Heatmap: Cluster_271 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d000023 (GRMZM2G012761)
-0.77 0.17 0.26 0.75 -0.07 -0.32 -0.33 -0.28 -1.31 -0.63 0.29 -0.26 -0.16 0.32 -0.85 0.36 0.87 0.35 1.14 -3.59 -0.72 0.21 -0.24 0.5 -0.39 -0.33 0.12 0.47 -3.2 1.35 -0.07 -1.26 -0.18 0.2 -0.46 0.01 -0.45
Zm00001d002656 (GRMZM2G117060)
-0.48 0.52 0.8 0.7 0.15 -1.01 -0.8 -0.28 -1.4 -1.06 -0.39 -0.58 -0.06 0.29 -0.83 0.43 0.96 0.06 0.39 -4.56 -0.01 -0.11 0.09 0.87 -0.49 0.18 0.11 0.45 -0.98 1.2 0.19 -0.82 -0.47 -0.09 0.04 -0.18 -0.82
-1.63 -0.12 0.73 0.66 0.05 -1.4 -1.67 -0.4 -1.52 -1.37 0.29 -0.83 -0.85 -0.05 -1.2 0.38 1.41 0.64 0.87 -5.39 -0.72 0.56 -0.34 1.27 -0.39 0.09 -0.39 0.08 - 1.98 0.08 -4.24 -0.72 0.26 -0.45 0.03 -0.62
Zm00001d005264 (GRMZM2G158575)
-0.3 0.5 0.35 0.54 0.11 -0.52 -0.33 -0.01 -1.26 -1.01 0.45 -0.42 -0.09 -0.28 -1.02 0.24 1.0 0.36 1.02 -3.75 -0.17 0.19 0.06 0.48 -0.33 -0.29 0.23 0.4 -3.83 1.04 -0.17 -2.09 -0.04 0.06 0.2 -0.15 -0.43
Zm00001d005350 (GRMZM2G466560)
-0.91 0.08 0.29 0.85 -0.01 -0.85 -0.64 -0.19 -1.67 -0.87 0.18 -0.27 -0.21 0.2 -0.86 0.12 0.87 0.15 0.88 -5.1 -0.88 0.16 0.12 1.02 -0.63 0.68 -0.21 0.29 - 1.4 -0.03 -1.9 -0.17 0.02 0.42 0.01 -0.34
Zm00001d005507 (GRMZM2G446872)
-0.86 0.48 0.41 1.01 0.03 -0.32 -0.33 -0.04 -1.63 -1.01 1.1 -0.38 -0.61 -0.12 -1.11 0.1 1.15 0.35 0.49 -6.68 -0.71 0.73 -0.43 0.96 -0.23 -0.25 -0.05 0.24 -3.09 0.98 -0.21 -3.32 -0.06 0.01 -0.52 -0.01 -0.21
Zm00001d005573 (GRMZM2G138178)
-1.15 0.7 0.31 0.97 0.0 -1.08 -1.25 -0.68 -1.87 -1.3 -0.38 -0.66 -0.97 0.49 -0.99 0.28 1.08 0.27 0.99 -3.06 -0.31 -0.07 -0.62 0.78 -0.53 -0.43 0.35 0.34 -2.31 1.84 0.24 -2.44 -0.19 0.79 -0.71 -0.23 -0.43
Zm00001d006344 (GRMZM2G081812)
-0.91 0.01 0.4 0.62 -0.11 -1.06 -0.96 -0.46 -1.59 -1.2 -0.38 -0.44 -0.19 0.55 -0.96 0.39 0.79 -0.05 0.21 -4.62 0.17 0.22 -0.61 0.18 -0.49 -0.64 0.7 0.55 -0.33 2.04 0.17 -1.17 0.04 0.49 -1.65 -0.24 0.06
Zm00001d006438 (GRMZM2G076730)
-0.67 0.41 0.69 0.63 0.16 -0.94 -1.23 -0.4 -1.41 -0.87 -0.05 -0.7 -0.64 0.19 -0.86 0.31 1.02 0.28 0.7 -3.9 -0.34 0.12 -0.12 0.88 -0.27 0.52 0.1 0.46 -0.61 1.07 -0.02 0.0 -0.51 0.04 -0.75 -0.19 -0.45
Zm00001d006478 (GRMZM2G168679)
