Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G03130 (PSAD-2)
-4.02 -0.47 -6.9 -7.24 -7.33 -8.04 -6.3 -10.1 -9.69 -7.83 -9.5 -8.94 -9.17 0.82 1.28 1.67 0.29 -0.11 -0.92 -0.75 -0.63 2.06 0.46 1.56 -2.94 2.16 0.57 0.51 -1.8 -3.63 -1.42 0.52 2.94 -0.68 -1.81 0.84 0.92 1.24 1.35 -1.37 -4.47 -6.7 -5.91 -7.24 -5.63 - -4.77 -8.16
AT1G03600 (PSB27)
-3.22 0.19 -9.38 -8.54 -6.58 -8.29 -7.57 - -11.24 -10.38 -11.48 -10.12 - 0.58 0.02 2.12 -0.37 -0.46 -0.66 0.66 0.44 2.13 1.02 1.52 -0.13 2.19 -0.66 0.52 -2.37 -0.49 -0.41 0.53 2.2 0.28 -0.02 0.96 0.19 1.23 1.02 -2.2 -2.36 -4.24 -4.83 -5.15 -4.57 - -4.31 -7.35
AT1G06680 (OE23)
-3.56 0.18 -5.4 -5.94 -5.28 -6.96 -4.91 -13.49 -10.14 -10.72 -11.54 -14.86 -13.25 0.92 -0.18 1.92 -0.58 -0.18 -1.3 0.19 0.16 2.17 0.77 1.67 -4.31 2.39 -0.25 1.02 -1.83 -5.94 -0.58 0.07 2.58 -0.28 -0.5 1.08 -0.08 1.55 1.18 -1.31 -5.19 -3.46 -6.89 -6.93 -5.67 - -12.19 -7.95
AT1G08380 (PSAO)
-4.04 -0.74 -8.67 -7.98 -7.3 -8.34 -6.82 -12.89 -10.69 -10.33 -10.96 -13.12 - 0.27 1.39 1.89 -0.4 -0.57 -0.81 -0.33 -0.52 2.12 0.85 1.83 -4.57 2.53 -0.96 -0.18 -2.48 -7.39 -1.03 1.04 2.78 -1.08 -0.29 1.54 -0.2 1.26 0.32 -0.14 -5.38 -4.12 -8.37 -12.69 -5.48 - -16.55 -12.42
AT1G15820 (CP24)
-3.49 -0.05 -3.98 -4.88 -4.09 -6.26 -4.98 -11.36 -10.49 -9.74 -10.85 -10.98 - 0.69 1.02 1.26 -0.27 0.35 -0.89 -0.24 -0.69 1.82 0.34 1.5 -5.43 2.06 -1.87 1.42 -1.03 -7.73 -0.72 0.49 3.08 -0.39 -0.44 1.19 -0.3 1.66 0.37 0.57 -3.48 -3.73 -4.1 -5.81 -5.65 -11.1 - -6.2
-1.51 0.75 -1.27 -1.66 -1.05 -1.9 -1.68 -4.56 -3.71 -4.52 -3.89 -6.77 -5.32 0.41 0.92 1.45 0.76 1.02 -0.84 0.36 0.69 1.3 0.74 1.46 -1.76 2.04 1.19 0.14 -1.53 -2.66 0.39 -0.08 1.71 0.14 -0.42 0.98 0.24 0.93 0.13 -3.79 - -1.24 -1.8 -0.64 -1.44 -5.43 -12.17 -1.88
AT1G29910 (CAB3)
-3.81 -0.6 -8.97 -6.54 -8.92 -10.17 -5.73 - -10.95 -10.88 -11.55 - - 1.09 0.1 0.62 -3.89 -3.65 -2.46 -1.29 -1.78 2.35 0.42 1.43 -6.32 1.83 -5.23 1.4 -2.15 -7.54 -1.47 0.77 3.62 -2.38 -1.83 0.85 -1.84 1.34 -0.25 2.47 -5.31 -10.99 -10.97 -10.75 -5.43 - -10.05 -9.14
AT1G29920 (CAB2)
-4.8 -1.09 -7.35 -7.39 -6.35 -6.76 -6.65 -12.2 -13.76 -10.56 -11.71 -13.04 - 0.88 0.4 -1.0 -4.89 -4.3 -4.17 -2.11 -2.95 2.15 0.07 1.55 -6.72 1.74 -2.95 0.86 -1.08 -8.55 -2.35 -0.37 3.54 -5.63 -4.06 -0.38 -1.47 1.79 0.88 3.31 -4.15 -9.73 -11.51 -10.73 -5.38 - -13.12 -12.87
AT1G29930 (CAB1)
-3.79 -0.6 -8.29 -8.12 -7.96 -10.31 -7.59 -14.1 -11.7 -10.84 -11.55 -14.62 - 0.79 -0.73 0.78 -1.17 -0.33 -1.11 -0.89 -1.62 1.46 0.31 1.37 -5.39 2.0 -1.77 1.0 -1.98 -7.61 -0.95 -0.23 3.01 -0.04 0.19 1.2 0.58 1.38 1.69 2.61 -2.47 -6.02 -10.16 -11.37 -5.89 - -8.6 -11.49
AT1G30380 (PSAK)
