Heatmap: Cluster_35 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d000137 (GRMZM2G420723)
-0.44 0.86 -0.02 -0.23 -0.37 -1.09 -0.61 0.65 -0.14 0.21 1.17 -0.43 -0.23 -0.54 -0.14 -0.11 1.02 0.68 0.56 -5.56 -0.77 0.61 -0.22 1.3 -0.19 -0.06 -0.28 -0.57 - 0.51 -0.68 -0.75 -1.21 -0.27 0.54 0.07 -1.33
Zm00001d000346 (GRMZM2G039106)
-1.52 -0.97 0.41 -0.6 -0.42 -1.53 -1.48 -0.7 -2.81 -1.9 0.31 -0.71 -1.24 1.02 -1.95 0.37 0.04 1.08 -0.17 -0.09 -1.22 0.05 0.11 -0.88 -0.41 1.08 0.03 0.1 -1.38 2.32 1.16 -2.88 -1.38 1.25 -0.39 -0.41 -0.39
Zm00001d001967 (GRMZM2G061672)
-0.67 -0.04 0.09 -0.72 -0.16 0.2 0.15 -0.09 -0.45 -0.35 -0.16 0.08 -0.52 -0.74 -0.91 0.05 0.07 -0.46 0.23 -3.8 -0.71 0.75 -0.4 -0.11 0.18 0.71 0.03 -0.05 0.21 1.16 -0.58 -0.43 -0.61 -0.21 1.74 0.14 -0.35
Zm00001d002012 (GRMZM2G063328)
-2.81 -0.86 -0.98 -0.12 -0.62 -0.06 -0.09 0.46 -1.32 -0.75 -0.1 -0.19 -0.79 0.33 -0.74 0.12 1.55 0.06 0.15 -7.93 0.26 1.24 0.06 1.18 0.37 -0.12 -0.71 -0.47 -1.89 1.69 -0.09 -1.71 -2.59 -0.17 0.09 0.01 0.35
Zm00001d002385 (GRMZM2G040672)
-3.38 -2.23 -1.75 0.23 -1.1 -0.14 0.82 -0.18 -0.66 -0.57 -0.07 0.31 -0.78 -0.33 -0.41 0.14 1.42 -0.24 0.44 -5.05 0.34 0.81 -1.64 0.31 0.56 0.29 -0.29 -0.44 -2.24 0.92 0.5 -1.71 -1.65 -0.43 1.93 0.42 -0.45
Zm00001d002824 (GRMZM2G062554)
-3.24 -1.68 -1.29 -1.32 -1.02 -2.03 -1.87 -1.1 -2.01 -2.1 -0.59 -0.86 -1.15 0.18 -1.41 -0.29 0.13 -0.87 -0.01 -6.04 -0.09 0.57 -0.74 0.18 0.81 1.83 -1.08 1.34 1.95 -0.32 0.4 1.01 1.18 1.4 -0.47 -0.7 -1.09
Zm00001d003066 (GRMZM2G030275)
-1.7 0.31 -0.55 -0.04 -0.17 -1.15 -1.62 -0.34 -0.7 -0.63 0.03 -0.17 -0.44 -0.58 -0.4 -0.67 -0.24 -0.81 -0.27 -4.84 0.23 -0.66 0.76 0.14 -0.07 -0.49 0.92 0.88 0.06 0.28 0.86 -0.54 1.06 1.05 1.28 -0.27 -0.11
Zm00001d003179 (GRMZM2G053557)
-1.46 -0.49 -0.39 -0.44 -0.35 0.31 0.79 0.45 -0.69 -0.52 0.09 0.16 -0.83 0.25 -0.66 0.49 0.63 -0.11 0.37 -4.73 0.27 0.24 0.69 -0.16 0.56 -0.36 -0.44 0.16 -3.64 0.76 0.68 -0.92 -0.41 0.4 0.35 0.2 -0.29
Zm00001d003525 (GRMZM2G051355)
-0.65 0.5 0.16 -2.41 -0.6 -0.19 -0.66 0.39 0.18 0.35 0.79 0.16 0.27 -0.82 -0.21 0.26 0.92 -0.01 -0.1 -7.55 -0.45 0.86 0.31 0.87 0.57 -1.55 -0.09 -0.56 -0.98 0.9 -0.06 -3.51 -0.88 -0.1 0.7 0.29 -1.16
Zm00001d003540 (GRMZM2G131448)
