Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Tin_g00268 (PAB1)	0.44	0.5	0.7	0.55	1.0	0.4	0.51
Tin_g00275 (NRPE8B)	0.41	0.42	0.7	0.62	1.0	0.54	0.33
Tin_g00304 (ARA7)	0.77	0.78	0.81	0.73	1.0	0.74	0.7
Tin_g00343	0.26	0.34	0.44	0.46	1.0	0.4	0.28
Tin_g00368 (PAE1)	0.49	0.52	0.69	0.59	1.0	0.41	0.41
Tin_g00461	0.37	0.41	0.68	0.61	1.0	0.56	0.49
Tin_g00589 (PAC1)	0.56	0.64	0.67	0.56	1.0	0.49	0.45
Tin_g00607	0.36	0.41	0.58	0.51	1.0	0.46	0.32
Tin_g00620 (PAG1)	0.58	0.62	0.67	0.58	1.0	0.43	0.48
Tin_g00683	0.63	0.59	0.82	0.71	1.0	0.53	0.52
Tin_g00765 (DGL1)	0.35	0.41	0.66	0.63	1.0	0.52	0.45
Tin_g00769	0.46	0.47	0.52	0.47	1.0	0.56	0.46
Tin_g00809	0.5	0.53	0.64	0.65	1.0	0.6	0.41
Tin_g01227 (FAC1)	0.3	0.36	0.45	0.39	1.0	0.39	0.2
Tin_g01296 (CLUB)	0.52	0.6	0.64	0.57	1.0	0.45	0.48
Tin_g01372	0.5	0.53	0.69	0.65	1.0	0.57	0.51
Tin_g01490	0.5	0.49	0.6	0.6	1.0	0.61	0.41
Tin_g01559 (PMM)	0.33	0.42	0.46	0.36	1.0	0.41	0.25
Tin_g01575	0.53	0.53	0.69	0.64	1.0	0.53	0.44
Tin_g01678	0.48	0.56	0.65	0.59	1.0	0.38	0.43
Tin_g01686	0.59	0.63	0.69	0.56	1.0	0.58	0.5
Tin_g02285	0.22	0.28	0.56	0.61	1.0	0.47	0.32
Tin_g02372	0.45	0.56	0.73	0.64	1.0	0.6	0.49
Tin_g02524 (VAP)	0.57	0.65	0.83	0.63	1.0	0.55	0.54
Tin_g02537 (OEP37)	0.52	0.5	0.62	0.63	1.0	0.57	0.48
Tin_g02565	0.48	0.52	0.71	0.61	1.0	0.58	0.54
Tin_g02632	0.6	0.61	0.81	0.66	1.0	0.53	0.54
Tin_g02645 (MOD1)	0.6	0.64	0.64	0.56	1.0	0.61	0.52
Tin_g03030	0.31	0.37	0.44	0.36	1.0	0.52	0.21
Tin_g03037 (ACR2)	0.46	0.51	0.6	0.52	1.0	0.44	0.29
Tin_g03047	0.33	0.42	0.46	0.51	1.0	0.47	0.36
Tin_g03132	0.52	0.5	0.64	0.62	1.0	0.61	0.53
Tin_g03217 (UNE5)	0.39	0.44	0.68	0.65	1.0	0.58	0.4
Tin_g03339	0.4	0.45	0.73	0.69	1.0	0.51	0.43
Tin_g03400	0.36	0.37	0.58	0.51	1.0	0.48	0.43
Tin_g03494 (MAR1)	0.65	0.64	0.7	0.73	1.0	0.67	0.56
Tin_g03617 (RPS15A)	0.52	0.52	0.75	0.74	1.0	0.52	0.42
Tin_g03631 (UBQ6)	0.33	0.37	0.69	0.56	1.0	0.53	0.44
Tin_g03826	0.55	0.57	0.66	0.63	1.0	0.54	0.47
