Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-0.35 1.58 -0.45 -4.75 -1.99 -1.44 -1.76 -1.57 -1.26 -2.24 -1.75 - -4.45 1.82 -1.09 -1.37 0.24 -1.41 -1.41 0.35 -2.25 -1.65 -2.41 -0.94 -3.04 -1.36 -1.18 -0.03 3.01 -0.88 3.21 -1.19 -2.09 -0.05 -1.55 -1.74 -0.77 -0.79 0.3 -3.12 - 0.8 -0.59 -0.75 -0.2 1.68 -2.05 -0.91
-0.31 2.02 - - - - - - - - - - - 1.7 -1.05 -4.9 - -3.07 - -0.27 -5.06 - - 2.75 -3.26 0.75 -5.06 - 4.05 -5.79 3.29 -3.26 -3.49 -1.51 -0.94 - - 1.16 -3.47 - - - - - -3.84 - - -
0.6 2.59 -0.9 -0.2 0.67 0.34 -0.41 -3.94 -6.82 -6.41 -5.54 - - 0.79 -3.1 -7.51 - - - -0.21 -6.85 - -4.9 2.46 -2.57 -0.1 - - 4.18 -2.89 2.89 -7.3 -6.2 -2.91 -4.63 -6.48 - -5.0 -5.02 - - -3.91 -6.41 - -5.4 - - -6.5
- 0.62 - - - - -3.65 - 0.36 -3.43 0.87 - 3.82 1.64 -2.22 -4.3 - - - -1.65 - - - 0.41 - -2.53 - - 3.33 - 3.77 - - -3.49 - - - - -5.01 - - - - - - - - -
-1.7 0.27 -1.78 -1.4 0.17 -0.33 -1.19 - -5.49 -3.62 - - -4.97 2.03 -0.14 - - - -5.21 -0.24 - - - 1.36 - -2.73 - - -1.68 - 5.11 - -7.18 - - - - -7.28 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.52 3.05 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - 3.21 1.91 4.23 - - - - - - - - - - - - - -
-1.85 2.71 - - - - - - - - - - - 2.41 -4.61 - -5.76 - -6.45 -1.55 -5.81 - -5.7 2.36 - -0.53 - - 4.22 - 3.46 - - -5.61 - - - - - - - - - - - - - -
- -2.42 - - - - 0.6 - - -0.76 - - - 3.4 - - - - - - - - - 2.02 - - - - 1.32 - 4.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.66 2.17 - - - - - - - - - - - 1.01 - -5.23 - - - -2.47 - - - 1.04 - -2.15 -3.11 - 4.44 - 4.01 - - -6.06 - - - -6.93 - - - - - - - 0.02 - -
-2.81 0.23 -1.36 -1.4 -4.07 - - - -3.84 - - -2.14 - 2.16 - - - - - -4.07 - - -2.49 2.47 - -1.73 -1.34 - 2.02 0.24 4.82 -3.51 -3.42 -2.85 -4.11 - -1.95 -3.92 -1.98 - - - -3.4 - - - - -
-3.63 - -0.22 1.47 -0.84 0.84 1.25 -2.86 -1.7 -3.93 -0.14 1.75 -3.04 -1.25 - - - - -0.86 -5.32 - - - -0.21 - -4.49 - - 4.67 - 2.82 - - -1.79 - - - -7.94 -5.05 - - - - - - - - -
- 0.69 - -3.16 - -5.22 -2.66 - - - - - -4.52 -0.69 -2.67 - - - -2.98 -1.08 - -3.41 - -0.04 - -1.85 -4.62 - 4.02 - 1.45 -1.05 -5.44 1.42 - - - -4.18 - - - 3.39 3.12 -0.16 -2.33 - - -0.19
AT1G73607 (LCR65)
-0.76 2.69 - - - - - - - - -3.96 - - 1.97 - - - - - -1.28 -5.22 - - 1.06 - -1.39 -3.85 -4.74 4.11 - 4.05 - - -5.33 - - - -9.47 -5.75 - - - - - - - - -
-6.29 0.52 - -5.57 - - - - -7.03 - - - - 1.57 -3.27 - - - - -1.45 -7.02 - - 1.08 -7.07 -1.89 -5.11 -5.54 4.94 - 2.99 -8.31 -6.82 -0.88 -10.58 - - -7.83 -0.14 - - -4.66 -3.99 -1.82 -3.12 - - -2.87
