Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g32201 (PAB8)
- -4.27 - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33019 (TOPP4)
- - - - - - -4.29 - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34344 (ARP2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34661 (PP2A-2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - -6.63 - - 3.32
- -3.17 - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35352 (EIF4A-2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g36272 (BIP1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37921 (STP4)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38207 (ORP3B)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38458 (CDC2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38662 (TUB5)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38708 (RAN1)
- -5.87 -4.27 - -6.1 - -4.11 -6.12 -4.93 3.29
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39029 (SAR2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39261 (RABA1e)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39447 (GPA1)
- - -6.77 - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -4.42 - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39808 (MSL5)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40475 (UBQ11)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40550 (LACS6)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40746 (ASK2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40920 (ACT11)
- - - - - - -4.06 - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41211 (ECH2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41668 (RBOHF)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41817 (IBR3)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41920 (CYC2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42056 (PHT3;1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42196 (SGT1A)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -6.0 - -6.29 - -5.33 - -3.63 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.