Heatmap: Cluster_102 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G03880 (CRB)
0.08 0.0 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14 0.02 0.0 0.02 4.23 9032.31 9.48 63.48 3.23 73.23 4320.78 0.13 6.61 0.03 0.42 0.16 0.03 2.78 371.94 0.0 0.0 0.0 0.03 32.05 0.03 0.09 0.0 0.0 0.04
1.38 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 1.48 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 1040.79 0.21 4.52 0.0 20.71 377.22 0.04 0.76 0.0 0.01 0.02 0.0 0.42 22.04 0.0 0.0 0.0 0.0 12.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.66 0.37 3.61 0.79 1.05 0.0 0.0 0.16 0.0 0.43 0.04 0.05 0.16 0.19 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.16 0.11 765.44 0.27 3.84 0.0 0.12 1004.29 0.01 73.43 1.08 1.85 0.03 0.0 0.93 0.31 0.29 0.0 0.0 0.15 6.04 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
AT1G17810 (BETA-TIP)
0.07 0.02 0.0 0.03 0.02 0.07 0.0 0.02 0.03 0.05 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 2.6 1392.88 2.12 11.91 53.92 9.72 1501.95 0.03 2.29 3.44 18.11 0.05 0.0 1.28 38.21 0.21 0.0 0.0 0.13 50.13 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.08 0.09 0.17 0.29 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 34.84 0.01 0.24 0.0 0.0 35.54 0.0 0.1 0.0 0.04 0.0 0.03 0.04 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G70840 (MLP31)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.27 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.16 0.13 0.04 1146.7 0.19 8.84 0.0 0.27 1775.62 0.0 7.72 0.04 0.43 0.32 0.13 0.97 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 8.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
AT1G73190 (TIP3;1)
2.74 0.01 0.12 0.13 0.05 0.05 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.36 2822.64 0.57 13.14 0.61 12.51 2691.69 0.01 13.35 0.44 1.0 0.08 0.3 2.61 43.05 0.02 0.95 0.0 0.13 89.72 0.0 0.0 18.32 0.0 0.0
4.11 0.66 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.62 1.5 7.31 1.56 0.18 0.57 5.08 0.24 1.4 0.15 1.04 459.67 0.99 3.85 0.98 2.2 613.81 0.56 5.61 8.03 5.71 0.06 0.19 0.49 4.05 8.4 4.53 13.3 0.0 20.51 1.67 0.1 0.0 10.01 0.02
AT1G75830 (LCR67)
19.73 0.08 1.86 0.96 4.18 1.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 1.62 0.0 0.0 0.92 4.35 100777.7 21.32 682.91 0.0 0.37 170265.75 1.31 2123.24 1.66 111.81 9.61 1.36 68.35 60.12 0.03 1.38 0.0 3.59 1015.74 0.0 2.4 0.0 0.0 0.0
AT1G77950 (AGL67)
8.25 0.15 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 1.03 0.3 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.92 0.07 123.71 0.14 0.7 0.0 2.63 126.0 0.17 7.37 0.05 0.86 0.0 0.29 0.19 3.03 0.0 0.0 0.05 0.36 6.26 0.97 0.0 0.0 0.0 0.12
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.16 0.05 0.0 0.06 0.5 11773.6 1.87 43.56 0.18 18.14 7671.27 0.22 55.02 0.25 1.0 0.22 0.17 3.52 27.47 0.01 0.0 0.0 0.0 93.21 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 1292.82 0.52 6.73 0.42 32.97 1477.51 0.14 26.8 0.05 0.51 0.04 0.0 0.38 35.75 0.0 0.0 0.0 0.0 25.88 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 870.68 0.0 8.23 0.0 7.78 843.18 0.0 2.7 0.0 0.23 0.04 0.0 0.0 7.57 0.04 0.0 0.0 0.0 27.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G19900 (NADP-ME1)
7.64 0.28 0.51 0.43 0.42 0.15 0.11 0.0 0.09 0.0 0.01 0.97 0.0 0.75 0.05 0.04 0.02 0.0 0.09 0.56 1.11 0.05 0.09 0.29 255.99 0.26 2.32 0.23 5.56 275.98 0.02 4.12 1.72 1.73 0.85 0.0 2.87 5.32 0.01 0.0 0.0 2.62 13.35 0.08 0.0 0.03 0.01 0.01
17.28 1.63 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.48 1.07 4.75 0.89 1.86 0.0 2.11 0.0 0.53 1.07 7.84 15956.75 10.59 97.07 8.86 16.11 21727.85 2.64 218.07 13.85 20.98 0.95 0.51 85.26 199.84 21.34 0.0 2.05 31.61 306.92 0.0 5.44 0.0 0.0 0.0
6.31 0.03 1.52 0.0 0.9 0.21 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.27 2.49 0.0 0.25 0.59 7508.13 1.48 39.25 0.0 0.81 5779.93 0.19 384.14 1.05 8.49 0.21 0.25 1.98 11.53 3.58 1.44 10.79 0.5 78.28 0.0 0.0 0.0 8.37 0.11