-2.85 -0.0 -4.28 -6.13 -4.42 -6.57 -6.21 -11.3 -10.62 -9.5 - -12.99 - 0.64 1.34 1.62 -0.53 -0.37 -1.09 -0.44 0.07 1.83 0.45 1.46 -4.4 2.07 -0.58 0.42 -2.23 -7.57 -1.15 0.39 3.09 -0.31 -0.99 1.13 -0.63 1.51 0.62 1.43 -4.42 -2.85 -5.98 -6.36 -5.79 - - -7.25
AT1G31330 (PSAF)
-2.92 -0.16 -7.43 -6.44 -6.6 -8.84 -6.18 -13.9 -10.82 -11.03 -12.27 - - 0.8 0.84 1.83 -0.32 -0.02 -1.13 -0.11 -0.14 2.02 0.76 1.65 -4.96 2.37 -0.94 1.06 -2.14 -7.42 -0.62 0.38 2.61 -0.36 -0.04 1.23 -0.22 1.54 1.13 -1.34 -2.73 -2.88 -6.55 -7.85 -5.37 - -12.41 -7.86
AT1G34000 (OHP2)
-3.05 -0.26 -2.85 -2.37 -2.8 -3.96 -2.22 -8.5 -8.09 -9.51 -8.79 - -7.79 -0.13 0.03 1.93 1.28 0.76 -1.91 -0.51 0.65 1.34 -0.21 1.45 -0.71 2.19 1.7 -0.9 -2.98 -0.98 -1.15 0.95 1.49 0.25 -0.97 0.6 0.7 0.91 1.35 -1.12 -6.52 0.16 0.08 -2.99 -3.18 -0.71 -11.72 -2.21
-4.92 -0.69 -5.98 -5.79 - -6.07 -5.75 - - -7.42 - - - 0.39 0.14 2.72 -2.58 -1.33 -1.65 -0.08 0.52 2.47 1.11 1.82 -5.19 2.65 -2.88 -1.14 -3.86 -6.03 -1.17 1.12 1.56 0.96 -0.95 1.38 -0.5 1.27 1.11 -0.49 - -4.79 - - -2.52 - - -
-2.21 0.51 -6.12 -7.16 -5.97 -6.81 -6.01 -8.47 -9.84 -7.75 -10.19 -11.01 -7.17 1.2 -0.88 1.61 -0.02 0.14 -0.03 0.64 0.57 1.55 0.4 1.72 -3.32 2.11 0.18 0.34 -1.27 -4.44 -0.04 0.08 2.55 -0.04 0.39 1.46 0.08 1.31 1.37 -2.43 -8.61 -2.69 -4.66 -6.25 -5.21 -9.2 -11.68 -6.57
-2.64 0.52 -3.19 -4.49 -4.35 -6.01 -4.66 -9.16 -10.86 -9.75 -10.54 -10.35 - 0.9 0.98 2.03 0.18 0.46 -1.55 0.19 0.75 1.94 1.09 1.68 -3.32 2.23 0.19 0.27 -1.79 -7.41 -0.71 0.83 1.74 -0.82 -0.09 1.66 0.35 1.06 0.26 -1.45 -1.0 -3.66 -7.82 -7.82 -5.65 - - -8.73
AT1G52230 (PSAH2)
-2.72 0.61 -7.27 -7.01 -6.16 -8.83 -7.0 -8.74 -7.1 -7.46 -6.99 - -7.16 0.74 -0.16 1.92 -0.01 0.41 -1.14 0.01 0.27 2.14 1.07 1.92 -4.18 2.56 -0.38 0.57 -2.89 -7.46 0.04 1.14 2.32 -0.81 0.09 1.21 -0.55 1.12 0.11 -2.8 -7.26 -8.28 -11.78 - -5.59 - - -11.0
AT1G55670 (PSAG)
-2.52 0.29 -8.16 -6.23 -6.36 -8.67 -5.75 - -9.28 -10.05 -11.84 - - 0.88 -0.77 1.78 0.03 0.67 -0.85 -0.25 0.55 1.99 0.35 1.78 -4.77 2.58 -0.46 0.49 -1.96 -7.08 -0.42 0.08 2.37 0.02 -0.15 1.29 0.14 1.38 1.19 -0.51 -3.93 -5.51 -8.09 -10.59 -5.49 - - -11.32
-3.61 -1.4 -8.64 -10.4 -7.58 - -7.87 -11.98 - -11.53 -10.8 -14.01 - 0.52 -3.47 1.84 -0.37 0.23 -1.63 -0.44 -0.45 2.14 0.73 1.78 -4.4 2.61 -0.3 -0.14 -2.92 -8.15 -0.43 0.52 2.96 0.32 -0.27 1.59 -0.16 1.55 1.1 -2.73 -7.73 -5.46 -10.67 - -5.82 - - -12.74
AT1G61520 (LHCA3)
-2.93 -0.24 -6.86 -6.66 -6.76 -8.78 -6.09 -12.77 -9.76 -10.39 -10.25 -11.5 -13.6 0.92 1.32 1.3 -0.99 -0.11 -1.3 -0.39 -0.52 1.65 0.1 1.54 -4.04 2.26 0.02 0.68 -1.8 -7.44 -0.97 -0.3 2.9 -0.63 -0.66 0.96 0.9 1.66 1.75 0.41 -2.98 -4.08 -7.21 -7.8 -5.53 - -5.28 -8.56
