Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Tin_g00596	0.43	0.14	0.29	-0.04	-1.01	-0.91	0.41
Tin_g00608 (TET8)	0.1	-0.82	0.66	0.23	-0.97	-0.28	0.34
Tin_g00921	0.13	-0.03	0.29	0.16	-1.04	-0.05	0.18
Tin_g00979 (BZO2H3)	-0.04	-0.13	0.17	0.14	-0.26	-0.29	0.3
Tin_g01104	0.76	-0.07	0.1	-1.16	-2.41	-1.5	1.2
Tin_g01107	-1.12	0.59	0.25	-0.49	-0.26	-0.81	0.79
Tin_g01115 (UBP23)	0.06	-0.1	-0.11	0.12	-0.02	-1.11	0.65
Tin_g01332	0.77	-0.09	0.59	0.32	-2.25	-1.49	0.05
Tin_g01488	0.23	0.05	0.22	0.1	-0.52	-0.26	0.03
Tin_g01959	0.21	-0.1	0.32	0.07	-0.71	-0.21	0.18
Tin_g01960	0.11	0.08	0.18	0.18	-0.47	-0.86	0.41
Tin_g02561	0.22	-0.02	0.32	0.19	-0.77	-0.34	0.11
Tin_g02655 (GAMMAVPE)	0.28	0.22	0.1	0.22	-0.64	-0.69	0.17
Tin_g02843 (BET9)	0.2	0.15	0.22	0.11	-0.32	-0.59	0.06
Tin_g03060	0.12	0.02	0.25	0.03	-0.68	-0.29	0.32
Tin_g03356 (SSADH)	0.18	-0.15	0.15	0.18	-0.35	-0.37	0.22
Tin_g03510 (NAC2)	0.49	-0.09	0.44	-0.35	-0.79	-0.75	0.43
Tin_g03850 (UGE5)	0.02	0.55	0.66	-0.16	-1.73	-1.16	0.37
Tin_g03915 (GPA1)	0.42	0.05	0.15	0.07	-0.37	-0.88	0.21
Tin_g03929 (UBC32)	0.09	0.07	0.47	0.23	-0.41	-1.06	0.13
Tin_g04430	0.22	0.12	0.37	0.14	-0.61	-0.79	0.17
Tin_g04584 (ELM1)	0.29	0.05	0.16	0.11	-0.38	-0.5	0.09
Tin_g04619 (ERF-1)	0.17	0.08	0.3	-0.04	-1.59	-0.59	0.69
Tin_g04749 (ATG18G)	0.03	0.08	0.16	0.04	-0.26	-0.46	0.28
Tin_g04808	0.29	-0.03	0.09	0.15	-0.27	-1.24	0.46
Tin_g05010	0.12	0.15	0.0	-0.01	-0.37	-0.31	0.3
Tin_g05161 (FIM5)	0.5	0.12	0.25	0.03	-0.61	-1.07	0.22
Tin_g05181	0.22	-0.11	0.13	0.08	-0.59	-0.45	0.44
Tin_g05274	0.41	0.36	0.56	0.26	-1.34	-1.61	-0.02
Tin_g05405	0.14	-0.19	0.42	0.16	-0.52	-0.53	0.24
Tin_g05455	-0.1	0.4	0.32	0.04	-0.83	-0.78	0.4
Tin_g05489	0.47	-0.05	0.36	-0.77	-2.21	-1.33	1.12
Tin_g05587	0.23	0.06	0.08	0.05	-0.57	-0.44	0.36
Tin_g05837	0.33	-0.03	0.11	0.02	-0.28	-0.31	0.06
Tin_g06360	0.23	-0.27	0.38	-0.11	-0.35	-0.27	0.2
Tin_g06525	0.17	0.07	0.27	0.03	-0.32	-0.3	-0.01
Tin_g06563 (ABF2)	0.25	0.03	0.35	0.09	-0.53	-0.78	0.23
