Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
- - 1.9 4.09 1.39 - 3.96 - - -3.63 -2.09 - - -1.05 - - - -2.36 2.91 -4.47 - - - - - - - - -0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.24 -3.7 4.83 2.79 - 0.21 2.8 - - -2.69 -1.06 - - - - - - - 1.38 -2.9 - - - -6.47 - - - - -2.3 - - - - - - - - - - - - - -0.9 - - - - -
- - 3.0 4.29 -0.42 - 3.34 - - -0.0 -1.45 - - - - -1.37 - - 2.95 -3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.95 2.95 3.56 - 2.28 3.2 - - - 0.99 1.95 - - - 0.64 - - - - - - - - - - 2.43 - - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.89 3.48 0.99 - 4.48 - - - -0.69 - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - -2.3 - 0.37 - - - - - - - 2.67 - - - - - -
- - 3.58 3.13 2.94 0.52 2.94 - - -1.76 - - -0.12 -3.17 - -2.34 - - 2.38 -3.49 - - - - - - - - 1.85 - - - -3.28 - - - - - - - - - - - - - - -
-3.78 -8.05 0.25 4.58 -1.18 -3.56 4.4 - -2.03 -4.63 -2.01 -3.27 - - - - - - -1.74 -7.32 - - - - - - - - -2.82 - -6.66 - -6.34 -5.52 - - - -5.82 -6.1 - - - - -3.61 - - - -
- -0.88 3.43 4.61 - - 1.61 - - - - - 2.31 - - - - - -0.37 -1.71 - - - -3.94 - - - - 0.23 0.77 - - - - - - - -2.12 - - - - - - - - - -
-8.85 -6.6 2.87 4.04 2.17 - 3.59 - -6.38 -3.25 -2.89 - - -6.72 -4.94 -5.93 - - 2.87 -4.62 -6.14 - - - - - -6.14 - -7.35 - -6.92 - -7.87 - -9.15 - - -5.99 - - - - - - - - - -
1.07 0.21 3.25 2.84 3.38 1.53 1.84 -2.15 -2.0 - - - -2.33 -0.37 - -1.65 -0.77 -0.95 -1.25 -1.61 - -2.07 - -0.69 -0.46 -1.16 - - 0.97 - -0.93 -3.83 -3.04 -3.63 -0.94 - -0.81 -1.97 -5.42 - - -0.64 -0.55 - - - - -
- -3.52 3.33 1.03 2.94 0.93 0.49 - - -2.35 - - - - - - - -1.33 4.26 -1.96 - - - - - - - 1.11 -0.45 - - - - - -3.35 -1.0 -0.9 -2.33 - -0.82 - - - - - - - -
-5.75 -2.14 1.92 3.89 2.22 -3.96 3.06 - - -3.29 -4.01 -5.6 - -1.39 0.18 1.03 -4.47 -3.81 2.85 -2.12 -0.69 -1.45 -1.25 -1.33 -2.42 -0.79 -1.05 - -5.06 -4.9 -4.7 -2.74 -1.09 -3.29 -5.3 -3.93 -4.52 -2.55 -1.23 -4.74 -2.93 - - - - - - -
AT1G75470 (PUP15)
1.03 - 3.49 3.01 3.32 0.27 3.04 - - - - -1.63 - - - - - - -0.48 -6.12 - - - -3.72 -3.01 -3.03 -0.3 -1.48 0.36 - - - -5.01 - - -2.6 1.27 -6.41 -0.3 - - - - - - - - -
AT2G01960 (TET14)
- -3.51 2.28 3.82 2.75 -3.19 3.71 - - -3.67 -3.6 -4.22 -1.15 -7.17 - - - - 2.89 -3.71 -5.27 -5.09 -2.53 -6.39 -5.4 - -5.01 -5.02 -2.59 -3.6 -5.27 -5.02 -6.55 -5.13 -5.7 -3.54 -5.03 -4.36 -7.24 - - - -5.08 - - - - -6.27
AT2G02280 (PP2-B4)
- - - 2.83 - - 4.53 - 2.99 - 2.93 - - -2.51 - - - - - - - - - - - - - - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.76 1.94 3.44 -0.18 0.04 3.42 - - - 0.37 2.54 - - - -0.82 - 2.68 - 0.77 - - - -4.09 - -1.68 - - -4.5 - - - -0.69 - - - 0.53 -2.21 -0.98 - - - - - - - - -
- -3.9 2.76 3.33 3.1 1.95 3.58 -0.42 -3.6 - -1.56 - - -2.81 -0.2 - - - - -6.31 - - - -3.59 - -5.36 - - 1.34 - - - -3.12 - - - - -5.22 -3.54 - - -1.27 -0.61 -2.6 -2.18 - -8.14 -2.82
- -7.26 3.07 4.62 -1.02 - 2.41 - - -3.13 - - - - -1.68 -4.67 - -3.21 2.78 -5.34 - - - -5.51 - - - - 0.53 - -4.54 - - -5.98 - -2.74 - -7.54 - - - - - - - - - -
