Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Tin_g00353 (AHP1)
0.19 0.19 1.0 0.59 0.19 0.28 0.42
0.04 0.16 1.0 0.25 0.14 0.02 0.83
0.28 0.31 1.0 0.91 0.52 0.38 0.47
0.34 0.32 1.0 0.62 0.31 0.32 0.95
0.26 0.4 0.98 1.0 0.59 0.41 0.55
0.26 0.45 1.0 0.67 0.38 0.43 0.56
0.4 0.45 1.0 0.79 0.46 0.4 0.6
0.31 0.22 1.0 0.5 0.28 0.16 0.89
0.38 0.29 1.0 0.62 0.25 0.28 0.81
Tin_g02131 (DGK1)
0.44 0.44 1.0 0.89 0.58 0.52 0.85
0.07 0.11 1.0 0.27 0.07 0.06 0.38
0.5 0.4 1.0 0.7 0.27 0.39 0.65
0.01 0.02 1.0 0.7 0.06 0.09 0.49
Tin_g02545 (BCA3)
0.11 0.14 1.0 0.83 0.03 0.06 0.38
0.51 0.49 1.0 0.89 0.53 0.49 0.72
0.39 0.48 1.0 0.7 0.38 0.51 0.66
0.06 0.06 1.0 0.61 0.12 0.26 0.4
0.06 0.12 1.0 0.37 0.02 0.08 0.25
Tin_g04128 (PAT1)
0.14 0.17 1.0 0.68 0.22 0.22 0.38
0.14 0.2 1.0 0.71 0.03 0.1 0.71
0.23 0.35 1.0 0.65 0.22 0.17 0.74
0.24 0.35 1.0 0.92 0.37 0.57 0.56
Tin_g05663 (WOL)
0.08 0.21 1.0 0.56 0.28 0.28 0.49
0.13 0.08 1.0 0.64 0.2 0.35 0.73
0.45 0.43 1.0 0.92 0.55 0.54 0.8
0.12 0.13 1.0 0.5 0.2 0.15 0.34
0.59 0.51 1.0 0.81 0.44 0.48 0.72
0.09 0.14 1.0 0.43 0.15 0.16 0.41
0.09 0.06 1.0 0.63 0.06 0.26 0.62
0.09 0.06 1.0 0.68 0.06 0.28 0.6
0.09 0.17 1.0 0.8 0.02 0.07 0.6
0.05 0.05 1.0 0.89 0.15 0.26 0.6
0.25 0.14 1.0 0.65 0.06 0.37 0.53
0.21 0.33 1.0 0.76 0.09 0.07 0.64
0.5 0.52 1.0 0.75 0.48 0.53 0.79
0.19 0.23 1.0 0.97 0.16 0.31 0.63
0.54 0.51 1.0 0.75 0.34 0.31 0.72
0.04 0.04 1.0 0.57 0.06 0.09 0.59
0.04 0.07 1.0 0.33 0.03 0.01 0.24
Tin_g09308 (IDH-V)
0.22 0.22 1.0 0.81 0.24 0.3 0.47
0.32 0.52 1.0 0.93 0.62 0.6 0.55
0.08 0.09 1.0 0.47 0.03 0.06 0.36
0.2 0.22 1.0 0.8 0.05 0.09 0.76
0.02 0.07 1.0 0.38 0.13 0.07 0.99
Tin_g10976 (HMA2)
0.05 0.05 1.0 0.56 0.17 0.08 0.59
Tin_g11116 (NPC1)
0.09 0.1 1.0 0.92 0.01 0.06 0.53
0.1 0.11 1.0 0.59 0.28 0.19 0.64
0.03 0.05 1.0 0.43 0.01 0.14 0.45
0.02 0.08 1.0 0.45 0.04 0.04 0.35
0.1 0.13 1.0 0.93 0.1 0.09 0.56
0.43 0.45 1.0 0.73 0.53 0.43 0.7
0.02 0.08 1.0 0.93 0.13 0.07 0.68
0.19 0.12 1.0 0.88 0.17 0.19 0.46
Tin_g12022 (PTR1)
0.44 0.42 1.0 0.72 0.49 0.35 0.54
0.21 0.16 1.0 0.6 0.06 0.13 0.52
0.02 0.04 1.0 0.76 0.05 0.19 0.88
0.17 0.36 1.0 0.93 0.21 0.45 0.67
0.06 0.07 1.0 0.81 0.13 0.22 0.76
0.14 0.15 1.0 0.92 0.12 0.12 0.76
Tin_g13083 (AAP3)
0.1 0.15 1.0 0.67 0.05 0.2 0.52
0.51 0.37 1.0 0.74 0.27 0.36 0.65
0.0 0.03 1.0 0.37 0.19 0.02 0.85
0.15 0.1 0.9 1.0 0.21 0.28 0.71