AT2G25340 (VAMP712)
1.29 0.0 0.96 0.66 0.7 0.06 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 54.07 0.01 0.46 0.0 0.0 66.26 0.0 0.08 0.06 0.02 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.87 3.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.08 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.66 0.02 3.29 0.3 0.52 0.1 0.0 0.0 0.0 0.19 73.38 0.11 0.29 0.38 0.63 69.72 0.0 0.15 0.01 0.03 0.0 0.04 0.0 0.66 0.02 0.0 0.0 0.0 2.57 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
AT2G41260 (M17)
0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.47 1449.11 1.68 23.35 0.0 2.91 2166.92 0.15 20.5 0.44 5.3 0.08 0.0 2.61 2.51 0.7 0.04 0.0 0.0 17.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.37 0.55 3.64 0.96 6.16 0.25 2.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.0 0.25 0.0 0.3 0.0 0.0 0.6 1.0 0.0 0.0 0.32 1.74 4591.77 2.3 17.54 11.6 6.59 6087.27 0.9 28.65 0.26 0.36 0.59 0.97 7.91 3.11 0.03 0.0 0.0 0.0 106.75 1.55 0.0 0.0 0.83 1.37
AT3G22640 (PAP85)
0.0 0.46 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.04 0.3 0.57 0.03 0.0 0.0 5.66 0.12 0.66 0.0 2.38 5951.63 4.35 31.87 3.58 53.48 6358.06 0.09 16.39 0.18 3.07 0.21 0.05 3.35 61.07 0.91 0.0 0.0 0.06 267.22 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 16.15 0.0 0.0 0.0 0.0 21.92 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.03 0.57 0.0 0.0 0.0 0.22 0.27 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
AT3G48270 (CYP71A26)
0.07 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.03 50.89 0.1 0.46 0.0 1.37 54.22 0.01 5.68 0.0 0.03 0.02 0.02 0.32 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 1.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G09600 (GASA3)
1.84 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 2240.99 0.38 11.21 0.0 2.39 2327.83 0.51 9.85 0.27 1.93 0.08 1.79 1.25 12.23 0.06 0.0 0.0 0.0 56.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G09610 (GASA2)
0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 1043.26 0.19 4.02 0.0 0.23 1219.23 0.33 0.72 0.0 0.3 0.01 0.6 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 53.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G10020 (HSD5)
0.27 0.26 1.46 2.44 1.16 0.74 2.22 1.13 0.07 0.55 0.09 0.12 0.17 0.19 0.09 0.06 0.11 0.02 0.35 0.21 0.09 0.04 0.0 1.32 486.74 1.02 2.25 6.38 11.29 450.28 0.09 10.03 0.35 5.31 0.07 0.19 0.57 15.85 0.74 2.99 0.17 0.12 21.11 0.43 0.04 4.23 0.36 0.15
AT4G15396 (CYP702A6)
0.02 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 114.25 0.03 0.95 0.0 1.21 72.37 0.03 3.9 0.43 0.54 0.01 0.0 0.05 0.79 0.01 0.0 0.0 0.78 1.89 0.05 1.37 0.0 0.0 0.15
AT4G18620 (RCAR7)
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.69 0.0 0.44 0.0 0.0 10.34 0.0 0.78 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.21 1.11 0.27 0.64 0.84 0.41 0.39 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.0 0.03 0.0 0.05 158.05 0.13 0.99 0.52 17.49 113.58 0.0 1.52 1.2 0.88 0.07 0.0 0.08 3.02 0.0 2.62 0.0 0.64 3.25 0.0 0.09 0.22 0.0 0.0
AT4G27140 (AT2S1)
0.74 0.06 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.2 0.0 0.05 0.0 0.52 0.0 0.07 0.13 22.42 14640.45 23.3 194.0 130.73 217.17 8702.09 0.33 8.65 0.25 0.9 0.39 3.74 4.0 409.57 0.01 0.0 0.0 0.0 7.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
AT4G27160 (AT2S3)
1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 57.34 74456.5 88.25 555.33 82.11 1459.75 39527.82 1.48 30.67 0.14 2.97 1.71 0.0 11.88 2131.8 0.0 0.0 0.0 0.54 131.42 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0
AT4G28520 (CRC)
0.39 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.0 2.23 0.0 0.0 0.02 13.48 52586.6 32.37 285.74 2.87 2023.04 18159.39 1.77 28.24 1.03 7.22 1.34 0.03 14.29 1307.71 0.0 0.0 0.0 0.06 28.91 0.02 0.06 0.0 0.0 0.01