Tin_g06830 (ECT8)	-0.1	-0.34	0.37	-0.0	-0.11	-0.23	0.27
Tin_g07085 (DREB2C)	0.4	-0.35	0.51	-0.44	-0.8	-0.43	0.51
Tin_g07418	0.36	0.16	0.43	-0.63	-1.8	-1.1	0.89
Tin_g07524	0.41	-0.01	0.13	-0.04	-0.59	-0.79	0.45
Tin_g07611 (I14H)	-0.03	-0.1	0.54	-0.15	-0.85	-0.45	0.53
Tin_g08066	0.06	-0.15	0.27	-0.0	-0.38	-0.23	0.31
Tin_g08116	-0.06	-0.1	0.46	0.16	-0.26	-1.01	0.35
Tin_g08378 (ORG1)	0.11	0.08	0.5	0.19	-0.66	-0.85	0.17
Tin_g08480	0.06	-0.14	0.1	0.04	-0.24	-0.13	0.25
Tin_g08697 (PLDP1)	0.04	0.2	0.03	-0.16	-0.24	-0.69	0.54
Tin_g08708 (CEO)	0.19	-0.25	0.33	0.12	-0.71	-0.57	0.47
Tin_g09118 (PLP)	0.2	-0.15	0.08	0.16	-0.71	-0.44	0.51
Tin_g09929 (TPR16)	-0.0	0.08	-0.01	-0.03	-0.1	-0.41	0.37
Tin_g10423	0.21	-0.18	0.37	0.1	-0.8	-0.35	0.31
Tin_g10674	0.21	-0.6	0.81	0.08	-1.8	-1.72	0.84
Tin_g10785 (LGT1)	0.09	0.2	0.22	-0.15	-0.67	-0.26	0.33
Tin_g10991 (emb1067)	-0.12	-0.28	0.34	0.09	-0.33	-0.41	0.47
Tin_g11334 (FC2)	0.06	-0.48	0.42	-0.06	-0.14	-0.4	0.35
Tin_g11335 (FC1)	-0.02	-0.56	0.59	0.14	-0.25	-0.45	0.22
Tin_g11336	0.14	-0.57	0.54	0.15	-0.46	-0.62	0.36
Tin_g11449 (NRAMP6)	0.08	-0.23	0.4	0.25	-0.27	-0.66	0.16
Tin_g11555 (ECT8)	0.32	-0.14	0.4	-0.21	-0.39	-0.84	0.43
Tin_g12219	0.39	-0.28	0.17	-0.11	-1.46	-1.18	1.01
Tin_g12249	0.19	-0.21	0.26	-0.06	-0.41	-0.26	0.33
Tin_g12498	0.34	-0.26	0.21	0.19	-0.69	-0.73	0.47
Tin_g13088 (ZML1)	0.24	0.1	0.14	0.11	-0.57	-0.58	0.29
Tin_g13099	0.13	-0.13	0.12	0.06	-0.38	-0.24	0.32
Tin_g13662	0.26	-0.08	0.12	0.04	-0.56	-0.41	0.38
Tin_g13851 (PFK2)	0.12	0.18	0.09	0.03	-0.82	-0.13	0.28
Tin_g13919	-0.23	-0.31	0.54	0.29	-0.97	-1.03	0.74
Tin_g13983 (GWD)	0.43	0.57	0.27	0.19	-1.03	-1.29	-0.11
Tin_g14003	0.02	-0.0	0.39	0.22	-0.78	-0.22	0.1
Tin_g14172	0.02	-0.33	0.2	0.07	-0.16	-0.43	0.43
Tin_g14302 (ALA2)	0.07	-0.02	0.12	0.2	-0.15	-0.65	0.25
Tin_g14451 (ECH2)	0.26	0.04	0.08	0.2	-0.63	-0.55	0.31
Tin_g14649	0.48	0.11	0.21	0.25	-1.2	-0.91	0.28
