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Heatmap: Cluster_154 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
-0.34 0.0 1.25 0.55 0.18 0.07 0.31 -0.57 -1.0 -0.56 0.84 -0.17 -1.44 -0.33 -1.15 0.42 0.48 0.01 0.29 -2.87 -1.35 -0.73 0.38 0.05 -0.32 0.65 0.4 0.45 -1.25 1.05 -0.2 -1.82 -0.18 0.43 -0.86 0.28 -0.58
Zm00001d001790 (GRMZM2G064212)
 -0.37 -0.2 1.56 0.34 0.73 -0.89 -0.96 -0.61 -0.82 -0.88 -0.41 -0.32 0.25 0.2 -0.39 0.75 0.43 -0.11 0.05 -4.8 0.18 -0.38 -1.65 0.03 0.02 -0.22 0.75 0.71 -0.99 1.05 -0.32 -1.58 0.03 0.08 -0.34 0.04 -0.07
Zm00001d001809 (GRMZM2G147854)
 0.26 0.78 1.17 -0.2 0.45 -0.73 -0.72 0.05 -0.61 -0.22 -0.55 -0.43 -1.13 -0.04 -0.88 0.61 0.54 0.59 0.06 -5.42 -0.58 0.13 -0.33 0.15 0.21 0.04 0.41 0.28 -2.04 1.09 0.07 -2.1 -0.06 0.38 -0.14 0.02 -0.6
Zm00001d001813 (GRMZM2G018595)
 -2.42 -3.41 -0.14 0.47 0.75 -0.01 -0.57 -0.35 -1.58 -1.21 -0.7 -0.2 0.39 1.03 -0.92 0.94 0.85 0.11 0.97 -8.7 0.56 0.17 0.55 0.15 0.1 0.49 -0.91 -0.31 -1.84 1.88 -1.28 -0.81 -2.68 -0.61 -1.2 0.19 0.12
Zm00001d001983 (GRMZM2G044011)
 0.51 0.52 0.78 0.34 0.73 -0.37 -0.19 -0.54 -0.63 -0.83 0.12 -0.02 0.32 -0.3 -0.22 0.3 0.02 0.23 -0.29 -2.78 -0.48 -1.35 0.11 -0.37 -0.2 0.18 0.85 0.29 -1.6 -0.16 0.38 -1.98 -0.1 0.54 0.3 0.24 0.01
Zm00001d002022 (GRMZM2G040017)
 0.99 0.52 1.66 0.57 0.77 -1.86 -1.42 -0.49 -0.14 0.21 -0.83 -0.24 0.14 -0.95 -0.67 0.74 0.33 0.06 1.14 -8.48 -0.86 -0.32 -1.08 0.03 -0.35 0.7 0.21 0.32 -2.31 -0.0 -0.17 -2.56 -0.13 -0.2 -0.46 -0.05 -0.8
Zm00001d002099 (GRMZM2G023037)
 -0.04 -0.74 1.2 0.92 0.87 0.26 0.3 -0.13 -0.43 -0.23 0.39 0.24 -0.55 0.19 -0.34 0.46 0.04 0.01 -0.23 -7.47 -0.91 -0.51 0.95 -0.03 -0.12 0.53 -0.03 -0.6 -1.37 -0.26 -0.35 -1.86 -2.31 -0.87 0.6 0.39 0.13
0.72 -0.34 1.46 0.47 0.82 -0.25 0.37 -0.72 -0.28 -0.11 0.31 -0.04 -0.39 -0.12 -0.1 0.2 -0.45 0.08 0.19 -0.79 -1.1 -0.87 0.32 -1.15 -0.3 0.81 0.42 -0.41 -0.95 0.07 -0.4 -1.68 -0.98 0.16 -0.25 0.38 -0.13
Zm00001d002388 (GRMZM2G130889)
 0.51 0.65 0.87 0.69 0.59 -0.89 -0.86 -0.58 -1.55 -1.59 0.07 -0.14 -0.77 0.21 -0.97 0.56 -0.23 0.17 0.74 -3.68 -0.93 -1.51 0.35 -0.63 0.15 0.82 0.2 0.3 0.49 -0.15 -0.51 -1.08 -0.35 -0.04 0.92 -0.08 0.1
