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Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Egg cell
Ovary
Ovule
Microspore
Bicellular microspore
Pollen (mature)
Pollen tube
Sperm cell
Pollen tube
Tassels (primordia)
Tassels (anther)
Tassels
Silk
Ear
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (primordia)
Zygote (12 HAP)
Zygote (24 HAP)
Daughter cell (apical)
Daughter cell (basal)
Embryo
Nucellus
Endopserm
Kernel
Kernel (germinating)
Seeds
Embryo Sac
Pericarp and aleurone
Coleoptile (5 day)
Seedling
Internode
Sheath
Shoot (apex)
Shoot
Whole plant
Vegetative Meristem & Surrounding Tissue
Meristem (SAM with Laser capture)
Apical meristem
Stem and meristem
Stems
Stem (Internode)
Leaf
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (seedlings)
Leaf and kernel
Ear (leaf)
Root
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
whole crown root (20-30 mm)
Secondary root
Root, root hairs removed
Root (maturation zone)
Zm00001e000091_P002 (Zm00001e000091)
 -1.73 -2.99 -0.21 -1.28 -3.26 -6.28 - -5.91 - 0.92 0.97 0.49 -1.53 0.25 -0.78 0.61 1.04 -0.25 -0.38 0.64 0.25 0.12 1.63 -2.13 -0.4 0.22 0.36 -0.52 -0.99 -0.53 0.11 0.88 0.77 0.36 -1.04 0.73 -1.66 -1.53 0.92 0.42 0.97 1.15 -0.09 -0.11 -1.93 -1.39 -0.75 -1.73 0.43 0.36 -0.7 -0.08 1.36 0.43 -2.02 0.26 -2.04
Zm00001e000499_P001 (Zm00001e000499)
 -0.76 -1.71 -0.11 -1.31 -4.22 -6.95 - -7.14 - 0.9 1.26 0.47 -0.46 0.1 -1.42 0.21 1.09 -1.35 -1.09 0.36 0.18 0.45 1.35 -0.51 0.05 0.34 0.48 -0.03 -0.78 0.58 0.25 0.25 0.56 0.3 -0.71 0.14 -1.79 -2.71 0.93 0.53 0.48 0.22 -0.13 -0.05 -0.86 -0.53 -0.67 -1.65 0.06 0.38 -0.27 1.06 0.86 0.55 -1.63 0.31 -0.76
Zm00001e000645_P002 (Zm00001e000645)
 0.0 -3.68 -0.09 -0.95 -2.79 -2.06 - -0.71 - 0.71 0.77 0.38 0.26 0.0 -1.32 -0.19 0.65 -1.22 -0.75 0.46 0.24 0.77 1.35 0.04 0.12 -0.04 0.59 0.01 -0.86 0.43 0.19 0.88 0.63 0.21 -0.84 0.35 -1.54 -2.42 0.11 0.37 1.07 1.08 -0.2 0.23 -1.17 -0.72 -0.99 -1.33 -0.01 0.34 -0.63 0.13 1.01 0.18 -2.09 0.01 -1.7
Zm00001e002031_P002 (Zm00001e002031)
 0.2 -2.98 -0.42 -1.09 -5.29 -5.48 - -7.02 - 0.56 1.12 0.11 -0.5 0.0 -0.77 -0.19 0.54 0.5 0.81 0.2 0.02 0.2 0.74 -1.08 -0.19 0.29 0.35 0.37 -0.92 -0.75 -0.04 0.81 0.28 0.29 -1.03 -0.11 -0.85 0.24 0.5 0.54 0.9 0.93 -0.28 0.15 -1.33 -1.15 -1.68 -1.18 -0.22 0.45 0.17 0.73 0.81 0.71 -0.58 0.42 -0.35