-2.39 0.75 0.53 0.54 -0.09 -1.38 -1.85 0.18 -1.4 -1.25 -1.55 -0.74 -0.75 -0.42 -1.31 0.27 1.31 -0.13 0.28 -5.02 -0.24 0.64 0.06 1.74 -0.46 0.57 -0.18 -0.06 - 1.76 0.3 - -1.2 -0.3 0.9 -0.35 -0.28
Zm00001d008763 (GRMZM2G365983)
-0.71 -0.11 0.49 0.54 -0.05 -0.15 0.19 -0.29 -1.75 -0.96 0.97 -0.31 -0.57 0.21 -1.09 0.07 0.48 0.65 1.08 -3.36 -0.9 0.27 -0.12 0.61 -0.34 0.46 0.08 0.6 - 1.42 -0.46 -2.49 -0.3 0.01 -0.87 -0.01 -0.32
Zm00001d009683 (GRMZM2G150484)
-0.35 1.04 0.14 0.72 -0.11 -0.39 -0.67 -0.36 -1.13 -0.74 -0.54 -0.56 0.09 0.52 -0.96 0.15 0.62 0.47 1.13 -2.02 -0.82 -0.31 -0.21 0.48 -0.46 -0.32 0.34 0.36 -2.27 1.5 0.17 -3.21 -0.41 0.27 -0.78 -0.12 -0.08
Zm00001d010997 (GRMZM2G173763)
-1.2 0.0 -0.05 1.04 -0.17 -0.48 -1.02 -0.11 -1.35 -1.37 0.9 -0.28 -0.49 -0.07 -0.59 -0.16 0.42 0.14 0.49 -4.17 -0.16 -0.06 -0.34 0.75 -0.61 0.35 -0.33 0.26 -2.01 1.75 0.04 -2.48 -0.38 0.13 0.53 0.03 0.62
Zm00001d011158 (GRMZM2G335720)
-1.07 -0.24 0.3 0.54 -0.12 -1.0 -0.8 -0.25 -1.1 -0.57 0.33 -0.47 -0.93 -0.85 -0.74 0.29 1.27 0.37 1.09 -3.39 -0.47 0.4 -0.64 1.24 -0.34 0.04 0.44 0.2 -3.61 1.56 -0.17 -2.53 -0.54 0.05 0.31 0.19 -0.6
Zm00001d011427 (GRMZM2G433333)
-1.45 -0.07 0.83 1.14 -0.15 -1.06 -1.23 -0.61 -2.14 -1.34 -0.53 -0.62 -0.58 0.7 -1.39 0.15 1.24 0.36 0.71 -6.05 -0.86 0.48 -0.81 0.89 -0.57 0.07 -0.1 0.07 -1.68 2.05 0.39 -2.22 -1.18 0.58 -0.39 -0.28 -0.74
Zm00001d011981 (GRMZM2G312365)
-0.34 0.45 0.48 0.86 0.07 -0.45 -0.53 -0.38 -1.7 -0.77 0.37 -0.48 -0.4 0.13 -0.91 0.17 0.91 0.36 0.72 -4.64 -0.8 -0.11 -0.13 0.69 -0.47 -0.19 0.23 0.68 -2.54 1.22 -0.03 -1.04 0.15 0.35 -1.11 0.04 -0.19
Zm00001d011983 (GRMZM2G027932)
-0.03 0.54 0.6 0.74 0.21 -0.5 -0.72 -0.37 -1.41 -0.9 0.17 -0.4 -0.29 0.24 -0.84 0.32 0.84 0.34 0.45 -4.39 -0.5 0.01 -0.04 0.58 -0.44 0.12 0.2 0.37 -2.27 1.17 0.09 -2.26 -0.35 0.14 0.04 0.14 -0.19
Zm00001d012974 (GRMZM2G160046)
-0.99 1.08 0.51 -0.15 0.13 -1.7 -1.06 0.01 -0.78 -0.37 -0.1 -0.7 -1.16 0.23 -0.89 0.35 1.04 0.17 0.5 -6.82 -0.56 0.63 -1.21 1.07 -0.16 0.75 0.27 0.08 -4.38 1.38 0.69 -3.99 -0.46 0.22 -0.31 -0.14 -0.55
Zm00001d013247 (GRMZM2G086287)
