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Heatmap: Cluster_168 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d003176 (GRMZM2G031398)
 -0.97 -1.05 0.04 0.32 0.18 0.42 0.53 0.19 -0.67 -0.38 1.64 0.45 -1.0 0.53 -0.49 -0.74 0.33 -0.12 -0.32 -7.68 -0.81 0.02 0.56 -0.07 -0.11 0.52 -0.13 -0.07 -3.14 1.29 -0.22 -4.73 -1.26 0.01 -0.71 0.89 -0.06
Zm00001d003294 (GRMZM2G323309)
 -2.07 0.66 -0.4 1.07 -0.02 -1.09 -1.9 -0.48 -2.86 -4.73 0.09 -0.27 0.22 0.28 -1.37 -0.44 0.64 0.01 1.57 -5.2 -0.82 -0.37 -0.72 1.16 -0.58 0.27 0.38 -0.08 - 1.75 0.79 - -0.31 0.12 1.23 -0.64 -1.08
Zm00001d003394 (GRMZM2G029001)
 -1.18 -1.03 -0.44 -0.53 -0.21 -0.02 -0.03 0.16 -0.71 -0.65 0.33 0.34 0.22 0.4 -0.4 0.19 0.17 0.09 -0.04 -2.96 0.15 0.21 -0.53 -0.15 0.3 -0.1 0.51 0.44 -0.4 0.64 0.48 0.52 0.06 0.19 -0.12 0.08 0.18
Zm00001d003890 (GRMZM2G136412)
 -1.12 -0.3 -0.08 -0.43 -0.17 -1.21 -0.51 0.26 -1.07 -1.25 0.25 0.13 0.23 0.47 -0.63 0.22 0.54 0.19 0.47 -3.53 -0.58 -0.23 0.24 0.45 0.02 -0.26 -0.42 0.23 -0.09 0.67 0.41 0.06 -0.25 0.74 0.86 0.02 0.18
-0.11 0.07 0.25 0.35 -0.03 -1.21 -1.05 -0.1 -1.53 -1.2 -0.03 -0.61 0.31 -0.14 -0.51 0.09 0.66 0.68 0.56 0.02 -1.37 0.08 -0.65 1.18 -0.06 0.62 -0.05 -0.22 -1.76 1.28 -0.37 -3.06 -1.52 -0.04 1.24 -0.26 -0.11
Zm00001d005308 (GRMZM2G017334)
 -0.87 -0.1 0.63 0.5 -0.1 -1.87 -2.39 -0.31 -2.44 -3.37 -2.5 -1.97 -0.14 -0.41 -1.82 0.63 1.02 0.71 -0.0 -0.02 0.24 -0.19 -0.25 1.04 -0.41 -0.69 1.3 0.51 -0.19 1.47 0.65 -0.12 -0.22 0.23 0.02 -0.86 -0.85
Zm00001d005912 (GRMZM2G168163)
 -0.25 1.26 -0.53 0.79 0.14 -1.46 -1.3 -0.5 -0.65 -0.78 -0.89 -0.2 0.6 -0.07 -0.09 0.52 0.1 1.68 -1.01 -1.46 -0.67 0.16 -0.61 -0.51 0.77 -1.87 1.61 -0.54 -1.3 -0.57 1.19 -3.69 -1.67 0.04 -0.11 -0.41 -0.24
Zm00001d006124 (GRMZM2G022921)
 -0.7 0.39 0.38 0.59 -0.1 -0.43 0.08 0.2 -1.13 -1.05 0.66 -0.07 -0.32 -0.17 -0.52 -0.08 0.55 0.32 0.91 -2.23 -0.84 -0.25 0.54 0.2 -0.09 -0.53 0.5 0.21 -0.05 1.09 -0.01 -1.07 -0.35 0.03 -0.83 -0.06 -0.62
Zm00001d006582 (GRMZM2G067520)
 -0.35 0.38 0.26 -0.59 -0.14 -0.53 0.76 0.06 -1.58 -1.3 -0.19 -0.05 0.5 0.77 -1.19 0.53 0.64 0.46 1.18 -2.21 -1.05 -0.41 -0.37 -0.05 -0.32 -0.51 0.32 -0.35 -2.94 1.39 1.02 -6.47 -0.89 0.26 -0.22 -0.0 -0.27