0.24 0.3 1.0 0.75 0.07 0.11 0.49
0.26 0.25 1.0 0.82 0.11 0.24 0.83
0.02 0.03 1.0 0.69 0.19 0.07 0.49
0.72 0.56 1.0 0.91 0.54 0.49 0.8
0.01 0.02 1.0 0.57 0.06 0.23 0.65
0.0 0.05 1.0 0.43 0.16 0.09 0.48
0.01 0.03 1.0 0.56 0.04 0.12 0.51
0.04 0.05 1.0 0.51 0.05 0.08 0.69
0.02 0.03 1.0 0.84 0.04 0.15 0.62
Tin_g16926 (AHP1)
0.27 0.24 1.0 0.88 0.45 0.41 0.89
0.43 0.47 1.0 0.78 0.24 0.18 0.7
0.31 0.14 1.0 0.63 0.13 0.17 0.58
0.12 0.13 1.0 0.84 0.09 0.07 0.68
0.16 0.19 1.0 0.32 0.14 0.15 0.32
0.03 0.02 1.0 0.23 0.03 0.0 0.26
0.07 0.0 1.0 0.5 0.01 0.09 0.73
0.07 0.09 1.0 0.45 0.12 0.17 0.37
Tin_g18864 (HSP17.4)
0.19 0.07 1.0 0.5 0.02 0.24 0.9
0.07 0.16 1.0 0.61 0.08 0.04 0.29
0.06 0.03 1.0 0.81 0.02 0.05 0.48
0.09 0.2 1.0 0.28 0.2 0.07 0.27
0.07 0.31 1.0 0.61 0.32 0.26 0.53
0.64 0.64 1.0 0.68 0.48 0.47 0.77
0.06 0.13 1.0 0.75 0.09 0.43 0.5
Tin_g19817 (KUP3)
0.06 0.16 1.0 0.61 0.35 0.34 0.41
Tin_g20184 (MRP12)
0.19 0.16 1.0 0.69 0.15 0.2 0.49
0.06 0.08 1.0 0.62 0.05 0.13 0.56
Tin_g20243 (VIT1)
0.02 0.12 1.0 0.78 0.04 0.15 0.53
0.21 0.38 1.0 0.41 0.32 0.12 0.64
Tin_g20525 (PUP1)
0.11 0.1 1.0 0.31 0.06 0.1 0.45
0.07 0.08 1.0 0.48 0.07 0.08 0.3
0.13 0.13 1.0 0.47 0.02 0.06 0.38
0.22 0.44 1.0 1.0 0.69 0.44 0.55
0.25 0.21 1.0 0.83 0.0 0.06 0.85
Tin_g21316 (RBOHF)
0.18 0.23 1.0 0.32 0.12 0.07 0.64
Tin_g21974 (SHR)
0.12 0.15 1.0 0.56 0.31 0.14 0.39
0.17 0.12 1.0 0.78 0.11 0.26 0.39
0.03 0.04 1.0 0.49 0.07 0.14 0.63
0.01 0.01 1.0 0.28 0.0 0.02 0.21
0.09 0.11 1.0 0.94 0.03 0.06 0.55
0.06 0.22 1.0 0.67 0.1 0.2 0.66
0.26 0.38 1.0 0.92 0.47 0.31 0.51
0.25 0.44 0.95 1.0 0.38 0.56 0.63
0.03 0.06 1.0 0.46 0.06 0.0 0.26
0.12 0.08 1.0 0.53 0.02 0.02 0.32
0.05 0.28 1.0 0.71 0.16 0.26 0.69
0.01 0.02 1.0 0.77 0.03 0.12 0.31
0.0 0.06 1.0 0.55 0.07 0.09 0.47
0.02 0.09 1.0 0.29 0.01 0.03 0.19
0.02 0.09 1.0 0.46 0.01 0.23 0.38
0.21 0.27 1.0 0.8 0.01 0.04 0.43
0.14 0.1 1.0 0.74 0.04 0.09 0.51
0.04 0.02 1.0 0.29 0.0 0.04 0.21
Tin_g24150 (TT7)
0.04 0.1 1.0 0.69 0.03 0.14 0.78
0.15 0.05 1.0 0.51 0.03 0.08 0.7
0.04 0.03 1.0 0.42 0.01 0.1 0.86
Tin_g24467 (AAP3)
0.1 0.18 1.0 0.65 0.19 0.22 0.78
Tin_g24683 (CBL9)
0.19 0.25 1.0 0.54 0.18 0.17 0.57
0.01 0.07 1.0 0.32 0.06 0.05 0.3
0.03 0.12 1.0 0.5 0.06 0.19 0.23
Tin_g25365 (GSTF9)
0.04 0.07 1.0 0.58 0.05 0.06 0.48
Tin_g25501 (LIP1)
0.06 0.18 1.0 0.38 0.07 0.13 0.72