Tin_g14679 (LEJ1)	0.28	0.22	0.29	0.09	-0.68	-0.56	0.05
Tin_g14703	0.22	-0.89	0.55	0.36	-2.63	-1.32	0.99
Tin_g14837	0.23	0.29	0.28	0.11	-1.05	-0.74	0.29
Tin_g15007 (ULT)	0.1	-0.04	0.12	-0.11	-0.11	-0.24	0.23
Tin_g15265	0.09	-0.04	0.24	0.13	-0.43	-0.16	0.08
Tin_g15476 (ATSIK)	0.58	-0.9	0.36	0.17	-1.29	-1.38	0.82
Tin_g15580 (ARA3)	0.27	-0.12	0.25	0.17	-0.53	-0.3	0.07
Tin_g15622	0.17	-0.31	0.31	-0.0	-0.39	-0.3	0.33
Tin_g16192	0.19	0.02	0.25	-0.21	-0.32	-0.73	0.48
Tin_g16346 (HMA5)	-0.03	0.73	0.52	-1.07	-2.97	-2.0	1.06
Tin_g16493 (YLS9)	0.44	-1.19	0.57	-0.72	-4.84	-1.23	1.41
Tin_g16695	-0.4	-0.29	0.33	-0.45	-1.86	0.37	0.9
Tin_g16759 (MAMI)	0.33	0.19	0.29	0.19	-1.36	-1.02	0.44
Tin_g16971 (NHD1)	0.43	0.14	0.3	0.03	-0.96	-0.66	0.19
Tin_g17004	0.05	-0.12	0.56	0.09	-0.68	-0.29	0.1
Tin_g17406	0.09	-0.24	0.39	0.2	-0.44	-0.46	0.21
Tin_g17920	-0.21	-0.98	0.74	0.39	-2.0	-0.17	0.6
Tin_g18410	0.1	0.12	0.18	0.05	-0.55	-0.35	0.27
Tin_g18695	-1.33	0.2	0.53	-0.04	-	-1.77	1.46
Tin_g18739	0.26	-0.53	0.57	0.3	-1.45	-0.7	0.5
Tin_g18807 (SAT-106)	0.68	-0.65	0.14	0.17	-1.84	-1.28	0.88
Tin_g18866	0.42	0.2	0.59	0.41	-3.12	-1.27	0.2
Tin_g19171	0.22	0.15	0.15	-0.49	-0.46	-0.16	0.36
Tin_g19311	0.46	0.05	0.46	-0.36	-1.48	-0.57	0.49
Tin_g19456	0.14	0.03	0.66	-0.2	-0.68	-0.69	0.24
Tin_g19718	0.28	-0.0	0.38	-0.02	-0.58	-0.4	0.11
Tin_g19813 (SCL14)	0.03	-0.18	0.21	-0.13	-0.34	0.01	0.3
Tin_g19955	0.1	-0.1	0.43	0.26	-0.56	-0.48	0.08
Tin_g20121	0.31	-0.71	0.28	0.08	-0.73	-0.47	0.64
Tin_g20138	0.31	0.01	0.21	-0.03	-0.43	-0.72	0.35
Tin_g20423	0.25	0.21	0.42	-0.5	-0.97	-0.67	0.55
Tin_g20424 (AHG3)	0.32	0.18	0.36	-0.38	-0.9	-0.71	0.51
Tin_g20546 (RHF2A)	-0.11	-0.11	0.25	0.21	-0.47	-0.54	0.47
Tin_g20771	0.26	0.29	0.14	-0.07	-1.54	-0.99	0.75
Tin_g21229 (UNE2)	0.32	0.26	0.23	0.24	-0.77	-0.63	-0.05
Tin_g22411	0.17	-0.26	0.24	-0.01	-0.29	-0.31	0.32
Tin_g22618	-1.15	-1.4	0.7	0.44	-2.4	-0.06	1.03
Tin_g22890	0.3	0.04	0.06	0.06	-0.39	-0.46	0.21
Tin_g23149	0.22	-0.62	0.77	0.29	-2.45	-1.48	0.78
