Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Tin_g17266 (PIP2)
-1.48 -2.01 -1.58 -1.68 -6.45 -4.86 2.51
Tin_g17843 (E37)
-2.35 -3.27 -4.34 -3.1 -3.72 -1.78 2.62
-2.25 -2.64 -2.66 -1.76 -1.98 -2.0 2.5
-4.29 - -4.13 -4.16 -4.34 -3.37 2.74
-4.48 - -3.44 -1.36 -2.59 -2.04 2.6
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g33639 (HB-3)
- -6.39 -3.36 -2.28 - -5.49 2.74
- - - - - - 2.81
Tin_g33683 (HXK2)
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.8 2.79
-3.91 -7.75 - -7.55 - -4.93 2.78
- - - - - -3.34 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-5.09 -5.38 - -3.16 - -2.36 2.73
- - - - - - 2.81
-4.74 -3.65 -3.63 - -4.79 -2.2 2.71
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g34415 (MBF1C)
- - - - - -5.3 2.8
- - - - - -2.51 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.93 2.79
-2.88 -3.93 - -2.96 - -3.93 2.72
Tin_g35332 (ELG)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g35398 (UBQ11)
-2.39 - - -1.89 -3.81 -2.28 2.65
- - - - -3.24 - 2.79
Tin_g35548 (UBQ11)
-4.35 - - - - - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-2.88 -2.69 - -4.71 -5.94 -3.74 2.72
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.16 2.78
- - -5.17 -5.09 - -5.07 2.79
- - - - - - 2.81
-3.9 - - - - -6.27 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g37479 (UBQ11)
- - - - - -5.25 2.8
- - - - - -4.45 2.8
- - - - - - 2.81
Tin_g37659 (ASK1)
- - - - - -3.45 2.79
Tin_g37672 (GLN1.3)
-4.84 - -7.81 - - -5.76 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g37850 (PHT3;1)
-5.74 - -7.42 -6.32 -7.32 -4.16 2.79
- - - - - - 2.81
-3.08 -4.66 -1.85 -3.63 -2.48 -4.88 2.65
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-2.89 -4.93 -5.28 -5.28 -3.5 -3.18 2.72
Tin_g38288 (GCN3)
-6.31 -9.77 -9.87 -8.75 - -6.07 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g38798 (AAc1)
- - - - - -2.66 2.77
-1.55 -2.32 - -4.49 - -4.5 2.67
- - - - - -2.16 2.76
- - - - - -4.16 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.79 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-1.99 - -4.83 - - -4.74 2.74
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g39568 (AAC3)
-0.76 -6.43 -4.24 -6.3 -6.32 -7.31 2.66
Tin_g39631 (PNC2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.08 2.78
- - - - - - 2.81
- - -1.77 - - - 2.75
- - - - - - 2.81
-6.01 -4.1 - - - - 2.79
- - - - - -2.02 2.76
- - - -4.33 - - 2.8
Tin_g40983 (EP3)
- -10.1 - - -9.98 -7.43 2.81
-6.04 -6.34 - - - - 2.8
- - - - - -2.99 2.78
Tin_g41131 (PTR1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g41374 (TO2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.76 2.79
Tin_g42058 (ACX1)
- - - - - -6.75 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Tin_g42629 (ROF1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -1.83 - - 2.75
- - - - - - 2.81
-3.58 -1.76 -3.57 -2.58 -3.48 -1.57 2.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.