- 3.06 -0.83 - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - -1.07 - - - 2.58 -0.76 -1.42 - - 4.25 -1.11 3.33 - - - - -1.36 - - - - - - - - - - - -
AT1G78710 (TBL42)
-3.12 2.47 -1.58 -1.05 -2.6 - -0.46 - - - -5.08 -5.6 - 0.48 1.55 - -3.12 -5.3 -2.99 1.15 - - - 1.96 -5.39 -0.74 -4.86 - 4.21 - 3.27 -2.14 - -5.56 -6.74 - - -5.92 -3.88 -2.62 - -2.98 -1.59 - - - - -2.62
0.66 2.47 - -7.29 - - - -6.21 - - - - - -1.73 - - - -6.0 -5.46 1.11 - - -7.19 2.76 -5.45 0.54 - - 4.19 - 3.42 -7.03 - -5.9 -8.85 -6.25 - -10.65 -8.6 - - - - - - 0.13 - -7.37
3.03 3.64 - - - - - - - - - - - -0.09 - - - - - 0.63 - - - 0.06 - - - - 3.33 - 3.76 - - - -3.19 - - - - - - - - - - - - -
3.1 - - - - - - - - - - - 2.41 - - - - - - 1.94 - - - - - - - - 4.21 - - - - 3.28 -0.42 - - 0.46 - - - - - - - - - -
- 4.49 - - - - - - - - - - - - 3.75 - - - 2.32 2.19 - - - - - - - - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 2.34 - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - -4.33 0.55 - - - 3.42 - 1.07 - - 3.39 - 4.0 - - -2.38 - -2.71 - - - - - - - - - - - -
- 4.52 - - - - - - - - - - 3.81 0.39 - - - - - - - - - 0.49 - - - - - - 2.74 - - 0.61 - - - - - - - - - - - - - -
3.42 4.44 - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - 0.53 - - - -3.08 - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.85 - 0.99 0.3 -0.09 - 0.44 - - - - 0.69 1.89 - - - - -2.18 0.5 - - - 1.5 - -1.61 - - 3.0 - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.32 - - - - - -2.93 -2.72 -2.24 -2.96 2.14 - 2.91 - - - - - -5.87 - - - -3.56 1.58 - -1.52 - 0.59 2.59 4.43 - - - - - -0.35 -5.66 - - - - -0.3 - - - - -3.53
-1.95 -1.16 - - - - - - - - - - - 1.84 - - -0.16 - - -0.54 - -0.39 - 1.01 - -0.48 - - 0.59 -1.76 5.17 - - - -3.85 - - -0.66 - - - - - - - - - -
- -4.93 - -2.42 0.24 1.26 - 2.1 0.84 0.56 1.02 -5.54 -3.12 2.81 - - - - - - - - - -2.15 - -4.45 - - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.53 - 3.53 - 0.73 4.03 - - - - - - - - 0.2 - - - - - - - 0.03 0.8 - - - 3.57 - - -0.79 -0.63 - - - - - - - - - - - - - - -
0.86 3.42 - - - - - - -5.41 - - - - 1.04 - - - -5.36 -6.61 0.46 -5.16 - -4.97 2.17 - -0.52 - - 4.1 - 3.25 - - -3.83 -8.74 - - - - - - -4.04 - - - - - -
