Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g02851 (GTE1)
- - 3.19 - - - - -0.56 -2.4 -
- - 3.21 - - - - -1.57 -1.36 -
- - 3.27 - - - - -1.61 - -
Spa_g28752 (MMZ3)
- - 3.21 - - - - -1.33 -1.66 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - -3.4 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.56 - -
- - 3.28 - - - - -1.94 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.82 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - -3.54 -5.18 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.5 - -
- - 3.3 - - - - -3.25 -4.12 -
- - 3.32 - - - - - -5.6 -
- - 3.3 - - - - -2.61 - -
- - 3.31 - - - - -3.95 - -
Spa_g43346 (PUR ALPHA-1)
- - 3.3 - - - -4.76 -4.66 -4.53 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.21 - - - - -1.24 -1.65 -
- - 3.3 - - - - -4.55 - -3.03
- - 3.3 - - - - -2.55 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -3.09 -3.94 -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g43594 (MEE49)
- - 3.31 - - - - -4.26 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - -2.57 -4.77 -
- - 3.31 - - - - -5.43 -3.67 -
- - 3.31 - - - - -4.49 -4.36 -
Spa_g43665 (SSP5)
- - 3.31 - - - - -3.76 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g43815 (GPX7)
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - -5.56 -4.72 - -6.57
- - 3.3 - - - - -3.1 - -
- - 3.32 - - - - - - -4.87
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - - -3.44 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - - - - -3.59 -2.45 -
- - 3.31 - - - - -4.93 -4.8 -
- - 3.3 - - - - -2.98 -4.44 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.98 -5.18 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44252 (emb1644)
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.26 - - - - -1.26 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44349 (TBP1)
- - 3.3 - - - - -3.9 -3.77 -
- - 3.31 - - - - -4.31 -4.17 -
- - 3.32 - - - - -5.88 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44530 (ATG8G)
- - 3.28 - - - - -2.9 -3.12 -4.5
- - 3.31 - - - - -4.08 - -
- - 3.3 - - - - -5.84 -2.69 -
- - 3.31 - - - - -4.27 - -
- - 3.28 - - - - -2.36 -3.82 -
- - 3.32 - - - - -6.09 - -
Spa_g44657 (PMZ)
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44684 (HAP5B)
- - 3.24 - - - - -2.9 - -1.33
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - -7.86 - - - - -3.05
- -5.66 3.3 - -8.44 - -5.12 -5.56 - -3.57
- - 3.32 - - - - -4.55 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g45001 (PSP)
- - 3.31 - - - - - -3.23 -
- - 3.32 - - - - - -4.44 -
- - 3.32 - - - - - - -4.42
- - 3.31 - - - - - - -3.92
- - 3.31 - - - - -3.95 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - - - - -5.04 -2.09 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - -5.02 -4.21 -3.26
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g46234 (TSO2)
- - 3.31 - - - - -5.92 -6.79 -5.44
- - 3.31 - - - - -3.78 - -
Spa_g46306 (RFC1)
- - 3.31 - - - - - - -3.59
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - - - -3.41
Spa_g46618 (ABCA1)
- - 3.31 - - - - -4.26 -6.95 -
- - 3.3 - - - - - - -2.73
Spa_g46693 (FRO1)
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g46928 (UBC27)
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -4.25 - -3.19
- - 3.32 - - - - - - -5.9
- - 3.28 - - - - - -1.77 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.25 - - - - -2.07 -2.8 -3.65
- - 3.31 - - - - -3.49 - -
- - 3.29 - -8.16 - -5.12 -3.51 -7.93 -3.8
Spa_g47719 (CYCB2;1)
- - 3.31 - - - - -4.01 - -
- - 3.3 - - - - - - -2.77
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - - - - -4.06 -1.86 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - - - - -1.68 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - - -2.46 -
- - 3.29 - - - - - - -2.07
- - 3.32 - - - - - - -6.17
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -5.61
- - 3.29 - - - - -2.62 -7.01 -4.16
- - 3.25 - - - - -1.1 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - - - -1.5 - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g49170 (NRPB7)
- - 3.31 - - - - - - -4.07
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - - - -2.54
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - - - - -4.46 - -1.65
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g49609 (RAC2)
- - 3.31 - - - - -3.23 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - -4.35 -5.2 -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g50098 (emb1187)
- - 3.3 - - - - -5.07 -4.95 -3.73

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.