Heatmap: Cluster_287 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002246 (GRMZM2G091302)
0.5 0.57 0.55 0.7 0.53 0.24 0.4 0.25 0.17 0.13 0.26 0.25 0.42 0.29 0.26 0.52 0.36 0.35 0.59 0.0 0.23 0.26 0.53 0.31 0.43 0.62 0.59 0.25 0.42 0.4 0.43 0.13 0.15 0.32 1.0 0.29 0.21
Zm00001d007422 (GRMZM2G169095)
0.39 0.59 0.56 0.46 0.33 0.04 0.04 0.15 0.1 0.1 0.18 0.16 0.22 0.17 0.14 0.28 0.32 0.26 0.45 0.0 0.1 0.14 0.14 0.28 0.18 0.25 1.0 0.26 0.07 0.37 0.32 0.06 0.18 0.27 0.19 0.19 0.1
Zm00001d007441 (GRMZM2G064366)
0.62 0.41 0.83 0.5 0.41 0.21 0.27 0.2 0.21 0.19 0.21 0.22 0.39 0.42 0.23 0.45 0.25 0.61 1.0 0.08 0.12 0.16 0.2 0.2 0.24 0.35 0.36 0.34 0.47 0.36 0.16 0.16 0.19 0.28 0.36 0.34 0.18
Zm00001d007650 (GRMZM2G134027)
1.0 0.66 0.95 0.58 0.65 0.33 0.3 0.31 0.19 0.2 0.23 0.36 0.4 0.83 0.26 0.55 0.44 0.5 0.61 0.05 0.15 0.46 0.27 0.36 0.41 0.71 0.78 0.41 0.1 0.43 0.36 0.07 0.25 0.4 0.53 0.47 0.58
Zm00001d011849 (GRMZM2G319187)
0.61 0.28 0.12 0.51 0.56 0.11 0.08 0.18 0.14 0.14 0.06 0.15 0.16 0.16 0.27 0.14 0.23 0.28 1.0 0.11 0.28 0.21 0.19 0.23 0.23 0.05 0.29 0.12 0.7 0.02 0.08 0.26 0.05 0.19 0.04 0.14 0.13
Zm00001d012223 (GRMZM2G129065)
0.76 0.64 0.94 0.52 0.53 0.15 0.18 0.25 0.23 0.27 0.4 0.3 0.41 0.3 0.27 0.59 0.34 1.0 0.56 0.12 0.24 0.38 0.29 0.34 0.41 0.32 0.75 0.49 0.76 0.58 0.39 0.4 0.41 0.61 0.53 0.38 0.23
Zm00001d013957 (GRMZM2G035779)
0.39 0.35 0.59 0.63 0.55 0.26 0.26 0.22 0.3 0.3 0.28 0.37 0.21 0.32 0.25 0.47 0.32 0.28 1.0 0.09 0.22 0.12 0.29 0.23 0.25 0.31 0.25 0.2 0.15 0.63 0.27 0.07 0.07 0.22 0.28 0.4 0.51
Zm00001d014783 (GRMZM5G823891)
0.48 0.31 0.83 0.33 0.52 0.57 0.46 0.46 0.22 0.22 0.49 0.39 0.3 0.45 0.32 0.42 0.32 0.6 0.79 0.64 0.24 0.23 0.71 0.49 0.25 0.46 0.43 0.22 0.34 0.37 0.21 0.12 0.16 0.26 1.0 0.48 0.52
Zm00001d015992 (GRMZM2G459755)
0.31 0.34 1.0 0.34 0.43 0.08 0.09 0.1 0.1 0.09 0.29 0.14 0.21 0.27 0.15 0.25 0.19 0.33 0.26 0.01 0.1 0.11 0.17 0.15 0.17 0.39 0.81 0.34 0.07 0.02 0.24 0.07 0.28 0.43 0.52 0.21 0.12
Zm00001d016704 (GRMZM2G073950)
0.39 0.7 0.91 0.56 0.64 0.18 0.19 0.35 0.25 0.22 0.23 0.32 0.52 0.32 0.29 0.59 0.6 0.55 0.81 0.0 0.28 0.33 0.33 0.45 0.56 0.3 1.0 0.41 0.28 0.55 0.46 0.15 0.14 0.5 0.67 0.34 0.23
Zm00001d017119 (GRMZM2G031107)
0.27 0.44 0.92 1.0 0.63 0.12 0.17 0.1 0.18 0.11 0.21 0.16 0.12 0.17 0.15 0.23 0.13 0.26 0.63 0.0 0.03 0.06 0.31 0.12 0.17 0.32 0.53 0.18 0.03 0.24 0.23 0.02 0.11 0.32 0.36 0.25 0.17