Tin_g23345	0.67	-0.1	0.48	-0.43	-0.54	-1.09	0.24
Tin_g23608	0.32	0.41	0.28	-0.19	-1.9	-1.43	0.76
Tin_g23754	0.35	0.09	0.26	0.25	-0.89	-0.58	0.11
Tin_g23837	-0.53	0.04	0.47	0.13	-1.87	-0.69	0.94
Tin_g23876	0.47	0.07	0.3	-0.83	-2.05	-1.48	1.12
Tin_g23919	0.6	-0.11	0.32	0.0	-0.7	-1.49	0.43
Tin_g24090 (GCL2)	0.1	-0.17	0.21	0.09	-0.45	-0.07	0.18
Tin_g24230	0.54	0.4	0.33	0.03	-0.84	-1.18	-0.09
Tin_g24399	0.22	-0.21	0.46	0.23	-0.96	-0.48	0.26
Tin_g24524 (INH3)	0.02	-0.01	0.28	0.19	-0.72	-0.31	0.29
Tin_g24562	-0.39	-0.07	0.23	-0.17	-0.07	0.01	0.33
Tin_g24953	0.18	-0.55	0.65	0.26	-0.61	-0.59	0.14
Tin_g25063	0.22	0.09	0.06	0.21	-0.33	-0.94	0.33
Tin_g25161 (BAT1)	0.1	0.31	-0.03	-0.2	-0.28	-0.81	0.53
Tin_g25340	0.05	-0.01	0.39	-0.02	-0.78	-0.65	0.54
Tin_g25947	0.43	-0.43	0.59	-0.07	-1.12	-1.21	0.64
Tin_g26064	0.52	0.38	0.06	-0.93	-1.21	-0.02	0.35
Tin_g26154	-2.62	-0.51	0.9	-0.26	-1.07	-0.93	1.29
Tin_g26290	0.34	-0.38	0.46	-0.0	-1.45	-0.74	0.7
Tin_g26636 (PHO1)	-3.81	-0.7	0.84	-0.84	-3.14	0.41	1.33
Tin_g26799	0.18	0.14	0.67	-0.32	-1.19	-1.24	0.6
Tin_g26859	0.46	0.04	0.26	-1.25	-2.61	-3.16	1.43
Tin_g27277	0.27	0.15	0.3	0.19	-1.02	-1.23	0.47
Tin_g27376 (ARR9)	0.78	-0.01	0.74	0.2	-2.36	-1.69	-0.07
Tin_g27640	0.12	-0.8	0.89	0.09	-2.33	-0.79	0.72
Tin_g27655	0.22	-0.03	0.23	0.29	-0.88	-0.81	0.43
Tin_g28177 (FLDH)	0.26	-0.17	-0.09	-0.1	-0.79	-0.25	0.7
Tin_g28403	-1.45	0.67	0.31	-0.17	-1.46	-1.22	1.09
Tin_g28842	0.24	-0.86	-0.1	0.24	-0.83	-0.99	1.06
Tin_g28941	-0.02	-0.13	0.29	-0.23	-0.85	-0.34	0.74
Tin_g29061	0.32	0.05	0.66	-0.03	-0.96	-0.89	0.14
Tin_g29452	0.03	-0.14	0.23	0.03	-0.38	-0.36	0.41
Tin_g29493	-0.21	-0.46	0.43	0.15	-0.69	-0.25	0.58
Tin_g29545	-0.28	-0.11	0.41	-0.14	-0.49	-0.38	0.62
Tin_g29701	0.02	-0.15	-0.17	0.11	0.12	-1.03	0.63
Tin_g30843 (NUZ)	0.29	0.18	-0.18	-0.23	-0.19	-0.77	0.54
Tin_g31883	0.36	-0.05	0.29	-0.03	-0.46	-0.48	0.14
Tin_g32402	0.14	-0.22	0.09	0.06	-0.35	-0.24	0.37