Tin_g03890	0.5	0.55	0.58	0.54	1.0	0.48	0.31
Tin_g03905 (FUS8)	0.44	0.46	0.64	0.68	1.0	0.6	0.43
Tin_g03908	0.37	0.43	0.78	0.7	1.0	0.61	0.48
Tin_g04106	0.43	0.46	0.6	0.54	1.0	0.35	0.45
Tin_g04286	0.31	0.31	0.66	0.6	1.0	0.46	0.32
Tin_g04321	0.44	0.42	0.6	0.53	1.0	0.6	0.35
Tin_g04433 (KAB1)	0.27	0.35	0.56	0.56	1.0	0.51	0.22
Tin_g04532	0.48	0.51	0.63	0.67	1.0	0.68	0.47
Tin_g04635	0.39	0.47	0.6	0.54	1.0	0.51	0.49
Tin_g04912 (PBD1)	0.51	0.53	0.6	0.46	1.0	0.41	0.4
Tin_g04978 (RGP1)	0.43	0.43	0.56	0.45	1.0	0.46	0.45
Tin_g04990	0.46	0.5	0.62	0.51	1.0	0.49	0.44
Tin_g05005	0.46	0.51	0.72	0.64	1.0	0.74	0.46
Tin_g05073 (EBS2)	0.58	0.62	0.57	0.58	1.0	0.46	0.53
Tin_g05201	0.36	0.4	0.54	0.56	1.0	0.37	0.32
Tin_g05258	0.37	0.36	0.71	0.63	1.0	0.5	0.39
Tin_g05310	0.5	0.53	0.57	0.43	1.0	0.35	0.27
Tin_g05397	0.49	0.54	0.77	0.67	1.0	0.67	0.55
Tin_g05444	0.35	0.42	0.51	0.47	1.0	0.44	0.23
Tin_g05642 (XLG3)	0.59	0.58	0.68	0.63	1.0	0.58	0.56
Tin_g05899 (UCU2)	0.51	0.54	0.67	0.63	1.0	0.65	0.51
Tin_g06322 (PFD5)	0.4	0.43	0.61	0.55	1.0	0.53	0.4
Tin_g06369	0.46	0.46	0.67	0.6	1.0	0.65	0.46
Tin_g06378	0.3	0.36	0.55	0.47	1.0	0.47	0.28
Tin_g06402 (PBG1)	0.54	0.58	0.67	0.55	1.0	0.55	0.51
Tin_g06526	0.53	0.55	0.67	0.53	1.0	0.52	0.36
Tin_g06587 (TS)	0.33	0.36	0.65	0.55	1.0	0.56	0.45
Tin_g06809	0.5	0.58	0.66	0.59	1.0	0.61	0.38
Tin_g07058	0.19	0.18	0.4	0.37	1.0	0.3	0.18
Tin_g07323	0.41	0.55	0.68	0.7	1.0	0.6	0.42
Tin_g07971	0.6	0.63	0.61	0.61	1.0	0.58	0.48
Tin_g08200	0.51	0.6	0.61	0.6	1.0	0.42	0.5
Tin_g08334	0.48	0.54	0.78	0.76	1.0	0.65	0.57
Tin_g08656	0.46	0.53	0.68	0.59	1.0	0.54	0.56
Tin_g09066	0.17	0.31	0.62	0.5	1.0	0.48	0.31
Tin_g09291	0.35	0.34	0.56	0.57	1.0	0.49	0.27
Tin_g09362 (CAT9)	0.49	0.59	0.7	0.57	1.0	0.52	0.44
Tin_g09378	0.3	0.37	0.6	0.46	1.0	0.38	0.2
Tin_g09524	0.42	0.45	0.56	0.51	1.0	0.57	0.41
Tin_g09578 (SK31)	0.59	0.66	0.72	0.66	1.0	0.53	0.57
Tin_g09887 (IDH1)	0.36	0.42	0.63	0.68	1.0	0.6	0.38
Tin_g10136	0.56	0.6	0.61	0.6	1.0	0.45	0.5