-2.65 0.36 0.64 0.25 0.18 -2.14 -1.6 0.21 -1.47 -1.12 0.46 -0.61 -0.64 -0.66 -1.17 0.52 1.39 -0.24 0.43 - -0.45 0.08 -1.04 1.01 -0.36 -0.02 0.35 0.23 - 2.05 0.74 -4.27 -0.51 1.07 -0.8 -0.19 -0.91
Zm00001d013828 (GRMZM2G146041)
-1.73 -0.19 0.42 0.38 -0.09 -0.12 -0.18 -0.41 -1.08 -0.37 -0.37 -0.32 -1.31 0.29 -1.04 0.11 1.13 0.46 0.68 -1.66 -0.65 0.32 0.3 0.63 -0.4 0.17 -0.27 -0.17 0.43 1.53 -0.09 -0.64 -0.79 -0.09 -0.21 -0.02 -0.38
Zm00001d014909 (GRMZM2G377887)
-0.85 0.27 0.36 0.98 -0.08 -1.07 -1.38 -0.56 -1.3 -0.94 -0.19 -0.79 -0.97 0.65 -0.93 0.19 1.23 0.24 0.42 -1.86 -0.23 0.49 -0.96 0.95 -0.55 0.11 -0.32 0.06 -0.85 1.78 -0.29 0.17 -0.33 -0.06 -1.2 0.06 -0.42
Zm00001d015248 (GRMZM2G410393)
-0.99 0.45 -0.1 0.54 -0.09 -0.68 -0.73 0.29 -0.94 -0.23 0.92 -0.14 -0.43 0.14 -0.49 0.1 1.0 0.2 0.23 -4.83 -0.34 0.35 0.1 0.77 -0.29 -0.13 0.14 0.0 -2.07 1.16 0.04 -1.69 -0.64 -0.07 -0.08 0.09 0.17
Zm00001d015955 (GRMZM2G118098)
-0.39 0.28 0.41 0.91 -0.06 -0.5 -0.28 0.03 -1.26 -0.95 0.14 -0.2 0.45 0.42 -0.47 0.21 0.75 0.35 0.52 -2.23 -1.13 -0.03 -0.44 0.42 -0.37 0.6 0.53 0.13 -4.73 1.22 -0.29 -3.03 -0.26 0.18 -0.14 -0.05 -0.5
Zm00001d017946 (GRMZM5G824439)
-1.07 0.7 1.31 0.83 0.21 -1.55 -1.92 -0.37 -1.71 -1.41 -0.43 -0.86 -0.68 0.42 -1.25 0.48 1.46 0.28 0.32 -6.97 -0.53 0.53 -0.58 1.07 -0.46 -0.06 0.55 0.2 -3.32 1.43 0.11 -2.4 -0.75 0.47 -1.24 -0.12 -0.84
Zm00001d019881 (GRMZM2G312110)
-1.1 -0.11 1.06 1.25 0.09 -0.39 -0.7 -0.65 -2.38 -1.56 1.72 -0.67 -1.3 -0.08 -1.26 -0.23 0.64 0.57 0.29 -5.57 -1.0 0.37 -0.24 0.59 -0.48 0.23 0.51 0.48 -1.39 1.01 -0.22 -2.16 -0.05 -0.08 -0.21 -0.14 -0.56
Zm00001d021188 (GRMZM2G070038)
-0.5 0.28 0.44 0.4 -0.13 -0.74 -0.48 -0.21 -1.46 -0.98 0.41 -0.51 0.08 0.26 -0.85 0.24 1.14 0.34 0.37 -3.73 -0.05 0.46 -0.24 0.64 -0.18 -0.73 0.49 0.28 -1.34 1.11 0.08 -0.98 -0.11 0.24 -0.61 -0.12 -0.13
Zm00001d022286 (GRMZM2G026991)
-1.14 0.28 0.14 1.2 -0.08 -1.06 -0.98 -0.08 -2.42 -1.68 0.73 -0.66 -0.37 0.05 -1.06 -0.25 1.25 0.26 0.47 -4.2 -0.36 0.69 -0.42 1.24 -0.48 0.34 -0.09 0.28 -2.47 1.47 -0.2 -1.79 -0.24 -0.32 0.19 -0.45 -0.24
Zm00001d022537 (GRMZM2G327042)
-1.52 1.38 0.85 -0.37 0.18 -2.54 -0.97 0.37 -0.84 -0.85 0.33 -0.37 0.19 -0.98 -0.74 0.23 1.08 0.06 0.34 -7.78 -1.0 0.26 -0.36 1.09 -0.0 1.11 0.22 0.39 - 0.06 0.13 -3.48 0.26 0.66 -0.43 -0.22 -0.91