Zm00001e002216_P002 (Zm00001e002216)
 -0.11 -2.38 0.01 -1.21 -4.02 -5.37 - -4.85 - 0.47 0.66 0.16 1.07 -0.03 -0.44 -0.15 0.33 -0.5 -0.87 -0.52 -0.74 0.24 1.85 -1.84 0.18 -0.14 0.69 0.94 -1.17 0.83 0.11 1.07 0.81 0.6 -0.97 0.59 -1.09 -1.52 -0.3 -0.03 1.17 1.39 0.12 -0.09 -1.37 -1.04 -0.9 -0.6 0.05 0.25 -0.89 -0.92 0.85 0.13 -1.08 -0.09 -2.04
Zm00001e002761_P004 (Zm00001e002761)
 -0.11 -2.59 -0.22 -3.14 -6.5 -6.9 - -2.94 - 0.98 0.6 -0.12 -0.41 0.3 -0.71 0.08 0.63 0.14 -0.01 -1.43 -2.42 0.74 1.6 -2.47 -0.55 0.58 0.66 -0.09 -0.91 0.07 0.21 0.88 0.7 0.2 -0.74 0.09 -0.97 -1.75 -0.58 0.5 1.07 1.05 -0.29 -0.17 -1.05 -0.64 -0.98 -0.7 -0.11 0.78 0.67 0.05 1.22 0.92 -0.75 0.63 -1.91
Zm00001e003140_P001 (Zm00001e003140)
 -0.53 -1.8 0.03 -1.16 -3.02 -5.65 - -7.09 - 0.73 0.79 0.26 -0.39 0.01 -0.65 -0.04 0.49 0.26 0.28 0.41 0.03 0.38 1.43 -0.59 0.1 0.24 0.53 0.65 -0.79 0.05 0.01 0.85 0.76 0.35 -0.89 0.46 -0.73 -0.64 0.49 0.26 0.94 1.04 -0.13 -0.03 -1.08 -1.02 -1.21 -1.18 -0.58 0.22 -0.44 0.28 0.69 0.11 -1.37 0.11 -0.87
-1.55 -2.04 -0.72 -2.59 -5.54 -6.31 - -2.34 - 0.83 1.1 0.61 -0.84 0.19 -0.5 -0.1 0.48 0.14 -0.25 0.78 0.35 0.34 0.86 -1.51 -0.5 0.49 0.35 -3.21 -0.77 0.32 0.2 1.38 -0.25 0.39 -0.84 0.28 -0.72 -2.2 0.17 0.36 1.3 1.58 0.0 -0.06 -0.96 -0.47 -0.77 -1.24 0.34 0.84 -0.57 -0.18 1.09 0.43 -1.66 0.31 -1.57
-1.34 -2.43 -1.13 -0.09 -3.52 -2.42 - 0.02 - 0.03 0.61 0.34 0.29 -0.08 -0.72 -0.58 -0.4 -1.26 -1.4 -0.87 -1.36 -0.02 0.68 -1.07 -0.13 0.11 0.62 -0.58 -0.94 0.13 0.33 1.71 0.58 0.5 -0.55 0.64 -0.46 -0.54 -0.29 0.39 1.53 1.94 0.04 0.05 -0.62 -0.56 -0.81 -1.26 -0.14 0.29 -0.01 0.03 1.03 0.45 -1.02 0.06 -0.93
-0.32 -2.71 -0.27 -0.89 -4.65 -6.14 - -6.85 - 0.37 0.77 0.57 -0.28 0.04 -1.02 -0.89 -0.04 -1.16 -0.78 -0.41 -0.72 0.21 0.87 -1.0 -0.39 0.85 0.35 -0.47 -0.5 0.04 0.46 1.22 0.67 0.06 -0.5 0.68 -1.3 -1.48 0.35 0.67 0.97 1.2 0.21 -0.28 -0.42 -0.19 -0.9 -0.78 -0.1 0.66 0.07 1.0 0.69 0.6 -0.42 0.72 -0.38
-0.03 -2.03 0.23 -2.71 -6.72 -4.82 - -3.12 - 0.88 0.34 -0.04 -0.16 -0.05 -0.14 0.18 0.4 -1.51 -1.59 -0.03 -0.55 0.38 1.55 0.02 0.54 0.58 0.68 0.22 -0.3 0.93 0.08 1.27 0.45 0.29 -1.0 0.92 -1.07 -2.65 0.06 0.12 1.07 1.43 0.02 0.16 -1.12 -0.93 -1.04 -1.19 -0.18 0.34 -0.87 -0.26 0.88 0.08 -1.65 -0.21 -1.9
