Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Tin_g00182	-0.46	-0.78	0.14	0.36	0.36	0.25	-0.27
Tin_g00206	-0.73	-1.2	0.22	0.41	0.47	0.31	-0.24
Tin_g00222	-0.81	-1.13	0.4	0.31	0.62	0.25	-0.53
Tin_g00286	-0.67	-1.09	0.2	0.51	0.37	0.49	-0.69
Tin_g00449	-0.71	-0.96	0.25	0.21	0.66	0.22	-0.36
Tin_g00494	-0.56	-0.79	0.3	0.29	0.41	0.04	-0.09
Tin_g00740 (ARP2)	-0.49	-0.8	0.21	0.26	0.38	0.17	-0.1
Tin_g00873	-0.71	-0.99	0.27	0.32	0.4	0.22	-0.07
Tin_g01438	-0.68	-0.7	0.13	0.33	0.64	0.17	-0.46
Tin_g01481 (RPS5B)	-0.52	-0.93	0.18	0.21	0.35	0.29	-0.01
Tin_g01561	-0.74	-1.02	0.25	0.48	0.48	0.1	-0.21
Tin_g01612	-0.64	-0.94	0.34	0.28	0.39	0.19	-0.14
Tin_g01620	-0.37	-0.53	0.22	0.29	0.34	0.11	-0.31
Tin_g01672 (OLI7)	-0.78	-1.02	0.28	0.48	0.39	0.06	-0.06
Tin_g01747	-0.48	-0.91	0.24	0.35	0.48	0.11	-0.29
Tin_g02344 (RPL16A)	-0.54	-0.81	0.13	0.31	0.57	0.15	-0.29
Tin_g02351	-0.86	-1.21	0.25	0.5	0.6	0.47	-0.97
Tin_g02369	-0.71	-1.01	0.36	0.48	0.29	0.24	-0.3
Tin_g02457	-0.53	-0.97	0.27	0.33	0.24	0.08	0.13
Tin_g02542	-0.81	-1.17	0.22	0.44	0.51	0.32	-0.33
Tin_g02620 (THO7)	-0.54	-0.88	0.25	0.23	0.34	0.19	-0.0
Tin_g02785	-0.94	-1.39	0.24	0.47	0.3	0.46	-0.1
Tin_g02964	-0.77	-1.23	0.31	0.54	0.44	0.37	-0.61
Tin_g03158	-0.26	-0.74	0.13	0.27	0.33	0.23	-0.26
Tin_g03230 (AAC3)	-1.42	-1.58	0.32	0.63	0.57	0.5	-0.73
Tin_g03632	-0.59	-0.74	0.23	0.5	0.24	0.17	-0.26
Tin_g03678 (RPL23AB)	-0.69	-1.07	0.27	0.35	0.4	0.15	0.0
Tin_g03689	-0.95	-1.32	0.31	0.41	0.54	0.36	-0.38
Tin_g03723	-0.37	-0.81	0.17	0.43	0.22	0.11	-0.08
Tin_g04956	-0.49	-0.57	0.05	0.16	0.59	0.16	-0.25
Tin_g04971	-0.28	-0.55	0.22	0.25	0.44	0.08	-0.46
Tin_g05366	-0.68	-0.97	0.28	0.54	0.23	0.36	-0.45
Tin_g05766	-0.47	-0.81	0.32	0.39	0.6	0.11	-0.84
Tin_g05827	-0.49	-0.84	0.32	0.39	0.3	0.2	-0.33
Tin_g08030	-0.64	-0.52	0.27	0.37	0.53	0.1	-0.61
Tin_g08501	-0.59	-0.89	0.47	0.28	0.34	0.23	-0.39
Tin_g08945 (HAP1)	-0.38	-0.78	0.39	0.5	0.29	0.13	-0.71
Tin_g09675	-0.66	-0.81	0.3	0.33	0.59	0.16	-0.54
Tin_g10596	-0.8	-0.91	0.35	0.23	0.52	0.22	-0.23
Tin_g10752	-0.6	-1.05	0.23	0.41	0.48	0.16	-0.24
Tin_g12044 (SNRNP-G)	-0.67	-1.03	0.37	0.49	0.19	0.2	-0.16
Tin_g12451	-0.81	-1.11	0.22	0.55	0.31	0.49	-0.52
Tin_g12571	-0.84	-1.19	0.38	0.53	0.33	0.45	-0.63
Tin_g12725 (AAC3)	-0.76	-0.95	0.33	0.56	0.38	0.05	-0.28