Zm00001d007823 (GRMZM2G018607)
 0.09 0.46 0.06 0.87 0.21 -0.71 -0.78 -0.18 -1.05 -0.85 -0.03 -0.12 0.71 -0.1 -0.27 0.06 0.19 -0.22 -0.0 -5.71 -0.42 -0.81 0.82 0.34 -0.26 0.43 0.72 0.24 -1.09 0.13 0.34 -2.4 -0.49 -0.05 1.17 -0.15 -0.23
Zm00001d007839 (GRMZM2G042343)
 -0.92 -0.06 -0.2 -1.56 0.15 -2.07 -1.68 0.24 -2.62 -2.66 -0.55 -0.68 0.1 0.5 -0.84 0.72 1.34 -0.02 1.08 -6.5 0.27 -0.0 -0.58 0.44 0.02 -1.13 1.07 -0.0 -0.35 1.7 1.26 -1.95 -1.2 -0.19 -0.54 -0.32 0.28
- - -1.1 2.08 -0.73 -2.0 -1.35 - - - -0.44 -1.05 - -2.46 -5.68 -0.08 -0.24 -5.19 -0.63 -7.7 -1.2 -1.27 - - -1.42 3.76 3.04 - - - -5.65 - -5.04 - -4.58 0.96 1.12
Zm00001d010048 (GRMZM2G006745)
 -1.0 -0.98 0.78 -0.3 0.4 -0.94 -0.22 -0.52 -0.55 -0.16 0.47 0.64 -0.99 0.57 -0.64 0.78 0.32 -0.3 -0.01 -4.09 0.57 -0.25 0.09 -0.33 -0.21 -0.09 0.44 -0.29 0.69 -0.02 0.0 -1.19 -0.73 -0.57 -0.61 0.71 1.22
-3.64 -2.63 1.39 - 0.22 - - 0.26 -0.35 - -0.9 -0.75 - 1.27 -3.77 1.66 - - 2.41 0.74 1.46 - - - -2.72 - -1.03 1.65 - - 1.69 1.28 -0.64 -0.18 -0.52 -1.27 1.26
Zm00001d010294 (GRMZM2G007384)
 -0.49 -0.58 0.18 0.35 0.1 -0.75 -0.58 0.01 -1.28 -1.05 -0.39 -0.3 0.31 0.15 -0.6 0.07 0.53 0.29 0.66 -2.06 -0.17 0.34 -0.22 0.64 0.06 0.24 -0.0 0.28 -2.74 0.93 0.06 -3.1 -0.21 0.07 1.55 -0.1 -0.25
-2.53 0.38 0.77 - 0.15 - - - - -0.94 - 0.29 - - -2.54 -0.66 0.65 -2.25 -0.52 - 0.05 - - -1.1 1.58 - -0.38 -1.34 - 2.94 -0.94 - -1.13 -2.9 1.52 -0.32 3.26
Zm00001d012749 (GRMZM2G118453)
 -0.8 -0.63 0.29 0.92 0.47 0.07 -0.06 0.11 -0.72 -0.29 1.01 0.5 -1.16 0.65 -0.34 -0.35 -0.92 -0.24 0.5 -5.49 -1.32 -1.44 1.83 -1.4 -0.55 -0.76 -0.28 -0.07 - 0.91 0.25 -1.37 -0.87 -0.41 0.6 0.71 0.34
Zm00001d012862 (GRMZM2G399750)
 -2.9 -0.43 -0.32 0.18 -0.28 1.82 0.68 0.69 0.18 0.82 1.51 0.95 -1.61 -1.72 0.09 -0.81 0.05 -0.32 0.32 -9.8 -1.25 -0.51 -0.02 -0.25 -0.49 -0.16 -0.02 -0.92 -0.15 -0.82 -1.06 -2.09 -1.6 -1.26 0.22 0.68 0.87
Zm00001d013402 (GRMZM2G181028)
 -2.45 1.52 -2.13 0.8 -0.1 -2.82 -2.04 -1.78 -2.08 -1.75 -0.4 -1.38 -2.05 -1.0 0.15 -0.67 -0.8 -0.16 0.11 -7.36 -2.59 -1.47 -1.33 -1.3 -2.09 3.0 1.34 -3.22 -4.85 0.66 -0.0 - -4.76 -0.04 2.58 -0.36 0.13