-2.85 -3.84 -0.6 -2.29 -3.65 -2.34 - -3.77 - 0.64 0.92 0.5 -0.81 0.18 -0.37 -0.57 0.78 -0.73 -1.25 -0.4 -1.17 0.33 1.91 -0.96 0.06 0.24 0.59 -2.49 -0.69 -0.32 0.29 1.23 0.15 0.73 -0.84 0.2 -0.43 -1.39 0.58 0.69 1.07 1.25 -0.28 0.43 -0.78 -0.7 -1.49 -1.76 -0.17 0.49 0.09 -0.02 1.39 0.85 -1.37 0.41 -1.33
Zm00001e003860_P003 (Zm00001e003860)
 -3.56 -1.51 0.3 -0.95 -4.14 -4.07 - -2.56 - 0.58 0.84 0.7 -0.01 0.15 -1.18 -0.06 0.59 -0.82 0.17 -0.37 -0.92 0.26 1.69 -1.48 -0.12 0.11 0.57 0.42 -1.47 -0.78 0.16 0.87 0.69 0.6 -0.78 0.3 -1.31 -0.85 0.31 0.46 1.07 0.92 -0.13 -0.17 -1.14 -0.86 -1.13 -1.09 -0.06 0.39 0.34 0.5 1.03 0.74 -1.31 0.49 -1.41
-1.23 -5.05 -0.84 -1.82 -6.22 -6.97 - -5.9 - 1.0 0.95 0.08 -0.39 0.46 -0.54 0.25 1.29 -1.39 -1.24 -0.98 -1.09 0.43 1.51 -1.32 -0.15 0.08 0.35 -0.43 -1.5 -0.1 0.45 0.61 1.15 0.53 -0.93 0.32 -1.38 -0.91 0.76 0.83 0.76 0.69 -0.22 0.43 -0.76 -0.42 -1.25 -1.31 -0.21 0.43 -0.34 0.71 1.2 0.81 -1.77 0.7 -0.83
-0.23 -4.12 0.81 -1.2 -3.58 -5.38 - -4.59 - 0.62 0.21 0.13 0.85 0.18 -1.09 0.03 0.65 -1.91 -1.58 1.21 0.79 -0.06 0.6 -1.0 -0.16 -0.04 0.48 0.2 -0.5 1.12 0.2 0.9 0.79 0.3 -0.9 0.38 -0.99 -3.05 0.18 0.51 0.96 0.93 0.18 0.03 -0.95 -0.68 -0.78 -1.07 -0.28 0.54 -0.38 -0.31 0.87 0.45 -0.87 -0.01 -1.82
-0.58 -1.59 0.05 -2.11 -4.52 -5.03 - -2.82 - 1.01 0.4 0.1 -1.54 0.04 -0.65 0.26 0.56 -1.17 -0.52 -0.43 -0.78 -0.03 0.86 -0.93 0.01 0.19 0.33 0.19 -1.04 -0.51 0.09 1.6 0.34 0.45 -1.02 1.05 -1.14 -0.07 0.6 0.48 1.55 1.91 -0.07 0.27 -1.52 -1.22 -0.73 -0.88 -0.14 0.55 -1.2 -0.06 1.02 0.14 -1.66 -0.12 -1.48
Zm00001e004737_P002 (Zm00001e004737)
 -3.13 -2.49 -1.09 -1.17 -2.74 -3.78 - -0.91 - 1.14 0.71 0.46 -1.53 0.29 0.5 0.09 1.13 -2.43 -2.71 -0.37 -1.24 0.49 1.2 -0.77 0.0 0.78 0.32 -1.49 -0.98 0.03 0.14 0.83 0.02 0.66 -0.9 0.66 -0.75 -2.54 0.58 0.69 0.75 0.87 -0.23 0.68 -1.15 -0.86 -1.0 -1.57 -0.12 0.41 0.02 0.62 0.7 0.85 -0.38 0.85 -0.47
-0.9 -2.94 -0.53 -0.6 -3.32 -2.39 - -0.74 - 0.77 1.44 0.39 -0.1 -0.13 -1.07 -0.24 0.42 0.23 -0.12 -0.14 -0.12 0.12 1.21 -0.37 0.33 0.23 0.52 -0.8 -0.63 0.43 -0.03 0.97 0.36 0.38 -1.24 -0.03 -1.03 -0.66 0.14 0.41 0.97 1.19 -0.59 -0.07 -1.63 -1.43 -1.41 -2.16 -0.48 0.4 0.49 0.65 0.77 0.76 -1.54 0.5 -1.12