Zm00001d018209 (GRMZM2G084086)
0.0 0.01 0.15 0.28 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.03 0.0 0.04 1.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d019957 (GRMZM2G091643)
0.01 0.0 0.11 0.11 0.3 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.47 0.12 0.01 0.24 0.05 0.18 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.09 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.08 0.03
Zm00001d020297 (GRMZM2G016660)
0.96 0.93 1.0 0.89 0.77 0.11 0.15 0.31 0.26 0.26 0.33 0.45 0.67 0.47 0.36 0.55 0.44 0.54 0.63 0.18 0.18 0.34 0.22 0.32 0.52 0.64 0.53 0.46 0.61 0.48 0.28 0.11 0.3 0.54 0.62 0.46 0.27
Zm00001d021506 (GRMZM2G077673)
1.0 0.53 0.47 0.69 0.67 0.2 0.33 0.15 0.22 0.2 0.45 0.31 0.3 0.33 0.27 0.27 0.17 0.43 0.39 0.01 0.09 0.08 0.44 0.13 0.23 0.82 0.74 0.48 0.12 0.36 0.19 0.04 0.23 0.41 0.32 0.42 0.33
Zm00001d021675 (GRMZM2G165681)
0.88 0.91 0.61 0.48 0.45 0.24 0.27 0.41 0.28 0.27 0.29 0.31 0.54 0.26 0.32 0.53 0.47 0.72 0.55 0.1 0.36 0.49 0.38 0.43 0.5 0.26 0.64 0.5 0.39 0.84 0.57 0.31 0.39 0.51 1.0 0.42 0.35
Zm00001d021998 (GRMZM2G097456)
0.24 0.05 0.03 0.58 0.43 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.06 0.0 0.1 0.02 0.0 0.21 1.0 0.58 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.19 0.11 0.3
Zm00001d023220 (GRMZM2G057557)
0.61 0.77 1.0 0.55 0.71 0.11 0.12 0.15 0.29 0.21 0.31 0.29 0.43 0.26 0.31 0.45 0.34 0.54 0.63 0.01 0.21 0.15 0.28 0.34 0.28 0.5 0.61 0.38 0.45 0.44 0.26 0.19 0.2 0.48 0.56 0.38 0.15
Zm00001d023368 (GRMZM2G407189)
0.34 0.4 0.41 0.42 0.3 0.09 0.1 0.13 0.07 0.07 0.12 0.1 0.11 0.22 0.1 0.32 0.52 1.0 0.76 0.04 0.19 0.23 0.18 0.27 0.18 0.38 0.27 0.17 0.0 0.44 0.15 0.06 0.1 0.24 0.11 0.2 0.12
Zm00001d023749 (GRMZM2G015238)
0.68 0.78 1.0 0.71 0.71 0.49 0.5 0.32 0.23 0.28 0.51 0.42 0.54 0.36 0.3 0.42 0.48 0.48 0.57 0.01 0.22 0.26 0.54 0.38 0.38 0.96 0.79 0.41 0.08 0.4 0.32 0.13 0.27 0.28 0.74 0.47 0.3
Zm00001d028474 (GRMZM2G127123)
0.42 0.6 0.43 0.36 0.28 0.21 0.16 0.11 0.14 0.23 0.02 0.09 0.09 0.13 0.12 0.09 0.09 0.4 1.0 0.0 0.06 0.06 0.1 0.05 0.12 0.19 0.13 0.1 0.37 0.45 0.19 0.02 0.02 0.15 0.14 0.16 0.09
Zm00001d029041 (GRMZM2G019991)
0.61 1.0 0.6 0.85 0.43 0.18 0.22 0.28 0.17 0.21 0.31 0.23 0.27 0.37 0.18 0.41 0.49 0.57 0.63 0.14 0.2 0.24 0.25 0.33 0.31 0.28 0.56 0.3 0.08 0.47 0.27 0.05 0.15 0.3 0.28 0.39 0.24
Zm00001d029416 (GRMZM5G866758)
