Heatmap: Cluster_323 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002682 (GRMZM2G019783)
0.16 0.19 0.56 0.76 0.65 0.27 0.33 0.28 0.24 0.26 0.43 0.44 0.26 0.37 0.34 0.41 0.49 0.38 0.39 0.0 0.23 0.81 0.37 0.48 0.4 0.19 0.34 0.2 1.0 0.38 0.27 0.01 0.04 0.34 0.4 0.39 0.2
Zm00001d002730 (GRMZM2G170516)
0.11 0.09 0.17 0.17 0.15 0.22 0.23 0.3 0.33 0.34 0.11 0.45 0.22 0.2 0.19 0.25 0.2 0.26 0.17 0.01 0.38 0.29 0.36 0.48 0.28 0.13 0.19 0.18 0.14 0.27 0.13 1.0 0.11 0.07 0.54 0.25 0.18
Zm00001d002819 (GRMZM5G825909)
0.24 0.12 0.38 0.7 0.44 0.3 0.21 0.26 0.19 0.23 0.16 0.44 0.35 1.0 0.36 0.36 0.17 0.26 0.21 0.01 0.25 0.25 0.42 0.29 0.2 0.5 0.19 0.28 0.09 0.69 0.17 0.13 0.09 0.23 0.27 0.45 0.34
Zm00001d005158 (GRMZM5G863076)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 0.61 0.0 0.1 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.01 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.03 0.09 0.03
Zm00001d005328 (GRMZM2G085939)
0.12 0.13 0.23 0.26 0.3 0.28 0.29 0.25 0.19 0.24 0.22 0.57 0.25 0.44 0.28 0.44 0.29 0.32 0.21 0.03 1.0 0.23 0.57 0.44 0.31 0.17 0.3 0.29 0.27 0.87 0.2 0.22 0.17 0.23 0.11 0.36 0.38
Zm00001d006628 (GRMZM2G360517)
0.12 0.19 0.31 0.43 0.27 0.12 0.21 0.13 0.09 0.15 0.23 0.24 0.18 0.3 0.16 0.33 0.27 0.2 0.28 0.0 0.07 0.16 0.24 0.22 0.15 0.28 0.28 0.33 0.07 1.0 0.21 0.09 0.15 0.26 0.08 0.28 0.31
Zm00001d006629 (GRMZM2G060114)
0.09 0.18 0.24 0.42 0.22 0.24 0.27 0.28 0.19 0.23 0.16 0.6 0.62 0.53 0.36 0.39 0.36 0.22 0.44 0.01 0.35 0.3 0.16 0.32 0.22 0.29 0.36 0.39 0.06 1.0 0.31 0.06 0.22 0.19 0.29 0.37 0.32
Zm00001d008591 (GRMZM2G119361)
0.39 0.15 0.4 0.96 0.46 0.07 0.14 0.12 0.21 0.21 0.04 0.29 0.63 0.51 0.26 0.28 0.37 0.26 0.31 0.0 0.2 0.48 0.32 1.0 0.28 0.31 0.33 0.38 0.2 0.57 0.36 0.27 0.41 0.31 0.36 0.3 0.24
0.3 0.12 0.33 0.4 0.46 0.69 0.58 0.68 0.54 0.42 0.47 0.85 0.44 0.7 0.53 0.54 0.37 0.38 0.26 0.03 0.75 0.57 1.0 0.34 0.46 0.41 0.39 0.38 0.73 0.55 0.35 0.4 0.15 0.21 0.24 0.49 0.53
Zm00001d012336 (GRMZM2G057075)
0.12 0.05 0.28 0.33 0.25 0.16 0.15 0.19 0.18 0.18 0.09 0.36 0.44 0.29 0.25 0.3 0.21 0.19 0.15 0.01 0.38 0.35 0.43 0.31 0.24 0.4 0.15 0.31 0.24 1.0 0.14 0.14 0.14 0.14 0.75 0.24 0.23
Zm00001d012625 (GRMZM5G869971)