Zm00001d002418 (GRMZM2G156638)
 0.11 0.04 1.01 0.91 0.47 -0.15 -0.45 -0.61 -0.69 -0.44 0.27 -0.26 -0.69 0.19 -0.62 0.43 0.41 0.22 0.58 -2.78 -1.06 -0.46 -0.49 0.09 -0.4 0.24 0.04 0.39 -1.86 1.26 -0.49 -2.48 -0.11 0.3 -0.24 0.3 -0.08
1.16 0.18 1.7 0.35 0.54 -0.56 -0.66 -1.05 0.36 0.4 0.3 0.04 -0.59 0.96 0.83 0.12 -2.62 -0.21 -1.11 -1.62 -2.46 -3.23 0.75 -1.94 -0.89 0.81 0.68 -1.02 -1.65 -1.38 -0.95 -1.51 -1.71 -0.8 1.05 0.66 0.01
Zm00001d002967 (GRMZM2G062412)
 -0.68 -0.06 1.08 -0.07 0.19 -0.18 0.43 -0.34 -0.64 -0.74 0.99 0.13 -1.74 -0.2 -0.77 0.22 0.46 0.51 0.47 -3.88 -0.74 -0.36 0.25 0.08 0.32 1.25 -0.04 -0.21 - 1.68 -0.27 - -2.22 -0.53 -0.56 0.22 -0.27
Zm00001d004270 (GRMZM2G077863)
 0.84 -0.07 0.86 0.3 0.58 -1.84 -1.3 -1.14 -1.23 -1.52 -1.76 -1.11 0.67 1.1 -0.72 0.35 -0.62 0.28 0.69 -2.77 -1.07 -0.44 -0.31 -0.09 -0.37 1.64 0.08 0.15 -0.18 0.15 -0.3 -0.72 -0.35 -0.23 1.15 -0.28 -0.57
Zm00001d004552 (GRMZM2G160184)
 0.49 0.72 0.88 0.19 0.57 -0.34 -0.3 -0.63 -0.79 -0.71 -0.54 -0.15 -0.8 1.06 -0.76 0.5 -0.23 0.38 0.56 -0.64 -1.14 -0.57 0.37 -0.56 -0.47 0.42 0.99 -0.19 -0.25 0.28 -0.64 -1.31 -1.24 -0.32 0.48 0.04 -0.42
Zm00001d004616 (GRMZM2G003692)
 0.04 -0.17 0.91 0.39 0.42 0.54 0.57 -0.41 0.2 0.29 0.4 0.31 -0.73 -0.17 -0.33 0.29 -0.36 0.2 0.49 -4.07 -0.82 -1.63 0.53 -1.2 -0.21 0.94 0.55 -0.45 -0.75 0.27 -0.71 -3.29 -1.48 -0.53 0.15 0.65 0.05
Zm00001d005372 (GRMZM2G018356)
 -0.52 -0.16 1.16 0.93 0.79 -0.13 -0.3 -0.45 -0.63 -0.25 0.47 0.12 -1.62 -0.74 -0.5 0.22 -0.3 0.14 0.61 -3.86 -1.25 -0.75 -0.06 -0.36 -0.1 0.41 0.97 0.16 -0.8 1.08 -0.01 -2.62 -0.99 0.29 -1.11 0.47 0.36
Zm00001d005489 (GRMZM2G176977)
 -0.7 0.19 0.74 0.44 0.72 -0.52 -0.39 -0.15 -1.26 -1.26 -1.47 -0.71 -0.71 -0.18 -0.93 0.6 1.13 -0.12 0.57 -8.25 0.14 0.3 -0.64 0.33 -0.04 0.91 1.05 0.22 -1.39 1.11 -0.28 -2.39 -0.72 -0.32 0.42 -0.23 -0.32
Zm00001d006415 (GRMZM2G158248)
 -1.12 -0.99 1.01 0.86 0.75 -0.28 -0.59 -0.74 -0.12 0.11 0.18 0.05 -2.26 -0.42 -0.42 0.03 -0.14 0.38 0.05 -1.76 -0.9 -0.89 0.77 -0.42 -0.3 0.61 -0.2 0.26 0.15 1.03 -1.17 -1.66 -0.64 -0.09 1.15 0.41 0.06
