1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
1.0 0.58 0.24 0.16 0.21 0.13 0.14 0.07 0.1 0.09 0.11 0.0 0.09 0.46 0.7 0.38 0.42 0.3 0.18 0.52 0.35 0.36 0.42 0.32 0.14 0.34 0.41 0.5 0.6 0.1 0.35 0.36 0.31 0.41 0.4 0.36 0.57 0.39 0.41 0.05 0.08 0.49 0.43 0.56 0.31 0.81 0.23 0.29
AT1G04050 (SDG13)
 1.0 0.1 0.07 0.07 0.04 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.05 0.09 0.04 0.03 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.07 0.02 0.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.14 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.09 0.03 0.0 0.26 0.03
AT1G05460 (SDE3)
 0.85 0.31 0.49 0.49 0.31 0.06 0.39 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.2 0.1 0.1 0.11 0.14 0.36 0.11 0.17 0.22 0.15 0.03 0.12 0.03 0.48 1.0 0.02 0.33 0.11 0.11 0.07 0.31 0.14 0.1 0.14 0.02 0.01 0.0 0.05 0.05 0.19 0.09 0.03 0.12 0.09
1.0 0.15 0.26 0.29 0.26 0.18 0.31 0.09 0.1 0.03 0.08 0.47 0.05 0.13 0.61 0.12 0.14 0.12 0.06 0.14 0.13 0.12 0.14 0.11 0.07 0.12 0.19 0.1 0.11 0.08 0.1 0.12 0.18 0.2 0.1 0.18 0.22 0.16 0.2 0.03 0.03 0.13 0.18 0.14 0.13 0.58 0.08 0.1
0.44 0.37 0.12 1.0 0.16 0.08 1.0 0.03 0.11 0.01 0.07 0.01 0.02 0.3 0.54 0.22 0.3 0.13 0.12 0.34 0.28 0.23 0.26 0.19 0.19 0.2 0.26 0.31 0.07 0.23 0.22 0.18 0.18 0.2 0.21 0.2 0.69 0.31 0.54 0.09 0.0 0.17 0.16 0.28 0.14 0.0 0.0 0.16
1.0 0.04 0.1 0.07 0.04 0.02 0.06 0.05 0.07 0.02 0.05 0.42 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.04 0.18 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.08 0.18 0.03 0.02 0.05 0.45 0.21 0.01
0.09 0.21 0.1 0.2 0.06 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.19 0.07 0.06 0.05 0.03 0.31 0.09 0.1 0.16 0.14 0.0 0.09 0.01 1.0 0.86 0.0 0.18 0.07 0.09 0.07 0.23 0.08 0.05 0.14 0.06 0.02 0.0 0.02 0.04 0.24 0.09 0.0 0.06 0.08
AT1G17720 (ATB BETA)
 0.42 0.69 0.49 0.59 0.5 0.46 0.58 0.42 0.39 0.18 0.25 0.01 0.05 0.57 0.3 0.39 0.58 0.56 0.28 0.61 0.42 0.44 0.71 0.39 0.15 0.37 0.69 0.61 0.9 0.08 0.58 0.76 0.28 0.48 0.58 0.44 0.64 0.45 0.35 0.23 0.22 0.63 1.0 0.71 0.95 0.78 0.06 0.63
0.41 0.37 0.17 0.19 0.16 0.09 0.18 0.04 0.06 0.06 0.1 0.0 0.03 0.17 0.12 0.12 0.11 0.06 0.11 0.37 1.0 0.14 0.23 0.17 0.05 0.14 0.08 0.58 0.86 0.04 0.28 0.11 0.1 0.1 0.28 0.11 0.17 0.18 0.12 0.08 0.1 0.12 0.09 0.24 0.1 0.0 0.08 0.14