0.25 0.16 0.36 0.57 0.73 0.31 0.23 0.15 0.3 0.39 0.21 0.58 0.55 0.58 0.48 0.48 0.27 0.44 0.63 0.01 0.39 0.28 0.36 0.29 0.34 1.0 0.23 0.25 0.38 0.81 0.2 0.17 0.07 0.24 0.39 0.46 0.45
0.32 0.21 0.26 0.37 0.32 0.41 0.6 0.34 0.46 0.62 0.67 0.8 0.47 0.61 0.64 0.66 0.37 0.31 0.3 0.0 0.44 0.27 0.51 0.49 0.41 0.19 0.24 0.4 0.27 1.0 0.23 0.18 0.16 0.31 0.25 0.71 0.54
Zm00001d012746 (GRMZM2G013391)
0.07 0.04 0.17 1.0 0.9 0.27 0.36 0.15 0.26 0.2 0.62 0.63 0.03 0.41 0.45 0.3 0.12 0.12 0.05 0.0 0.21 0.06 0.25 0.18 0.15 0.09 0.08 0.08 0.0 0.05 0.11 0.02 0.08 0.04 0.16 0.3 0.52
Zm00001d016655 (GRMZM2G020840)
0.08 0.01 0.1 0.65 0.27 0.29 0.11 0.13 0.19 0.1 0.21 0.45 0.09 0.74 0.19 0.36 0.03 0.09 0.11 0.0 0.21 0.09 0.44 0.03 0.1 0.28 0.04 0.16 1.0 0.49 0.13 0.18 0.02 0.14 0.09 0.25 0.12
Zm00001d018388 (GRMZM2G469142)
0.15 0.03 0.15 0.42 0.46 0.24 0.26 0.23 0.19 0.24 0.08 0.51 0.24 0.27 0.46 0.34 0.14 0.15 0.28 0.0 0.22 0.11 0.27 0.26 0.12 0.15 0.17 0.27 0.39 1.0 0.43 0.2 0.04 0.08 0.04 0.27 0.24
Zm00001d018826 (GRMZM2G093761)
0.08 0.07 0.26 0.41 0.32 0.21 0.22 0.11 0.27 0.29 0.17 0.35 0.18 0.42 0.29 0.28 0.11 0.16 0.15 0.0 0.17 0.12 0.43 0.11 0.18 0.51 0.24 0.24 1.0 0.17 0.1 0.29 0.05 0.13 0.16 0.24 0.19
0.18 0.24 0.35 0.62 0.4 0.42 0.37 0.25 0.22 0.38 0.41 0.56 0.23 0.64 0.35 0.52 0.33 0.29 0.4 0.03 0.13 0.25 0.5 0.31 0.22 0.21 0.4 0.42 0.04 1.0 0.28 0.08 0.22 0.38 0.14 0.67 0.68
Zm00001d023498 (GRMZM2G156506)
0.1 0.11 0.19 0.42 0.92 0.11 0.09 0.12 0.05 0.04 0.19 0.37 0.3 0.47 0.25 0.32 0.46 0.18 0.07 0.0 0.26 0.27 0.11 0.25 0.3 0.42 0.15 0.22 0.0 1.0 0.16 0.02 0.03 0.27 0.13 0.26 0.41
Zm00001d024143 (GRMZM2G146981)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.53
Zm00001d025950 (GRMZM2G000973)
0.43 0.24 1.0 0.79 0.63 0.16 0.23 0.33 0.45 0.49 0.04 0.45 0.65 0.76 0.58 0.68 0.29 0.49 0.2 0.0 0.46 0.5 0.39 0.62 0.4 0.77 0.36 0.35 0.38 0.75 0.21 0.09 0.13 0.34 1.0 0.66 0.43
Zm00001d026695 (GRMZM2G011590)
0.03 0.02 0.14 0.38 0.29 0.12 0.16 0.07 0.28 0.32 0.32 0.56 0.2 0.6 0.43 0.24 0.07 0.15 0.19 0.0 0.12 0.08 0.21 0.2 0.14 1.0 0.14 0.2 0.92 0.19 0.04 0.17 0.05 0.16 0.18 0.25 0.23
Zm00001d026704 (GRMZM5G885706)