-5.86 0.42 -6.1 - - -7.23 -7.32 - - - - - - 1.18 0.2 1.97 0.05 0.16 -0.94 1.01 0.8 2.14 1.5 1.4 -0.82 2.02 -0.44 0.54 -2.69 -0.26 -1.02 0.9 0.61 0.66 0.33 0.77 0.49 0.94 0.25 -1.26 -6.94 -2.11 -1.84 -4.1 -4.77 0.14 - -3.21
AT1G67740 (PSBY)
-3.64 0.22 -8.42 -6.97 -8.08 -11.29 -7.07 - -8.83 -11.91 -11.24 - - 0.75 -0.7 1.6 0.08 0.2 -1.44 -0.25 -0.22 1.69 0.5 1.41 -4.17 1.98 -0.05 1.52 -1.22 -7.83 -1.02 0.32 3.11 0.18 -0.93 0.5 0.16 1.53 1.75 -0.98 -4.02 -3.03 -5.68 -10.28 -5.68 - - -6.53
-0.87 -0.05 -0.21 -0.31 -0.4 -1.01 -0.24 -2.24 -2.83 -3.72 -3.8 -4.18 -2.84 0.15 0.66 1.68 -0.29 -0.8 -1.23 0.13 0.28 0.8 -0.02 1.03 0.48 1.67 2.03 -1.1 -1.62 0.73 -0.21 0.27 0.52 -0.7 -0.41 0.46 1.35 0.67 0.55 -2.98 0.53 -0.84 -1.64 -1.15 -1.73 - -0.21 -2.4
-2.4 0.43 -4.24 -3.46 -5.22 -7.94 -3.53 -12.83 -10.61 -10.32 -11.18 -6.88 -8.45 0.9 1.57 0.85 -0.17 -0.26 -1.25 0.62 -0.33 1.62 0.69 1.07 -4.45 1.59 -1.12 1.34 -0.87 -5.89 0.07 0.21 2.45 1.82 0.15 0.28 0.55 0.86 1.15 1.15 -4.18 -2.01 -4.59 -5.78 -5.63 - - -5.49
-3.3 -0.14 -4.6 -2.69 -3.17 -3.41 -2.17 -4.16 -3.17 -3.81 -3.24 1.56 -2.16 0.4 1.59 1.74 -1.04 -0.86 -2.12 -0.68 -0.08 2.08 0.05 1.88 -5.21 2.49 -1.05 -0.38 -2.07 -7.08 -1.18 0.4 2.5 -0.19 -1.25 1.5 -0.47 1.17 0.18 -1.14 -6.1 -3.3 -5.83 -5.62 -5.28 - - -6.62
AT1G76100 (PETE1)
-4.35 0.16 -8.52 -7.92 -10.61 -8.13 -7.17 - -9.87 -12.04 - -9.2 - 0.99 0.31 1.43 0.71 0.25 -0.01 0.46 -0.1 1.86 0.92 1.82 -5.32 2.46 -1.37 1.61 -2.18 -7.44 -0.3 -0.24 2.27 -0.1 -0.23 0.81 0.78 1.28 0.51 -0.36 -4.24 - -5.09 -8.26 -4.2 - - -4.77
AT1G79040 (PSBR)
-2.09 -0.03 -5.72 -5.56 -4.38 -4.67 -4.89 -7.03 -7.58 -9.31 -9.9 -13.71 - 0.11 0.35 1.78 -0.75 -0.98 -1.09 -0.46 -0.49 1.07 -0.48 1.46 -3.09 2.29 0.78 -0.22 -2.12 -5.6 -1.38 -0.13 2.61 -0.47 -1.13 0.5 0.41 1.59 1.79 2.65 -3.31 -2.39 -6.06 -8.98 -6.24 - -12.41 -8.9
AT2G05070 (LHCB2)
-3.97 0.18 -9.16 -6.49 -8.64 -9.59 -6.41 - -7.82 -10.89 -9.79 -14.74 -8.86 1.22 0.42 -0.23 -2.12 -0.9 -1.14 -0.78 -1.7 1.62 -0.23 1.64 -6.13 1.91 -1.94 1.11 -0.7 -7.53 -0.98 0.68 3.38 -2.89 -1.01 1.33 0.42 1.74 1.24 1.81 -3.89 -10.05 -12.82 - -6.08 - - -13.89
AT2G05100 (LHCB2)
-3.8 -0.52 -7.19 -7.3 -7.41 -8.9 -7.86 -11.06 -9.79 -12.28 -9.83 - -5.87 0.91 1.69 -0.87 -2.91 -1.76 -1.87 -1.3 -2.15 1.34 -0.8 1.56 -4.5 1.77 -0.32 1.03 -1.45 -7.8 -1.48 0.58 3.45 -2.85 -2.05 1.28 1.18 1.95 1.64 1.3 -2.62 -7.19 -10.95 - -6.15 - -17.48 -13.75
-1.58 0.77 -3.38 -1.24 -3.26 -6.07 -1.43 - -7.73 -9.92 -8.75 - - 0.8 0.62 2.37 -0.2 -0.35 -1.51 0.89 0.72 1.72 0.89 1.72 -1.46 2.42 1.14 0.37 -2.52 -2.65 -0.24 -0.1 1.03 -0.41 -0.12 1.44 0.62 1.06 -0.45 -1.77 -6.37 -3.0 -7.32 - -5.64 - - -