0.37 0.73 0.24 0.25 0.31 0.12 0.1 0.12 0.07 0.06 0.22 0.18 0.22 0.12 0.12 0.27 0.41 0.33 0.35 0.01 0.31 0.15 0.25 0.17 0.36 0.2 1.0 0.42 0.1 0.26 0.36 0.06 0.31 0.33 0.29 0.19 0.16
Zm00001d029861 (GRMZM2G089285)
0.05 0.13 0.2 0.19 0.23 0.01 0.01 0.16 0.03 0.01 0.05 0.02 0.05 0.21 0.03 0.29 0.36 1.0 0.31 0.08 0.11 0.14 0.05 0.3 0.15 0.05 0.09 0.15 0.03 0.23 0.11 0.06 0.12 0.2 0.07 0.06 0.05
Zm00001d030471 (GRMZM2G019673)
0.49 0.34 0.73 0.9 0.49 0.34 0.34 0.25 0.14 0.2 0.34 0.22 0.27 0.46 0.2 0.35 0.63 0.34 0.53 0.0 0.16 0.35 0.28 0.46 0.24 0.43 0.5 0.24 0.07 1.0 0.43 0.01 0.08 0.35 0.31 0.38 0.24
0.05 0.04 0.36 0.39 0.31 0.46 0.34 0.36 0.22 0.31 0.27 0.28 0.36 0.39 0.17 0.35 0.37 0.25 1.0 0.12 0.22 0.33 0.23 0.17 0.23 0.28 0.17 0.13 0.03 0.17 0.18 0.02 0.05 0.13 0.21 0.35 0.29
Zm00001d032734 (GRMZM2G117763)
0.3 0.21 1.0 0.72 0.56 0.24 0.28 0.2 0.27 0.26 0.43 0.33 0.23 0.28 0.23 0.39 0.32 0.5 0.88 0.04 0.12 0.19 0.28 0.24 0.29 0.41 0.49 0.37 0.07 0.37 0.25 0.01 0.24 0.33 0.43 0.41 0.25
Zm00001d033684 (GRMZM2G086003)
0.35 0.54 0.78 0.99 0.91 0.2 0.23 0.32 0.27 0.3 0.51 0.5 0.19 0.41 0.4 0.54 0.44 0.26 0.34 0.03 0.3 0.17 0.45 0.29 0.35 0.54 1.0 0.5 0.1 0.35 0.53 0.33 0.2 0.46 0.13 0.52 0.27
Zm00001d034519 (GRMZM2G062357)
0.1 0.21 0.73 0.23 0.34 0.2 0.2 0.14 0.27 0.22 0.17 0.2 0.01 0.04 0.13 0.09 0.13 0.35 1.0 0.0 0.09 0.1 0.19 0.11 0.1 0.88 0.37 0.13 0.07 0.24 0.22 0.01 0.09 0.23 0.26 0.32 0.2
Zm00001d034834 (GRMZM2G045241)
0.22 0.22 1.0 0.49 0.58 0.38 0.62 0.21 0.31 0.34 0.42 0.36 0.14 0.47 0.19 0.54 0.54 0.71 0.91 0.25 0.3 0.23 0.27 0.22 0.33 0.35 0.38 0.22 0.04 0.93 0.21 0.05 0.09 0.24 0.27 0.4 0.41
Zm00001d036222 (GRMZM2G005499)
0.8 0.17 0.59 0.31 0.62 0.16 0.2 0.12 0.14 0.17 0.08 0.15 0.42 0.37 0.18 0.63 0.27 0.98 1.0 0.05 0.14 0.17 0.21 0.17 0.17 0.18 0.44 0.16 0.0 0.53 0.27 0.08 0.05 0.07 0.09 0.33 0.24
Zm00001d037099 (GRMZM2G085530)
0.85 0.63 1.0 0.83 0.61 0.45 0.43 0.3 0.25 0.32 0.58 0.26 0.37 0.49 0.25 0.6 0.73 0.73 0.82 0.57 0.17 0.48 0.34 0.59 0.34 0.87 0.51 0.37 0.0 0.96 0.48 0.04 0.15 0.37 0.41 0.62 0.32
Zm00001d037305 (GRMZM2G120163)
0.09 0.16 0.77 0.54 0.9 0.35 0.2 0.17 0.23 0.26 0.08 0.28 0.06 0.3 0.24 0.19 0.24 1.0 0.61 0.07 0.15 0.19 0.15 0.18 0.14 0.49 0.21 0.19 0.0 0.19 0.2 0.04 0.05 0.12 0.16 0.38 0.52
Zm00001d037332 (GRMZM2G132373)
0.16 0.14 1.0 0.7 0.59 0.33 0.19 0.12 0.16 0.18 0.33 0.19 0.1 0.51 0.13 0.27 0.24 0.34 0.59 0.0 0.06 0.13 0.31 0.17 0.16 0.3 0.48 0.19 0.15 0.27 0.11 0.04 0.07 0.17 0.22 0.3 0.26
