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Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Egg cell
Ovary
Ovule
Microspore
Bicellular microspore
Pollen (mature)
Pollen tube
Sperm cell
Pollen tube
Tassels (primordia)
Tassels (anther)
Tassels
Silk
Ear
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (primordia)
Zygote (12 HAP)
Zygote (24 HAP)
Daughter cell (apical)
Daughter cell (basal)
Embryo
Nucellus
Endopserm
Kernel
Kernel (germinating)
Seeds
Embryo Sac
Pericarp and aleurone
Coleoptile (5 day)
Seedling
Internode
Sheath
Shoot (apex)
Shoot
Whole plant
Vegetative Meristem & Surrounding Tissue
Meristem (SAM with Laser capture)
Apical meristem
Stem and meristem
Stems
Stem (Internode)
Leaf
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (seedlings)
Leaf and kernel
Ear (leaf)
Root
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
whole crown root (20-30 mm)
Secondary root
Root, root hairs removed
Root (maturation zone)
Zm00001e000001_P001 (Zm00001e000001)
 -2.41 -2.58 -1.16 -0.96 -2.71 -2.61 - -3.49 - 1.25 0.86 0.24 -0.47 0.58 -0.68 0.83 0.35 -6.56 -2.91 -2.82 -2.41 0.58 1.39 -1.9 -0.88 -0.68 0.14 -1.12 -1.97 0.1 1.34 0.72 0.87 0.38 -0.03 1.2 -1.4 -3.85 0.66 0.3 0.95 0.72 1.04 0.4 0.61 1.23 0.75 -0.11 0.98 -0.42 -1.9 -0.14 -0.36 0.13 -2.67 -0.92 -1.55
Zm00001e000108_P001 (Zm00001e000108)
 -1.81 -1.74 -1.48 -1.57 -3.94 -4.06 - -4.34 - 0.35 0.09 -0.05 0.07 0.49 1.63 -0.98 -0.44 -0.28 -2.73 -2.95 -2.84 0.03 0.23 -1.52 -0.34 0.04 -0.03 -0.44 -2.4 0.39 0.71 0.83 0.23 0.47 0.38 0.82 0.58 0.57 -0.17 -0.27 0.71 1.1 0.83 0.58 0.76 0.81 -0.35 0.86 0.48 0.24 -0.84 -0.36 0.05 0.48 -0.56 -0.0 -0.46
-0.13 -4.36 -1.09 -1.92 -4.66 -6.14 - -2.23 - 0.1 1.05 0.03 -1.82 0.09 -1.49 -0.87 -0.38 -1.13 -0.38 -1.23 -1.34 0.25 0.13 -1.01 -0.38 -0.12 0.0 -1.55 -1.87 1.49 1.06 0.86 1.39 -0.14 0.57 0.69 -1.35 -1.61 -0.21 0.12 0.59 0.64 0.95 -0.07 1.59 1.62 -0.13 -0.19 0.21 -0.26 0.12 0.3 0.43 -0.12 -0.73 0.15 -0.71
Zm00001e000492_P001 (Zm00001e000492)
 -0.19 -1.76 -0.49 -1.22 -3.91 -4.1 - -5.45 - 0.61 0.72 0.0 -1.39 0.36 -0.22 0.15 0.16 -1.72 0.15 0.35 0.28 -0.27 0.17 -1.62 -0.73 0.1 0.02 -0.43 -1.66 -0.63 0.29 0.91 0.54 0.22 -0.17 0.35 -0.36 0.54 0.64 0.79 0.94 0.86 0.98 0.42 0.26 0.22 -1.27 -0.49 0.18 -0.08 -0.74 0.58 -0.02 -0.13 0.31 0.14 0.72