AT2G05620 (PGR5)
-1.8 1.34 -3.47 -2.55 -2.34 -2.38 -2.45 -3.09 -3.6 -3.22 -4.23 -9.48 -2.54 0.58 -0.8 1.69 -0.95 -0.74 -0.91 0.24 0.49 1.46 0.14 1.6 -1.32 2.15 1.57 0.22 -3.07 -1.54 -0.55 0.46 1.63 0.27 -0.92 0.57 0.86 1.16 1.69 0.31 -2.01 -0.79 -3.54 -4.44 -6.12 - - -3.61
AT2G06520 (PSBX)
-2.84 0.23 -5.11 -5.51 -4.81 -6.57 -4.92 -9.28 -8.3 -8.49 -8.55 -14.85 -9.01 0.94 -0.13 1.7 -0.54 0.28 -0.76 -0.32 0.53 1.92 0.54 1.48 -3.72 2.11 0.3 0.74 -1.78 -7.02 -0.57 0.59 2.9 0.43 -0.34 1.02 -0.01 1.65 0.74 -2.49 -5.59 -2.97 -4.52 -4.84 -5.18 -4.36 -9.93 -4.62
AT2G20260 (PSAE-2)
-3.44 -0.03 -7.44 -8.5 -7.71 -8.09 -8.09 - - -10.68 -11.61 -10.79 -8.94 0.3 -1.48 2.07 0.3 0.08 -0.94 0.17 0.4 2.0 0.48 1.94 -3.48 2.61 -0.11 0.17 -2.57 -6.44 -0.27 0.8 2.07 -0.16 -0.08 1.39 0.63 1.17 1.36 -1.36 -3.96 -3.12 -5.63 -6.32 -6.34 - -9.94 -7.9
-3.11 -0.65 -4.98 -4.77 -4.84 -5.82 -4.06 -9.97 -8.73 -9.75 -10.47 - -13.15 0.3 1.13 2.52 0.01 0.54 -1.13 0.06 0.81 1.83 0.58 2.06 -2.85 2.74 0.9 -0.52 -3.7 -7.12 -0.51 0.51 1.35 -0.45 -0.75 1.24 0.3 0.75 0.95 -2.2 -4.77 -5.49 -9.42 -8.3 -5.51 - - -8.79
AT2G30570 (PSBW)
-2.53 -0.15 -6.45 -5.67 -5.86 -7.17 -5.2 -11.27 -9.63 -10.26 -9.56 -6.32 -10.25 0.83 -0.26 2.12 -0.04 0.46 -0.6 -0.22 0.48 1.77 0.42 1.74 -3.41 2.35 0.31 0.71 -1.15 -6.15 -0.63 0.09 2.34 -0.63 -0.36 1.13 -0.24 1.8 0.58 0.63 -2.75 -4.8 -8.62 -9.52 -5.41 -7.08 - -10.25
AT2G34420 (LHB1B2)
-2.41 0.02 -8.78 -7.7 -8.4 -10.5 -7.35 -14.09 -10.98 -10.42 -11.27 -13.2 - 0.85 0.04 0.45 -1.51 -0.5 -1.66 -0.52 -1.43 1.14 -0.74 1.54 -4.64 2.38 -0.58 0.95 -2.01 -7.37 -0.65 0.31 3.2 -2.64 -1.0 1.33 1.08 1.9 1.74 1.45 -3.41 -3.52 -6.54 -11.69 -6.48 -6.9 -8.82 -10.37
-2.56 0.75 -7.57 -6.14 -6.42 - -8.32 - -9.06 - - - -9.8 1.12 -0.28 1.53 0.56 0.64 0.21 0.71 0.65 1.59 0.73 2.02 -4.92 2.45 -1.65 1.08 -1.21 -8.44 0.56 0.72 1.82 -0.58 -0.04 1.59 -1.97 0.95 -0.59 0.61 -8.53 -4.63 - - -6.87 - - -
-1.67 -0.67 0.42 0.91 0.75 -0.29 0.99 -6.73 -4.78 -5.85 -5.06 -7.1 -7.01 -0.21 0.21 2.38 -0.14 -0.01 -1.55 -0.86 -1.0 0.91 -0.71 1.71 -1.85 2.57 1.18 -3.59 0.09 -2.39 -2.14 -0.44 1.37 -1.29 -4.08 0.68 0.92 1.03 1.63 -2.62 - -3.15 -3.14 -4.13 -4.69 - -8.08 -6.23
-1.84 0.33 -1.17 -1.1 -1.55 -3.84 -1.36 -8.57 - -9.37 -9.07 - - 0.54 0.19 1.31 0.25 -0.42 -1.8 0.96 0.56 1.97 1.73 0.72 -1.23 0.93 0.11 0.75 0.04 -2.0 0.29 1.27 0.31 0.14 0.59 0.88 0.24 0.48 0.84 -2.82 -5.14 -0.98 -0.23 0.73 0.12 - -6.18 -0.36
-4.08 0.35 -6.75 -6.5 -6.44 -7.21 -6.18 -8.28 -11.42 -10.52 -10.34 - - 1.02 0.9 1.34 0.25 0.49 -0.91 0.28 -0.23 2.71 1.56 1.21 -6.02 1.51 -3.82 0.62 -3.1 -7.24 -0.4 0.78 2.58 0.22 0.45 1.41 -0.76 0.54 -0.14 0.95 -5.17 -6.73 -8.98 -9.38 -5.75 - - -7.77