Zm00001d037521 (GRMZM2G002959)
0.6 0.62 0.89 0.79 0.77 0.3 0.33 0.25 0.23 0.2 0.58 0.39 0.35 0.3 0.29 0.38 0.36 0.5 0.41 0.0 0.27 0.24 0.58 0.34 0.46 0.66 1.0 0.45 0.15 0.53 0.53 0.03 0.31 0.53 0.56 0.51 0.35
Zm00001d040061 (GRMZM2G336879)
0.07 0.0 1.0 0.03 0.34 0.01 0.0 0.0 0.31 0.06 0.0 0.02 0.04 0.04 0.14 0.08 0.0 0.14 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.04 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.23 0.14 0.04
Zm00001d042690 (GRMZM2G005444)
0.31 0.32 0.6 0.69 0.5 0.62 0.63 0.28 0.38 0.53 0.51 0.42 0.18 0.23 0.29 0.34 0.29 1.0 0.98 0.65 0.17 0.17 0.48 0.18 0.22 0.43 0.38 0.16 0.1 0.33 0.15 0.08 0.05 0.18 0.71 0.6 0.28
Zm00001d042884 (GRMZM2G014136)
0.39 0.18 0.45 0.75 0.52 0.16 0.17 0.09 0.14 0.12 0.34 0.23 0.07 0.15 0.15 0.15 0.14 0.21 0.26 0.0 0.08 0.07 0.28 0.11 0.17 0.41 1.0 0.26 0.11 0.18 0.17 0.04 0.15 0.32 0.12 0.25 0.19
Zm00001d043490 (GRMZM2G042818)
0.15 0.15 0.93 0.4 0.45 0.07 0.09 0.14 0.21 0.12 0.08 0.14 0.18 0.19 0.15 0.37 0.23 0.41 1.0 0.0 0.16 0.14 0.28 0.13 0.16 0.37 0.48 0.14 0.02 0.14 0.12 0.02 0.02 0.13 0.28 0.23 0.13
Zm00001d043543 (GRMZM2G138152)
0.08 0.11 0.51 0.41 0.31 0.15 0.13 0.13 0.16 0.13 0.16 0.12 0.05 0.18 0.09 0.28 0.12 0.27 1.0 0.0 0.05 0.04 0.11 0.08 0.09 0.11 0.19 0.11 0.11 0.22 0.09 0.03 0.03 0.09 0.07 0.22 0.17
Zm00001d043845 (GRMZM2G085078)
0.29 0.28 0.34 1.0 0.36 0.06 0.05 0.1 0.19 0.15 0.1 0.09 0.05 0.09 0.09 0.12 0.11 0.42 0.63 0.11 0.05 0.06 0.26 0.08 0.08 0.55 0.32 0.19 0.0 0.14 0.19 0.03 0.1 0.11 0.1 0.18 0.34
Zm00001d044175 (GRMZM2G180732)
0.29 0.27 1.0 0.56 0.3 0.05 0.06 0.07 0.12 0.1 0.09 0.12 0.22 0.15 0.14 0.23 0.11 0.25 0.26 0.0 0.06 0.09 0.23 0.1 0.13 0.24 0.21 0.33 0.2 0.25 0.15 0.03 0.19 0.27 0.36 0.19 0.08
Zm00001d044594 (GRMZM2G044448)
0.03 0.03 1.0 0.68 0.34 0.0 0.01 0.01 0.25 0.06 0.0 0.04 0.02 0.13 0.09 0.25 0.0 0.16 0.33 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.29 0.14 0.05
Zm00001d044844 (GRMZM2G003023)
0.31 0.22 0.41 0.28 0.43 0.16 0.17 0.13 0.11 0.11 0.16 0.18 0.2 0.22 0.14 0.29 0.23 0.26 1.0 0.01 0.23 0.2 0.27 0.17 0.15 0.44 0.14 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.03 0.31 0.17 0.24
Zm00001d045251 (GRMZM5G864319)
0.35 0.37 0.5 0.48 0.46 0.28 0.56 0.22 0.17 0.18 0.31 0.25 0.15 0.11 0.21 0.21 0.35 0.56 1.0 0.24 0.12 0.1 0.22 0.2 0.24 0.26 0.61 0.18 0.01 0.37 0.16 0.01 0.05 0.15 0.13 0.35 0.21
Zm00001d045326 (GRMZM2G443985)