-0.94 -2.36 -0.66 -0.98 -3.29 -4.17 - -2.41 - 1.46 0.03 0.01 -0.34 -0.07 0.01 0.11 1.31 0.16 0.93 -0.19 -0.0 -0.04 0.58 -0.88 -0.29 0.05 0.23 0.36 -1.47 1.23 -0.17 0.62 0.78 0.11 -0.99 0.34 -1.01 0.9 0.46 0.19 0.77 0.88 -0.28 0.38 -0.89 -0.98 -1.45 -0.96 -0.45 0.15 -0.44 0.33 0.43 0.25 -1.23 -0.25 -0.65
Zm00001e004844_P002 (Zm00001e004844)
 -0.95 -3.05 0.17 -0.79 -3.44 -6.05 - -2.58 - 0.76 0.33 0.05 -0.16 0.14 -0.71 -0.01 0.58 0.68 0.46 0.18 0.46 -0.36 0.29 -1.47 -0.57 0.39 0.23 -0.19 -1.14 -0.14 -0.12 0.8 0.12 0.34 -0.94 0.13 -0.7 0.83 0.53 0.63 0.88 0.89 0.06 0.26 -0.78 -0.68 -0.96 -0.91 -0.66 0.59 0.02 0.46 0.96 0.76 -0.48 0.46 -0.8
-0.04 -3.47 -0.69 -0.35 -3.81 -4.09 - -3.97 - 0.62 0.73 0.4 -0.45 0.07 -1.32 -0.34 0.23 -0.23 -0.76 -0.39 -0.83 0.28 0.67 -1.57 -0.55 0.42 0.43 -0.57 -1.19 -0.33 0.25 1.02 0.47 0.48 -0.66 0.19 -1.19 -0.85 0.13 0.59 1.05 1.08 0.09 0.18 -0.83 -0.53 -0.74 -1.19 0.69 0.66 0.56 0.98 1.21 0.86 -1.08 0.63 -0.61
Zm00001e005410_P001 (Zm00001e005410)
 -0.46 -2.21 -0.87 -0.67 -4.06 -6.23 - -2.84 - 0.43 0.88 0.05 -0.2 0.22 -0.41 -0.61 -0.12 -0.24 -0.65 -0.29 -0.61 -0.19 0.95 -0.65 0.11 0.51 0.64 -0.32 -0.48 0.27 0.56 0.83 0.73 0.43 -0.51 0.47 -1.02 -1.06 -0.31 0.49 0.75 1.01 0.26 -0.03 0.0 0.14 -0.38 -0.48 -0.63 0.88 0.05 -0.29 1.32 0.82 -0.57 0.28 -1.35
Zm00001e005436_P004 (Zm00001e005436)
 -1.35 -2.19 -0.61 -2.48 -5.9 -5.59 - -3.3 - 0.98 1.09 0.27 -0.74 0.12 -1.04 0.18 0.93 -1.61 -1.62 -0.06 -0.53 0.5 1.06 -1.3 -0.3 0.34 0.69 -0.35 -1.46 -0.14 0.27 0.96 0.52 0.38 -0.88 0.1 -1.54 -2.15 0.75 0.89 1.19 1.13 -0.19 0.27 -1.3 -0.84 -0.88 -1.62 0.01 0.56 0.19 1.11 1.07 0.73 -1.15 0.51 -0.92
0.66 -1.83 -0.53 -1.54 -3.91 -2.89 - -4.22 - 0.33 0.85 0.33 0.48 0.04 -1.07 -0.09 0.37 -0.74 -0.17 0.31 0.25 0.29 1.41 -0.45 0.17 0.43 0.6 -0.54 -1.06 0.09 0.13 0.57 1.21 0.11 -0.76 0.17 -1.81 -1.29 0.0 0.15 0.86 0.79 -0.06 -0.47 -1.33 -0.87 -0.59 -0.81 0.31 0.48 0.12 0.35 1.03 0.63 -0.92 0.23 -1.45
-1.81 -3.07 -0.98 -2.73 -6.32 -6.01 - -0.75 - 0.61 0.93 0.44 -0.69 0.2 -0.93 -0.48 0.24 -0.5 -3.51 -2.81 -3.16 0.27 0.27 -1.35 -0.65 0.67 0.34 -0.24 -0.27 -0.06 0.65 1.34 0.64 0.74 -0.49 1.32 -1.12 -0.4 0.03 0.7 1.34 1.49 0.44 -0.22 -0.59 -0.2 -0.68 -0.67 0.5 0.79 -0.18 0.15 1.17 0.54 -1.64 0.11 -1.53