Zm00001e000552_P002 (Zm00001e000552)
 -1.08 -1.74 -0.54 -1.79 -7.39 -5.95 - -5.11 - 1.22 0.66 -0.15 -0.34 0.36 -0.03 -0.05 1.15 -1.51 -1.31 -0.62 -0.38 0.64 1.03 -0.8 -0.26 -0.06 0.34 -0.98 -1.14 0.61 0.51 0.45 0.93 0.67 0.0 0.5 0.11 -1.7 1.03 0.59 0.71 0.66 0.47 1.07 0.56 0.66 -0.75 -1.23 0.07 0.06 -2.63 0.15 0.41 -0.28 -2.65 -0.74 -0.84
-2.28 -2.28 -0.45 -3.82 -6.6 -7.27 - -7.11 - 1.06 0.18 -0.05 0.55 0.49 -0.82 0.43 0.32 -2.09 -2.74 -2.11 -3.4 -2.49 2.23 -2.93 -0.64 -1.46 0.57 -1.36 -1.73 1.66 1.08 0.93 0.48 0.37 -0.44 0.91 0.57 -1.53 0.01 -0.11 0.8 1.12 0.75 0.47 0.71 1.66 0.57 -0.01 0.32 -0.66 -0.83 -0.84 -0.71 -0.38 -3.14 -0.9 -3.31
-1.31 -3.14 -1.0 -1.33 -4.41 -6.43 - -2.28 - 0.47 0.98 -0.28 0.06 -0.28 -0.97 -1.32 0.46 -1.4 -0.33 -1.09 -1.79 -0.3 0.72 -1.18 -0.05 -0.51 -0.14 -1.21 -2.15 2.7 1.15 0.53 1.76 -0.2 0.51 0.41 -1.25 -0.23 -0.12 0.32 0.66 0.52 0.53 0.35 1.5 1.27 -0.39 -0.34 -0.54 -0.94 -2.7 -0.39 -0.62 -0.68 -1.81 -0.7 -0.99
Zm00001e000712_P001 (Zm00001e000712)
 -2.73 -3.25 -0.74 -0.71 -7.14 -5.94 - -2.8 - -0.19 0.11 -0.08 -1.33 -0.29 -1.25 -0.98 -0.02 -1.09 -1.06 -2.09 -3.4 -0.75 0.91 -0.3 0.58 0.09 1.02 -1.3 0.67 0.5 0.41 0.63 2.07 -0.23 -0.39 0.25 -1.19 -0.24 -1.27 1.05 1.03 0.87 0.57 -0.72 -0.24 -0.1 -0.35 -0.92 -0.57 0.79 0.56 1.1 0.31 0.54 -0.26 1.01 0.58
Zm00001e000876_P001 (Zm00001e000876)
 -0.77 -2.69 -0.01 -1.18 -4.97 -6.72 - -3.92 - 0.56 0.9 0.28 -1.37 0.34 -0.44 0.34 0.4 0.45 -0.1 1.41 1.19 0.29 1.32 -0.9 -0.22 0.07 0.09 -0.81 -1.08 0.71 0.49 0.23 0.75 0.98 -0.91 0.1 -0.39 -0.38 0.99 0.36 0.68 0.39 0.05 0.34 -0.07 -0.05 -0.62 -1.65 -1.21 -0.05 -0.97 0.48 0.58 -0.86 -2.63 -0.98 -1.73
0.04 -2.46 -0.92 -0.28 -4.62 -4.15 - -7.06 - 0.46 1.26 0.83 -0.97 -0.29 -0.96 -0.78 0.18 0.02 -0.08 -1.19 -0.83 -0.03 0.61 -1.12 -0.42 0.21 0.05 -1.93 -0.65 0.64 0.89 0.28 0.31 0.22 0.04 0.51 -0.62 -1.59 0.53 0.61 0.27 0.28 0.51 0.05 0.93 1.09 -0.03 -0.23 -0.35 0.07 -0.15 0.94 0.83 0.27 -0.79 0.12 -0.05