-3.3 0.1 -2.77 -3.17 -2.96 -3.28 -3.26 -3.35 -3.78 -3.76 -3.8 2.14 -1.81 0.59 -0.23 2.21 -1.75 -1.41 -1.71 0.41 0.33 1.76 0.87 1.18 -2.27 1.96 0.8 0.16 -3.2 -2.76 -0.77 0.41 0.92 0.36 -0.25 0.45 0.0 0.58 1.32 1.82 -3.23 -7.35 -9.26 -7.68 -6.94 - - -9.36
AT2G47450 (CAO)
-4.45 0.39 -9.28 -10.33 -10.32 -11.68 -8.45 - - -11.06 - -8.07 -8.41 0.71 0.75 1.34 -0.59 0.03 -1.82 0.49 -0.41 2.05 1.52 0.87 -3.34 1.51 0.17 1.79 -1.29 -6.53 -0.27 0.76 2.43 0.71 0.54 0.77 1.1 1.0 1.2 -2.67 -5.16 -3.34 -4.45 -1.8 -3.75 - - -5.31
-2.56 0.26 -3.46 -4.25 -3.85 -5.55 -4.3 - -6.96 -8.36 -7.39 - -7.15 1.03 1.21 1.66 -0.42 -0.34 -1.33 0.02 -0.5 2.48 1.42 1.45 -3.74 1.95 -0.74 1.51 -1.99 -5.43 -0.68 0.95 2.23 0.6 -0.08 0.79 -0.48 0.96 0.31 -1.79 - -2.84 -3.47 -1.6 -2.48 - - -2.83
AT3G08940 (LHCB4.2)
-4.23 -0.36 -6.93 -6.46 -6.3 -7.1 -5.79 -12.59 -9.65 -10.94 -13.1 -7.94 - 0.95 0.08 0.64 -1.41 -1.29 -1.0 -0.25 -0.82 1.59 -0.1 1.78 -3.82 2.52 -1.07 0.46 -2.52 -4.56 -0.7 0.99 2.95 0.27 -0.98 1.11 0.74 1.37 1.59 1.54 -3.86 -4.51 -5.37 -5.9 -5.47 -4.29 -10.95 -7.1
-1.77 0.29 -2.38 -1.91 -1.59 -0.79 -1.56 -1.43 -1.3 -5.43 -5.43 -6.84 -10.25 0.29 0.95 1.39 -0.55 -0.52 -1.39 0.16 0.32 1.88 0.4 1.38 -1.73 2.05 0.54 0.12 -1.82 -1.98 -0.67 0.63 2.33 0.78 -0.76 0.66 -0.11 1.0 0.63 0.21 -4.7 -2.18 -3.17 -2.14 -3.48 -1.9 0.2 -3.6
AT3G16140 (PSAH-1)
-3.26 0.23 -7.97 -8.45 -8.11 -10.36 -7.52 -10.74 -10.57 -10.56 -10.97 - -9.7 0.29 -0.0 1.81 -0.21 0.21 -1.37 0.04 0.29 1.82 0.45 1.81 -3.88 2.57 -0.11 0.29 -1.53 -6.34 -0.44 0.58 2.12 0.07 -0.47 1.13 0.34 1.48 1.41 0.92 -2.52 -4.86 -8.24 -9.65 -5.84 - - -11.43
AT3G17040 (HCF107)
-1.49 1.22 -3.51 -3.36 -3.68 -5.59 -3.19 - -7.81 - -6.0 - -11.14 0.98 0.65 0.09 0.44 0.13 -1.2 1.01 -0.05 0.9 0.76 0.88 -3.64 1.28 0.46 1.36 -0.56 -6.13 0.53 0.57 1.65 0.56 0.59 1.12 1.4 0.72 0.4 1.64 -1.45 -0.34 -1.06 -2.84 -6.39 - - -2.58
AT3G21055 (PSBTN)
-3.52 0.02 -6.81 -6.55 -7.05 -8.04 -5.53 - -10.76 -10.52 -10.47 - - 0.24 -1.53 2.1 -0.2 0.17 -1.01 -0.02 0.4 2.08 0.83 1.83 -4.02 2.5 -0.23 0.75 -2.25 -7.39 -0.3 0.38 2.65 -0.59 0.24 1.38 -0.69 1.34 0.56 -0.76 -3.64 -5.38 -9.54 -10.16 -5.61 - - -13.52
AT3G27690 (LHCB2)
-3.72 -0.89 -3.13 -3.12 -4.02 -6.85 -3.27 -11.12 -9.23 -11.39 -10.92 -12.69 - 0.29 0.68 -1.07 -2.76 -3.51 -1.43 -1.46 -2.8 0.95 -1.81 1.43 -7.5 1.21 -6.67 0.76 -0.98 -7.37 -3.96 1.01 3.88 -2.28 -2.31 0.96 -3.64 1.87 1.81 2.75 -7.01 - -10.81 -10.2 -5.58 - - -9.13
AT3G47470 (CAB4)