Zm00001d013627 (GRMZM2G379428)
 -0.21 -0.11 0.48 0.12 -0.0 0.08 0.74 -0.01 -1.15 -0.74 -0.89 -0.18 -0.03 -0.43 -0.46 -0.17 -0.08 -0.01 0.65 -2.77 -0.75 -1.31 1.75 -0.24 -0.51 -0.07 0.21 0.01 -1.45 1.31 0.49 -1.95 -1.17 -0.0 -1.09 0.8 0.44
Zm00001d014585 (GRMZM2G168920)
 -0.61 1.09 0.16 0.32 0.32 -1.57 -0.24 0.16 -1.39 -1.3 -0.02 -0.23 0.6 -0.03 -0.62 0.02 0.92 -0.18 -0.02 -4.81 -0.58 -0.14 -0.14 1.12 -0.03 -0.55 1.32 0.33 -1.14 -0.23 0.2 -1.38 0.22 0.24 0.09 -0.43 -0.66
Zm00001d015290 (GRMZM2G147800)
 -0.94 -0.34 -0.04 0.2 -0.22 0.85 1.04 0.44 -0.37 0.09 0.99 0.59 0.09 -0.12 0.02 -0.1 0.38 0.22 0.11 -4.04 -0.88 -0.31 0.45 -0.01 -0.23 -0.36 -0.24 -0.25 -3.98 0.3 -0.25 -2.23 -1.06 -0.86 0.17 0.48 0.78
Zm00001d015319 (GRMZM5G867030)
 -1.46 -1.28 -0.84 0.04 -0.38 -0.46 -0.29 -0.23 -0.97 -1.0 -0.73 0.21 -0.64 0.6 -1.01 -0.23 -0.21 0.65 0.38 0.53 -0.66 -1.21 -0.63 -0.37 -0.64 -0.54 0.4 0.4 0.78 1.46 0.93 0.73 0.65 0.23 -1.19 -0.04 0.46
Zm00001d015450 (GRMZM2G109818)
 0.3 0.24 0.74 0.44 0.0 -1.28 -1.23 0.38 -1.16 -1.03 -0.28 -0.46 0.39 0.01 -0.68 0.18 0.49 0.27 0.36 -1.85 -0.38 0.69 -0.06 0.93 0.14 -0.58 -0.11 -0.46 -0.78 0.93 -0.25 -2.38 -1.32 -0.51 1.52 -0.27 -0.55
Zm00001d016075 (GRMZM2G092154)
 -0.78 -1.52 0.44 0.18 0.48 0.43 -0.01 -0.05 -1.33 -1.23 0.91 0.27 -1.5 0.21 -0.72 -0.12 -0.08 0.31 -0.78 -5.34 -0.73 -0.07 -0.74 0.07 0.04 -0.36 0.87 0.43 0.56 0.86 0.67 -0.41 0.02 0.24 -0.78 0.09 0.57
- - - - - - - - - - - 3.75 - - - 2.2 - - - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - -
Zm00001d018219 (GRMZM2G018757)
 -0.66 0.64 0.74 0.58 -0.06 0.2 0.28 0.11 -1.32 -0.49 0.23 -0.11 -0.34 0.35 -1.14 0.43 1.39 -0.33 -0.26 -7.04 -0.12 0.54 1.02 0.55 0.23 0.28 0.25 -0.28 - -0.49 -0.57 -4.53 -1.0 -0.77 0.45 -0.07 -0.31
Zm00001d018636 (GRMZM2G120572)
 -2.08 -1.27 -0.05 0.14 -0.31 -0.34 -0.66 0.34 -1.51 -1.35 0.21 0.01 -0.19 0.88 -0.35 -0.02 0.64 0.01 0.23 -4.52 -0.85 -0.4 0.04 0.78 -0.39 -0.02 1.14 -0.33 -1.35 1.47 0.33 -0.49 -1.12 0.27 0.83 -0.03 0.34
Zm00001d019363 (GRMZM2G106141)
 -1.52 -1.4 0.43 0.54 0.19 -0.19 -0.3 -0.03 -0.65 -0.39 -0.22 0.38 -0.11 -0.5 -0.54 0.04 0.44 0.26 1.02 -6.77 -0.87 -0.2 0.67 0.3 -0.18 0.64 0.38 0.09 -1.07 1.19 0.2 -1.64 -0.63 0.25 -0.03 0.36 -0.33