0.48 0.48 0.56 0.45 0.58 0.85 1.0 0.35 0.47 0.71 0.58 0.62 0.32 0.4 0.49 0.52 0.79 0.93 0.82 0.09 0.37 0.53 0.82 0.54 0.44 0.73 0.39 0.25 0.04 0.9 0.21 0.06 0.07 0.24 0.55 0.79 0.34
Zm00001d045695 (GRMZM2G058026)
0.01 0.0 1.0 0.97 0.26 0.22 0.21 0.06 0.18 0.19 0.14 0.15 0.01 0.24 0.15 0.16 0.0 0.44 0.44 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.1 0.1 0.03 0.12 0.01 0.02 0.13 0.02 0.04 0.06 0.33 0.1
Zm00001d048154 (GRMZM2G081729)
0.54 0.19 0.47 0.21 0.29 0.15 0.19 0.12 0.16 0.15 0.15 0.18 0.15 0.3 0.17 0.29 0.21 0.39 1.0 0.0 0.11 0.14 0.19 0.15 0.19 0.34 0.16 0.06 0.03 0.1 0.09 0.02 0.03 0.11 0.27 0.24 0.19
Zm00001d048763 (GRMZM2G100118)
0.28 0.25 1.0 0.46 0.51 0.41 0.4 0.21 0.21 0.23 0.31 0.25 0.14 0.41 0.18 0.35 0.27 0.32 0.28 0.01 0.09 0.23 0.16 0.2 0.27 0.53 0.51 0.26 0.02 0.22 0.16 0.02 0.21 0.32 0.29 0.39 0.32
Zm00001d049409 (GRMZM2G020801)
0.53 0.55 0.27 0.36 0.34 0.09 0.08 0.14 0.07 0.07 0.13 0.13 0.21 0.23 0.12 0.21 0.33 0.38 0.5 0.0 0.14 0.27 0.14 0.28 0.26 0.34 1.0 0.41 0.08 0.44 0.33 0.01 0.24 0.37 0.35 0.2 0.17
Zm00001d050395 (GRMZM2G095552)
0.58 0.59 0.68 0.46 0.46 0.19 0.22 0.14 0.17 0.11 0.17 0.22 0.3 0.26 0.19 0.55 0.25 0.38 1.0 0.01 0.15 0.13 0.23 0.16 0.19 0.19 0.46 0.22 0.28 0.12 0.12 0.09 0.11 0.18 0.37 0.28 0.26
Zm00001d051447 (GRMZM2G137029)
0.33 0.21 0.73 0.86 0.6 0.13 0.24 0.21 0.22 0.29 0.26 0.31 0.26 0.43 0.23 0.48 0.22 0.4 1.0 0.02 0.22 0.17 0.13 0.17 0.27 0.28 0.4 0.3 0.18 0.24 0.22 0.41 0.21 0.2 0.29 0.31 0.32
Zm00001d052124 (GRMZM2G165961)
0.24 0.06 0.42 0.43 0.47 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.04 0.07 0.3 0.03 0.24 0.01 0.25 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.4 0.06 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.09 0.22
Zm00001d053308 (GRMZM5G854613)
0.32 0.21 0.46 0.31 0.41 0.12 0.08 0.09 0.09 0.08 0.35 0.22 0.1 0.16 0.16 0.18 0.16 0.31 0.33 0.02 0.09 0.09 0.46 0.16 0.23 0.69 1.0 0.41 0.05 0.19 0.32 0.02 0.24 0.39 0.74 0.25 0.21
Zm00001d053401 (GRMZM2G148118)
0.4 0.31 1.0 0.91 0.54 0.29 0.27 0.21 0.22 0.2 0.52 0.24 0.29 0.38 0.23 0.45 0.41 0.52 0.65 0.26 0.14 0.19 0.29 0.28 0.23 0.46 0.37 0.3 0.35 0.79 0.24 0.04 0.1 0.31 0.27 0.39 0.18
Zm00001d053783 (GRMZM2G010152)
0.37 0.2 1.0 0.63 0.68 0.31 0.22 0.2 0.19 0.2 0.48 0.3 0.13 0.37 0.22 0.32 0.27 0.59 0.42 0.28 0.11 0.18 0.29 0.19 0.22 0.74 0.38 0.32 0.22 0.44 0.25 0.66 0.16 0.36 0.3 0.37 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)