- -6.44 1.85 4.38 -0.36 - 3.24 - - -4.79 -2.27 - - - - - - - 3.27 -4.26 -1.56 - - -3.75 - - - -3.09 1.19 -3.4 - - - -4.19 -6.9 -3.19 -1.69 - -6.96 - - - - - - - - -
- -7.47 0.98 4.5 1.52 -2.35 3.22 - - -5.78 -2.26 - - - - - - - 3.13 -5.97 - - - -2.73 - -2.09 - - - - - - - - - - - -2.31 -8.05 0.55 - - - - - - - -
- -6.4 2.64 4.32 1.75 -1.33 3.15 -2.15 - -2.53 -1.62 - - -4.67 - - - -0.77 2.91 -6.32 - - - -8.15 -2.9 - - - - - - - - -4.87 - - - -5.03 - - - - - - - - - -
- -6.24 1.54 4.27 1.97 - 3.8 -4.6 - -3.81 -4.4 - -2.24 - - -4.27 - - 2.82 -4.93 - - - -6.47 - -6.44 - - - - - -5.05 -5.3 -3.85 -5.41 -4.34 - -5.68 -8.13 - - - - - -2.67 - - -
- -7.43 2.83 4.02 2.08 -3.99 3.67 -3.77 -4.31 -4.43 -2.78 - - -6.16 - - - - 2.45 -5.44 - - - -1.4 - -2.28 - -5.45 0.09 -3.72 -5.39 - - -6.02 -9.88 - - - - - - - - - - - - -
-0.35 -4.16 2.55 3.58 2.57 1.86 4.03 - -0.49 - -2.21 - - - - - - - -0.15 - - - - -3.23 - -1.89 - -2.0 -0.84 - -4.73 -3.54 - - - - -2.01 - -4.74 - - - - - - - - -
- -4.9 2.23 3.86 2.78 -3.46 4.01 - - -3.64 -3.22 - - -4.43 - - - - 2.33 -5.03 - - - - - - - -3.06 - -3.95 - - - - - - - - - - - - - - -3.08 - - -
- -8.32 2.13 4.36 2.04 - 3.6 -5.49 - -2.62 -3.02 - - - - - - - 2.56 -5.21 - - - - - - - - - - - - - -6.23 - -4.97 -0.98 - -8.67 - - - - - -4.88 - - -
-1.52 -4.94 2.6 3.82 2.77 0.97 3.99 - -2.0 -2.01 - - - - - - - - 0.19 -4.09 - - - - - - -1.54 - -1.45 - - - - - - -1.39 - -6.02 - - - - - - - - - -
- -2.6 4.32 4.1 1.42 - 1.15 -1.15 - -0.66 - 1.49 - - - - - - -1.84 -4.58 - - - -1.61 - - - - -0.02 - - - - -2.67 - - - -4.31 -4.2 - - - - - - - - -
- - - 4.85 2.08 - 3.82 - - - - - - - - - - - -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.96
-2.37 -1.44 3.68 1.62 3.48 1.76 2.07 -3.74 1.64 -1.56 1.33 - 1.9 -5.18 - - - -2.95 -0.84 -3.97 - - - -5.53 - - - - -0.46 - -3.87 - -3.2 -4.03 - -3.49 -3.37 -4.3 -5.66 - - -1.49 -2.4 -1.81 - - - -2.97
- -6.78 3.19 3.84 2.95 -1.1 3.18 - -3.58 -5.55 -4.26 - - - - -5.13 - - 2.77 -4.85 - - - -9.72 -4.47 - - - -2.18 - - - - - - - - -6.98 - - - - - - - - - -
- -2.87 2.16 3.59 1.54 -1.07 4.42 - -2.96 - - - -3.44 -4.06 - - - - 0.47 -3.94 - - - - - -4.73 - - -0.31 - -2.98 -4.78 - - - -2.58 - - -6.34 -2.55 - - - - - - 1.79 -
- - - 4.58 - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.5 4.18 1.56 - 3.71 - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - -0.77 - - - - - - - - - -3.19 - - - - - - - - -
- -8.88 2.59 3.85 2.56 -1.02 3.97 -7.06 -4.93 -4.89 -3.33 - - - - -8.01 -9.8 - 2.44 -6.51 - -10.03 -9.53 -10.31 - -11.74 - - -9.94 - - - -11.46 -6.23 -10.19 - -7.22 -12.37 - - - - - - -7.51 - - -
- -3.63 2.82 4.2 - - 3.28 - - - - - - - - - - - 3.08 - 1.36 - -0.3 - - - - - -1.63 - - - - -2.35 -4.56 - - -1.32 - - - - - - - - - -
- -1.16 3.35 - 4.88 - 1.14 - 1.77 - 0.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.14 -3.01 0.35 3.78 -0.04 -0.96 3.82 - -0.41 -5.14 -1.6 -4.14 -2.67 -0.26 -1.49 -4.47 -2.09 - -3.1 -3.33 - -3.51 -3.49 -1.17 - -0.86 -1.43 -2.44 -2.85 -1.76 -6.08 - -1.18 -4.43 -3.15 -1.55 0.33 -0.36 0.03 1.53 - -0.56 -3.49 - - - - -4.56
