Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
4.08 1.37 10.65 10.95 9.46 8.96 17.28
17.68 18.95 32.95 35.36 25.3 33.1 44.69
Tin_g00942 (AUD1)
44.2 37.83 85.84 95.26 71.61 72.68 156.56
Tin_g00968 (AFB2)
4.24 5.69 10.63 10.92 13.39 12.44 26.48
8.37 8.86 10.98 10.34 10.59 10.2 13.95
13.6 13.97 46.77 40.62 54.07 40.84 128.13
Tin_g03517 (PUM12)
1.39 1.54 4.03 4.34 4.66 3.83 6.36
Tin_g03897 (TBP1)
37.75 32.25 49.58 48.41 46.44 39.0 52.53
3.38 3.93 14.61 12.77 7.47 10.55 31.54
2.56 2.86 4.87 4.91 3.95 3.91 7.54
17.42 15.42 42.33 43.19 36.77 38.81 72.7
Tin_g06000 (ADT6)
29.01 20.47 65.61 75.96 32.76 47.66 114.16
Tin_g06048 (BGLU42)
6.76 7.23 26.96 18.19 19.59 10.82 42.15
19.89 14.94 36.99 50.08 34.74 36.98 67.61
Tin_g06124 (RAN1)
10.04 10.17 16.26 17.81 14.06 10.95 25.84
2.11 10.0 52.83 35.84 29.89 14.71 79.66
0.34 0.46 0.63 1.31 0.44 0.57 2.04
7.01 5.95 20.95 18.83 17.71 11.03 30.06
5.44 3.37 9.06 7.76 6.16 9.34 15.37
Tin_g08511 (C4H)
7.53 10.77 46.53 48.02 58.25 49.45 268.71
1.9 3.79 8.03 9.0 10.54 5.03 17.22
Tin_g09581 (DAL1)
10.58 10.54 18.28 16.61 16.9 16.89 25.47
13.38 9.5 20.55 19.02 15.63 19.38 29.93
0.74 1.23 8.88 7.03 10.57 5.59 23.65
Tin_g10320 (ACO3)
5.28 8.05 16.08 17.87 15.63 14.49 25.12
Tin_g10455 (CYP709B2)
1.21 1.71 5.36 6.37 5.13 6.05 19.76
1.28 1.51 4.03 4.01 4.66 4.1 13.31
24.85 23.28 36.59 40.83 34.82 29.17 41.15
Tin_g12676 (TT7)
0.12 0.31 2.61 2.43 3.17 2.02 5.44
0.29 0.48 2.47 2.31 2.9 1.71 6.16
3.34 1.99 10.94 8.13 6.58 6.01 17.1
Tin_g13214 (RR1)
6.1 9.18 18.23 14.42 17.59 16.09 40.72
2.89 3.17 4.83 5.82 4.14 7.49 12.49
Tin_g13820 (RBL1)
21.95 25.26 58.61 49.94 42.66 35.25 78.9
3.69 4.07 8.01 6.93 10.18 7.12 18.75
Tin_g14358 (SK13)
10.94 5.89 13.92 12.08 16.63 20.29 43.99
Tin_g14550 (WOL)
1.27 2.78 8.69 12.53 3.14 5.32 21.61
Tin_g14805 (GRF2)
2.71 2.09 5.78 5.76 3.54 4.44 9.87
33.81 30.3 47.39 52.25 45.18 44.84 59.97
1.99 2.57 3.8 4.95 3.34 3.01 7.59
1.75 1.7 7.36 13.3 5.94 7.82 18.73
Tin_g19244 (ADT6)
7.26 11.85 29.63 36.25 29.56 26.36 45.5
12.19 9.41 27.74 33.23 29.42 30.41 83.11
Tin_g19990 (FEI1)
1.66 1.36 5.3 4.86 2.77 4.27 11.2
1.58 1.43 3.4 3.69 3.34 2.07 5.99
Tin_g21984 (SDF2)
26.63 27.35 39.58 49.04 48.57 38.97 61.12
14.92 16.68 60.33 69.01 63.88 32.92 125.28
3.67 7.4 27.3 14.4 14.18 18.41 67.86
1.7 1.06 1.87 2.91 1.18 2.0 4.21
2.2 1.85 7.98 7.15 4.29 8.04 14.37
1.89 0.95 3.75 3.7 3.9 3.17 4.68
1.36 0.96 2.01 2.08 2.05 2.13 4.73
4.11 5.17 14.35 11.33 9.54 8.82 21.93
18.07 14.51 46.55 51.84 54.01 47.05 142.0
27.22 14.37 195.83 267.04 74.54 168.72 436.32
Tin_g27763 (DDE1)
1.67 1.46 2.13 2.86 3.3 3.33 7.96
2.85 2.74 6.98 7.44 4.88 6.03 11.29
0.03 0.07 1.65 0.81 2.28 2.42 5.16
Tin_g30115 (MAPKKK15)
0.19 0.4 1.08 0.46 2.29 1.87 6.58
2.18 2.08 3.22 2.93 3.23 3.05 4.38
1.54 1.65 3.03 5.55 1.27 2.89 8.8
0.61 0.07 1.65 2.24 0.89 2.01 3.67
2.52 1.51 10.89 11.72 5.3 14.17 23.15
0.5 2.91 13.48 18.08 9.74 16.86 33.06
0.38 0.43 1.37 0.77 1.81 1.43 4.59
6.16 10.98 22.85 26.9 11.41 14.72 37.5
Tin_g37717 (RLP7)
0.08 0.17 3.17 5.98 1.58 1.83 8.54
10.73 8.82 16.73 16.77 14.43 13.05 21.73
1.18 0.97 3.94 6.76 2.75 5.35 11.19
3.52 9.29 22.87 33.8 12.08 15.82 60.94
Tin_g44186 (ARFA1B)
1.47 3.21 8.43 11.67 8.77 7.4 21.01
2.28 2.45 5.33 5.64 4.54 3.99 7.72

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)