AT1G26110 (DCP5)
 1.0 0.39 0.37 0.29 0.26 0.13 0.29 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.21 0.24 0.26 0.26 0.13 0.37 0.3 0.27 0.35 0.21 0.11 0.21 0.26 0.41 0.59 0.1 0.34 0.29 0.22 0.3 0.36 0.24 0.31 0.27 0.44 0.2 0.99 0.32 0.33 0.45 0.37 0.33 0.21 0.32
AT1G26760 (ATXR1)
 0.4 0.31 0.09 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.03 0.01 0.01 0.02 0.43 0.02 0.2 0.51 0.1 0.0 0.05 0.0 0.71 1.0 0.0 0.42 0.07 0.08 0.04 0.58 0.08 0.0 0.12 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.4 0.2 0.0 0.0 0.2
AT1G31280 (AGO2)
 1.0 0.12 0.05 0.08 0.06 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.04 0.06 0.04 0.05 0.09 0.06 0.03 0.06 0.07 0.08 0.05 0.07 0.08 0.54 0.04 0.19 0.05 0.03 0.04 0.07 0.06 0.07 0.04 0.07 0.01 0.15 0.07 0.04 0.05 0.04 0.0 0.32 0.03
0.72 0.38 0.4 0.36 0.33 0.19 0.34 0.15 0.06 0.02 0.01 0.0 0.04 0.36 0.22 0.27 0.33 0.36 0.14 0.35 0.25 0.31 0.42 0.28 0.14 0.3 0.28 0.46 0.7 0.1 0.33 0.3 0.24 0.37 0.29 0.36 0.34 0.34 0.34 0.24 1.0 0.37 0.54 0.37 0.66 0.47 0.28 0.36
0.99 0.85 0.89 1.0 0.72 0.38 0.89 0.18 0.18 0.11 0.13 0.1 0.04 0.5 0.41 0.32 0.34 0.39 0.36 0.63 0.39 0.28 0.39 0.32 0.19 0.32 0.43 0.63 0.84 0.21 0.64 0.34 0.28 0.32 0.54 0.2 0.37 0.34 0.46 0.07 0.26 0.33 0.34 0.49 0.37 0.37 0.57 0.39
1.0 0.24 0.32 0.21 0.2 0.04 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.12 0.12 0.07 0.08 0.29 0.14 0.2 0.24 0.16 0.04 0.14 0.02 0.33 0.54 0.05 0.2 0.15 0.11 0.06 0.25 0.1 0.08 0.11 0.12 0.05 0.0 0.03 0.1 0.22 0.11 0.25 0.0 0.1
1.0 0.34 0.19 0.2 0.15 0.13 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.49 0.15 0.43 0.32 0.25 0.33 0.41 0.16 0.19 0.21 0.11 0.2 0.24 0.2 0.48 0.1 0.32 0.23 0.2 0.29 0.2 0.24 0.53 0.27 0.32 0.05 0.04 0.43 0.24 0.13 0.26 0.04 0.19 0.11
AT1G50300 (TAF15)
 0.88 0.37 0.5 0.23 0.36 0.18 0.2 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.22 0.26 0.17 0.17 0.13 0.12 0.46 0.17 0.25 0.36 0.18 0.11 0.16 0.11 0.46 1.0 0.1 0.32 0.29 0.23 0.22 0.38 0.21 0.3 0.27 0.3 0.07 0.07 0.17 0.25 0.71 0.25 0.0 0.41 0.29
AT1G51740 (UFE1)
 1.0 0.26 0.2 0.17 0.22 0.21 0.19 0.27 0.4 0.2 0.25 0.34 0.1 0.21 0.36 0.14 0.24 0.14 0.25 0.22 0.21 0.13 0.18 0.17 0.07 0.14 0.22 0.18 0.53 0.09 0.17 0.15 0.13 0.17 0.16 0.16 0.18 0.19 0.21 0.11 0.05 0.3 0.42 0.2 0.16 0.9 0.04 0.17