0.57 -2.34 -0.49 -2.38 -6.92 -7.28 - -6.88 - 0.84 1.0 -0.16 -0.84 0.47 0.43 -0.1 0.51 0.76 1.07 -0.26 -0.13 0.03 1.0 -1.34 -0.38 -0.07 -0.2 0.28 -1.56 1.05 0.75 0.41 1.04 0.35 0.65 -0.02 0.07 -0.13 0.56 0.39 0.62 0.27 0.17 0.37 0.27 -0.1 -1.1 -1.81 -1.57 -0.33 -1.9 -0.02 -0.04 -0.83 -0.46 -0.67 -0.2
-0.82 -2.1 -0.7 -1.6 -4.09 -3.85 - -0.8 - 0.29 1.07 0.38 0.57 0.18 -2.11 -0.37 0.09 -1.83 -1.79 -0.35 -1.01 0.08 1.1 -1.11 -0.53 -0.1 0.28 -1.16 -1.62 0.4 1.47 0.76 1.19 0.34 -0.15 1.53 -1.57 -3.82 -0.2 -0.33 0.76 1.15 1.15 -0.27 0.71 1.31 0.82 -0.11 0.52 -0.31 -0.61 -0.49 -0.19 -0.6 -2.39 -0.95 -2.16
Zm00001e001747_P001 (Zm00001e001747)
 -3.15 -2.64 -1.81 -1.36 -4.72 -4.45 - -5.92 - 1.91 0.23 -0.8 0.18 0.34 0.37 0.74 0.35 -0.67 -1.77 -3.72 -3.52 -0.12 0.75 -1.73 -0.64 0.12 -1.06 -1.74 -2.2 0.67 1.58 0.12 0.84 1.55 -0.48 0.62 -0.13 1.49 0.35 -0.01 0.44 0.22 1.34 0.33 1.35 1.77 0.59 -0.91 -0.54 -1.01 -2.95 -1.06 -0.64 -1.43 -5.77 -2.65 -2.42
-1.34 -3.35 -1.79 -1.8 -4.12 -6.1 - -5.55 - 0.89 0.93 -0.2 -1.11 0.36 -0.22 -0.44 0.57 -0.89 -0.44 -1.3 -1.11 -0.25 -0.04 -1.86 -0.86 -0.26 -0.11 -3.68 -3.31 0.39 1.3 1.2 0.74 0.59 0.17 0.83 -0.57 -0.55 0.1 0.63 1.2 1.4 1.0 0.48 1.28 1.61 0.34 -0.41 0.45 -0.3 -1.6 0.0 -0.12 -0.34 -2.39 -0.49 -0.79
Zm00001e002552_P001 (Zm00001e002552)
 -2.23 -1.9 0.17 -2.14 - -7.18 - -6.83 - 0.67 0.44 -0.34 -0.14 0.36 -0.62 0.06 1.14 -1.37 -1.32 -0.86 -1.33 -0.27 0.66 -0.52 -0.23 -0.17 0.19 1.26 -1.65 1.64 0.46 0.28 1.33 0.34 0.06 -0.02 -0.09 1.17 0.63 0.41 0.41 0.23 0.87 0.26 0.33 0.42 -0.35 -0.24 0.0 -0.03 -1.37 -0.57 0.51 -1.14 -1.06 -0.35 -1.39
Zm00001e002883_P001 (Zm00001e002883)
 -2.05 -1.56 -0.92 -2.54 -4.88 -5.41 - -4.55 - 1.06 0.26 -0.01 -0.29 0.43 -0.56 0.08 0.94 -3.68 -2.45 -1.23 -1.18 0.27 1.25 -0.97 -0.17 0.16 0.04 -1.02 -0.93 0.28 0.87 0.3 0.99 0.57 -0.18 1.06 -0.65 -0.99 0.6 0.45 0.62 0.12 0.65 0.45 -0.29 0.1 0.28 0.18 0.58 0.58 -0.29 0.48 0.89 0.45 -1.02 0.38 -1.01
Zm00001e002914_P004 (Zm00001e002914)
 -2.35 -1.65 -0.76 -2.8 -6.1 -6.06 - -4.5 - 0.67 0.06 -0.13 -0.71 0.36 -0.25 0.78 0.59 -1.39 -0.68 -1.52 -1.97 0.06 0.46 -0.23 -0.21 -0.16 -0.02 -0.47 -1.94 1.64 0.91 -0.15 1.56 0.14 0.25 0.88 -0.42 -0.89 0.67 0.35 0.26 -0.29 0.73 0.8 0.69 0.84 -0.26 0.27 0.02 -0.05 -0.86 0.84 -0.85 -0.22 -0.28 -0.3 0.26