0.25 0.16 0.53 0.24 0.63 0.6 0.55 0.63 0.43 0.48 0.49 0.68 0.6 0.62 0.68 0.53 0.32 0.34 0.37 0.01 0.41 0.52 0.45 0.27 0.52 1.0 0.37 0.35 0.78 0.62 0.33 0.22 0.11 0.31 0.48 0.65 0.53
Zm00001d027266 (GRMZM2G073979)
0.28 0.13 0.72 0.49 0.57 0.47 0.51 0.35 0.23 0.32 0.57 0.66 0.3 0.55 0.39 0.54 0.32 0.29 0.31 0.0 0.22 0.33 0.25 0.22 0.36 1.0 0.38 0.4 0.5 0.75 0.18 0.18 0.11 0.34 0.45 0.63 0.6
Zm00001d030098 (GRMZM2G158976)
0.22 0.05 0.17 0.74 0.39 0.35 0.33 0.36 0.24 0.26 0.04 0.56 0.33 0.49 0.29 0.31 0.21 0.17 0.15 0.0 0.48 0.17 1.0 0.35 0.14 0.18 0.4 0.24 0.19 0.21 0.34 0.27 0.11 0.07 0.16 0.42 0.65
Zm00001d032899 (GRMZM2G017388)
0.07 0.02 0.12 0.06 0.11 0.11 0.11 0.07 0.16 0.14 0.04 0.33 0.42 0.69 0.37 0.38 0.03 0.14 0.07 0.0 0.26 0.19 0.04 0.09 0.22 0.6 0.79 0.2 0.3 1.0 0.19 0.06 0.03 0.1 0.29 0.23 0.04
0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.33 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
Zm00001d033316 (GRMZM2G472643)
0.04 0.01 0.03 0.1 0.26 0.5 0.94 0.14 0.33 0.27 0.95 1.0 0.05 0.71 0.34 0.74 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.87 0.03 0.04 0.02 0.06 0.04 0.12 0.04 0.5 0.01 0.01 0.01 0.05 0.43 0.31
Zm00001d034521 (GRMZM2G047299)
0.0 0.0 0.4 0.05 0.57 0.08 0.09 0.04 0.3 0.14 0.1 0.36 0.0 0.33 0.29 0.02 0.0 0.06 0.05 0.0 0.01 0.01 0.6 0.0 0.06 0.22 1.0 0.08 0.8 0.12 0.01 0.22 0.01 0.12 0.36 0.26 0.16
Zm00001d034740 (GRMZM2G156459)
0.3 0.36 1.0 0.49 0.98 0.4 0.35 0.39 0.28 0.28 0.73 0.66 0.46 0.41 0.43 0.68 0.88 0.62 0.52 0.02 0.7 0.44 0.99 0.82 0.85 0.7 0.79 0.6 0.79 0.62 0.73 0.11 0.33 0.69 0.99 0.6 0.5
0.01 0.05 0.13 0.15 0.1 0.21 0.2 0.22 0.25 0.35 0.09 0.61 0.08 0.6 0.26 0.29 0.25 0.24 0.14 0.0 0.5 0.14 0.26 0.37 0.16 0.24 0.19 0.23 0.42 1.0 0.22 0.27 0.08 0.14 0.09 0.34 0.31
Zm00001d036440 (GRMZM2G134930)
0.04 0.08 0.24 0.61 0.78 0.47 0.35 0.16 0.36 0.39 0.62 0.81 0.33 1.0 0.56 0.5 0.64 0.2 0.13 0.01 0.15 0.2 0.7 0.14 0.27 0.46 0.7 0.19 0.33 0.46 0.17 0.09 0.02 0.21 0.17 0.65 0.94
0.0 0.0 0.3 0.65 0.49 0.4 0.97 0.4 0.69 0.49 0.9 1.0 0.11 0.61 0.51 0.51 0.09 0.08 0.08 0.01 0.48 0.31 0.21 0.05 0.36 0.1 0.06 0.05 0.14 0.31 0.14 0.06 0.03 0.03 0.33 0.41 0.71
Zm00001d038478 (GRMZM2G390436)