Zm00001d006751 (GRMZM2G376432)
 0.5 0.41 0.74 0.92 1.03 -0.38 -0.75 -0.72 -1.07 -0.84 0.02 -0.06 -0.63 -0.53 -0.62 0.36 -0.09 0.93 0.46 0.21 -1.17 -0.44 0.48 -0.35 -0.29 -0.21 0.49 -0.01 -0.39 -0.03 -0.68 -0.35 -0.99 -0.22 -0.39 0.2 0.22
Zm00001d007294 (GRMZM2G048661)
 0.07 -0.1 1.06 -0.2 0.69 -0.32 -0.04 -0.25 -0.84 -0.86 0.01 -0.05 0.77 0.18 -0.57 0.79 0.37 1.08 0.63 -1.75 -0.01 -0.14 -1.03 -0.05 0.19 0.16 0.38 0.06 -0.9 0.17 -0.97 -1.01 -0.58 -0.48 -1.3 0.1 -0.34
Zm00001d007945 (GRMZM2G461569)
 -0.69 0.32 0.21 0.03 0.72 -0.21 -1.16 -0.49 -0.06 0.17 0.24 0.13 -1.57 0.78 -0.25 0.6 0.51 -0.05 0.03 -3.78 -0.79 -0.18 0.12 0.13 -0.25 0.68 -0.65 -0.89 -0.95 2.01 -1.67 -3.6 -3.53 -1.2 0.71 0.64 0.15
Zm00001d008320 (GRMZM2G381933)
 0.84 1.47 0.97 0.96 0.68 -0.35 0.04 -0.42 -0.27 0.35 -0.1 -0.49 -0.91 -0.05 -1.1 0.42 0.43 0.67 0.77 -3.46 -0.71 -0.86 -0.34 -0.17 -0.4 -0.28 0.69 -0.37 -2.58 0.26 -0.38 -3.24 -1.12 -0.39 -0.67 0.05 -0.59
Zm00001d009055 (GRMZM2G075992)
 0.17 0.38 0.72 0.31 0.05 -0.16 0.18 -0.33 -0.61 -0.36 0.23 -0.08 0.02 0.02 -0.66 0.34 0.33 0.1 0.26 -7.57 -0.85 -0.02 -0.0 0.08 0.18 0.69 0.26 -0.43 -0.55 1.02 -0.19 -3.43 -1.14 0.36 0.3 0.21 -0.43
Zm00001d009131 (GRMZM2G027737)
 -1.31 0.35 0.86 0.58 0.6 -0.64 -0.2 0.04 -0.95 -0.66 0.16 -0.06 0.31 -0.23 -0.91 0.79 0.66 -0.61 -0.18 -7.37 -0.32 -0.29 0.1 0.18 0.17 0.63 0.46 -0.58 0.21 0.64 0.12 -3.68 -0.82 -0.05 0.13 0.21 0.08
Zm00001d009205 (GRMZM2G075690)
 -0.27 -0.52 1.5 0.27 0.71 -0.39 -0.53 -0.96 -0.75 -0.66 0.09 -0.21 -0.95 0.27 -0.86 0.56 0.08 0.14 0.49 -3.74 -0.87 -1.14 0.07 -0.48 -0.61 0.63 0.32 0.39 -1.33 1.04 -0.63 -0.3 0.2 0.45 0.63 0.07 -0.43
Zm00001d009324 (GRMZM2G173119)
 0.53 0.31 1.03 0.67 0.8 -0.56 -0.46 -0.68 -1.23 -0.97 0.17 -0.29 0.1 -0.13 -1.18 0.61 0.38 0.06 0.34 -3.19 -0.39 -0.68 -1.4 0.03 -0.02 0.31 0.4 0.79 -2.31 0.94 -0.28 -2.05 0.33 0.57 -0.48 -0.07 -0.55
Zm00001d009364 (GRMZM2G006554)
 -0.44 0.52 0.49 0.49 0.59 -0.31 -0.0 -0.34 0.2 0.26 0.56 0.39 -0.18 -0.43 -0.22 0.25 0.54 0.11 -0.21 -7.22 -0.48 -0.2 0.6 0.15 0.02 0.14 0.14 -0.62 - 0.97 0.16 -5.27 -2.05 -0.41 0.3 0.41 -0.06