Tin_g32632	0.34	-0.12	0.52	-1.15	-2.51	-1.52	1.27
Tin_g32920 (bHLH121)	0.09	-0.05	0.26	-0.13	-0.29	-0.37	0.34
Tin_g32990	0.29	0.32	0.0	-0.87	-0.4	-0.51	0.61
Tin_g34603	0.25	-0.51	0.65	0.24	-1.6	-0.44	0.37
Tin_g34755	0.17	0.44	0.29	-1.27	-1.87	-0.41	0.89
Tin_g35295 (VSR3)	0.75	-0.15	0.27	0.15	-2.25	-1.68	0.66
Tin_g36292	0.44	-0.23	0.46	-0.01	-0.97	-0.39	0.2
Tin_g36307 (XLG3)	0.29	0.23	0.22	0.02	-0.78	-0.72	0.31
Tin_g37242	0.35	-0.49	0.78	-0.4	-1.88	-1.28	0.9
Tin_g37374	0.08	0.22	0.01	-0.03	-0.36	-0.3	0.27
Tin_g37596	-0.04	-0.43	0.55	0.17	-0.54	-0.64	0.46
Tin_g38389	0.26	0.28	-0.0	-0.44	-0.34	-0.22	0.27
Tin_g38486	-0.01	-0.48	0.47	0.22	-0.61	-0.36	0.38
Tin_g38779	-0.37	0.46	0.91	-0.11	-5.34	-2.83	0.91
Tin_g39339	0.19	1.35	0.14	-1.01	-	-2.57	0.63
Tin_g39682	0.21	0.56	0.05	0.08	-	-2.33	1.05
Tin_g39868	-0.85	0.35	0.31	0.28	-0.55	-1.1	0.65
Tin_g39946	-0.12	-0.05	0.35	0.23	-0.45	-0.47	0.28
Tin_g40060	-1.63	-3.0	0.92	-0.27	-5.36	0.17	1.43
Tin_g41686	-0.17	-0.0	0.23	-0.54	-0.74	-0.16	0.81
Tin_g42493	0.09	0.01	0.55	0.09	-2.29	-0.56	0.6
Tin_g43769	-0.16	-0.48	0.79	0.07	-1.37	-1.28	0.86
Tin_g43785	0.31	-0.03	1.0	-0.36	-1.24	-1.5	0.29
Tin_g44132 (LAC1)	-3.62	1.56	0.64	-1.17	-	-1.45	0.68
Tin_g44570 (DECR)	0.27	-0.77	0.56	0.24	-0.73	-0.87	0.49
Tin_g44576	0.04	-0.34	0.32	0.32	-0.44	-0.7	0.41
Tin_g44635	0.22	0.2	0.07	-0.45	-0.36	-0.24	0.35
Tin_g44695	0.2	0.09	0.01	-0.64	-0.45	-0.08	0.55
Tin_g45004	-0.22	-0.35	0.7	0.28	-1.22	-0.68	0.55
Tin_g45182	0.56	-0.38	0.43	-1.14	-1.69	-0.99	1.1
Tin_g45212	0.62	0.05	0.59	-0.08	-0.76	-1.31	-0.01
Tin_g45246	0.04	0.11	-0.35	-0.41	0.02	-0.94	0.86
Tin_g45405	-0.09	-1.15	1.18	0.26	-3.28	-0.97	0.62
Tin_g45720	0.49	-0.05	0.6	0.17	-2.1	-1.12	0.37
Tin_g45791	0.49	-0.02	0.12	0.17	-0.93	-0.74	0.36
Tin_g45980	0.41	-0.22	0.56	0.08	-1.11	-0.79	0.32
Tin_g46052 (AMY2)	-0.23	-0.2	0.31	0.12	-0.42	-0.38	0.53
Tin_g46181	0.28	-0.17	0.08	-0.09	-1.24	-0.27	0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.