Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Tin_g00859 (ATS2)	1.0	0.79	0.67	0.68	0.36	0.66	0.86
Tin_g01909 (GLR3.3)	1.0	0.94	0.39	0.4	0.49	0.3	0.84
Tin_g03053 (FdC1)	1.0	0.6	0.5	0.61	0.2	0.83	0.56
Tin_g03532	1.0	0.76	0.37	0.51	0.44	0.24	0.6
Tin_g03809 (emb1513)	1.0	0.65	0.67	0.77	0.4	0.88	0.79
Tin_g04435	1.0	0.41	0.52	0.77	0.3	0.69	0.71
Tin_g05100 (ACR3)	1.0	0.4	0.1	0.1	0.14	0.27	0.29
Tin_g06212	1.0	0.76	0.32	0.36	0.33	0.26	0.82
Tin_g06839	1.0	0.5	0.68	0.77	0.33	0.83	0.77
Tin_g08129	1.0	0.69	0.48	0.52	0.39	0.45	0.86
Tin_g08686 (ELF3)	1.0	0.71	0.75	0.67	0.59	0.67	0.74
Tin_g09355	1.0	0.61	0.81	0.82	0.38	0.96	0.76
Tin_g09371 (ALS)	1.0	0.59	0.7	0.75	0.38	0.95	0.59
Tin_g09604	1.0	0.63	0.73	0.69	0.6	0.39	0.77
Tin_g09659	1.0	0.66	0.54	0.69	0.27	0.6	0.77
Tin_g10070 (DCA1)	1.0	0.74	0.47	0.55	0.29	0.51	0.93
Tin_g10133 (RHF2A)	0.94	0.53	0.61	0.58	0.35	0.52	1.0
Tin_g11053	1.0	0.39	0.52	0.8	0.31	0.76	0.81
Tin_g11083	1.0	0.65	0.57	0.62	0.5	0.51	0.91
Tin_g11471 (OVA5)	1.0	0.76	0.7	0.79	0.5	0.72	0.76
Tin_g13159 (TOC132)	1.0	0.68	0.45	0.48	0.51	0.55	0.64
Tin_g13420	1.0	0.8	0.8	0.81	0.59	0.96	0.77
Tin_g13798	1.0	0.79	0.66	0.7	0.34	0.45	0.87
Tin_g14314 (FTSH11)	1.0	0.75	0.57	0.66	0.39	0.52	0.86
Tin_g14379	1.0	0.41	0.38	0.49	0.27	0.46	0.96
Tin_g14648	1.0	0.74	0.6	0.61	0.45	0.57	0.76
Tin_g16264	1.0	0.68	0.43	0.61	0.27	0.6	0.7
Tin_g16282	1.0	0.65	0.5	0.61	0.14	0.4	0.61
Tin_g16319	1.0	0.34	0.48	0.29	0.31	0.28	0.64
Tin_g16960	1.0	0.37	0.19	0.11	0.21	0.32	0.69
Tin_g17631	1.0	0.78	0.57	0.7	0.62	0.65	0.72
Tin_g17800 (EMB2261)	1.0	0.81	0.74	0.63	0.57	0.59	0.83
Tin_g17825	1.0	0.68	0.75	0.66	0.64	0.48	0.81
Tin_g18053	1.0	0.12	0.2	0.06	0.0	0.25	0.81
Tin_g18082	0.8	0.0	0.1	0.0	0.03	0.08	1.0
Tin_g18551 (APO2)	1.0	0.71	0.7	0.83	0.62	0.92	0.8
Tin_g19176	1.0	0.72	0.48	0.57	0.47	0.54	0.98
Tin_g19597	1.0	0.09	0.14	0.01	0.0	0.06	0.76
Tin_g19721	1.0	0.53	0.43	0.46	0.19	0.46	0.54
Tin_g20315	1.0	0.39	0.3	0.36	0.11	0.24	0.75
Tin_g20558 (HMA2)	1.0	0.55	0.39	0.44	0.19	0.26	0.87
Tin_g20806	1.0	0.0	0.11	0.04	0.0	0.0	0.39
Tin_g20880	1.0	0.58	0.39	0.58	0.24	0.55	0.53
Tin_g20948	1.0	0.62	0.55	0.48	0.29	0.28	0.69
Tin_g21298	0.92	0.51	0.57	0.64	0.38	0.52	1.0
Tin_g21650	1.0	0.47	0.69	0.59	0.3	0.2	0.67
Tin_g21735	0.96	0.99	0.49	0.31	0.29	0.19	1.0
Tin_g23726	1.0	0.48	0.29	0.32	0.06	0.18	0.77
Tin_g23939 (SAT-106)	1.0	0.53	0.48	0.54	0.19	0.45	0.9
Tin_g24994	1.0	0.53	0.58	0.67	0.11	0.39	0.64
Tin_g25220 (YSL6)	1.0	0.72	0.81	0.7	0.59	0.48	0.87
Tin_g26423	0.73	0.68	0.35	0.56	0.36	0.42	1.0
Tin_g26861	0.97	0.31	0.33	0.5	0.2	0.33	1.0
Tin_g26871	1.0	0.75	0.66	0.66	0.55	0.53	0.6
Tin_g26996	1.0	0.57	0.35	0.42	0.43	0.36	0.51
Tin_g28206	1.0	0.45	0.09	0.13	0.19	0.3	0.31
Tin_g28428 (MYC2)	0.89	0.49	0.53	0.54	0.32	0.4	1.0
Tin_g28547	1.0	0.64	0.48	0.45	0.36	0.58	0.57
Tin_g28823	0.94	1.0	0.61	0.33	0.38	0.3	0.98
Tin_g29309	1.0	0.52	0.52	0.49	0.11	0.32	0.48
Tin_g29598	1.0	0.6	0.64	0.69	0.33	0.68	0.76
Tin_g30111 (CYP71B20)	1.0	0.14	0.13	0.14	0.01	0.08	0.54
Tin_g32852	1.0	0.54	0.49	0.57	0.09	0.36	0.56
Tin_g34108	1.0	0.92	0.29	0.44	0.36	0.39	0.74
Tin_g35131	1.0	0.85	0.34	0.67	0.47	0.4	0.62
Tin_g37052	1.0	0.79	0.66	0.74	0.57	0.65	0.8
Tin_g37465	1.0	0.71	0.75	0.81	0.82	0.63	0.94
Tin_g38292 (CYP71B37)	1.0	0.2	0.14	0.23	0.03	0.13	0.82
Tin_g38368	1.0	0.69	0.72	0.58	0.46	0.54	0.85
Tin_g38648	1.0	0.65	0.3	0.17	0.11	0.18	0.61
Tin_g39334	1.0	0.6	0.65	0.28	0.38	0.27	0.59
Tin_g43654	1.0	0.37	0.39	0.32	0.33	0.35	0.91
Tin_g44237 (AFH14)	0.96	0.57	0.51	0.58	0.38	0.49	1.0
Tin_g44455	1.0	0.87	0.53	0.77	0.21	0.4	0.63
Tin_g44981	1.0	0.8	0.32	0.46	0.34	0.55	0.76
Tin_g45198	0.96	0.79	0.49	0.57	0.24	0.39	1.0
Tin_g46119 (CYP71A26)	1.0	0.21	0.15	0.29	0.03	0.16	0.91
Tin_g46149 (BAM2)	1.0	0.54	0.62	0.56	0.56	0.5	0.94

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)