Zm00001d009413 (GRMZM2G387569)
 0.26 -0.38 1.29 -0.06 0.36 0.51 -0.03 -0.79 -1.05 -0.82 -0.15 -0.08 -1.29 0.07 -0.53 0.79 -1.08 0.23 -0.53 -3.71 -1.21 -1.64 1.81 -0.5 -0.68 0.67 0.25 -1.01 0.86 -0.38 -0.77 -0.55 -1.34 0.24 0.44 0.3 0.35
Zm00001d009941 (GRMZM2G104133)
 0.08 0.26 1.06 -2.63 0.62 -0.06 -1.75 -0.24 -0.26 -0.15 0.16 -0.26 0.14 -0.01 -0.36 0.57 0.44 0.2 0.71 -2.93 -0.1 -0.75 -0.2 -0.11 -0.36 0.45 0.55 0.77 -1.75 0.2 -0.18 -1.36 -0.02 -0.05 0.08 0.14 0.11
Zm00001d010050 (GRMZM2G337616)
 -0.3 0.96 2.02 1.76 1.11 -0.94 -0.95 -1.25 -1.28 -1.97 -0.26 -0.52 -0.48 0.18 -1.55 0.98 0.13 -0.52 -0.52 -7.44 -1.05 -1.12 -0.22 -1.65 -0.4 0.39 0.16 0.36 -0.95 1.01 -0.09 -4.84 -0.24 0.27 -0.54 -0.42 -0.44
Zm00001d010199 (GRMZM2G097502)
 -0.42 0.09 1.51 -0.16 0.89 -0.8 -0.49 -0.98 -0.92 -0.94 -0.09 -0.36 -0.83 0.46 -1.06 0.96 0.05 -0.13 0.24 -6.54 -0.92 -1.12 -0.33 0.11 -0.57 0.03 0.71 0.8 -1.3 0.98 -0.25 -1.55 0.36 0.86 -0.18 0.1 -0.02
Zm00001d010227 (GRMZM2G104400)
 0.07 0.02 1.53 0.27 1.22 -0.33 -0.36 -0.58 -0.45 -0.22 -0.81 0.28 -0.79 0.75 -0.36 0.05 -0.21 0.31 0.2 -5.37 -1.49 -0.37 0.55 0.04 -0.13 0.43 -0.12 0.33 -2.05 0.16 -1.18 -3.11 -0.37 0.33 -0.14 0.36 0.45
Zm00001d010315 (GRMZM2G078468)
 -0.98 -0.76 1.23 1.15 0.38 0.86 1.05 -0.15 -0.49 -0.29 1.15 0.46 -0.98 0.0 -0.28 -0.2 0.01 0.25 0.19 -6.16 -1.76 -0.99 -0.17 -0.52 -0.39 0.62 0.15 -0.06 -1.22 -0.05 -1.25 -1.77 -0.52 -0.31 -0.78 0.59 0.18
-0.3 -0.49 1.23 0.45 1.24 -1.33 -1.22 -0.5 -1.47 -1.73 0.11 -0.11 0.16 1.0 -0.95 0.89 -0.45 0.15 -0.13 -6.58 -0.1 -0.77 -1.22 -1.35 0.35 0.68 -0.26 0.31 0.19 1.47 -1.27 -2.7 -2.39 0.08 0.68 0.51 -0.12
Zm00001d010806 (GRMZM2G052200)
 -0.35 -0.69 1.04 0.75 0.71 -0.59 -0.65 -0.84 -0.81 -0.77 -0.39 -0.19 -0.11 0.89 -0.63 0.46 -0.23 0.12 0.26 -0.69 -0.72 -0.52 -0.12 -0.83 -0.37 0.61 -0.22 0.52 0.05 1.27 -0.57 -1.48 0.02 0.33 -0.31 0.12 -0.03
Zm00001d010887 (GRMZM2G170798)
