Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Tin_g29365 (scpl40)
-7.83 -6.41 -6.24 -7.18 - -5.43 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -5.96 2.8
Tin_g33674 (UGT85A7)
- - - -6.79 -5.35 -3.86 2.79
- - - - - -5.01 2.8
- - - - - -3.11 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.06 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.36 2.79
- - - - - -3.16 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - -3.04 - 2.78
- - - - - - 2.81
- -4.77 -4.64 - -3.66 -4.52 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.42 2.79
- - - - - -3.05 2.78
- - - - - - 2.81
Tin_g36245 (sks4)
-6.21 -5.71 -6.14 -6.16 - -4.34 2.78
- - - - - -5.65 2.8
- - - - - - 2.81
Tin_g36449 (ATG8F)
- - - - - - 2.81
Tin_g36500 (GPAT6)
- - - - -9.42 -5.4 2.8
- - - - -5.43 - 2.8
- - - - -4.12 - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.95 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - -5.37 -4.81 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -6.58 2.81
Tin_g37696 (UGT85A7)
- - - - -2.94 -5.94 2.78
Tin_g38082 (RAB)
- - - -4.97 -5.22 -4.96 2.79
- -6.46 -5.31 - - -3.41 2.78
- - - - - -4.1 2.8
Tin_g38138 (GA3)
- -9.0 - - -6.56 -6.45 2.8
- - - - - - 2.81
- - -4.24 -6.52 - - 2.79
- - - - - -5.97 2.8
- -7.47 - - -8.08 -4.78 2.8
- - - - - -4.35 2.8
- - - - - -3.09 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g39289 (ATG8E)
- - - - - -2.67 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -5.4 - - - -3.8 2.79
Tin_g39466 (UGT85A7)
- - - - -7.8 -4.63 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g39987 (FATB)
- - -5.14 -5.85 -4.67 -5.41 2.78
-4.7 -4.71 -6.01 - -7.26 -4.51 2.78
-4.42 -5.89 -4.93 -4.23 -4.25 -3.13 2.74
- - - - - -2.9 2.78
- - - - - -2.92 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.52 2.79
- - - - - -3.94 2.79
- - - - - -2.52 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.43 2.8
- - - - - -4.75 2.8
-6.54 - -6.43 -4.78 -4.35 -5.42 2.78
- - - - - -2.85 2.78
Tin_g41347 (MBF1A)
- - - - - - 2.81
-7.0 - -5.2 -4.87 -6.03 -5.28 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-8.4 -8.42 - - -4.87 -5.9 2.8
-4.87 -3.74 -5.88 -6.89 -5.15 -4.78 2.77
Tin_g41815 (STV1)
- - - - - -2.97 2.78
Tin_g41826 (CXE18)
- - - - - -4.29 2.8
Tin_g42003 (scpl31)
- - - - - -5.48 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.