Tin_g10429	0.43	0.47	0.6	0.59	1.0	0.46	0.36
Tin_g11078 (ZAC)	0.35	0.44	0.67	0.55	1.0	0.53	0.36
Tin_g11544	0.36	0.33	0.54	0.55	1.0	0.55	0.3
Tin_g11963	0.39	0.4	0.54	0.52	1.0	0.52	0.41
Tin_g12403 (GDI1)	0.5	0.54	0.7	0.64	1.0	0.48	0.57
Tin_g12532 (AXS1)	0.22	0.29	0.57	0.42	1.0	0.5	0.24
Tin_g12584	0.33	0.36	0.44	0.36	1.0	0.4	0.38
Tin_g12628	0.23	0.38	0.45	0.33	1.0	0.4	0.4
Tin_g12644	0.53	0.57	0.73	0.65	1.0	0.48	0.43
Tin_g13224	0.3	0.32	0.36	0.36	1.0	0.38	0.25
Tin_g13504 (PMP)	0.63	0.66	0.74	0.62	1.0	0.49	0.45
Tin_g14035 (CRT1)	0.37	0.52	0.57	0.45	1.0	0.4	0.34
Tin_g14053	0.44	0.44	0.6	0.51	1.0	0.49	0.4
Tin_g14132	0.22	0.25	0.45	0.43	1.0	0.45	0.29
Tin_g14357	0.37	0.42	0.5	0.51	1.0	0.41	0.36
Tin_g14411	0.5	0.56	0.68	0.58	1.0	0.68	0.37
Tin_g14460	0.5	0.52	0.64	0.55	1.0	0.5	0.58
Tin_g14734	0.47	0.43	0.63	0.59	1.0	0.56	0.53
Tin_g14738	0.54	0.61	0.63	0.57	1.0	0.57	0.49
Tin_g15223 (PRMT3)	0.51	0.46	0.64	0.56	1.0	0.55	0.45
Tin_g15369	0.57	0.65	0.7	0.58	1.0	0.65	0.49
Tin_g15378	0.43	0.51	0.6	0.59	1.0	0.46	0.45
Tin_g15538 (PHT3;1)	0.35	0.45	0.83	0.72	1.0	0.54	0.44
Tin_g15557 (MCB1)	0.49	0.51	0.64	0.56	1.0	0.46	0.53
Tin_g15657	0.67	0.67	0.74	0.68	1.0	0.52	0.47
Tin_g16210	0.33	0.39	0.59	0.57	1.0	0.6	0.24
Tin_g16483	0.5	0.53	0.6	0.56	1.0	0.51	0.38
Tin_g16771 (CPI1)	0.26	0.33	0.46	0.37	1.0	0.37	0.26
Tin_g17290 (CDS2)	0.46	0.55	0.66	0.55	1.0	0.52	0.44
Tin_g17333	0.42	0.44	0.58	0.59	1.0	0.44	0.41
Tin_g17727	0.32	0.38	0.67	0.62	1.0	0.58	0.35
Tin_g17771	0.35	0.35	0.58	0.43	1.0	0.44	0.34
Tin_g17868 (CID12)	0.34	0.44	0.53	0.48	1.0	0.42	0.45
Tin_g18628	0.65	0.67	0.69	0.59	1.0	0.52	0.51
Tin_g19292 (RAD23)	0.53	0.59	0.74	0.61	1.0	0.51	0.45
Tin_g19963 (GRP2)	0.43	0.47	0.5	0.57	1.0	0.56	0.4
Tin_g20212	0.67	0.67	0.74	0.76	1.0	0.61	0.49
Tin_g21386 (NFD1)	0.47	0.43	0.64	0.63	1.0	0.55	0.46
Tin_g21468	0.43	0.43	0.61	0.59	1.0	0.57	0.47
Tin_g21481	0.34	0.44	0.69	0.59	1.0	0.57	0.43
Tin_g22200	0.54	0.58	0.6	0.55	1.0	0.39	0.44