 -0.31 -0.41 0.76 0.39 0.53 -0.88 -1.08 -0.5 -1.2 -0.98 0.65 -0.07 -0.45 0.18 -0.31 0.59 0.49 0.01 0.57 -9.0 -0.54 -0.53 0.1 -0.33 -0.15 0.49 0.07 0.62 -1.33 1.13 -0.1 -2.8 0.13 0.26 0.18 0.33 0.33
Zm00001d010974 (GRMZM2G155123)
 -0.48 -0.53 0.8 0.26 0.47 -0.3 -0.3 -0.48 -1.29 -0.7 0.88 -0.3 -1.09 -0.13 -0.67 0.34 0.14 0.12 0.77 -1.79 -1.34 -0.85 -0.0 -0.22 -0.66 0.4 0.79 0.9 -1.28 0.97 -0.09 -1.37 0.37 0.49 -0.16 0.12 0.04
Zm00001d011353 (GRMZM2G107757)
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 0.14 0.14 0.77 0.94 0.68 -0.15 0.17 -0.61 -0.44 -0.13 0.71 0.19 -0.97 -0.23 -0.3 0.35 -0.28 -0.02 0.6 -7.31 -1.12 -1.13 -0.17 -0.43 -0.35 0.72 0.75 0.33 -2.35 0.79 -0.15 -2.58 -0.43 0.13 -0.34 0.24 -0.07
Zm00001d052905 (GRMZM2G098557)
 0.04 -0.05 0.26 0.66 0.01 -1.07 -1.29 -0.53 -1.26 -0.38 0.51 -0.22 -0.38 1.55 -0.89 0.57 0.16 -0.33 0.22 -5.03 -0.95 -0.37 -0.2 0.0 -1.03 0.59 0.4 0.53 -2.05 1.29 0.07 -1.25 0.05 0.69 -1.05 -0.03 0.21
Zm00001d052922 (GRMZM2G104449)
 0.5 -0.28 0.96 -0.53 0.55 0.22 -0.15 -0.57 -0.14 0.5 0.36 0.07 -0.65 -0.06 0.27 0.88 0.19 0.13 -0.29 -7.36 -0.8 -0.91 0.15 -0.34 -0.11 0.81 0.5 -0.43 -1.53 0.4 -1.16 -3.06 -1.34 -0.22 0.58 0.81 -0.03
Zm00001d053665 (GRMZM2G050484)
 -0.48 -0.99 1.16 1.93 0.87 -0.17 -0.25 -1.05 -0.97 -1.06 -0.79 -0.31 -0.72 -0.39 -0.57 0.34 0.08 0.1 0.96 -3.48 -0.49 -0.84 0.5 -1.24 -0.7 0.52 0.33 0.57 0.45 0.23 -1.09 -1.44 -0.23 -0.43 0.18 0.03 -0.3
Zm00001d053741 (GRMZM2G143445)
 -1.17 -0.54 1.39 -0.22 0.41 -0.19 -0.48 -0.47 -1.17 -0.81 1.44 -0.05 -1.05 -0.71 -0.79 0.1 0.65 0.18 0.08 -7.19 -1.07 -1.33 0.61 0.57 -0.53 0.47 0.59 0.33 -1.91 1.06 -0.53 0.14 -0.52 0.07 -0.2 0.31 -0.3
Zm00001d053931 (GRMZM2G174568)
 -0.15 -0.37 0.5 0.39 0.34 -0.37 -0.2 -0.42 -1.15 -0.98 -0.39 -0.29 -0.13 0.33 -0.62 0.2 0.25 0.09 0.27 -3.83 -0.8 -0.64 -0.04 -0.17 -0.08 0.66 0.92 0.33 -1.18 0.91 0.72 -2.23 -0.05 0.45 0.46 -0.04 0.36
Zm00001d053997 (GRMZM2G374088)
 -2.28 -1.62 1.12 1.01 1.13 -1.56 -2.07 -1.27 -2.46 -3.3 -0.76 -1.27 -1.75 -0.53 -0.8 0.59 -0.11 0.14 0.19 -4.23 -1.49 -0.7 -1.05 -0.93 -0.89 0.6 1.99 0.49 -2.12 1.72 -0.14 -1.57 0.2 0.71 1.69 -0.55 -0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.