Heatmap: Cluster_169 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00238 (GRP2)	-0.08	0.03	0.27	-0.67	0.66	0.02	0.72	-1.73	-0.38	-0.17
Spa_g01644	0.23	-0.18	0.6	0.07	-0.02	0.18	-0.17	-0.57	-0.48	-0.02
Spa_g01829	0.63	0.68	0.14	-0.46	0.4	-0.13	0.02	-2.27	-0.16	-0.57
Spa_g02431	0.16	-0.18	0.13	-0.04	0.3	0.24	0.1	-0.89	0.04	-0.19
Spa_g03516	0.1	-0.24	0.12	0.05	0.15	0.27	0.1	-0.62	-0.02	-0.1
Spa_g04414 (RNL)	0.29	0.39	-0.05	-0.21	0.13	0.11	0.1	-0.82	-0.23	-0.03
Spa_g05308 (CEN2)	-0.05	-0.27	0.22	0.03	0.12	0.12	0.14	-0.57	0.19	-0.12
Spa_g05753	0.35	0.22	0.19	-0.11	0.12	-0.08	0.04	-0.67	-0.11	-0.19
Spa_g06083	-0.22	0.04	0.25	0.36	0.17	0.32	0.16	-0.8	-0.21	-0.5
Spa_g07189	0.17	-0.26	-0.14	0.09	0.17	0.28	0.31	-0.99	-0.04	0.02
Spa_g07328	-0.08	-0.45	0.47	0.16	0.3	0.18	0.17	-0.89	-0.15	-0.16
Spa_g08507 (OXA1L)	0.35	-0.03	0.04	-0.12	0.1	-0.02	0.02	-0.52	-0.02	0.08
Spa_g08695 (EMB1401)	-0.07	-0.22	-0.04	0.09	0.16	0.23	0.27	-0.7	0.06	-0.0
Spa_g08869 (NFD2)	0.11	-0.13	0.31	0.01	0.19	0.17	0.09	-0.88	-0.14	-0.05
Spa_g09811	0.31	-0.16	0.17	0.05	0.04	0.2	0.13	-0.84	-0.05	-0.13
Spa_g10270	0.17	-0.27	0.26	-0.49	0.59	-0.1	0.44	-1.12	-0.15	-0.02
Spa_g12174	0.3	-0.03	0.18	-0.06	0.28	0.07	0.14	-0.85	-0.13	-0.22
Spa_g12708	0.05	-0.06	0.23	-0.13	0.16	0.09	0.18	-0.77	-0.09	0.1
Spa_g12968 (GRP4)	0.24	0.01	0.03	-0.18	0.22	0.19	0.14	-0.9	0.14	-0.23
Spa_g13287	0.09	-0.05	0.11	0.25	0.24	0.26	0.11	-1.37	-0.19	-0.04
Spa_g13393	-0.3	-1.37	0.88	-0.16	0.56	0.5	0.38	-2.26	0.1	-0.75
Spa_g15756	0.27	0.2	0.19	-0.17	0.04	0.02	0.01	-0.59	-0.01	-0.15
Spa_g15807	-0.03	-0.22	0.29	0.04	0.16	0.13	0.24	-0.6	-0.07	-0.15
Spa_g15858	0.25	0.23	0.05	-0.05	0.17	-0.04	0.13	-0.64	-0.06	-0.25
Spa_g17117	0.06	-0.37	0.0	0.45	-0.12	0.47	0.11	-0.84	-0.38	0.14
Spa_g17179	-0.3	0.55	0.23	0.16	-0.04	-0.0	0.11	-0.75	0.29	-0.82
Spa_g17710	-0.27	-2.46	0.93	0.57	0.42	0.26	0.16	-1.49	-0.17	-0.53
Spa_g18547 (EIF2 GAMMA)	0.17	-0.27	-0.01	-0.06	0.21	0.07	0.23	-0.67	0.12	-0.01
Spa_g18945	0.18	-0.65	0.19	-0.01	0.2	0.22	0.2	-0.66	0.08	-0.08
Spa_g18974 (REME1)	0.39	0.34	0.12	-0.26	0.08	-0.11	0.12	-0.69	0.04	-0.34
Spa_g19919	0.07	0.25	0.04	-0.09	0.19	0.04	0.26	-0.83	-0.02	-0.19
Spa_g22508	0.04	-0.5	0.52	-0.05	0.0	0.01	0.25	-0.67	0.1	-0.04
Spa_g22574 (VAC1)	0.03	-0.05	0.53	-0.32	-0.04	0.17	0.17	-1.07	0.17	-0.09
Spa_g22971	0.04	-0.03	0.31	-0.14	0.29	-0.17	0.32	-0.67	-0.03	-0.19
Spa_g23549	0.39	0.5	0.07	-0.27	0.33	-0.06	0.3	-2.01	-0.37	-0.12