-2.71 -0.15 -6.03 -7.1 -5.73 -6.44 -6.46 -8.69 -10.84 -10.33 -11.91 -11.17 -12.04 0.78 0.75 0.71 -1.35 -1.01 -1.91 -0.36 -1.05 1.58 -0.07 1.4 -4.72 2.0 -1.06 0.14 -2.16 -7.08 -1.05 -0.04 2.52 -1.63 -1.27 1.11 0.66 1.25 0.94 3.41 -2.37 -4.17 -6.54 -5.32 -5.92 -11.5 -4.11 -6.95
-2.92 0.32 -4.41 -5.56 -4.84 -6.72 -5.51 - - -8.15 - -7.83 -8.6 0.97 1.2 1.9 0.68 0.9 -0.48 -0.2 1.15 1.73 0.1 1.54 -3.39 2.09 -1.31 -0.48 -0.06 -3.01 -0.49 0.07 2.51 0.19 -1.11 0.82 -1.41 1.14 0.35 -1.76 -3.27 -1.4 -2.87 -2.35 -4.06 -1.0 -0.11 -3.92
AT3G50820 (OEC33)
-1.22 -0.81 -7.24 -7.77 -7.72 -9.42 -8.13 -12.1 -11.78 - - - - 0.26 -0.42 1.93 -1.79 -1.21 -0.83 -0.92 -0.5 2.14 0.54 1.81 -3.5 2.63 0.65 1.42 -1.86 -7.22 -2.22 0.17 2.45 -0.94 -1.85 0.91 1.27 1.65 1.47 -0.78 -8.35 -3.54 -6.43 -7.72 -5.06 - -9.03 -7.25
AT3G54890 (LHCA1)
-3.37 -0.19 -6.35 -6.5 -6.43 -8.35 -6.22 -12.39 -11.12 -10.74 -13.21 -11.7 - 0.77 1.22 1.06 -0.71 -0.68 -1.56 -0.26 -0.77 1.78 0.1 1.59 -4.83 2.25 -0.86 0.93 -1.96 -7.35 -1.21 0.26 2.94 -2.76 -0.36 1.11 0.14 1.43 0.76 2.16 -1.17 -6.38 -8.57 -7.42 -5.8 - -14.95 -9.08
AT3G54900 (CXIP1)
-1.19 0.79 -1.17 -1.19 -1.18 -1.56 -1.17 -6.89 -6.28 -8.43 -7.15 -7.74 - 0.51 0.89 0.79 -0.76 0.37 -1.3 0.12 -0.3 1.28 0.53 1.28 -1.08 1.77 0.18 0.52 -1.82 -1.53 0.43 0.13 2.1 0.06 0.38 1.13 1.21 0.95 0.98 -5.84 - -0.59 -1.0 -1.06 0.31 -4.74 -2.23 -1.03
AT3G56940 (ACSF)
-2.99 0.44 -8.84 -6.67 -8.2 -10.94 -6.22 -12.66 -10.68 -10.91 - - -12.84 1.11 1.22 0.75 -0.95 -0.57 -1.4 0.4 -0.12 1.82 0.95 1.31 -4.36 1.77 -0.48 1.82 -1.67 -7.69 -0.07 0.39 2.56 0.46 0.05 0.95 0.48 0.97 1.11 1.05 -2.08 -2.73 -6.5 -7.72 -6.55 -4.8 -11.29 -7.65
AT3G59400 (GUN4)
-2.35 0.63 -8.21 -7.03 -8.22 -6.6 -6.61 -9.31 - -8.68 - - -10.91 1.16 -0.33 0.54 -1.04 -1.13 -0.32 0.59 -0.67 1.7 1.13 1.27 -4.1 1.56 -0.88 1.75 -1.65 -7.31 0.32 1.52 2.74 1.05 0.48 1.39 0.35 1.16 0.69 -1.23 -2.19 -4.06 -5.38 -9.38 -6.64 - -13.74 -7.45
AT3G61470 (LHCA2)
-4.3 -0.98 -8.68 -7.94 -8.93 -9.6 -7.24 -14.51 -12.01 -10.28 -13.07 - - 0.45 0.85 1.46 -0.67 -0.45 -1.69 -1.07 -1.34 1.43 0.0 1.61 -4.46 2.53 -0.52 0.03 -2.41 -7.78 -1.92 0.16 2.95 -0.2 -0.98 1.18 0.79 1.74 2.0 1.3 -2.44 -5.59 -11.91 -11.74 -5.94 - - -
AT4G02770 (PSAD-1)
-4.01 0.22 -6.53 -7.26 -6.58 -9.66 -6.54 - -10.95 -11.66 -11.44 -12.17 - 0.95 0.33 1.59 -0.01 0.6 -0.94 -0.11 0.16 1.65 0.69 1.58 -3.53 2.27 0.41 1.26 -1.87 -7.3 -0.45 0.2 2.67 -0.17 -0.28 1.22 0.2 1.43 1.04 -1.43 -3.53 -3.21 -5.98 -9.98 -5.41 - - -9.14
AT4G05180 (PSBQ)
-3.4 -0.33 -9.01 -8.1 -7.32 -9.41 -7.27 - -11.13 -11.05 - - - 0.75 1.15 2.03 -0.44 -0.19 -1.03 -0.08 0.14 1.89 0.5 1.77 -5.18 2.5 -1.19 0.5 -1.77 -7.95 -0.52 -0.26 2.23 -1.35 -0.69 0.95 0.67 1.08 2.3 -0.63 -4.23 -4.54 -9.4 -11.71 -5.53 - - -