0.04 0.04 1.0 0.15 0.0 0.0 0.69
0.09 0.12 1.0 0.55 0.04 0.16 0.43
0.08 0.14 1.0 0.45 0.06 0.08 0.42
Tin_g26286 (MYB20)
0.01 0.11 1.0 0.83 0.09 0.07 0.53
0.0 0.02 1.0 0.58 0.13 0.11 0.65
Tin_g26358 (PDR1)
0.29 0.38 1.0 0.81 0.38 0.36 0.64
Tin_g26364 (MYC2)
0.11 0.12 1.0 0.54 0.09 0.21 0.87
0.07 0.21 1.0 0.71 0.22 0.33 0.44
0.07 0.12 1.0 0.67 0.14 0.07 0.59
0.0 0.11 1.0 0.33 0.01 0.11 0.34
0.01 0.01 1.0 0.39 0.06 0.22 0.61
0.1 0.07 1.0 0.51 0.17 0.21 0.26
0.05 0.18 1.0 0.44 0.18 0.13 0.49
0.0 0.0 1.0 0.39 0.0 0.13 0.25
0.09 0.1 1.0 0.8 0.0 0.03 0.41
Tin_g27146 (PHB)
0.05 0.08 1.0 0.58 0.07 0.16 0.64
0.29 0.21 1.0 0.72 0.15 0.28 0.52
0.09 0.1 1.0 0.59 0.18 0.18 0.43
0.02 0.04 0.96 1.0 0.05 0.2 0.68
Tin_g27957 (DGK5)
0.27 0.12 1.0 0.6 0.05 0.01 0.56
0.02 0.05 1.0 0.99 0.26 0.09 0.64
0.03 0.02 1.0 0.54 0.05 0.07 0.33
0.3 0.3 1.0 0.43 0.11 0.07 0.54
0.07 0.16 1.0 0.84 0.09 0.21 0.51
0.05 0.1 1.0 0.48 0.24 0.23 0.26
0.07 0.12 1.0 0.6 0.0 0.07 0.65
Tin_g28745 (EVR)
0.06 0.05 1.0 0.55 0.0 0.04 0.28
0.16 0.17 1.0 0.61 0.02 0.05 0.53
0.14 0.15 1.0 0.86 0.04 0.12 0.74
0.19 0.25 0.98 1.0 0.25 0.31 0.74
Tin_g29243 (RBL1)
0.07 0.12 1.0 0.56 0.09 0.17 0.4
0.24 0.11 1.0 0.4 0.15 0.23 0.74
0.59 0.54 1.0 0.92 0.65 0.52 0.82
0.1 0.18 1.0 0.56 0.05 0.09 0.64
0.4 0.27 1.0 0.64 0.27 0.3 0.88
0.28 0.29 1.0 0.6 0.16 0.49 0.86
Tin_g31077 (MYB20)
0.09 0.15 1.0 0.51 0.26 0.27 0.5
Tin_g31165 (LSR3)
0.2 0.13 1.0 0.66 0.21 0.35 0.77
0.43 0.52 1.0 0.64 0.35 0.41 0.61
0.12 0.35 1.0 0.76 0.15 0.23 0.66
0.02 0.05 1.0 0.42 0.02 0.1 0.71
0.02 0.05 1.0 0.67 0.0 0.05 0.48
0.26 0.18 1.0 0.52 0.03 0.12 0.72
0.04 0.09 1.0 0.67 0.03 0.08 0.4
Tin_g36820 (ATL8)
0.07 0.06 1.0 0.43 0.09 0.09 0.32
0.15 0.21 1.0 0.89 0.09 0.1 0.78
0.14 0.22 1.0 0.42 0.03 0.05 0.59
0.1 0.1 1.0 0.5 0.18 0.14 0.57
0.11 0.13 1.0 0.6 0.17 0.19 0.43
Tin_g39211 (SD2-5)
0.27 0.37 1.0 0.79 0.11 0.26 0.64
0.07 0.16 1.0 0.44 0.21 0.14 0.68
0.53 0.41 1.0 0.76 0.3 0.3 0.54
0.0 0.02 1.0 0.4 0.11 0.17 0.35
0.11 0.26 1.0 0.48 0.08 0.08 0.71
0.25 0.11 1.0 0.71 0.03 0.11 0.69
0.27 0.2 1.0 0.53 0.04 0.15 0.33
0.26 0.3 1.0 0.42 0.1 0.14 0.78
Tin_g45206 (MRP6)
0.18 0.2 1.0 0.63 0.21 0.24 0.95
0.2 0.14 1.0 0.55 0.06 0.23 0.48
Tin_g46372 (PDAT)
0.25 0.44 1.0 0.5 0.23 0.23 0.66
0.06 0.11 1.0 0.55 0.02 0.05 0.36
0.0 0.09 1.0 0.31 0.0 0.15 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)