Zm00001e003081_P002 (Zm00001e003081)
 -6.56 -1.68 -0.53 -4.9 -5.23 -7.14 - -9.23 - 0.91 -0.32 0.29 -1.03 0.46 0.09 0.68 1.04 -5.29 -3.9 -5.07 -6.07 0.42 0.78 -0.55 -0.31 0.66 0.05 -3.07 -0.51 -1.37 0.38 0.6 0.66 0.61 0.07 0.07 0.41 -1.88 1.41 0.6 0.7 0.81 0.75 0.84 0.14 0.47 -1.71 -0.92 0.06 0.35 -0.24 1.15 0.3 0.51 -0.04 0.35 0.73
-1.59 -0.86 -0.43 -3.56 -4.77 -3.06 - -1.31 - 0.79 0.07 0.22 -0.66 0.36 -0.56 0.47 0.63 -2.02 -2.1 -0.79 -1.67 0.44 0.95 -0.6 0.15 0.2 0.53 -0.48 -0.94 0.56 0.71 1.14 0.55 0.49 -0.47 1.24 -1.02 -3.4 0.49 0.54 1.16 1.42 0.51 0.02 -0.64 -0.06 -0.17 -0.85 0.29 0.26 -0.56 0.19 0.49 0.33 -1.41 0.12 -1.14
Zm00001e003273_P002 (Zm00001e003273)
 0.19 -1.81 -0.51 -1.47 -5.83 -5.4 - -2.77 - 0.32 0.02 -0.0 -1.44 0.22 0.64 0.13 0.68 0.06 -0.11 0.21 0.56 0.06 0.89 -0.37 -0.17 -0.1 0.03 -0.5 -0.45 -0.05 0.48 0.77 0.32 0.3 0.38 0.44 -0.55 -3.34 0.77 0.52 0.57 0.84 0.58 0.58 0.79 0.75 -0.87 -0.68 -0.25 0.08 -0.56 -0.3 0.0 -0.21 -0.73 0.13 -0.42
Zm00001e003401_P001 (Zm00001e003401)
 -2.73 -4.0 -0.31 -2.81 -5.24 -6.06 - -2.38 - 1.52 -0.26 0.03 -0.21 0.74 -0.31 0.55 1.07 -2.44 -2.62 -1.01 -2.05 0.77 1.92 -1.07 -0.41 -0.37 0.13 -0.97 -0.66 0.97 0.56 0.03 0.44 0.62 -0.28 0.76 -0.02 -0.54 1.07 0.51 1.02 0.14 0.18 1.09 0.27 0.76 -0.62 -0.98 0.43 -0.1 -1.45 0.01 0.39 -0.74 -3.36 -0.63 -1.63
Zm00001e003609_P001 (Zm00001e003609)
 -2.56 -3.16 -0.62 -3.27 -5.57 -1.97 - -6.18 - 0.53 0.26 0.12 -0.03 0.11 -0.19 -0.72 0.81 -1.76 -1.53 -2.37 -3.46 -0.17 1.6 -1.24 0.09 0.99 0.27 0.49 -1.41 1.14 0.13 0.75 0.53 -0.25 0.01 0.13 -0.65 0.79 -0.0 0.4 0.38 0.62 0.41 0.49 0.17 0.01 -1.58 -0.92 -0.23 0.4 -0.43 0.52 0.89 0.57 0.25 0.72 0.07
-2.74 -2.88 -0.8 0.56 -3.04 -5.98 - -3.56 - 0.83 0.28 -0.12 -0.21 0.01 -1.05 0.08 0.93 -1.77 -0.85 0.44 -0.01 0.17 0.84 -2.11 -1.15 -0.19 -0.29 -0.71 -1.47 1.8 1.18 -0.3 1.99 0.19 0.35 0.72 -1.36 -0.17 0.73 0.38 0.35 -0.2 0.39 0.08 1.31 1.17 -0.38 -1.19 -0.08 -0.43 -2.61 0.16 0.01 -1.02 -3.22 -0.73 -1.88
Zm00001e004121_P001 (Zm00001e004121)
 -0.35 -3.03 0.28 0.07 -4.73 -4.11 - -0.34 - -0.26 0.28 -0.31 -0.87 -0.01 -0.65 0.1 0.71 0.4 0.38 -0.12 -0.52 0.15 1.19 -1.31 -0.32 -0.55 -0.36 0.48 -1.41 2.37 0.57 -0.65 1.45 -0.89 0.66 -0.08 -1.12 1.32 0.37 -0.53 -0.32 -0.59 0.78 0.07 1.05 1.06 -1.49 0.06 -0.78 -1.09 -2.44 -0.57 -0.69 -2.06 -1.18 -1.29 -0.68