Zm00001d019374 (GRMZM2G037882)
 -0.75 1.09 -0.32 0.09 0.11 -5.71 -3.02 -0.4 -2.44 -2.55 -1.77 -1.69 1.06 0.03 -1.34 0.74 -0.16 0.64 1.12 -3.51 0.09 -1.17 -2.38 0.61 -0.41 -0.96 0.54 0.19 0.46 1.77 1.21 -0.37 0.05 1.07 -0.26 -1.66 -1.54
Zm00001d020939 (GRMZM2G006752)
 0.06 -0.33 1.29 1.58 0.86 -0.05 -0.22 -0.35 -0.87 -0.42 1.01 0.03 -1.88 -0.4 -0.34 -0.08 -0.41 -0.28 -0.22 -3.19 -1.67 -1.49 0.49 -0.36 -1.07 -0.12 1.35 0.06 -2.77 -0.64 0.15 -1.32 -0.08 0.29 0.19 0.35 -0.07
Zm00001d023367 (GRMZM2G036685)
 -1.07 -0.56 0.39 0.74 -0.14 -0.62 -1.23 -0.39 -1.27 -1.01 -0.08 -0.14 -0.49 0.18 -0.95 -0.1 0.1 0.33 0.65 -1.78 -0.59 -0.28 0.46 0.28 -0.5 -0.12 -0.04 0.63 0.4 1.15 -0.21 -0.03 0.44 0.48 0.78 -0.13 -0.17
Zm00001d023682 (GRMZM2G081541)
 -0.26 0.48 0.07 0.73 -0.17 -0.19 0.4 -0.19 -0.47 -0.0 1.17 0.52 -0.46 0.4 -0.48 -0.32 0.01 -0.37 0.07 -5.16 -1.2 -0.21 0.53 0.01 -0.26 -0.07 0.4 -0.46 -1.18 -0.06 -0.08 -1.49 -0.99 0.14 1.12 0.28 0.01
Zm00001d023919 (GRMZM2G401561)
 -1.16 -0.16 0.16 0.13 -0.28 -0.84 -0.45 0.04 -0.88 -0.46 0.8 0.29 -0.08 0.12 -0.25 -0.23 1.03 0.23 0.97 -6.23 -1.98 0.2 0.04 1.23 -0.06 1.21 0.13 0.25 -4.05 -0.22 -0.1 -2.84 -0.54 0.15 0.24 0.02 -0.26
Zm00001d023974 (GRMZM2G027431)
 -0.36 -0.15 0.56 0.21 0.09 -0.04 -0.08 0.24 -0.49 -0.15 0.44 0.19 -0.01 0.03 -0.58 0.34 0.06 0.4 1.27 -2.65 -0.72 -0.64 0.09 -0.43 -0.31 0.06 0.53 0.15 -0.07 1.01 -0.43 -4.83 -0.73 -0.3 -0.04 0.19 -0.3
Zm00001d024429 (GRMZM2G087395)
 -1.14 0.15 0.13 0.08 0.08 -0.92 -0.79 0.31 -0.37 -0.38 -1.07 0.2 0.54 -0.31 -0.29 0.74 0.97 -0.18 0.3 -3.84 -0.1 -0.14 0.18 0.83 0.18 -0.24 0.34 -0.08 - 0.53 0.39 -1.0 -0.85 -0.09 1.06 -0.03 0.08
Zm00001d024466 (GRMZM2G027750)
 -1.36 -0.26 0.16 0.38 0.01 -0.87 -0.62 -0.28 -2.28 -1.52 0.28 -0.46 -0.5 0.84 -1.46 0.3 0.76 0.53 0.95 -3.38 0.15 0.3 -0.55 0.58 0.12 0.17 0.1 -0.29 - 2.09 0.29 -2.01 -1.1 0.15 -0.14 -0.59 0.14
- - -3.21 - -0.79 -4.67 - - - - - 1.15 - - - 1.55 -3.36 - 1.64 -4.72 -3.93 3.89 - -4.05 0.07 1.69 - -3.26 - - - - -4.96 - -0.14 -3.8 2.9
Zm00001d025460 (GRMZM2G045280)