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.16 1914.77 0.78 10.56 0.42 1.5 1542.77 0.04 21.84 0.41 0.78 0.2 0.19 0.8 31.67 0.01 0.0 0.0 0.77 26.92 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0
AT5G10000 (FD4)
0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 57.31 0.02 0.4 0.0 0.03 97.41 0.0 0.64 0.04 0.0 0.01 0.0 0.09 0.16 0.01 0.0 0.0 0.49 1.81 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 55.53 0.01 0.51 0.0 1.21 64.72 0.0 1.21 0.14 0.08 0.0 0.02 0.02 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.45 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 121.04 0.03 1.07 0.0 0.15 120.93 0.01 3.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.05 1.12 0.03 0.0 0.0 0.0 3.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G24950 (CYP71A15)
0.0 0.05 0.0 0.11 0.01 0.05 0.0 0.07 0.3 0.11 0.29 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 26.81 0.02 0.13 0.0 0.16 14.8 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.47 0.0 0.0 0.0 0.03 0.73 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01
AT5G25180 (CYP71B14)
0.09 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.13 0.07 0.02 0.1 0.0 0.03 0.02 0.32 61.95 0.4 0.41 0.41 0.14 78.41 0.08 0.38 0.29 0.45 0.02 0.37 0.3 0.53 0.93 0.05 0.0 0.06 3.9 0.02 0.02 13.26 0.0 0.07
0.14 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.46 0.11 0.0 0.0 0.02 0.32 11503.7 2.29 61.65 0.0 0.09 7889.32 0.09 135.86 0.1 1.87 0.22 0.1 3.94 0.46 0.01 0.0 0.0 0.1 182.91 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.91 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.53 1.1 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 168.3 1.19 0.0 0.0 0.98 261.35 0.0 3.12 1.11 0.0 0.08 2.53 4.97 1.29 0.26 0.0 0.0 0.0 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58
2.37 0.23 0.44 0.3 0.53 0.45 0.12 0.41 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.37 0.95 0.45 37.94 6.1 0.19 1.34 2.39 0.53 0.0 0.46 492.33 0.28 4.45 1.14 1.55 581.6 0.17 16.8 0.58 0.63 0.22 0.75 4.86 6.4 1.07 1.92 15.45 0.3 15.31 1.44 0.16 14.52 9.96 0.22
AT5G44120 (CRU1)
0.18 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.58 0.0 0.0 0.8 0.6 0.02 0.18 0.03 36.57 42560.95 50.69 234.63 163.52 203.99 18340.85 0.69 36.8 3.34 24.09 0.82 0.02 5.5 1599.54 0.02 0.0 0.02 0.0 80.59 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
AT5G50600 (HSD1)
0.15 0.03 0.07 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.1 0.07 0.0 0.15 0.02 2.1 0.05 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 1.18 3667.4 2.09 21.11 0.14 28.12 3659.42 0.08 4.2 0.09 0.43 0.1 0.02 2.86 24.26 0.24 0.01 0.0 0.66 127.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01
AT5G50700 (HSD1)
0.15 0.03 0.07 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.1 0.07 0.0 0.15 0.02 2.1 0.05 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 1.18 3667.4 2.09 21.11 0.14 28.12 3659.42 0.08 4.2 0.09 0.43 0.1 0.02 2.86 24.26 0.24 0.01 0.0 0.66 127.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01
AT5G51760 (AHG1)
1.95 0.02 0.49 1.29 0.86 0.06 0.7 0.32 0.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 534.08 0.15 4.35 0.21 2.56 233.05 0.04 8.75 0.23 0.41 0.12 0.04 0.35 3.12 0.03 0.0 0.0 5.42 15.1 0.0 0.24 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 94.09 0.01 0.26 0.0 0.05 104.31 0.0 0.16 0.0 0.0 0.07 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.39 0.19 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.49 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 45.16 0.02 0.22 0.0 0.03 52.43 0.0 0.4 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 2.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.12 0.02 0.08 0.01 0.14 0.26 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 52.99 0.02 0.68 0.0 0.06 94.14 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)