- - 1.46 4.31 2.14 - 3.71 - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.17
- - 4.31 - 4.26 - 1.01 - 0.56 -0.54 - - - - - - - - 0.5 - - - - 0.07 - - - - 0.97 - -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -6.67 2.28 4.1 1.94 -1.26 3.51 -7.17 -2.98 -3.2 -2.43 -2.98 -0.16 -7.37 - -5.96 -6.83 - 3.11 -5.05 - -6.58 -6.56 -8.45 - -8.72 -6.51 -6.51 -7.97 -8.41 - -7.72 -9.04 - -7.79 - -6.52 -9.91 -8.08 - - - - - - - - -
0.21 -2.13 2.23 3.35 1.79 - 4.34 -0.62 - - - 0.94 - -0.52 - - - - - - - - -0.39 - - - - - -0.79 - - - - 0.69 - - - -1.97 -3.67 - - 0.63 - - - - - -
- - 2.93 3.76 2.98 - 2.99 - -1.68 -3.03 -1.35 - - - - -2.22 - - 2.83 -4.08 - - - -6.82 - - - - - -0.28 - - - - - -1.31 - - -5.09 -1.27 - - -1.24 -0.63 - - - -
-5.05 -8.68 2.94 3.69 3.08 -1.66 3.48 - -3.07 -2.34 -3.92 -5.22 - -4.9 - - -4.05 -4.17 2.67 -4.78 - -3.52 - -2.71 - -3.45 - - -3.95 - -5.72 -6.54 - -7.1 - - - -5.85 - - - -3.85 - - - - - -
- -5.82 2.39 4.16 1.39 -0.96 3.8 - - -4.15 - -2.2 - - - - - - 2.82 -5.98 -3.69 - - -4.84 - -5.65 - - -2.6 - - - - -5.63 - -3.56 - - -4.72 - - - - - - - - -
- - 2.32 4.4 - - 2.04 - 0.14 -1.11 - 1.03 1.95 - - - - - 2.89 - - - - - - - - - -1.87 - - - - - -4.2 -0.53 0.89 -3.88 - - - - - - - - - -
- -2.23 1.11 0.3 1.29 - - - - - 0.21 4.23 4.0 - - - - - 1.45 - - - - -1.75 - - - 0.42 -1.13 - - - - - -1.03 - - -4.03 -3.45 - - - - - - - - -0.79
-3.91 - 1.69 4.33 0.71 -3.0 3.75 - - -5.45 -4.21 - - - - -5.13 - - 2.34 -6.17 - - - -0.96 -4.37 -1.93 -4.24 - -4.56 -5.89 - -4.53 -5.52 -6.18 - 0.98 -0.71 -0.79 -7.89 - - - - - - - - -
- -8.41 2.28 3.95 1.69 -0.98 3.74 -1.13 -3.47 -2.13 -2.65 1.73 -3.23 - -4.04 - - - 2.61 -6.8 - - - - - - - - -6.3 - -7.49 - - - - - - -9.18 - - - - - - - - - -
- - 2.54 3.73 3.28 1.76 3.12 - - - - - - - - - - - -1.39 -2.16 - -0.35 - - - -1.47 - 0.03 - - - - - - -3.93 - 1.53 -2.64 - - - - - 0.27 - - - -
- -1.78 4.97 - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - - - - - - -
- - - 3.59 - - 4.97 - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-7.72 - 1.79 4.09 2.71 -4.01 3.75 - -5.0 -3.23 -2.35 - - - - -4.65 - - 2.54 -5.74 - -5.06 - -3.04 -4.89 -4.7 - - 0.05 - - -6.63 - - -9.13 - - - - - - - - - - - - -
AT5G40120 (AGL76)
- -1.22 3.03 3.69 2.28 - 3.67 - - 1.41 - - -0.22 -0.98 - - - - 0.36 - - - - - - - - - 1.69 - -1.98 - - - - - - -2.85 - - - - - - - - - -
AT5G49240 (PRR4)
- -7.37 2.87 4.1 2.4 -3.99 3.47 - - -3.69 -3.77 -2.71 -2.28 - - -6.08 - -4.35 2.7 -5.34 - -6.67 - -8.77 - - - - -5.55 - - - -7.57 - -10.39 - - - - - - - - -6.04 - - - -5.46
- -7.15 3.02 3.92 3.05 -2.55 3.29 -6.65 - -3.21 -3.35 -4.99 0.14 - - -6.03 - -3.98 2.31 -5.43 - - - -11.62 - - - - -7.53 - - - - -8.16 -9.81 - -6.0 -10.43 - - - - - - - - - -3.98
AT5G52460 (EDA41)
- -1.59 1.32 3.48 3.58 2.18 3.93 - - -1.72 - -0.16 - - - - - - -0.82 - - - - - - - - - -1.66 - - - - - - - - -2.55 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.