-1.46 -0.23 0.46 -0.86 -0.17 -0.25 -0.74 -0.49 -0.13 -0.34 0.18 0.18 -1.25 0.15 -0.56 -0.71 -0.21 -0.02 -0.05 -3.68 -0.71 -0.93 0.28 -0.52 0.2 1.41 0.85 -0.44 0.65 0.72 0.82 -2.95 -1.69 0.7 1.59 -0.16 -0.34
Zm00001d003928 (GRMZM2G086267)
-0.69 -0.49 0.46 -0.06 0.35 0.06 0.53 0.41 -0.54 -0.46 0.22 0.25 -0.07 0.7 0.19 0.33 -0.25 -0.58 -0.51 -4.25 -0.28 -1.27 1.47 -0.29 -0.19 -0.48 0.34 -0.35 -0.51 -1.66 0.37 -1.1 -0.81 -0.08 0.5 0.31 0.88
Zm00001d004123 (GRMZM2G125310)
-0.52 -0.13 0.71 -0.74 0.06 0.16 -0.01 -0.35 0.85 0.9 -0.63 0.49 -0.51 -1.32 0.35 -0.26 -0.26 -0.04 0.22 -5.73 -0.83 -1.01 0.6 -0.65 -0.21 0.37 0.62 0.26 -0.63 -0.13 -0.23 -1.96 -0.21 -0.18 1.46 0.53 -0.79
Zm00001d004547 (GRMZM2G480356)
-4.7 -1.81 0.66 -1.43 -0.54 0.4 -0.1 0.06 -2.3 -1.65 -0.62 0.64 -0.3 1.21 -1.8 1.32 1.12 -0.21 -0.15 -1.98 -0.27 -0.64 0.11 0.25 1.23 0.11 -1.18 -0.04 - 1.94 0.21 -1.56 -0.79 0.12 -1.53 0.17 -0.21
-1.15 0.36 0.41 0.15 -0.26 -0.89 -0.22 -0.76 0.66 0.32 -0.63 0.25 0.23 0.46 -0.16 1.01 0.26 -0.93 -0.65 -8.55 0.78 0.19 -1.83 0.08 0.76 1.6 -0.48 -0.86 0.1 -1.1 1.29 -2.73 -1.61 -0.15 -0.76 0.0 -1.46
-2.7 -2.51 0.76 0.19 0.2 -0.05 0.33 0.21 -0.54 -0.83 0.49 0.58 -0.63 0.28 -0.17 0.53 -0.02 -0.59 -0.26 -4.92 -0.53 -0.46 0.63 -0.77 0.05 0.4 0.08 0.01 1.31 0.65 -0.79 -0.96 -1.05 0.4 -0.27 0.17 0.64
Zm00001d005586 (GRMZM2G116004)
0.9 0.73 0.9 -0.36 0.53 -0.66 -0.34 -0.61 -0.72 -0.54 -0.28 -0.04 -0.0 -1.08 -0.23 0.14 -0.23 0.16 0.35 -5.56 -0.88 -1.22 0.77 0.07 -0.03 0.51 0.06 0.22 -2.19 0.02 -0.32 -0.43 -0.15 0.29 1.36 -0.02 -0.49
Zm00001d005858 (GRMZM2G134430)
0.21 -1.13 0.78 -1.08 0.21 -1.25 -1.24 -0.84 -0.92 -1.0 -1.15 -0.46 0.04 -0.58 -0.44 -0.14 -0.74 -0.13 -0.27 -1.11 0.27 0.39 -1.16 -0.48 0.02 0.95 -0.49 0.36 1.82 -0.94 -0.39 0.39 -0.36 -0.32 2.17 -0.45 -0.47
Zm00001d005966 (GRMZM2G137558)
-0.75 -1.08 -0.33 0.02 0.0 -2.74 -2.39 -0.58 -3.72 -3.27 -1.3 -1.4 -0.58 1.15 -1.89 -0.09 0.82 1.19 -0.94 0.98 -0.46 1.98 -1.5 0.21 0.7 0.51 0.34 0.23 -1.22 1.15 0.5 -2.28 -0.33 0.73 0.11 -1.06 -0.89
Zm00001d006204 (GRMZM2G073942)
-1.65 -1.62 0.06 -0.43 -0.26 0.51 0.31 0.41 -0.96 -0.76 -0.27 0.17 -0.9 -0.07 -0.19 0.28 0.09 -0.51 -1.06 -3.5 0.64 0.17 0.96 -0.01 0.55 -0.49 -0.13 0.15 0.17 0.56 0.09 0.8 -0.43 -0.08 0.65 0.05 0.32
Zm00001d007034 (GRMZM2G049347)
0.07 -0.19 1.58 0.65 0.2 -0.41 0.38 -0.62 -0.13 0.48 0.66 -0.11 -0.93 0.48 -0.78 0.59 -0.24 0.24 0.15 -1.23 -1.58 -0.82 0.53 -0.57 -0.16 0.69 -0.58 -0.54 -0.58 0.13 0.64 -3.58 -2.05 0.3 -0.02 0.23 -1.51