0.01 0.0 0.16 0.63 0.17 0.01 0.05 0.12 0.33 0.21 0.3 1.0 0.13 0.18 0.52 0.52 0.05 0.12 0.16 0.0 0.05 0.08 0.0 0.16 0.1 0.27 0.05 0.11 0.0 0.3 0.06 0.05 0.08 0.11 0.27 0.32 0.13
Zm00001d038684 (GRMZM2G120173)
0.29 0.63 0.56 0.65 0.61 0.34 0.3 0.51 0.4 0.39 0.21 1.0 0.58 0.57 0.61 0.53 0.57 0.56 0.86 0.04 0.48 0.25 0.51 1.0 0.44 0.41 0.72 0.87 0.55 0.76 0.47 0.22 0.78 0.94 0.44 0.63 0.6
Zm00001d039173 (GRMZM2G026884)
0.0 0.0 0.04 0.11 0.2 0.21 0.16 0.11 0.06 0.09 0.84 0.76 0.03 0.2 0.23 0.06 0.12 0.15 0.22 0.0 0.17 0.12 1.0 0.21 0.33 0.24 0.14 0.09 0.18 0.21 0.06 0.01 0.02 0.12 0.14 0.27 0.22
Zm00001d039916 (GRMZM2G169182)
0.12 0.07 0.26 1.0 0.4 0.26 0.24 0.25 0.13 0.16 0.08 0.31 0.31 0.84 0.32 0.3 0.23 0.27 0.18 0.0 0.17 0.2 0.37 0.27 0.18 0.35 0.31 0.24 0.29 0.45 0.16 0.2 0.23 0.22 0.15 0.34 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.1 0.07 0.21 1.0 0.14 0.96 0.0 0.0 0.46 0.01 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.08 0.07 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.17 0.01 0.23 0.8
Zm00001d041201 (GRMZM2G062613)
0.03 0.07 0.17 0.29 0.64 0.12 0.07 0.08 0.22 0.31 0.18 0.56 0.18 1.0 0.45 0.29 0.21 0.26 0.1 0.0 0.26 0.11 0.5 0.16 0.28 1.0 0.46 0.2 0.42 0.56 0.41 0.01 0.09 0.46 0.72 0.49 0.27
0.08 0.01 0.27 0.33 0.31 0.54 0.2 0.22 0.14 0.12 0.16 0.65 0.08 0.39 0.16 0.25 0.04 0.06 0.04 0.0 0.14 0.06 1.0 0.14 0.07 0.11 0.1 0.03 0.03 0.1 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.25 0.4
Zm00001d042808 (GRMZM2G128918)
0.44 0.16 0.32 0.46 0.55 0.48 0.31 0.46 0.29 0.3 0.56 0.66 0.48 0.78 0.45 0.5 0.24 0.36 0.25 0.02 0.37 0.49 0.25 0.18 0.47 0.45 0.52 0.58 1.0 0.7 0.42 0.74 0.34 0.36 0.44 0.45 0.54
Zm00001d043519 (GRMZM5G815165)
0.27 0.16 0.46 0.22 1.0 0.29 0.28 0.17 0.39 0.48 0.32 0.49 0.08 0.1 0.5 0.28 0.11 0.42 0.57 0.0 0.14 0.11 0.45 0.14 0.17 0.17 0.28 0.14 0.56 0.17 0.22 0.13 0.06 0.19 0.4 0.66 0.38
Zm00001d044451 (GRMZM2G034536)
0.26 0.18 0.62 1.0 0.61 0.18 0.12 0.16 0.25 0.3 0.26 0.47 0.32 0.43 0.39 0.44 0.22 0.31 0.38 0.04 0.17 0.3 0.74 0.17 0.27 0.73 0.34 0.24 0.49 0.35 0.18 0.22 0.03 0.23 0.18 0.38 0.21
Zm00001d046148 (GRMZM2G021879)
0.11 0.02 0.18 0.66 0.66 0.81 0.45 0.42 0.47 0.49 0.51 1.0 0.22 0.94 0.6 0.56 0.1 0.16 0.08 0.01 0.24 0.1 0.43 0.14 0.12 0.13 0.16 0.14 0.55 0.44 0.07 0.54 0.05 0.08 0.05 0.52 0.61
