-0.74 -0.51 -0.18 -0.27 -0.07 -0.0 0.3 0.07 0.24 -0.13 -0.42 -0.51 -1.04 0.69 0.39 0.82 0.43 0.7 0.19 0.53 -2.73 -0.49 -0.53 -0.24 -0.08 0.17
-1.77 -1.47 -0.81 -0.42 -0.46 -0.54 0.24 0.11 0.1 -0.06 -0.52 -0.65 -1.72 0.73 0.35 0.95 0.39 1.16 0.35 0.27 -1.29 0.67 0.4 -0.4 -0.21 -0.2
-2.91 -1.51 -0.58 -0.38 -0.53 -1.06 0.23 0.2 0.06 0.37 -0.21 -0.56 -2.74 0.91 0.38 1.21 0.72 1.07 0.69 0.75 -1.52 -1.24 -0.26 -0.93 -0.21 0.05
-1.72 -0.72 -0.34 0.01 -0.12 -0.71 0.08 -0.03 -0.13 0.02 -0.38 -0.6 -1.74 0.71 0.24 0.91 0.38 1.12 0.41 0.6 -1.86 0.31 -0.14 -0.8 -0.1 0.17
-1.7 -0.91 -0.65 -0.19 -0.07 0.26 0.13 0.12 0.35 0.13 0.02 -0.23 -1.62 0.65 0.35 0.63 0.17 0.82 0.46 0.19 -1.75 0.12 -0.36 -0.63 0.24 -0.05
-0.62 -0.19 -0.01 -0.11 0.06 0.1 0.22 0.07 -0.05 -0.13 -0.44 -0.57 -0.65 -0.04 0.59 0.37 0.35 0.73 0.47 0.36 -2.25 0.73 -0.67 -0.49 -0.22 -0.23
-3.48 -1.69 -0.88 -0.46 -0.13 -0.07 0.15 -0.05 0.24 0.34 -0.07 -0.29 -3.07 1.2 0.61 1.09 0.45 0.51 0.19 0.16 -1.78 0.07 -0.36 0.01 -0.57 0.33
-0.88 -0.99 -0.55 -0.28 -0.33 -0.16 0.33 0.43 0.66 0.24 -0.24 -0.54 -0.79 0.52 0.08 0.47 0.02 1.19 0.36 0.2 -1.88 -0.38 -0.36 -0.53 0.18 0.04
-0.85 -0.53 -0.27 -0.24 -0.11 -0.18 0.0 -0.15 -0.09 -0.06 -0.29 -0.43 -1.02 0.51 0.59 0.67 0.28 0.58 0.47 0.18 -1.41 0.82 -0.4 -0.2 -0.43 0.21
-1.72 -1.25 -1.18 -0.7 -0.66 -0.77 -0.32 -0.44 -0.33 -0.64 -1.09 -1.1 -1.7 1.26 0.98 1.37 0.63 1.02 0.77 0.8 -2.49 -0.75 -0.29 -0.17 0.15 0.29
-3.47 -1.66 -0.82 -0.85 -0.45 -0.55 -0.07 -0.3 -0.06 0.03 -0.57 -0.89 -3.01 0.81 0.89 1.02 0.43 0.94 0.61 0.36 -0.96 1.14 -0.05 -0.1 -0.28 -0.27
-3.02 -1.27 -0.74 -0.51 -0.38 0.27 0.05 -0.08 0.2 -0.02 -0.44 -0.64 -2.73 0.71 0.72 0.93 0.39 0.79 1.0 0.22 -1.1 0.69 -0.19 -0.25 -0.71 -0.4
-2.81 -1.4 -0.55 -0.41 -0.14 -0.42 0.35 0.02 -0.1 0.23 -0.37 -0.67 -2.5 0.9 0.37 1.48 0.65 0.91 0.77 1.09 -2.91 -1.42 -2.17 -0.77 -0.56 0.25
-1.73 -0.8 -0.14 -0.27 -0.26 -0.39 0.19 -0.13 0.12 0.06 -0.05 -0.38 -1.91 0.75 0.39 0.76 0.33 0.9 0.32 0.51 -1.73 -0.75 -0.15 0.11 0.15 0.18
-1.93 -0.9 -0.52 -0.57 -0.28 0.06 0.25 -0.02 0.17 0.05 -0.45 -0.48 -2.04 0.93 0.87 0.83 0.46 1.05 0.71 0.59 -2.08 -1.0 -0.52 -0.61 -0.45 0.03