Zm00001d007060 (GRMZM5G871572)
-0.71 -0.5 0.5 -0.48 -0.08 0.38 0.86 0.03 -0.45 0.1 0.51 0.31 -0.7 -0.26 -0.4 0.43 0.57 -0.25 0.39 -4.63 -0.05 -0.23 -0.19 0.01 0.41 0.18 0.2 0.15 -2.46 0.61 -0.09 -0.65 -0.33 0.12 -0.41 0.44 0.11
Zm00001d007571 (GRMZM2G135195)
0.53 0.39 -0.15 -0.65 -0.3 -0.04 -1.01 -0.37 -1.32 -0.77 0.95 -0.41 -1.71 0.26 -1.46 0.21 -0.19 0.7 1.04 -5.57 -1.62 -0.72 0.73 -0.98 -0.06 0.97 0.43 0.22 0.51 -0.92 1.17 -0.35 -0.84 1.08 -0.18 -0.4 -0.86
Zm00001d007822 (GRMZM2G322641)
-0.69 -0.44 0.14 -0.39 0.19 -1.54 -1.93 -0.74 -1.14 -1.64 -2.33 -0.51 -0.12 1.18 -0.79 0.18 -0.34 -0.41 -0.59 -2.92 0.72 0.47 0.65 -0.24 0.39 -0.09 0.49 0.15 1.35 0.52 0.38 1.73 -0.7 0.27 -0.59 -0.59 -0.82
Zm00001d009068 (GRMZM2G367001)
-3.25 -1.67 -3.18 0.63 -0.18 -1.64 -0.77 - - - -0.72 -1.02 -2.78 -3.85 -2.6 0.59 1.07 -1.19 -0.05 -2.6 -0.07 0.04 2.21 1.82 -1.37 0.34 - -3.28 - -0.16 -2.51 - -1.96 -5.32 3.62 -1.06 -1.14
Zm00001d010159 (GRMZM2G126010)
-5.01 -2.06 0.36 -0.35 0.13 -1.21 -1.03 -0.86 -2.26 -3.17 -0.72 -0.62 -1.65 0.75 -1.67 -0.21 -1.8 -0.14 -2.23 -7.38 -2.67 -1.15 0.4 -3.02 -0.63 -0.42 1.87 1.99 0.79 -0.94 1.51 -0.8 1.96 1.82 -0.72 -1.12 -0.55
Zm00001d010305 (GRMZM2G100116)
-2.26 -0.75 0.72 -0.3 -0.02 -0.33 0.16 -0.37 -0.03 -0.15 0.43 0.15 -1.15 -0.03 -0.49 0.23 -0.01 -0.43 -0.07 -4.91 -0.46 -0.93 0.62 -0.17 -0.22 0.84 0.08 -0.15 -1.93 1.36 -0.3 -3.23 -0.51 -0.27 2.02 0.24 -0.16
Zm00001d010711 (GRMZM2G060284)
-0.27 0.72 0.04 0.18 -0.01 -0.44 0.03 -1.01 -0.4 -0.57 -0.14 0.02 -0.34 -0.69 -0.38 -0.07 -0.04 0.05 1.01 -0.77 -0.38 -1.69 1.2 -0.16 0.07 -0.1 -0.01 0.04 0.44 0.08 0.26 -1.46 -0.1 0.31 0.8 0.06 -0.32
Zm00001d010859 (GRMZM2G381129)
-0.44 0.43 0.94 0.15 0.22 0.28 0.84 -0.39 0.12 -0.15 0.28 0.37 -1.12 -0.7 -0.68 0.21 -0.14 -0.17 -0.04 -5.83 -0.89 -1.36 0.58 -0.62 0.22 0.47 1.51 -0.17 -2.74 -0.21 0.14 -3.25 -1.23 -0.37 1.23 -0.19 -0.32
Zm00001d011519 (GRMZM2G002297)
-0.48 0.05 1.17 -0.6 0.38 -0.04 -1.04 -0.81 -0.87 -0.7 1.0 0.19 -1.27 0.89 -0.69 0.4 -0.35 -0.12 -0.41 -7.33 -1.11 -1.1 1.47 0.05 0.03 0.25 0.51 -1.11 -1.51 0.18 0.91 -2.51 -1.87 0.62 0.59 0.3 0.16
Zm00001d011624 (GRMZM2G144021)