AT1G52520 (FRS6)
 1.0 0.59 0.38 0.45 0.41 0.29 0.4 0.06 0.04 0.03 0.02 0.56 0.11 0.44 0.38 0.32 0.39 0.34 0.2 0.59 0.45 0.3 0.35 0.3 0.4 0.3 0.34 0.55 0.9 0.57 0.51 0.21 0.22 0.28 0.36 0.25 0.48 0.29 0.32 0.24 0.14 0.32 0.31 0.41 0.3 0.01 0.33 0.23
1.0 0.33 0.31 0.23 0.2 0.07 0.19 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.2 0.11 0.15 0.16 0.11 0.09 0.27 0.16 0.14 0.21 0.13 0.1 0.13 0.26 0.24 0.6 0.11 0.21 0.14 0.13 0.14 0.2 0.12 0.25 0.17 0.29 0.11 0.34 0.19 0.12 0.27 0.15 0.16 0.48 0.12
1.0 0.35 0.35 0.36 0.33 0.18 0.31 0.03 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.28 0.23 0.2 0.26 0.24 0.1 0.35 0.25 0.25 0.35 0.22 0.09 0.2 0.14 0.33 0.48 0.06 0.34 0.29 0.16 0.2 0.29 0.28 0.22 0.26 0.24 0.06 0.03 0.18 0.45 0.44 0.53 0.91 0.35 0.4
AT2G35350 (PLL1)
 0.31 0.18 0.07 0.06 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.04 0.02 0.03 0.04 0.19 0.08 0.1 0.16 0.16 0.01 0.11 0.03 0.26 1.0 0.0 0.21 0.09 0.05 0.04 0.3 0.11 0.05 0.11 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 0.17 0.11 0.0 0.0 0.06
0.97 0.34 0.14 0.17 0.14 0.17 0.16 0.1 0.07 0.01 0.01 0.11 0.02 0.39 0.49 0.35 0.46 0.34 0.1 0.34 0.24 0.24 0.24 0.43 0.1 0.7 0.49 0.42 0.92 0.03 0.27 0.19 0.24 0.31 0.2 0.32 1.0 0.4 0.45 0.04 0.01 0.31 0.2 0.12 0.27 0.17 0.0 0.06
0.37 0.44 0.23 0.28 0.21 0.2 0.22 0.09 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.46 0.38 0.23 0.36 0.38 0.15 0.42 0.33 0.28 0.42 0.27 0.08 0.28 0.29 0.6 1.0 0.05 0.39 0.31 0.24 0.36 0.34 0.36 0.33 0.33 0.35 0.29 0.46 0.3 0.58 0.41 0.68 0.68 0.36 0.39
0.79 0.19 0.3 0.28 0.19 0.06 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.14 0.08 0.09 0.05 0.03 0.12 0.19 0.11 0.11 0.16 0.13 0.17 0.11 0.21 0.31 1.0 0.13 0.19 0.17 0.08 0.1 0.14 0.08 0.24 0.11 0.31 0.04 0.16 0.1 0.11 0.29 0.16 0.0 0.01 0.15
AT3G48470 (EMB2423)
 0.78 0.55 0.84 0.94 0.54 0.31 0.78 0.17 0.16 0.06 0.1 0.68 0.23 0.31 0.37 0.17 0.19 0.1 0.21 0.5 0.21 0.23 0.33 0.21 0.1 0.17 0.23 0.84 1.0 0.09 0.43 0.23 0.16 0.12 0.35 0.14 0.27 0.23 0.22 0.09 0.04 0.14 0.21 0.67 0.28 0.01 0.38 0.27
AT3G61570 (GC3)
 1.0 0.31 0.26 0.25 0.24 0.22 0.21 0.08 0.04 0.02 0.02 0.02 0.04 0.35 0.49 0.21 0.28 0.18 0.12 0.24 0.25 0.17 0.19 0.24 0.1 0.26 0.71 0.17 0.56 0.06 0.21 0.19 0.17 0.18 0.12 0.28 0.4 0.26 0.29 0.08 0.11 0.3 0.39 0.17 0.25 0.41 0.0 0.18