-0.61 -2.04 -0.35 -2.42 -4.06 -5.52 - -1.89 - 1.0 0.72 0.16 -1.21 0.25 -0.35 -0.17 0.46 0.46 -0.35 -0.57 -0.68 0.31 1.4 -1.46 0.09 0.31 0.37 -0.1 -0.47 -1.12 0.34 0.79 0.53 0.78 -0.77 0.72 -0.54 -0.05 0.36 0.44 0.74 0.9 0.16 0.14 -1.17 -0.88 -0.82 -0.72 0.01 0.57 -0.11 0.28 0.84 0.45 -0.66 0.2 -0.5
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0.04 -2.93 -0.12 -3.57 -5.95 -3.45 - -2.72 - 0.83 0.02 0.01 -0.37 0.18 -0.88 -0.08 0.9 -1.02 -0.74 0.12 -0.17 0.35 0.62 -0.39 -0.3 0.05 0.5 -0.6 -1.64 0.55 0.22 0.87 0.64 0.42 -0.72 -0.67 -0.93 0.07 0.34 0.85 1.2 0.95 -0.09 0.53 -0.39 -0.15 -1.02 -1.05 -0.19 0.56 -0.02 0.73 1.15 0.74 -1.47 0.49 -1.22
Zm00001e040638_P002 (Zm00001e040638)
 -1.34 -2.47 0.35 -1.87 -4.49 -2.54 - -5.0 - 0.52 0.16 0.27 -0.94 0.08 -0.93 0.31 0.06 0.15 -0.58 0.54 0.08 0.53 0.86 -0.87 -0.19 0.46 0.48 0.39 -0.14 -0.19 0.09 0.96 0.29 0.59 -0.78 0.34 0.24 0.56 0.38 0.5 0.98 0.99 0.0 0.16 -0.89 -0.85 -1.01 -0.11 -0.58 0.55 -0.42 -0.13 1.01 0.13 -0.37 -0.18 -1.22
Zm00001e040836_P005 (Zm00001e040836)
 -0.6 -2.42 -0.55 -2.11 -4.57 -5.67 - -10.0 - 0.79 0.84 0.04 -0.0 0.29 -0.47 0.22 1.17 -0.27 -0.62 -0.61 -0.73 0.49 1.01 -1.54 -0.38 0.08 0.34 -0.04 -1.38 1.24 -0.09 0.67 0.77 0.23 -0.73 -0.23 -0.8 0.35 0.62 0.4 0.72 0.71 -0.02 0.17 -0.54 -0.51 -1.18 -1.05 -0.4 0.42 -0.13 0.4 1.02 0.59 -0.27 0.3 -0.41
Zm00001e040855_P003 (Zm00001e040855)
 -1.01 -3.32 -0.22 -1.19 -3.44 -3.16 - -8.07 - 0.49 0.54 0.42 0.16 -0.04 -1.57 0.04 0.29 0.04 -1.34 -0.23 -1.03 0.53 1.39 -1.35 -0.5 0.19 0.44 0.01 -0.25 1.08 0.4 0.59 1.21 0.69 -0.63 0.64 -1.31 -2.16 0.24 0.58 0.57 0.63 0.01 -0.78 -0.59 -0.54 -0.67 -0.72 -0.67 0.72 0.15 -0.2 1.87 0.66 -0.96 -0.2 -2.1
-1.5 -3.44 -0.81 -1.96 -5.3 -4.32 - -6.02 - 1.13 0.56 0.01 -0.93 0.15 -0.89 -0.1 0.78 -1.6 -1.33 -1.0 -1.74 0.47 1.71 -0.05 0.35 0.21 0.61 -0.4 -0.29 -0.21 0.44 1.13 0.66 0.27 -0.57 0.47 -0.47 -0.84 0.67 0.42 1.07 1.27 -0.01 0.26 -0.3 0.16 -0.93 -0.84 -0.23 0.48 -0.42 0.12 0.88 0.66 -1.64 0.06 -1.43
Zm00001e041677_P002 (Zm00001e041677)
 -4.72 -5.09 -0.74 -2.17 -4.43 -5.62 - -4.78 - 0.73 0.03 -0.12 -1.05 -0.1 -0.85 -0.32 0.36 -3.48 -2.11 -1.28 -1.49 0.21 0.75 -1.87 -0.68 0.02 0.41 -0.14 -1.23 0.6 0.57 1.22 0.76 0.27 -0.36 0.35 -1.12 -3.01 0.4 0.91 1.26 1.36 -0.04 0.37 0.24 0.37 -0.97 -1.21 0.28 0.92 0.7 1.1 1.11 0.81 -0.77 1.03 -0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.