-0.03 0.35 0.69 -1.61 -0.06 -0.34 -1.35 -0.32 -0.9 -1.29 -0.09 -0.07 -0.13 0.66 -0.54 0.62 -0.24 -0.19 -0.29 -4.87 -0.97 -1.53 0.29 0.01 -0.1 2.03 0.69 -0.26 -0.14 0.13 0.66 -3.46 -1.4 0.33 1.06 0.14 -0.5
Zm00001d011850 (GRMZM2G016827)
-0.54 -0.1 1.02 0.31 0.16 -1.11 -0.82 -0.37 -0.08 -0.33 -1.56 -0.51 0.23 0.5 -0.28 0.36 -0.29 0.33 0.24 -4.64 -0.41 -1.15 -0.76 -0.61 0.21 1.32 -0.4 0.18 -0.99 0.58 0.08 -2.12 -0.22 0.95 1.5 -0.07 -0.84
Zm00001d012590 (GRMZM2G106250)
-1.27 -1.29 0.24 -0.22 -0.1 -0.72 -0.21 -0.64 -2.05 -2.75 -0.02 -0.24 -1.19 1.66 -0.94 -0.13 -0.84 -0.56 -0.98 -7.74 -1.46 -1.71 0.75 -1.25 -0.29 0.63 0.3 0.31 1.03 0.94 1.51 -0.74 0.43 1.13 0.51 -0.3 0.37
-1.12 0.02 -0.43 0.9 -0.64 -2.92 -5.64 0.25 -2.12 -4.28 -3.22 -2.5 0.42 0.54 -1.98 0.36 1.53 -0.54 -0.64 -7.75 -0.88 0.19 1.46 1.73 -0.43 -0.12 -1.59 -1.44 -0.21 -0.17 -0.12 - -2.59 -1.28 2.61 -1.0 0.87
Zm00001d012768 (GRMZM2G700839)
-1.23 0.59 -0.33 0.21 -0.64 -0.48 0.4 -0.14 0.22 0.15 -0.39 -0.03 -0.82 0.44 0.71 -0.8 -0.04 -0.43 -0.38 -1.9 -0.25 -0.84 1.35 -0.68 0.24 0.46 0.13 -0.83 -2.42 -2.97 0.43 0.5 -0.91 0.5 1.65 0.06 -0.66
-3.23 -0.82 -1.36 -1.35 -1.57 -1.31 -2.8 0.5 0.68 0.91 -2.06 0.21 -0.39 -1.54 -0.17 0.23 0.97 0.36 0.23 -5.04 -0.25 1.03 1.16 1.12 0.28 -0.51 -1.31 -1.13 -1.02 1.64 0.16 -0.61 -2.05 -0.86 0.9 0.6 0.19
Zm00001d013360 (GRMZM2G129700)
-0.33 -0.29 0.45 0.58 0.06 0.14 0.12 -0.16 -0.18 -0.12 -0.58 0.26 -0.13 -1.09 -0.18 -0.08 -0.41 0.13 0.23 -2.82 -0.32 -0.94 1.26 0.02 -0.39 0.75 -0.34 -0.23 0.57 0.69 0.07 -1.72 -0.55 0.39 0.56 0.12 -0.9
Zm00001d013431 (GRMZM2G090172)
-1.45 -0.72 0.24 -0.35 -0.45 0.0 0.39 0.2 0.23 -0.03 -0.72 0.02 -0.02 -0.34 0.05 0.33 0.69 -0.39 -0.59 -7.02 -0.11 0.99 -0.25 0.57 0.24 -0.65 -0.1 -0.27 -1.06 0.63 -0.28 -2.16 -0.56 0.0 1.88 0.12 -0.67
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Zm00001d026487 (GRMZM2G104199)
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Zm00001d038204 (GRMZM2G147961)
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Zm00001d038242 (GRMZM2G149145)
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Zm00001d038557 (GRMZM2G440949)
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Zm00001d043382 (GRMZM2G094712)
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Zm00001d051546 (GRMZM2G106795)
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Zm00001d051553 (GRMZM2G147780)