- -2.7 - - - - - - - - - - - 3.04 - - - - - -4.11 - - - -0.24 - - - - 2.56 - 5.03 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.85 3.1 -5.84 -5.67 - - - -2.89 -3.63 -3.93 -3.55 -5.77 -2.52 -1.31 -1.4 -5.04 -3.21 -4.38 -3.3 0.92 -4.18 - - 1.49 -2.83 -0.28 -3.7 -3.94 4.15 -2.91 3.23 -3.37 -2.73 -1.42 -6.61 - -5.81 -4.15 -9.03 - - -4.64 -5.55 -4.97 -3.97 - - -2.82
- - 1.27 - 1.86 - -0.76 - - - - -1.35 - 0.02 - -1.42 -0.48 - - -2.35 - - - 1.96 - - - - 4.62 - 3.08 -0.12 - -1.31 - - - -1.36 - - - - - - - - - -
- 1.6 - - - - - - -0.36 - - -0.01 0.29 0.35 1.05 - - - -1.63 -0.95 - - - 2.91 - 0.12 - - 3.71 - 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.46 3.0 - - - - - - - - - - - 1.57 - - - - -2.47 -0.69 - - - -1.65 - - - - 4.17 - 4.04 -4.11 - -4.53 - - - - -7.06 - - - - - - - - -
-2.97 0.87 -0.53 -0.81 0.11 -0.62 -0.69 -3.17 -7.97 -5.18 -7.69 - -2.75 1.42 - -6.74 -4.95 -2.98 -6.41 -2.03 -6.88 -7.59 -7.57 2.12 -8.05 -0.79 -4.92 -6.52 4.37 - 3.57 - -1.72 -0.17 -5.18 - - -2.27 -7.74 -7.45 - -5.06 - -6.97 - - - -7.65
1.14 2.42 -8.17 -6.89 - - - - - - -8.02 -7.16 - 1.73 -1.07 -6.94 - - -6.4 0.51 -5.82 - -6.38 2.59 -8.38 0.28 -4.11 -5.27 3.5 - 4.05 -7.88 - -5.12 -10.81 -6.38 -7.15 - - - - -6.98 -7.89 - -7.88 - - -
-0.34 2.47 -4.68 - - - - -3.3 -4.97 - - 0.36 -3.9 0.23 - -2.48 -1.2 -1.96 -6.58 0.62 - -5.07 -2.3 1.85 -4.04 -0.99 -4.51 - 4.02 - 3.88 -4.44 -4.52 -2.68 -0.92 - -4.81 -2.5 -5.09 - - -3.64 - - -3.54 - - -
AT3G45150 (TCP16)
- 0.56 1.09 - - - - - 2.4 - 2.45 - - - - - - - -1.28 0.05 - - - 1.4 - -0.26 - - 2.43 - 1.23 - -0.56 3.38 -1.37 -0.5 - -2.03 - - - 2.49 0.58 - 0.57 - - -
- 1.61 - - - - - -0.42 - - - - - -0.63 - - - - -0.02 -3.2 - - - 1.51 - - - - 4.87 - 1.82 - - 2.31 - - - -5.3 - - - 0.83 - - - - - -
- -4.21 1.03 0.73 2.38 - 1.81 - 0.65 - - - - 2.71 - - - - -2.18 -0.62 - - - - - - - - - - 4.7 - - -1.01 - - - - -4.1 - - - - - - - - -
1.98 1.48 -2.26 -2.11 -1.97 - - - -3.5 - - 0.53 -5.02 -1.53 -3.1 - - - -3.47 0.45 - - - 1.98 -3.58 -0.55 -3.3 -4.05 3.99 - 3.99 -5.26 -4.43 - -6.04 - -4.06 -7.63 - - - -3.17 -4.11 -3.5 -4.08 - - -5.27
- 1.01 - - - - 1.28 - - - -0.39 - - 0.41 0.73 - - - - -1.3 - - - 3.44 - -0.36 - - 0.01 - 4.69 - - -0.21 - - - -5.87 - - - - - - - - - -
- -2.34 - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - - -4.98 -3.81 - -3.7 2.94 - -0.01 - - 2.05 - 4.81 - - -2.04 - - - -8.25 - - - -2.68 - -3.01 - - - -
-2.57 -3.77 -1.23 -0.73 -2.8 -2.72 0.13 -1.88 - - - 0.09 -1.19 -0.11 - - - - -0.52 -3.47 - - - 1.52 - -0.01 -0.71 -0.63 4.91 - 2.02 - -3.16 0.25 - -2.34 -2.22 -3.77 - - - - - - -0.25 - - -
AT3G61172 (LCR8)