-2.18 0.85 0.04 0.76 0.04 -4.68 -3.86 0.34 -2.92 -2.57 -2.49 -1.3 0.05 0.4 -1.55 0.54 1.92 0.07 0.17 -4.58 -0.07 0.98 -1.4 2.17 -0.31 -0.28 -0.22 -0.2 -1.52 -1.17 0.82 -0.78 -0.3 0.06 0.81 -1.25 -1.09
Zm00001d023391 (GRMZM2G314661)
-0.72 0.22 0.1 0.39 -0.32 -0.12 -0.38 -0.02 -1.88 -1.3 0.66 -0.46 -0.71 0.41 -1.14 0.27 1.1 0.6 0.83 -3.43 -0.66 0.26 -0.41 0.88 -0.01 -0.05 0.05 0.21 -1.13 1.11 0.09 -0.8 -0.69 -0.41 -0.07 -0.07 0.23
Zm00001d024533 (GRMZM2G030659)
-1.5 -0.11 0.07 0.62 -0.35 -0.16 -0.3 0.32 -1.47 -0.52 0.83 -0.11 -0.68 -0.2 -0.59 -0.27 0.72 0.17 0.27 -4.4 -0.56 0.13 0.73 0.84 -0.57 0.22 -0.38 0.04 -1.02 1.11 -0.26 -0.75 -0.47 -0.24 0.83 -0.04 0.42
Zm00001d024583 (GRMZM2G044306)
-1.13 0.19 -0.17 1.27 -0.32 -0.89 -1.14 -0.59 -2.0 -1.41 -0.13 -0.8 -0.9 -0.06 -1.06 -0.18 0.92 0.36 1.11 -3.44 -0.36 0.44 -0.44 1.18 -0.69 0.26 -0.09 0.94 -2.75 1.73 -0.02 -2.55 -0.21 -0.08 -0.66 0.11 0.39
Zm00001d025238 (GRMZM2G159720)
-0.63 0.32 0.35 0.57 -0.21 -1.34 -1.15 -0.21 -2.22 -1.81 0.61 -0.62 0.01 0.66 -0.97 0.14 1.02 0.34 0.79 -3.41 -0.42 0.58 -0.77 1.1 -0.17 0.46 0.01 -0.1 - 1.69 -0.28 -3.19 -1.57 0.05 0.64 -0.39 -0.4
Zm00001d025870 (GRMZM5G827485)
-1.17 0.9 0.55 0.27 -0.16 -2.16 -2.09 0.0 -1.8 -1.74 -0.4 -0.82 0.38 -0.05 -0.78 0.89 1.49 0.47 0.69 -4.71 -0.33 0.78 -2.54 1.72 -0.53 -0.89 0.2 -0.06 - 1.2 0.28 -2.87 -0.43 0.04 0.28 -0.56 -0.89
Zm00001d026691 (GRMZM2G110869)
-1.65 0.75 0.18 0.93 -0.15 -0.87 -0.49 -0.54 -1.92 -1.02 1.01 -0.42 -0.63 -0.05 -1.06 -0.14 1.28 0.76 0.85 -2.43 -0.5 0.42 -0.7 1.07 -0.27 -0.02 0.37 0.45 -4.43 1.07 0.2 -3.92 -0.38 0.23 -1.17 -0.01 -0.92
Zm00001d027299 (GRMZM2G114459)
-1.05 0.18 0.69 0.58 -0.02 -0.33 -0.2 -0.45 -1.89 -1.28 0.62 -0.75 -0.69 -0.07 -1.43 0.58 1.14 0.29 0.56 -6.13 -0.79 0.45 -0.54 0.85 -0.53 0.18 0.16 0.37 - 1.83 0.27 -2.43 -0.09 -0.17 -0.83 -0.09 -0.33
Zm00001d028022 (GRMZM2G002002)
-0.8 0.57 0.46 0.62 -0.06 -0.46 -0.58 -0.35 -1.57 -0.94 0.88 -0.6 -0.59 0.17 -0.92 0.12 1.13 0.3 0.71 -3.52 -0.96 -0.2 0.18 0.72 -0.68 0.35 0.42 0.39 -1.03 1.15 -0.12 -2.5 -0.26 0.37 -1.0 0.0 -0.26
Zm00001d028660 (GRMZM2G078052)
