Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Tin_g30573 (GRF2)
- - - - - -1.26 2.72
- - - - - -0.95 2.7
- - - - - -0.84 2.69
- - - - - -0.86 2.69
- - - - - -0.89 2.69
- - - - - -0.82 2.69
- - - - - -1.09 2.71
- - - - - -0.72 2.68
- - - - - -2.52 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.32 2.77
- - - - -3.43 -3.3 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.01 2.78
- - - - - -1.86 2.75
Tin_g33739 (Hsp70b)
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.61 2.74
Tin_g33912 (ATPT2)
- - - -9.34 -9.09 -6.43 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -0.93 2.7
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.28 2.72
- - - - - - 2.81
Tin_g34437 (CAM6)
- - -4.21 - - -2.57 2.76
Tin_g34479 (BIP)
- - - - - -0.74 2.68
- - - - - - 2.81
Tin_g34564 (mMDH1)
- - - - - -0.89 2.69
- - - - - -5.68 2.8
-2.24 -6.13 -3.66 -2.91 - -1.59 2.64
- - - - - -2.88 2.78
- - - - -3.97 -3.05 2.77
Tin_g35615 (MAX1)
- - - - - -4.92 2.8
- -5.17 - - - -6.42 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.68 2.8
- - - - - -2.74 2.78
- - - - - -0.6 2.66
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.31 2.77
Tin_g36421 (Hsp70b)
- -2.31 - - - -0.73 2.63
- - - - - -0.66 2.67
Tin_g36635 (AAC3)
- - - - - -1.08 2.71
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - -3.81 - -3.69 - 2.78
Tin_g37017 (AGL42)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - -1.4 -1.22 2.63
Tin_g37120 (PFL)
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.36 2.77
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.12 2.71
Tin_g37839 (XSP1)
- - -10.55 - - -6.5 2.8
- - - - - -2.02 2.76
- - - - - -0.67 2.67
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.94 2.75
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.69 2.8
- - - - -2.83 -3.26 2.76
- - - - - -1.21 2.72
- - - - - -1.95 2.75
- - - - - - 2.81
Tin_g39189 (PHP)
- - - - - - 2.81
- - - - - -0.87 2.69
- - - - - -1.19 2.71
- - - - - -1.62 2.74
- - - - - - 2.81
Tin_g39329 (CCD7)
- - - - - -7.76 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -0.72 2.68
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.66 2.77
Tin_g39643 (HTA9)
- - - - - -0.69 2.67
- - - - - -3.39 2.79
- - - - - -0.97 2.7
- - - - - -1.14 2.71
- - - - - -2.47 2.77
- - - - - -0.65 2.67
- - -10.49 - - -6.3 2.8
- - - - - -1.14 2.71
- - - - -5.1 -1.38 2.72
- - - - - -5.75 2.8
- - - - - -0.63 2.67
- - - - - -2.98 2.78
- - - - - -0.79 2.68
- - -5.08 - -6.98 -3.87 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.25 2.76
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.13 2.76
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.98 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.57 2.74
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.31 2.72
- - - - - -0.8 2.68
- - - - - -1.67 2.74
- - - - - -2.85 2.78
- - - - - -2.69 2.78
- - - - - -4.23 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.68 2.74
- - - -3.48 - -1.86 2.73
- - - - - -0.93 2.69
- - - - - -0.59 2.66
- - - - - -1.36 2.72
- - -3.46 - - - 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.98 2.75
- - - - - -0.98 2.7
Tin_g42231 (USPL1)
- - - - -5.56 -5.04 2.8
- - - - - -0.93 2.69
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -0.69 2.67
- - - - - - 2.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.