Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00606	0.4	0.39	0.57	0.72	0.54	0.56	0.76	1.0	0.86	0.85
Spa_g00709	0.0	0.05	0.02	0.02	0.07	0.03	0.22	0.13	0.23	1.0
Spa_g01385	0.0	0.11	0.04	0.01	0.34	0.01	0.57	0.53	0.94	1.0
Spa_g01467	0.91	0.73	0.63	0.41	0.39	0.44	0.4	0.62	1.0	0.89
Spa_g01678 (GGPS1)	0.06	0.0	0.02	0.04	0.06	0.09	0.15	0.38	1.0	0.37
Spa_g01757 (VPS28-1)	0.12	0.17	0.6	0.1	0.52	0.14	0.64	0.62	1.0	0.47
Spa_g01888	0.78	0.83	0.71	0.63	0.6	0.63	0.62	0.82	0.91	1.0
Spa_g02660	0.45	0.47	0.46	0.43	0.4	0.58	0.54	0.78	1.0	0.83
Spa_g02684	0.0	0.05	0.0	0.01	0.03	0.0	0.08	0.4	0.3	1.0
Spa_g02825	0.03	0.05	0.09	0.01	0.18	0.01	0.12	0.16	0.29	1.0
Spa_g03071	0.06	0.37	0.88	0.11	0.2	0.12	0.1	0.4	1.0	0.72
Spa_g03417	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.79	1.0
Spa_g03826	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.6	0.38	1.0
Spa_g05801 (GIS)	0.0	0.0	0.1	0.0	0.01	0.0	0.0	0.22	0.73	1.0
Spa_g05825	0.02	0.04	0.06	0.04	0.26	0.12	0.61	0.8	0.95	1.0
Spa_g06634	0.0	0.05	0.04	0.02	0.08	0.02	0.23	0.06	0.21	1.0
Spa_g07733	0.43	0.42	0.29	0.46	0.52	0.3	0.59	1.0	0.87	0.86
Spa_g07886	0.36	0.0	0.3	0.02	0.0	0.01	0.0	0.76	1.0	0.77
Spa_g07952 (ICL)	0.01	0.23	0.02	0.04	0.17	0.03	0.29	0.09	0.42	1.0
Spa_g08381	0.0	0.41	0.2	0.16	0.5	0.12	0.4	0.18	1.0	0.9
Spa_g10493	0.3	0.05	0.44	0.11	0.12	0.16	0.18	0.15	0.54	1.0
Spa_g11339	0.03	0.0	0.08	0.03	0.01	0.03	0.01	0.19	0.47	1.0
Spa_g11723 (CAD9)	0.17	0.0	0.06	0.02	0.0	0.03	0.0	0.26	0.34	1.0
Spa_g12677	0.17	0.16	0.17	0.26	0.39	0.25	0.53	0.49	1.0	0.57
Spa_g13853	0.51	0.37	0.38	0.24	0.43	0.29	0.66	0.93	1.0	0.67
Spa_g14613	0.04	0.46	0.26	0.1	0.22	0.06	0.32	0.15	1.0	0.76
Spa_g15563	0.19	0.14	0.06	0.17	0.1	0.31	0.13	0.89	0.86	1.0
Spa_g16904	0.36	0.36	0.49	0.63	0.64	0.59	0.84	1.0	0.76	0.63
Spa_g17084	0.0	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.21	0.02	0.16	1.0
Spa_g17410 (AGB1)	0.32	0.37	0.35	0.39	0.35	0.46	0.48	0.66	1.0	0.78
Spa_g17941	0.0	0.2	0.11	0.12	0.17	0.12	0.27	0.32	1.0	0.7
Spa_g21539	0.0	0.0	0.37	0.0	0.12	0.0	0.39	0.27	1.0	0.53
Spa_g21643 (TSB2)	0.03	0.16	0.08	0.02	0.33	0.01	0.62	0.82	1.0	0.93
Spa_g21929 (CPK7)	0.14	0.24	0.01	0.34	0.36	0.35	0.73	0.71	0.76	1.0
Spa_g23439	0.37	0.46	0.09	0.32	0.22	0.26	0.25	0.5	0.52	1.0
Spa_g23555	0.62	0.22	0.19	0.13	0.27	0.31	0.18	0.97	0.89	1.0
Spa_g24016	0.3	0.52	0.55	0.28	0.5	0.22	0.69	0.55	1.0	0.69
Spa_g24279	0.1	0.44	0.28	0.24	0.51	0.3	0.54	0.31	1.0	0.98
Spa_g24565 (ACR3)	0.61	0.52	0.21	0.19	0.29	0.25	0.36	0.7	1.0	0.87
Spa_g25451	0.29	0.32	0.48	0.26	0.29	0.23	0.47	0.52	1.0	0.74
Spa_g25515	0.04	0.01	0.04	0.23	0.07	0.23	0.16	0.32	0.38	1.0
Spa_g25700	0.1	0.12	1.0	0.17	0.17	0.14	0.25	0.57	0.94	0.47
Spa_g26480	0.39	0.34	0.44	0.54	0.42	0.66	0.43	0.86	1.0	0.95
Spa_g26584 (DFL2)	0.07	0.07	0.03	0.04	0.11	0.05	0.22	1.0	0.43	0.89
Spa_g27158	0.02	0.01	0.94	0.0	0.01	0.01	0.0	0.61	1.0	0.53
Spa_g27562	0.51	0.41	0.34	0.25	0.27	0.57	0.69	0.55	1.0	0.7