-0.04 -2.39 0.07 -1.47 - -7.03 - -7.04 - 0.04 0.25 -0.01 -0.4 0.09 -0.9 -0.07 0.93 -0.07 -1.2 -1.74 -1.47 -0.2 0.93 -2.36 -1.14 -0.33 0.01 0.25 -2.32 2.66 0.98 -0.1 2.35 -0.76 1.02 0.02 -0.87 -0.05 0.69 0.45 0.43 -0.36 0.67 0.43 1.2 1.16 -1.53 -1.66 -1.78 -1.52 -1.78 -0.83 -1.42 -1.21 -1.05 -1.2 -1.16
-0.72 -3.17 -1.14 -1.58 -3.83 -2.72 - -3.79 - 0.26 0.51 0.03 -0.21 -0.2 -1.29 -0.97 0.39 -2.07 -0.86 -0.36 -0.71 0.24 0.36 0.2 0.65 0.06 0.26 -0.9 -1.39 1.61 0.78 0.69 1.3 -0.38 0.24 0.37 -1.51 -1.41 0.24 0.51 0.82 0.63 0.46 0.26 1.25 1.05 -0.39 -1.32 0.05 -0.3 -0.62 0.93 0.2 0.34 -1.04 0.04 -0.49
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Zm00001e010323_P002 (SYCO ARATH)
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-1.33 -1.73 -0.48 -2.54 - -6.44 - -5.3 - 1.18 0.72 -0.23 -0.27 0.66 -0.42 0.42 0.84 -1.69 -3.36 -0.48 -0.43 0.51 1.18 -1.71 -0.48 -0.07 0.21 -0.79 -1.28 0.65 1.09 0.63 1.4 0.59 0.26 -0.06 -0.77 -2.2 0.89 0.41 0.86 0.78 0.91 0.41 1.09 1.27 -1.05 -2.41 -1.14 -0.23 -2.36 0.31 0.01 -0.29 -2.19 -0.36 -0.73
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Zm00001e039649_P001 (Zm00001e039649)
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0.96 -3.5 -0.19 -2.18 -6.16 -6.62 - -4.68 - 1.03 0.25 -0.51 -1.62 0.16 -0.23 -0.31 0.59 0.68 0.51 -0.02 0.7 0.5 0.53 -0.99 -0.61 0.23 -0.38 -0.28 -1.75 1.2 0.75 -0.13 1.32 -0.03 0.25 0.25 -0.34 0.73 1.06 0.13 0.16 0.03 0.21 0.44 1.01 0.57 -0.3 -0.67 -1.36 -0.69 -2.31 0.78 -0.49 -1.09 -2.11 -1.08 -0.38
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Zm00001e041203_P001 (Zm00001e041203)
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Zm00001e041749_P001 (POLGAMMA2)
 -0.1 -2.0 -0.09 -1.04 -4.2 -6.2 - -5.03 - 1.5 0.27 -0.36 -0.87 0.91 -0.4 0.64 1.38 -0.55 -0.71 0.23 -0.18 0.38 0.77 -1.2 -0.66 -0.53 -0.29 -0.19 -1.9 1.5 0.6 0.06 0.89 0.33 -0.6 -0.19 -0.13 0.14 1.31 0.6 0.6 0.1 0.49 1.23 0.35 0.77 -0.57 -1.68 -0.74 -0.83 -2.81 0.02 -0.53 -1.03 -2.07 -0.95 -1.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.