Tin_g13393	-0.75	-1.21	0.3	0.53	0.1	0.4	-0.14
Tin_g13815	-0.83	-1.22	0.28	0.46	0.38	0.45	-0.42
Tin_g14125	-0.44	-1.1	0.34	0.5	0.14	0.2	-0.22
Tin_g14465	-0.48	-0.59	0.35	0.55	0.09	0.21	-0.61
Tin_g14726	-0.71	-0.76	0.26	0.56	0.31	0.04	-0.21
Tin_g15055	-0.34	-0.7	0.24	0.18	0.27	0.28	-0.22
Tin_g15303	-0.5	-0.83	0.29	0.52	0.3	0.16	-0.46
Tin_g15439	-0.52	-0.91	0.29	0.25	0.37	0.21	-0.14
Tin_g18530	-0.46	-0.98	0.26	0.52	0.19	0.31	-0.42
Tin_g19212	-0.71	-1.1	0.12	0.47	0.38	0.47	-0.39
Tin_g21399	-0.49	-0.99	0.22	0.45	0.26	0.14	-0.06
Tin_g21511	-0.28	-0.58	0.26	0.4	0.24	0.17	-0.56
Tin_g21523 (LOS1)	-0.59	-1.12	0.21	0.49	0.27	0.14	0.01
Tin_g21600	-0.45	-1.05	0.28	0.53	0.03	0.35	-0.27
Tin_g22379	-0.69	-1.25	0.23	0.49	0.21	0.44	-0.21
Tin_g23099 (STV1)	-0.46	-0.92	0.24	0.25	0.24	0.36	-0.14
Tin_g23670	-0.44	-0.45	0.16	0.16	0.43	0.13	-0.22
Tin_g25963	-0.84	-1.25	0.41	0.59	0.2	0.35	-0.4
Tin_g26251	-0.35	-0.64	0.19	0.35	0.23	0.07	-0.1
Tin_g26329	-1.26	-1.51	0.16	0.43	0.74	0.5	-0.55
Tin_g26346	-0.65	-1.04	0.33	0.44	0.48	0.24	-0.55
Tin_g26404	-0.47	-0.81	0.26	0.29	0.62	0.12	-0.58
Tin_g26632	-0.45	-0.96	0.11	0.32	0.51	0.14	-0.13
Tin_g27506	-0.67	-0.85	0.23	0.29	0.5	0.18	-0.19
Tin_g27670	-1.16	-1.06	0.41	0.45	0.49	0.37	-0.56
Tin_g28444	-0.3	-0.53	-0.03	0.25	0.42	0.18	-0.24
Tin_g29053	-0.67	-0.68	0.36	0.23	0.45	0.26	-0.48
Tin_g29092	-0.54	-0.83	0.2	0.28	0.55	0.3	-0.52
Tin_g29093	-0.61	-0.92	0.15	0.31	0.62	0.18	-0.32
Tin_g29759	-0.58	-1.15	0.18	0.34	0.47	0.39	-0.35
Tin_g29829	-0.5	-0.92	0.33	0.4	0.44	0.22	-0.57
Tin_g30092	-0.28	-0.74	0.4	0.58	0.11	0.15	-0.79
Tin_g30457	-1.02	-1.4	0.21	0.54	0.45	0.53	-0.5
Tin_g30696	-0.59	-0.85	0.2	0.55	0.39	0.33	-0.71
Tin_g30788 (SAP18)	-0.24	-0.55	0.09	0.43	0.4	0.03	-0.47
Tin_g35509	-0.31	-0.91	0.28	0.35	0.14	0.1	0.0
Tin_g36488	-0.84	-1.08	0.3	0.4	0.57	0.3	-0.52
Tin_g40004	-0.73	-1.26	0.24	0.43	0.34	0.22	0.04
Tin_g40547	-0.63	-0.84	0.26	0.36	0.4	0.06	-0.07
Tin_g43604	-0.58	-0.88	0.28	0.38	0.34	0.31	-0.38
Tin_g43938	-0.38	-0.72	0.42	0.31	0.44	0.19	-0.87
Tin_g44032	-0.49	-0.88	0.28	0.16	0.41	0.24	-0.14
Tin_g44672	-0.86	-1.19	0.3	0.45	0.59	0.12	-0.29
Tin_g44710	-0.57	-0.94	0.29	0.52	0.28	0.52	-1.01
Tin_g45582	-0.31	-0.79	0.28	0.53	0.4	0.2	-1.02
Tin_g45841	-0.64	-0.85	0.32	0.45	0.22	0.3	-0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.