0.31 0.2 0.19 0.32 0.24 0.33 0.35 0.1 0.08 0.02 0.02 0.0 0.03 0.13 0.34 0.12 0.25 0.16 0.11 0.22 0.3 0.15 0.2 0.17 0.04 0.12 0.04 0.57 1.0 0.02 0.34 0.15 0.1 0.05 0.28 0.12 0.02 0.11 0.01 0.03 0.02 0.05 0.17 0.23 0.2 0.13 0.03 0.14
AT4G15410 (PUX5)
 1.0 0.18 0.26 0.28 0.21 0.11 0.27 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.09 0.06 0.1 0.08 0.09 0.18 0.11 0.08 0.14 0.11 0.15 0.08 0.09 0.26 0.32 0.09 0.22 0.12 0.07 0.07 0.21 0.1 0.1 0.1 0.06 0.07 0.17 0.09 0.13 0.16 0.13 0.05 0.42 0.15
1.0 0.32 0.26 0.16 0.15 0.06 0.14 0.05 0.06 0.06 0.07 0.79 0.07 0.23 0.24 0.2 0.21 0.15 0.28 0.27 0.24 0.19 0.22 0.16 0.24 0.17 0.27 0.4 0.54 0.26 0.24 0.19 0.14 0.13 0.24 0.16 0.26 0.17 0.4 0.44 0.23 0.22 0.15 0.21 0.14 0.34 0.04 0.12
AT4G19490 (VPS54)
 0.24 0.43 0.21 0.11 0.21 0.17 0.09 0.1 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.36 0.3 0.23 0.37 0.32 0.12 0.36 0.4 0.26 0.37 0.25 0.07 0.25 0.23 0.35 0.4 0.04 0.34 0.35 0.21 0.4 0.27 0.34 0.26 0.29 0.29 0.13 0.17 0.39 0.71 0.49 0.64 1.0 0.31 0.41
AT4G21430 (B160)
 0.37 0.41 0.16 0.17 0.11 0.1 0.14 0.02 0.03 0.01 0.01 0.09 0.01 0.26 0.18 0.19 0.22 0.12 0.08 0.38 0.37 0.24 0.31 0.25 0.01 0.23 0.1 0.28 1.0 0.01 0.33 0.16 0.11 0.11 0.23 0.2 0.17 0.17 0.06 0.18 0.03 0.07 0.18 0.28 0.16 0.42 0.02 0.13
AT4G28190 (ULT)
 0.47 0.31 0.4 0.28 0.45 0.31 0.34 0.13 0.09 0.1 0.06 0.0 0.03 0.06 0.1 0.04 0.03 0.02 0.14 0.36 0.12 0.05 0.07 0.22 0.0 0.13 0.0 0.71 1.0 0.0 0.22 0.12 0.08 0.09 0.19 0.07 0.0 0.19 0.03 0.04 0.0 0.03 0.19 0.46 0.09 0.0 0.0 0.2
1.0 0.27 0.52 0.35 0.23 0.05 0.27 0.02 0.12 0.04 0.16 0.0 0.06 0.16 0.12 0.11 0.12 0.07 0.13 0.26 0.14 0.15 0.22 0.11 0.18 0.1 0.1 0.27 0.67 0.16 0.24 0.1 0.11 0.09 0.19 0.09 0.21 0.14 0.2 0.17 0.29 0.06 0.06 0.18 0.1 0.03 0.15 0.08
AT5G04290 (KTF1)
 1.0 0.23 0.04 0.06 0.04 0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.13 0.1 0.09 0.09 0.34 0.11 0.18 0.26 0.13 0.04 0.12 0.05 0.67 0.76 0.03 0.33 0.13 0.08 0.07 0.32 0.17 0.14 0.13 0.07 0.01 0.01 0.04 0.05 0.14 0.14 0.02 0.07 0.04
1.0 0.18 0.19 0.2 0.23 0.23 0.22 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.03 0.11 0.15 0.15 0.08 0.19 0.23 0.11 0.12 0.13 0.08 0.11 0.1 0.13 0.14 0.06 0.28 0.15 0.08 0.1 0.19 0.14 0.11 0.12 0.07 0.01 0.0 0.15 0.18 0.16 0.21 0.25 0.27 0.11