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-2.66 -0.79 -0.33 -0.02 0.09 -0.33 0.31 0.38 0.22 0.22 0.05 -0.38 -2.5 0.89 0.25 0.98 0.82 1.11 0.29 0.41 -3.35 -0.5 -0.86 -1.01 -0.59 -0.42
-2.79 -2.28 -1.07 -0.61 -0.55 -0.1 0.56 0.43 0.77 0.36 -0.44 -0.88 -2.99 1.11 0.68 1.2 0.37 1.01 0.15 0.39 -1.8 -0.22 -0.58 -1.07 -0.44 -0.22
-1.75 -1.12 -0.71 -0.33 -0.38 -0.5 0.14 0.13 0.21 0.06 -0.34 -0.64 -2.02 0.76 0.36 1.06 0.36 0.7 0.34 0.21 -1.81 0.49 0.3 -0.33 0.09 0.14
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-1.69 -1.05 -0.52 -0.38 -0.11 0.04 0.22 -0.03 0.39 0.22 -0.12 -0.57 -1.92 0.82 0.59 1.01 0.53 0.67 0.27 0.49 -1.87 -0.49 -0.15 -0.4 -0.22 -0.19
-0.77 -0.69 -0.35 -0.25 -0.19 -0.12 0.36 0.33 0.41 0.25 -0.22 -0.41 -0.71 0.39 0.39 0.53 0.16 0.77 0.27 0.3 -1.85 -0.19 -0.19 -0.72 0.11 0.07
-1.9 -1.11 -0.7 -0.64 -0.23 -0.0 0.35 0.01 0.29 0.21 -0.41 -0.67 -2.06 0.93 0.77 1.08 0.55 0.78 0.66 0.54 -2.74 -0.96 -0.05 -0.39 -0.65 -0.15
-1.61 -1.74 -0.58 -0.05 -0.15 -0.18 0.41 0.33 0.66 0.47 0.0 -0.5 -1.7 0.5 -0.1 0.86 0.21 1.13 0.05 0.27 -2.63 -0.1 0.28 -0.98 -0.02 -0.27
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-3.0 -2.07 -0.88 -0.3 -0.03 0.34 0.73 0.54 0.81 0.33 -0.42 -0.91 -2.92 0.8 0.21 0.89 0.23 1.16 0.22 0.27 -2.23 -0.11 -0.56 -1.23 -0.13 -0.32
-2.08 -1.28 -1.08 -1.01 -0.92 -0.76 -0.26 -0.52 -0.22 -0.14 -0.69 -0.84 -2.25 0.83 0.64 1.41 0.46 0.64 0.68 0.16 -0.54 1.43 -0.32 0.1 -0.39 -0.12
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-2.24 -1.25 -0.66 -0.61 -0.43 -0.9 0.07 -0.26 -0.36 -0.11 -0.81 -1.06 -2.2 1.11 0.79 1.26 0.78 1.24 0.72 0.67 -1.83 -1.54 -0.15 -0.68 -0.05 0.29
-2.32 -1.3 -0.89 -0.69 -0.39 -0.39 0.2 -0.12 0.04 -0.02 -0.64 -0.96 -2.51 0.96 0.62 0.99 0.7 1.35 0.85 0.64 -2.31 -0.2 -1.23 -0.45 -0.2 0.25
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-2.07 -1.01 -0.64 -0.34 -0.23 -0.51 0.27 0.05 0.0 0.22 -0.37 -0.55 -2.04 0.87 0.37 0.93 0.62 0.98 0.66 0.57 -1.94 -0.74 -0.24 -0.44 0.07 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.