Spa_g24354	0.33	-0.09	0.13	-0.18	0.36	-0.13	0.32	-0.72	-0.37	-0.0
Spa_g26005 (HSP91)	0.12	-0.49	0.72	0.26	0.28	0.08	-0.31	-0.75	-0.25	-0.25
Spa_g26033 (GOS12)	-0.02	0.02	0.11	-0.11	0.32	0.07	0.41	-0.75	-0.31	-0.05
Spa_g26170 (VAC1)	0.36	0.02	0.28	-0.42	0.47	-0.37	0.42	-1.15	-0.25	-0.07
Spa_g27761	0.04	-0.14	0.38	-0.58	0.55	0.17	0.28	-1.63	-0.02	-0.03
Spa_g28246	-0.26	-0.33	0.28	0.16	0.28	0.24	0.36	-1.2	-0.05	-0.07
Spa_g30847 (CUTA)	-0.1	-0.13	0.04	0.12	0.13	0.22	0.07	-0.44	-0.02	-0.0
Spa_g32689	0.42	0.3	0.36	0.06	-0.32	0.23	-0.24	-0.95	-0.71	0.22
Spa_g38495 (NFD2)	-0.03	-0.08	0.19	0.03	0.12	0.16	0.11	-0.69	0.05	-0.05
Spa_g39401 (DRL1)	0.17	-0.25	0.32	-0.05	-0.04	0.15	-0.04	-0.19	-0.17	0.01
Spa_g40643	0.02	0.12	0.15	-0.08	0.35	0.07	0.55	-0.68	-0.68	-0.31
Spa_g41801 (EIF2 GAMMA)	0.12	-0.11	0.25	-0.0	0.11	0.1	0.23	-0.92	-0.07	-0.01
Spa_g43750	0.74	0.55	0.3	-0.74	0.53	-0.39	0.55	-4.21	-1.01	-0.29
Spa_g44186	0.13	-0.58	0.56	0.01	-0.07	0.13	0.18	-0.72	0.07	-0.11
Spa_g46480 (ACS12)	-0.54	0.24	0.69	0.18	0.13	0.11	0.29	-0.78	-0.09	-1.08
Spa_g46936	0.16	-0.73	0.29	0.11	0.09	0.31	0.13	-0.81	0.11	-0.09
Spa_g50270	0.29	-0.94	0.1	0.14	0.11	0.34	0.08	-0.38	-0.11	-0.02
Spa_g50271	0.31	-0.79	0.18	0.08	0.03	0.16	-0.01	-0.31	0.12	-0.03
Spa_g50272	0.19	-0.77	0.27	0.03	0.08	0.24	0.11	-0.54	0.12	-0.08
Spa_g50787	-0.91	0.36	0.69	0.35	0.39	0.55	0.32	-1.25	-0.33	-3.9
Spa_g50861	0.25	-0.31	0.11	0.02	0.1	0.29	-0.06	-0.62	-0.14	0.14
Spa_g51169 (TIM23-2)	0.25	-0.05	0.19	0.11	-0.38	0.36	-0.14	-0.41	-0.43	0.24
Spa_g51449	-0.03	-0.27	-0.07	0.25	0.35	0.3	0.04	-0.98	-0.23	0.21
Spa_g51450	0.19	-0.12	0.27	0.08	0.18	-0.05	0.04	-0.74	-0.1	0.03
Spa_g51511	0.29	-0.16	0.15	-0.35	0.26	-0.09	0.4	-0.78	-0.12	0.04
Spa_g53026 (RR1)	0.35	-0.22	0.31	-0.0	0.11	0.16	0.19	-0.65	-0.27	-0.28
Spa_g53149	0.08	-0.8	0.27	-0.08	0.19	0.35	0.25	-0.78	0.25	-0.27
Spa_g54214	0.72	-1.2	1.01	0.05	0.4	-0.18	-0.26	-1.03	-0.3	-0.9
Spa_g54394	0.12	-0.17	0.21	-0.26	0.35	0.08	0.41	-1.16	-0.2	0.1
Spa_g54647 (CRR2)	0.19	-0.22	0.44	-0.2	0.05	0.16	-0.22	-1.15	0.28	0.14
Spa_g55877	0.38	-0.33	0.25	-0.06	0.18	0.23	-0.09	-1.13	-0.22	0.25
Spa_g55942 (ANN5)	-0.62	0.13	0.57	0.35	0.14	0.36	0.22	-1.86	0.16	-0.84
Spa_g56048	0.41	0.22	0.16	-0.09	0.07	-0.06	-0.03	-0.65	-0.04	-0.25
Spa_g56389 (SNL2)	0.12	-0.82	0.55	0.16	-0.04	0.31	-0.14	-0.58	0.07	-0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.