1.0 2.73 - - - - - - -0.6 -1.87 - -4.37 - 3.18 - - - - -1.17 -0.46 - - - 1.86 - 1.27 0.77 - 3.53 - 2.91 - - 0.27 - - - -2.63 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.54 - 0.77 4.6 1.06 3.75 - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.17 - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - 3.34 - 0.31 - - 1.13 - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G11510 (RALFL28)
0.95 3.32 - - - - -3.11 - -3.41 - -4.24 - -4.9 1.69 - - - -4.52 - -0.23 - - - 0.86 - -2.67 -1.52 - 4.1 - 3.6 -5.29 -6.6 -6.43 - - - -7.57 -5.32 - - - - - - - - -
-6.06 -5.81 - - - - - -0.5 - 0.28 - - 5.2 -1.93 - - - - -3.84 -5.57 - - - -0.16 - -2.42 - - 1.6 - 0.03 - -4.39 1.95 - - - -6.22 - - - - - - - - - -
0.81 2.36 - - - - -2.46 - - - - - - 1.25 -2.03 - - - - -0.07 - - - 2.33 - 0.37 - - 3.75 - 4.13 -5.1 - - - - - - - - - - - - - - - -
3.26 0.78 3.72 - - - - - - - - - - 1.94 - - - - - 0.43 - - - - - - - - 3.57 - - - - - 0.42 - - -0.11 - - - - - - - - - 2.06
1.12 3.45 - -3.63 - - - - - - -4.17 - - 1.33 0.28 - - -3.92 - 1.39 - - - -0.09 - -2.7 - - 3.9 - 3.62 - - -3.47 - - - - - - - - - - - - - -
- 1.68 - - - - - - -2.6 - - - 0.89 2.17 - - - - -4.17 -3.12 - - - -0.89 - -2.03 - - 3.93 - 4.41 - - -4.46 -5.16 - -1.4 - -6.27 - - - -2.14 - - - - -3.36
-0.03 -0.34 -1.23 -3.02 -0.7 -1.08 -5.44 -0.43 - -0.97 - -5.83 -0.87 -0.18 -0.1 -0.66 -2.69 -1.36 -0.9 -0.94 -1.9 -1.1 -0.32 -1.66 -2.57 -1.25 0.21 0.55 -0.6 -2.75 -1.1 -0.21 -0.54 -0.06 -0.43 0.43 2.91 0.55 2.51 -2.51 -1.25 1.12 1.68 1.47 0.1 -2.73 0.22 1.0
- 2.62 -1.45 - - - -3.34 - - -1.14 - - - 1.74 -0.32 - -3.05 - -2.39 0.55 - - - -0.24 -3.38 -1.71 -3.1 - 2.68 - 3.61 -0.93 1.47 0.25 -4.98 1.42 - -2.01 -4.04 - - 1.2 -0.88 - 2.21 - - -4.07
-0.26 1.71 -5.75 -6.42 - -6.89 - - - -8.02 - - - 1.94 -3.7 - - - - -0.48 - - - 0.34 -6.91 -3.66 - -4.39 4.52 - 3.85 -8.15 -7.11 -1.65 -6.88 - - -5.27 - - - - - - - - - -
1.07 2.78 -3.1 - - - - - - - - - - 2.07 -2.55 - - - - 0.51 - - - -1.25 - -4.66 - - 3.89 - 4.1 - - -0.64 -8.3 - - - - - - - - - - - - -
-3.69 0.65 -2.29 - - - - - - - - - - 2.98 -1.59 - - - - -2.31 - - - 0.42 -4.69 -3.83 - - 3.21 - 4.73 - - -1.24 - - - -7.72 - - - - - - - - - -
0.19 -2.01 -5.3 -2.16 - - -5.18 - -4.19 -5.55 -2.25 - 3.52 2.03 -3.75 - - - -6.44 -1.37 - - - 0.19 - -2.7 - - 4.44 - 2.8 - -7.23 -3.5 - - - -8.21 -8.68 - - - - - - - - -
-1.25 -1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.54 - - - 1.72 - - 4.15 - 3.24 1.29 - - - - - - - -1.88 - 3.18 - - - - - - 2.18 -