 -0.79 -0.15 0.5 0.39 0.07 -0.18 0.4 0.11 -0.89 -0.68 -0.54 0.15 -0.05 0.41 -0.21 0.18 0.06 -0.08 0.8 -3.35 -0.35 -1.42 0.94 0.33 -0.26 0.58 0.19 0.11 -1.58 0.76 0.15 -1.19 -0.84 -0.32 0.57 0.17 -0.07
Zm00001d025538 (GRMZM2G097499)
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Zm00001d032112 (GRMZM2G073988)
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Zm00001d049329 (GRMZM2G063468)
 -1.84 0.27 0.72 0.41 0.19 -0.57 -0.41 0.62 -0.32 -0.02 -0.35 0.53 -0.03 -0.22 -0.4 0.52 0.77 0.07 0.39 -8.6 -0.04 0.29 -0.24 0.64 -0.05 0.26 0.02 0.2 - 0.95 0.18 -4.49 -0.98 -0.36 0.31 0.14 -0.59
Zm00001d049729 (GRMZM2G056573)
 -0.14 0.79 0.46 0.36 0.17 -1.49 -0.91 -0.6 -1.65 -1.42 0.07 -0.53 0.12 0.41 -0.79 -0.08 0.27 0.82 0.7 -0.98 -1.45 -0.76 -0.13 0.17 -0.64 0.48 0.4 0.71 -0.96 0.49 0.3 -2.0 0.72 0.7 0.44 -0.3 -0.47
Zm00001d050104 (GRMZM2G108418)
 -2.9 0.5 0.11 -0.34 -0.68 - - 0.88 - - - -4.31 -0.42 -2.67 -2.84 0.09 2.08 -0.03 0.63 0.68 0.94 0.43 - 1.87 -0.66 -3.26 -0.34 1.99 - -0.86 0.16 -1.49 2.01 0.4 -0.94 -2.66 -2.89
Zm00001d052113 (GRMZM2G115013)
 -1.24 0.13 0.19 0.18 -0.23 -0.13 0.32 0.24 -0.43 0.18 0.64 0.01 0.04 0.08 -0.63 0.0 0.28 0.93 1.06 -1.41 -0.8 0.45 -0.12 0.53 0.03 0.19 -0.33 -0.4 -1.58 0.57 -0.39 -3.44 -1.14 -0.27 0.23 0.16 -0.02
Zm00001d052218 (GRMZM2G405815)
 -0.81 0.26 0.42 0.39 -0.09 0.03 0.22 -0.15 -0.69 -0.24 0.69 0.17 -0.04 0.1 -0.43 -0.08 0.43 0.22 1.12 -5.16 -0.57 -1.02 0.34 0.39 -0.08 0.02 0.64 -0.31 -3.48 0.54 0.48 -3.52 -1.23 -0.58 0.56 0.15 0.18
Zm00001d052847 (GRMZM2G027972)
 - -4.34 -0.69 -1.22 -2.31 0.11 0.56 -0.16 -0.09 0.38 0.38 0.64 -1.6 -0.11 -0.11 -0.41 0.53 0.03 0.04 -1.95 -1.06 -0.78 0.85 -1.08 0.31 -2.16 1.06 -1.5 - -0.39 2.2 - -3.2 2.08 -1.23 0.85 0.38
Zm00001d053555 (GRMZM2G109731)
 -0.04 1.11 0.49 -0.09 0.1 -1.37 -1.22 -0.16 -1.95 -2.08 -0.17 -0.8 0.08 -0.48 -1.27 0.32 0.92 0.87 0.61 -1.3 0.08 0.3 -0.46 0.72 0.09 -0.58 0.76 0.2 -1.46 0.41 0.56 -0.35 -0.34 -0.06 0.12 0.18 -0.94
Zm00001d053848 (GRMZM2G119932)
 -0.71 -0.97 -1.53 -0.07 -0.27 0.27 0.84 0.04 -1.25 -1.0 -0.42 0.14 -0.13 -0.23 -1.14 0.16 -0.04 0.32 0.37 -3.42 -0.12 -0.78 -0.12 -0.1 -0.39 -0.51 0.55 0.05 -0.54 1.9 1.08 0.85 -1.04 -0.26 -1.18 0.09 0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.