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Zm00001d048074 (GRMZM2G024571)
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-0.87 0.09 0.33 0.6 -0.14 -0.52 -0.56 -0.63 -1.71 -1.13 1.09 -0.59 -0.54 0.39 -1.06 0.14 0.87 0.49 1.21 -6.14 -1.21 0.33 -0.34 0.7 -0.58 0.3 0.11 0.51 -1.45 1.42 -0.38 -2.56 -0.09 0.11 -0.67 -0.02 -0.2
Zm00001d049140 (GRMZM2G315264)
-1.6 1.19 0.3 0.4 0.05 -2.3 -1.89 -0.15 -1.44 -1.26 0.28 -0.75 -0.08 -0.19 -1.04 0.41 1.28 0.34 0.52 -6.06 -0.33 0.41 -1.01 0.89 -0.15 0.2 0.01 0.41 -0.78 1.28 0.65 -2.51 0.04 0.79 -0.92 -0.48 -1.25
Zm00001d049269 (GRMZM2G406712)
-0.68 0.37 0.45 0.42 0.06 -0.24 -0.37 -0.23 -1.23 -0.68 -0.21 -0.38 -0.55 0.01 -0.74 0.46 1.05 0.43 0.64 -2.24 -0.56 0.04 -0.17 0.83 -0.39 0.06 -0.04 0.49 -1.86 0.77 -0.12 -0.95 0.32 0.63 -0.2 0.09 -0.66
Zm00001d049442 (GRMZM2G007734)
-0.83 0.07 0.32 0.54 -0.11 -0.53 -0.46 -0.39 -1.35 -0.59 0.29 -0.24 -0.24 0.44 -0.92 0.27 0.95 0.33 0.72 -4.76 -0.7 0.26 0.02 0.75 -0.35 -0.14 0.0 0.3 - 1.59 -0.01 -1.46 -0.12 0.35 -0.12 -0.04 -0.45
Zm00001d049636 (GRMZM2G142157)
-1.64 -0.92 0.09 0.12 -0.44 0.1 0.24 -0.05 -0.73 -0.56 1.02 -0.13 -2.4 -2.31 -0.12 -1.17 0.57 -0.18 0.64 -1.79 -0.95 -1.17 1.52 0.67 -0.84 1.28 -0.16 0.46 -1.72 0.43 -0.15 -1.46 -0.1 0.41 1.14 0.01 -0.36
Zm00001d051017 (GRMZM2G019450)
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Zm00001d052751 (GRMZM2G363038)
-1.61 -0.22 0.09 1.47 -0.33 -0.37 -0.74 -0.98 -1.8 -1.01 0.23 -0.84 -2.36 0.5 -1.46 0.02 0.79 0.27 1.04 -3.73 -1.14 0.58 -0.18 0.48 -0.79 0.12 -0.1 0.47 -1.85 1.98 0.11 -3.3 0.07 0.25 -0.37 -0.03 0.18
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Zm00001d053882 (GRMZM2G117346)
-0.81 0.25 0.64 0.41 0.03 -1.0 -0.92 -0.11 -2.0 -1.24 0.18 -0.7 -0.49 0.1 -1.04 0.29 1.04 0.75 0.59 -4.01 -0.13 1.13 0.05 0.83 -0.23 0.38 0.08 -0.16 -0.93 1.15 0.26 -1.44 -1.14 -0.11 -0.09 -0.33 -0.48
Zm00001d053986 (GRMZM2G154059)
-1.5 1.31 0.23 0.33 0.08 -3.48 -4.21 0.21 -3.46 -2.61 -1.28 -1.67 -0.25 -0.98 -1.61 0.45 1.71 -0.2 0.08 -7.33 0.26 0.92 -0.77 1.77 -0.79 1.1 0.32 0.11 - 0.97 0.54 -2.37 -0.29 -0.15 0.54 -1.09 -0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.