Zm00001d046378 (GRMZM2G009335)
0.19 0.12 0.61 0.52 0.66 0.62 0.57 0.37 0.33 0.48 0.47 0.6 0.63 1.0 0.48 0.48 0.15 0.33 0.11 0.0 0.1 0.11 0.64 0.1 0.29 0.33 0.55 0.24 0.64 0.29 0.13 0.06 0.03 0.27 0.08 0.63 0.3
Zm00001d046499 (GRMZM2G058336)
0.06 0.06 0.19 0.32 0.27 0.29 0.28 0.35 0.25 0.26 0.42 0.62 0.4 0.45 0.39 0.31 0.39 0.26 0.23 0.01 0.44 0.3 0.33 0.58 0.35 0.39 0.25 0.27 0.85 1.0 0.21 0.71 0.13 0.21 0.68 0.33 0.3
Zm00001d046716 (GRMZM2G092493)
0.55 0.09 0.41 0.66 0.87 0.42 0.34 0.34 0.2 0.2 0.6 0.59 0.22 0.59 0.39 0.46 0.49 0.29 0.31 0.01 0.44 0.24 0.39 0.36 0.33 0.21 0.17 0.34 0.49 1.0 0.31 0.09 0.21 0.37 0.11 0.61 0.81
Zm00001d047335 (GRMZM2G113866)
0.07 0.02 0.47 0.73 0.72 0.51 0.38 0.29 0.3 0.41 0.36 0.91 0.12 0.43 0.57 0.23 0.43 0.33 0.51 0.01 0.71 0.53 0.77 0.64 0.33 0.28 0.17 0.33 1.0 0.18 0.3 0.34 0.09 0.11 0.04 0.48 0.42
Zm00001d048431 (GRMZM2G115674)
0.13 0.14 0.27 0.37 0.27 0.53 0.4 0.34 0.16 0.24 0.13 0.33 0.38 0.68 0.24 0.46 0.49 0.29 0.25 0.0 0.4 0.34 0.28 0.44 0.23 0.25 0.26 0.26 0.1 1.0 0.37 0.08 0.1 0.22 0.16 0.44 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0
Zm00001d050886 (GRMZM2G312806)
0.12 0.25 0.41 0.75 0.35 0.33 0.24 0.63 0.37 0.35 0.06 0.76 0.54 0.57 0.55 0.34 0.75 0.39 0.76 0.16 0.48 0.42 0.58 0.69 0.29 0.34 0.43 0.46 0.26 1.0 0.5 0.74 0.33 0.29 0.67 0.48 0.27
0.07 0.06 0.02 0.04 0.06 0.01 0.0 0.09 0.11 0.08 0.03 1.0 0.23 0.13 0.47 0.08 0.01 0.08 0.05 0.0 0.07 0.04 0.01 0.17 0.1 0.23 0.22 0.11 0.0 0.21 0.27 0.06 0.03 0.09 0.07 0.18 0.27
0.4 0.33 0.71 0.74 0.62 0.15 0.1 0.15 0.2 0.19 0.26 0.43 0.4 0.44 0.25 0.41 0.29 0.41 0.42 0.06 0.23 0.19 0.23 0.23 0.2 0.33 0.28 0.4 1.0 0.53 0.23 0.32 0.22 0.47 0.17 0.36 0.19
Zm00001d052303 (GRMZM2G059669)
0.7 0.52 0.51 0.75 0.58 0.26 0.12 0.47 0.44 0.38 0.06 0.44 0.84 0.44 0.55 0.69 0.82 0.77 0.43 0.09 0.86 0.47 0.38 0.71 0.37 0.32 0.52 0.53 0.13 0.71 0.25 1.0 0.28 0.12 0.95 0.52 0.35
Zm00001d052561 (GRMZM2G011173)
0.57 0.26 0.75 0.37 0.45 0.2 0.18 0.16 0.3 0.31 0.03 0.55 0.38 0.23 0.34 0.35 0.26 0.52 0.28 0.0 0.25 0.16 0.29 0.38 0.22 0.56 0.31 0.67 0.23 1.0 0.23 0.18 0.24 0.2 0.4 0.47 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)