AT4G10340 (LHCB5)
-3.78 -0.28 -6.8 -6.65 -6.07 -7.81 -6.42 -14.21 -10.73 -11.04 -11.32 -15.34 - 0.83 1.33 1.34 -0.77 -0.27 -1.45 -0.46 -0.31 1.95 0.36 1.62 -5.48 2.3 -1.79 0.91 -2.05 -7.38 -0.84 0.36 2.54 -0.61 -0.51 1.26 0.11 1.23 0.63 2.25 -4.28 -4.89 -8.06 -7.94 -5.96 -7.46 -4.72 -8.42
AT4G12800 (PSAL)
-3.6 -0.06 -7.93 -7.65 -7.57 -9.97 -6.94 -13.39 -10.51 -11.1 -11.37 -13.34 - 0.43 0.28 1.98 -0.33 0.02 -1.04 -0.07 -0.26 1.86 0.49 1.73 -3.89 2.54 0.02 0.38 -2.56 -7.55 -0.87 0.61 2.59 -0.63 0.06 1.23 0.45 1.64 1.42 -1.84 -5.47 -6.2 -10.79 -10.2 -5.86 - -16.2 -10.89
AT4G15560 (CLA)
-1.74 0.53 -6.22 -3.81 -5.83 -6.98 -3.69 -11.86 -10.95 -10.82 -9.68 -10.95 - 0.75 1.12 0.39 0.12 0.71 -0.83 0.71 -0.14 1.15 0.81 0.76 -4.09 1.31 -0.23 1.3 0.39 -6.82 0.08 0.67 1.88 1.11 0.33 0.27 0.69 0.58 0.57 1.57 -2.09 -0.83 -0.79 -1.13 -1.69 -0.91 -0.5 -1.74
AT4G25080 (CHLM)
-2.84 0.46 -4.83 -4.65 -4.94 -5.98 -3.98 -9.69 -8.79 -8.82 -9.08 -6.38 -11.14 0.66 0.87 1.57 0.07 0.04 -1.18 0.9 0.14 1.98 1.13 1.21 -3.71 1.79 -1.9 1.42 -1.69 -4.98 -0.39 0.75 1.98 0.84 0.31 0.58 -0.05 0.9 0.6 1.76 -5.26 -2.72 -3.4 -3.72 -3.61 - - -4.49
0.15 -0.28 -1.42 -1.87 -1.55 -2.35 -2.18 -4.89 -4.01 -5.17 -4.66 -0.12 -3.19 0.11 -0.22 2.09 1.06 0.4 -0.54 0.07 0.65 1.01 0.03 0.81 0.82 1.46 2.35 -0.85 -1.86 0.45 -0.83 0.84 0.53 -0.4 -0.93 0.52 0.18 0.33 0.86 -1.22 -1.26 -1.02 -1.47 -1.27 -2.13 - -0.59 -2.23
AT4G28750 (PSAE-1)
-3.02 0.77 -7.74 -7.8 -7.13 -9.72 -6.18 - -5.93 -9.19 -4.94 - -11.23 1.11 -1.46 1.75 -0.55 -0.23 -1.47 -0.73 -0.59 1.58 -0.1 1.6 -4.13 2.28 -0.28 0.85 -1.81 -7.69 -1.19 0.27 2.87 0.11 -0.86 0.79 -0.48 1.7 1.89 1.02 -2.21 -4.49 -11.45 - -5.7 - - -11.97
-4.86 -1.87 -8.22 -7.39 -8.79 -8.49 -6.95 - -7.27 -10.75 -6.87 - -11.56 -0.24 -1.1 2.07 -0.28 -0.2 -1.22 -0.34 -0.43 2.02 0.58 2.05 -3.36 2.77 0.36 -1.25 -3.95 -7.01 -0.58 1.01 2.96 -0.46 -0.56 1.46 -0.08 1.38 0.72 -2.09 -6.2 -5.62 -9.78 - -5.52 - - -13.22
AT5G01530 (LHCB4.1)
-4.73 -0.62 -6.95 -7.12 -7.19 -9.37 -6.93 -13.56 -9.55 -10.49 -8.81 -13.59 -9.98 0.07 -0.21 1.63 -0.22 0.27 -1.11 -0.47 -0.54 1.76 0.42 1.48 -3.52 2.33 -0.03 0.77 -1.49 -4.13 -1.2 0.39 2.45 -0.23 -0.3 0.96 0.21 1.4 1.69 2.18 -4.06 -4.66 -6.21 -6.35 -5.7 -6.03 -5.7 -7.89
AT5G02120 (OHP)
-2.04 0.15 -4.04 -2.13 -2.53 -2.41 -1.54 -6.27 -4.63 -8.18 -5.4 -6.81 - 0.14 0.09 2.05 -0.25 -0.03 -0.6 0.2 0.45 2.23 1.0 1.86 -2.71 2.32 0.69 -0.6 -3.85 -4.73 0.1 1.45 1.91 0.12 -0.59 1.5 0.09 0.73 0.06 -2.32 -6.31 -2.84 -4.62 -5.31 -5.61 - - -4.84
AT5G16400 (ATF2)