Tin_g22420	0.3	0.38	0.56	0.47	1.0	0.6	0.31
Tin_g22640 (CPFTSZ)	0.39	0.47	0.63	0.49	1.0	0.56	0.38
Tin_g23433 (EIF3K)	0.45	0.43	0.57	0.61	1.0	0.54	0.39
Tin_g23680	0.45	0.44	0.57	0.58	1.0	0.53	0.41
Tin_g23834 (APT3)	0.41	0.49	0.73	0.68	1.0	0.44	0.34
Tin_g24388	0.17	0.16	0.25	0.22	1.0	0.27	0.11
Tin_g24909	0.56	0.67	0.61	0.53	1.0	0.53	0.46
Tin_g25085	0.53	0.46	0.63	0.65	1.0	0.65	0.44
Tin_g26004 (MMZ3)	0.37	0.43	0.54	0.48	1.0	0.47	0.39
Tin_g26206	0.04	0.1	0.41	0.23	1.0	0.44	0.09
Tin_g26285 (AE3)	0.45	0.45	0.69	0.73	1.0	0.62	0.47
Tin_g26354 (CAM3)	0.2	0.24	0.46	0.49	1.0	0.43	0.26
Tin_g26432 (PBA1)	0.55	0.61	0.75	0.65	1.0	0.51	0.44
Tin_g26688 (HIT3)	0.61	0.61	0.79	0.76	1.0	0.51	0.53
Tin_g27353 (COX6B)	0.39	0.48	0.68	0.63	1.0	0.51	0.29
Tin_g28026	0.29	0.35	0.51	0.43	1.0	0.44	0.2
Tin_g28229	0.42	0.49	0.58	0.53	1.0	0.44	0.43
Tin_g28666	0.41	0.41	0.5	0.48	1.0	0.45	0.32
Tin_g28798	0.47	0.52	0.63	0.56	1.0	0.52	0.35
Tin_g29390	0.41	0.42	0.61	0.55	1.0	0.44	0.32
Tin_g29848 (VDAC1)	0.53	0.57	0.76	0.68	1.0	0.47	0.44
Tin_g29993	0.42	0.45	0.58	0.56	1.0	0.51	0.29
Tin_g30516 (PBF1)	0.55	0.53	0.66	0.58	1.0	0.64	0.47
Tin_g30656	0.56	0.64	0.72	0.58	1.0	0.49	0.62
Tin_g32693	0.43	0.51	0.52	0.51	1.0	0.49	0.31
Tin_g35542	0.43	0.5	0.75	0.68	1.0	0.62	0.42
Tin_g36467	0.54	0.49	0.55	0.48	1.0	0.53	0.48
Tin_g36684	0.67	0.65	0.76	0.69	1.0	0.61	0.63
Tin_g37007	0.49	0.52	0.74	0.75	1.0	0.67	0.51
Tin_g38977	0.57	0.53	0.72	0.71	1.0	0.6	0.46
Tin_g39151 (VAG2)	0.56	0.58	0.78	0.69	1.0	0.59	0.41
Tin_g40978 (RGP)	0.15	0.24	0.47	0.36	1.0	0.49	0.21
Tin_g41314	0.27	0.38	0.47	0.45	1.0	0.4	0.32
Tin_g41546	0.38	0.35	0.51	0.57	1.0	0.46	0.35
Tin_g43485	0.37	0.31	0.57	0.62	1.0	0.56	0.35
Tin_g44911 (IMP4)	0.58	0.66	0.64	0.53	1.0	0.55	0.5
Tin_g45481 (emb1129)	0.4	0.41	0.5	0.52	1.0	0.6	0.4
Tin_g45585	0.42	0.47	0.53	0.41	1.0	0.29	0.32
Tin_g45965	0.44	0.41	0.72	0.6	1.0	0.5	0.46
Tin_g46386	0.46	0.5	0.81	0.71	1.0	0.65	0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)