AT4G30064 (LCR61)
- -2.81 - - - - - - - - - - - 3.04 - - - - - -5.35 - - - 2.62 - -1.6 - - 1.99 - 4.85 - - -5.12 - - - - - - - - -1.78 - - - - -3.96
AT4G30070 (LCR59)
2.76 1.85 - -2.4 -3.96 - -2.4 - - - - - - 0.44 0.39 - - -3.95 -2.79 0.52 - - - 1.22 - -1.45 -3.62 - 4.38 - 3.18 - - - -5.81 - - - - - - -2.49 - - - - - -
-2.12 -1.79 -0.59 -2.4 0.2 -2.77 -1.75 -1.92 -1.62 -3.91 -1.67 - 0.81 2.43 - - -2.59 -2.71 - -2.21 - - - 0.5 -2.65 -1.0 -0.84 -0.69 2.25 -4.13 4.22 -1.66 - 0.95 - -0.39 2.04 -0.43 0.65 - - - - - - - -5.51 -2.52
0.01 2.32 - - - - -2.16 - - - - - 3.11 1.19 -2.71 - - - - 0.7 - - - 2.48 - -0.23 -3.91 - 2.82 - 3.94 - - -2.55 - - - -8.18 - - - - - - - - - -
-2.47 2.55 - - - - -3.79 - - - - - - 0.51 - - - - -5.37 -0.27 - - - 2.31 - -0.29 -3.95 - 4.16 - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT5G33340 (CDR1)
-0.31 2.72 - -5.67 - - - - - - - - - 2.08 0.32 - -5.86 - -6.43 1.39 -5.79 - - 0.24 -5.07 -1.04 -4.2 -1.84 2.45 - 4.53 - -8.07 0.81 - - - - -9.42 - - - - - -3.58 - - -
AT5G39270 (EXP22)
- -1.58 -3.99 - - - - - - - - -3.53 - 3.2 - - - - - -4.16 - - - -2.43 - -5.74 - - 4.0 -6.43 4.46 - - - -5.58 - - - - - - - - - - - - -
AT5G39290 (EXP26)
-4.08 0.71 -3.13 - - - - - - - - - - 2.27 - - - - - -4.43 - - - -1.76 - -4.88 - - 4.17 -5.57 4.49 - - -0.95 - - - -8.69 - - - - - - - - - -
- 5.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.39 - - - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.41 - - - - - - -3.69 -3.66 - - - 3.68 - - - - -4.26 -4.19 - - - -4.17 - -5.39 - - -0.52 - 5.07 - -4.58 - -7.37 - - - - -1.28 - - - - - - - -
- 1.41 - 0.08 - -1.92 - - - - - - -0.39 2.32 - - - - -1.57 -3.54 - - - 2.3 - -0.78 - - 1.93 - 4.71 -3.73 - - - 1.05 - -2.02 - - - - - - - - - -
AT5G48905 (LCR12)
-7.91 -0.33 - - - - - - - - - - - 2.51 - - - - - -5.91 - - - 2.72 - -0.5 - - 2.35 - 4.86 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.87 4.14 - -0.56 - -0.91 - - - - - - - -1.78 - - - - - 1.29 - - - -0.2 - - - - 4.08 -2.33 2.89 - - -1.13 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.88 -2.35 -0.74 -1.0 -0.61 -2.46 -1.86 -3.37 -3.98 -6.7 -7.61 -7.35 -4.32 1.5 -3.64 -4.93 -5.32 -6.91 -4.57 -2.93 -7.65 -4.72 -4.48 1.68 -3.83 -1.33 0.32 -1.81 4.51 -6.53 2.63 -5.77 -5.27 -3.91 -6.28 -4.71 -5.25 -2.31 -2.71 -1.37 2.28 -2.71 -4.27 -3.52 -6.42 - - -6.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.