-1.64 0.5 -1.46 -1.52 -1.69 -3.29 -1.97 -5.76 -6.1 -6.68 -6.15 -8.37 -8.09 0.66 0.14 1.62 0.21 0.16 -0.62 0.47 0.57 1.43 0.65 1.5 -2.38 1.93 0.22 1.69 0.27 -3.98 -0.24 0.73 1.76 0.25 0.39 0.83 0.43 1.09 -0.46 0.77 -6.55 -2.52 -3.61 -4.13 -4.18 - -5.8 -4.56
-2.07 0.76 0.03 -0.22 -0.02 -1.05 -0.27 -1.8 -2.04 -2.01 -2.27 -8.89 -4.53 0.57 1.77 1.47 -1.53 -1.42 -1.51 0.25 -0.19 1.83 0.68 0.96 -2.93 1.48 -0.15 1.25 -0.07 -3.5 -0.87 -0.23 1.65 -0.12 -0.92 -0.09 -1.27 0.53 -0.43 2.24 -4.33 -2.79 -2.61 -0.39 -3.51 - -4.25 -2.12
-2.72 0.62 -1.93 -1.28 -2.26 -3.13 -1.42 - - - -6.04 - -6.43 0.5 0.96 1.55 -0.9 -1.49 -1.18 0.62 0.44 2.01 0.89 1.37 -3.67 1.86 -0.55 0.92 -0.29 -4.5 -0.19 0.97 2.32 0.98 -0.34 0.06 -0.68 0.91 0.09 0.14 - -3.77 -3.8 -1.62 -2.84 -3.34 0.73 -2.99
AT5G46110 (TPT)
-4.16 0.15 -7.47 -7.37 -8.54 -10.31 -6.82 -12.34 -11.35 -10.88 -11.06 -7.63 -10.78 0.92 -0.71 1.82 0.61 1.64 -1.04 0.29 0.83 1.47 0.41 1.4 -4.6 2.1 -0.53 -0.17 -1.21 -7.67 -0.44 0.12 1.4 -0.79 -0.42 1.37 1.38 1.14 1.79 1.1 -0.53 -3.77 -8.76 -11.92 -5.68 -7.41 - -12.31
-1.24 0.49 -3.88 -3.85 -3.9 -6.99 -3.94 - -7.72 -8.06 - -10.81 - 0.14 1.06 2.42 0.1 0.16 -1.3 0.26 0.8 1.9 0.65 1.69 -3.32 2.34 0.61 0.11 -1.44 -5.15 0.09 1.26 1.32 0.8 -0.49 0.49 -0.86 0.57 0.49 -1.88 -7.38 -1.41 -3.56 -5.02 -2.91 -5.96 -0.16 -5.18
AT5G51545 (LPA2)
-0.78 0.31 -2.2 -2.05 -1.6 -2.15 -2.03 -4.53 -2.09 -7.28 -2.38 -7.21 -7.65 0.55 -0.66 1.97 0.5 0.49 -0.52 0.7 0.44 2.08 1.44 1.27 -1.27 1.84 0.29 0.49 -0.88 -1.7 0.43 1.26 0.67 0.28 0.71 0.85 0.39 0.75 0.46 -3.02 -6.91 -2.87 -4.31 -2.69 -2.63 - -4.81 -4.03
-4.87 0.75 -6.8 -6.09 -5.22 - -6.1 - -6.18 -8.61 -8.72 - - 0.86 0.66 2.52 -2.81 -2.89 -2.98 -0.34 0.27 3.06 1.75 2.19 -6.21 2.66 -3.08 -4.33 -7.91 -7.13 -1.25 1.24 0.98 -2.81 -2.54 1.66 -3.77 0.72 0.31 -0.47 - -7.15 -8.06 - -5.74 - - -
AT5G54270 (LHCB3)
-2.94 -0.14 -8.81 -7.63 -7.99 -10.21 -6.88 - -12.01 -9.45 -10.01 -8.88 -14.36 1.38 -0.21 0.68 -1.6 -0.59 -1.29 -0.58 -0.97 1.89 0.12 1.92 -5.44 2.38 -1.66 0.91 -2.3 -7.73 -0.79 0.8 2.92 -1.27 -0.73 1.4 0.1 1.84 0.89 1.4 -1.92 -5.01 -7.65 -8.74 -5.52 -4.31 -13.89 -9.74
AT5G64040 (PSAN)
-4.52 -0.74 -7.01 -6.2 -6.08 -8.83 -5.64 -11.77 -9.8 -10.14 -9.97 - -10.62 0.57 2.05 1.79 -0.59 -0.69 -1.24 -0.69 -0.17 1.9 0.16 1.64 -5.41 2.24 -1.64 0.59 -2.59 -7.98 -1.77 0.32 2.65 -0.92 -1.36 1.17 -0.9 1.22 1.33 1.92 -6.0 -3.93 -6.64 -6.23 -5.67 - -13.24 -7.66
AT5G66570 (OEE1)
-3.2 0.13 -2.36 -2.8 -2.41 -3.86 -2.72 -12.16 -9.65 -9.08 -8.93 - - 0.48 0.33 1.84 -0.3 0.08 -1.14 0.03 -0.12 1.72 0.66 1.53 -4.69 2.36 -0.39 1.05 -1.63 -7.71 -0.78 -0.15 2.48 -0.09 -0.49 0.84 0.19 1.51 1.91 0.04 -4.34 -3.63 -6.97 -9.25 -5.73 - - -8.83

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.