AT5G13390 (NEF1)
 1.0 0.39 0.3 0.31 0.26 0.21 0.35 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.12 0.2 0.26 0.33 0.2 0.4 0.36 0.24 0.35 0.24 0.22 0.22 0.22 0.69 0.97 0.15 0.48 0.33 0.21 0.3 0.39 0.31 0.37 0.28 0.57 0.1 0.16 0.22 0.47 0.38 0.49 0.97 0.07 0.41
0.69 0.48 0.96 1.0 0.89 0.58 0.9 0.12 0.04 0.02 0.02 0.03 0.08 0.31 0.36 0.22 0.2 0.11 0.11 0.37 0.22 0.23 0.28 0.19 0.1 0.22 0.16 0.34 0.11 0.1 0.3 0.27 0.25 0.22 0.22 0.22 0.4 0.25 0.68 0.03 0.03 0.34 0.22 0.41 0.2 0.0 0.18 0.23
1.0 0.45 0.33 0.43 0.26 0.18 0.42 0.04 0.04 0.01 0.02 0.18 0.03 0.3 0.18 0.25 0.3 0.39 0.14 0.45 0.33 0.28 0.39 0.25 0.12 0.22 0.22 0.49 0.61 0.1 0.54 0.35 0.16 0.25 0.55 0.32 0.3 0.3 0.27 0.05 0.06 0.25 0.48 0.48 0.5 0.92 0.26 0.38
AT5G22770 (alpha-ADR)
 0.39 0.43 0.28 0.22 0.19 0.19 0.21 0.23 0.14 0.06 0.06 0.02 0.09 0.41 0.22 0.26 0.31 0.31 0.16 0.4 0.29 0.36 0.44 0.27 0.11 0.29 0.37 0.52 1.0 0.07 0.39 0.4 0.29 0.49 0.38 0.37 0.46 0.35 0.67 0.62 0.92 0.57 0.68 0.51 0.67 0.31 0.32 0.36
0.21 0.22 0.31 0.69 0.34 0.38 0.66 0.62 0.33 0.31 0.12 0.01 0.06 0.15 0.35 0.17 0.13 0.1 0.39 0.25 0.23 0.25 0.3 0.28 0.02 0.22 0.01 1.0 0.99 0.01 0.25 0.13 0.14 0.08 0.17 0.3 0.06 0.22 0.04 0.11 0.0 0.05 0.32 0.46 0.27 0.75 0.21 0.39
0.35 0.24 0.75 1.0 0.66 0.53 0.95 0.48 0.47 0.09 0.16 0.0 0.15 0.29 0.37 0.28 0.36 0.12 0.21 0.17 0.2 0.13 0.13 0.11 0.05 0.12 0.19 0.1 0.35 0.06 0.07 0.13 0.13 0.2 0.08 0.14 0.37 0.19 0.39 0.76 0.14 0.4 0.27 0.14 0.13 0.04 0.08 0.09
AT5G44930 (ARAD2)
 1.0 0.45 0.21 0.01 0.14 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.33 0.15 0.08 0.11 0.51 0.35 0.43 0.29 0.22 0.07 0.22 0.16 0.27 0.7 0.04 0.62 0.28 0.14 0.08 0.21 0.13 0.29 0.16 0.35 0.05 0.02 0.06 0.05 0.26 0.11 0.0 0.0 0.11
1.0 0.35 0.34 0.23 0.25 0.14 0.22 0.04 0.04 0.02 0.03 0.05 0.0 0.23 0.14 0.18 0.2 0.15 0.17 0.3 0.2 0.16 0.21 0.15 0.16 0.16 0.32 0.3 0.25 0.16 0.22 0.22 0.16 0.21 0.19 0.18 0.36 0.19 0.51 0.24 0.13 0.2 0.27 0.32 0.21 0.17 0.16 0.19
AT5G67250 (VFB4)
 0.45 0.23 0.2 0.17 0.18 0.2 0.16 0.15 0.04 0.01 0.01 0.0 0.18 0.17 0.37 0.11 0.12 0.1 0.07 0.26 0.12 0.09 0.11 0.18 0.06 0.16 0.15 0.4 1.0 0.04 0.19 0.12 0.13 0.16 0.18 0.18 0.22 0.13 0.23 0.19 0.1 0.16 0.13 0.18 0.14 0.43 0.29 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)