-3.24 -0.94 -1.0 -3.04 -2.37 -0.53 -1.21 0.39 0.1 0.5 -1.49 -0.26 0.31 -0.88 0.17 -0.5 1.16 0.52 -0.09 -9.45 0.9 1.52 -0.1 0.81 0.54 0.48 -2.06 -0.71 -2.26 2.27 -1.35 -2.46 -3.24 -0.47 0.91 0.48 -1.34
Zm00001d051702 (GRMZM2G127548)
0.23 0.21 0.37 0.17 0.26 -2.03 -1.45 -0.7 -0.95 -0.7 -0.64 -0.22 0.04 -0.25 -0.48 0.13 -0.12 -0.07 -0.39 -2.91 -0.74 -0.88 0.43 0.37 -0.35 1.45 -0.14 -0.23 -0.92 0.69 -0.28 -0.62 -0.61 0.19 2.28 -0.36 -0.62
Zm00001d052325 (GRMZM2G089876)
-1.31 0.17 -0.14 -0.65 -0.03 -0.95 -0.23 0.3 0.77 0.68 -0.56 0.42 0.29 -0.64 0.5 0.65 0.77 0.33 0.12 -9.2 0.07 -0.01 -0.46 0.06 0.67 -0.36 0.03 -0.26 -2.15 -0.43 -0.02 -3.2 -1.13 -0.7 1.67 0.24 -0.8
-0.25 -1.05 0.96 0.68 0.61 -1.06 -0.7 -0.33 -0.53 -1.33 -1.69 -0.62 -0.29 0.1 -0.24 0.81 0.48 0.04 -1.37 -6.39 0.52 -0.88 0.65 0.45 0.54 0.64 0.21 -0.62 0.6 0.39 -0.26 -0.36 -1.63 -0.31 0.91 0.07 0.18
0.43 -0.05 0.65 0.9 -0.11 -1.14 -1.28 -1.29 -1.4 -1.48 -0.52 -0.68 -0.18 -0.03 -0.76 -0.18 -0.35 0.16 0.07 0.09 -1.14 -1.13 0.5 0.24 -0.3 0.67 -0.0 0.66 0.64 1.4 -0.46 -0.86 0.32 0.71 0.37 -0.28 -0.55
Zm00001d052660 (GRMZM2G117614)
-1.79 0.1 0.13 -0.45 0.04 -0.7 -0.66 -0.66 -1.27 -0.97 -0.16 -0.45 -0.43 -0.05 -1.22 0.03 0.38 -0.3 -0.93 -7.48 -0.37 0.24 0.46 0.96 0.14 -0.52 -0.41 -0.05 -0.09 1.03 2.4 -4.27 -1.39 0.99 0.57 -0.21 -0.48
Zm00001d052678 (GRMZM2G046574)
-1.22 -0.69 -0.1 0.28 -0.23 -0.36 -0.53 -0.08 -0.36 -0.64 -2.22 0.36 0.33 0.25 -0.68 -0.11 0.21 0.15 -0.83 -5.0 0.29 -0.07 1.43 0.33 0.18 1.18 0.29 0.48 -0.57 0.7 0.05 -1.77 -0.42 0.37 0.46 0.1 -1.0
Zm00001d052947 (GRMZM2G017411)
-2.14 -2.21 -0.42 -1.01 -1.1 -1.37 -1.11 -1.71 -4.11 -3.28 0.97 -0.68 -2.46 1.35 -2.46 -0.25 -1.05 1.0 1.27 -5.18 -0.95 0.33 0.19 -2.02 -0.38 1.93 -2.36 0.31 -0.26 2.54 0.77 -4.13 -1.67 0.89 0.53 -0.5 -1.49
Zm00001d053776 (GRMZM2G119482)
-1.59 0.39 0.65 -0.76 -0.1 -1.24 -2.23 -0.42 -1.99 -1.9 -0.34 -1.4 -1.19 0.89 -1.43 0.4 0.56 0.36 -0.08 -4.94 -0.29 -0.21 0.21 0.33 -0.29 0.94 1.42 0.52 -5.86 0.58 1.59 -8.39 -0.32 0.44 1.41 -0.86 -0.63
Zm00001d053975 (GRMZM2G069486)
-0.35 -0.41 0.01 -0.03 -0.22 -0.02 0.39 0.16 -1.28 -0.79 0.37 -0.2 -0.43 0.3 -0.96 0.4 1.35 0.03 0.1 -3.22 -0.2 0.81 -0.81 0.85 0.48 -0.05 0.1 -0.1 -2.72 1.05 0.06 -2.2 -1.08 0.37 0.11 -0.03 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.