Spa_g27601	0.22	0.29	0.28	0.23	0.28	0.2	0.35	0.07	1.0	0.8
Spa_g28318	0.08	0.03	0.19	0.03	0.11	0.09	0.22	0.05	0.27	1.0
Spa_g28612	0.0	0.04	0.38	0.04	0.01	0.14	0.0	0.0	0.41	1.0
Spa_g28944	0.18	0.19	0.04	0.3	0.36	0.24	0.46	0.78	0.94	1.0
Spa_g28989	0.03	0.0	0.43	0.11	0.42	0.0	0.36	0.79	1.0	0.92
Spa_g29231	0.8	0.62	0.58	0.43	0.4	0.47	0.44	0.74	1.0	0.71
Spa_g29317	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.48	1.0
Spa_g29423	0.29	0.09	0.1	0.52	0.17	0.28	0.5	0.91	0.59	1.0
Spa_g29425	0.03	0.06	0.02	0.02	0.1	0.03	0.21	0.16	0.37	1.0
Spa_g29981	0.0	0.02	0.0	0.05	0.09	0.1	0.23	0.09	0.54	1.0
Spa_g30191	0.01	0.03	0.26	0.0	0.24	0.01	0.34	0.0	1.0	0.46
Spa_g30322	0.1	0.05	0.03	0.15	0.33	0.11	0.5	0.7	1.0	0.9
Spa_g30771	0.29	0.78	0.35	0.29	0.76	0.35	0.7	0.71	0.79	1.0
Spa_g31038 (CKX5)	0.38	0.05	0.29	0.0	0.05	0.01	0.06	0.23	0.36	1.0
Spa_g31713	0.01	0.0	0.99	0.0	0.01	0.0	0.0	0.66	1.0	0.59
Spa_g32521	0.0	0.0	0.15	0.02	0.26	0.0	0.6	0.0	1.0	0.83
Spa_g33453	0.0	0.33	0.03	0.05	0.21	0.02	0.33	0.03	0.41	1.0
Spa_g35914	0.18	0.17	0.08	0.1	0.12	0.09	0.21	0.28	0.4	1.0
Spa_g36412	0.35	0.21	0.42	0.28	0.26	0.5	0.4	1.0	0.81	0.64
Spa_g37517	0.02	0.28	0.19	0.02	0.5	0.06	0.32	0.56	0.74	1.0
Spa_g38232	0.02	0.1	0.07	0.0	0.12	0.13	0.33	0.07	0.26	1.0
Spa_g38314 (MYC2)	0.0	0.0	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.11	0.58	1.0
Spa_g39969	0.23	0.9	0.12	0.27	0.5	0.21	0.47	0.38	0.52	1.0
Spa_g40780	0.11	0.21	0.81	0.05	0.61	0.09	0.56	0.61	1.0	0.88
Spa_g40862	0.03	0.17	0.19	0.14	0.25	0.35	0.22	0.4	1.0	0.66
Spa_g41039	0.11	0.17	0.05	0.25	0.23	0.23	0.35	0.57	0.55	1.0
Spa_g41108 (CPK30)	0.25	0.38	0.08	0.14	0.1	0.13	0.22	0.98	0.75	1.0
Spa_g41318 (CYP704B1)	0.07	0.0	0.1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.42	1.0
Spa_g41392 (CPK7)	0.32	0.07	0.06	0.23	0.26	0.18	0.48	1.0	0.91	0.85
Spa_g41393 (CPK13)	0.25	0.11	0.01	0.26	0.26	0.18	0.41	0.72	0.66	1.0
Spa_g42160 (SWEET11)	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.06	0.0	0.02	0.4	1.0
Spa_g42317	0.01	0.05	0.3	0.13	0.13	0.14	0.09	0.3	0.43	1.0
Spa_g42671	0.0	0.11	0.0	0.21	0.03	0.04	0.03	0.0	0.35	1.0
Spa_g42888	0.31	0.15	0.31	0.66	0.14	0.68	0.19	0.76	0.95	1.0
Spa_g42951	0.01	0.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.91	1.0
Spa_g45745	0.36	0.33	0.87	0.37	0.75	0.46	0.58	0.94	1.0	0.83
Spa_g46491	0.02	0.07	0.25	0.2	0.27	0.09	0.37	0.42	0.35	1.0
Spa_g46670 (PTR2)	0.0	0.03	0.21	0.0	0.06	0.0	0.04	0.47	1.0	0.62
Spa_g50130	0.17	0.1	0.59	0.23	0.5	0.3	0.54	1.0	0.71	0.51
Spa_g50157	0.36	0.33	0.74	0.33	0.5	0.35	0.67	0.58	1.0	0.73
Spa_g50285	0.11	0.1	0.59	0.13	0.2	0.08	0.31	0.22	1.0	0.78
Spa_g52333	0.06	0.11	0.03	0.16	0.26	0.21	0.31	0.65	1.0	0.51
Spa_g52811	0.08	0.0	0.08	0.0	0.09	0.06	0.0	1.0	0.59	0.76
Spa_g56234	0.32	0.41	0.35	0.42	0.48	0.4	0.49	0.45	0.46	1.0
Spa_g56614	0.84	0.62	0.59	0.35	0.46	0.46	0.38	0.72	1.0	0.7
Spa_g56926 (PIP2)	0.24	0.25	0.41	0.42	0.16	0.49	0.2	0.82	1.0	0.99

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)