Heatmap: Cluster_211 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
583.51 14.32 40.78 348.19 33.79 281.6 25.79 57.1 28.22 160.31
Spa_g02460 (OEP16)
406.2 260.86 349.17 382.58 229.11 330.31 220.8 269.96 231.56 275.7
50.22 12.58 30.02 38.68 11.62 40.13 13.41 16.43 17.33 24.0
20.17 2.93 11.59 14.15 3.07 12.0 3.36 9.37 6.18 11.11
21.2 0.18 1.01 11.69 0.83 10.79 0.64 2.57 3.14 7.52
26.97 1.34 11.43 25.09 6.52 22.11 6.2 5.94 9.38 19.84
Spa_g05512 (GONST5)
28.56 1.05 14.46 26.17 6.55 30.2 6.37 4.62 9.05 18.02
59.11 13.68 31.17 37.23 15.06 37.76 14.96 23.56 23.51 26.4
Spa_g06190 (IBO1)
31.56 5.1 10.79 24.49 5.53 24.13 4.8 12.54 15.36 13.45
34.93 5.18 22.69 24.21 7.84 25.87 7.0 15.88 13.85 14.95
Spa_g07255 (TOM2A)
37.77 2.52 19.85 29.28 9.05 30.4 8.65 15.49 13.92 27.96
Spa_g07608 (MAP70-4)
16.94 1.28 8.79 10.12 2.62 10.82 2.75 8.41 6.44 7.26
12.4 5.99 10.74 9.45 5.4 10.55 5.33 7.43 7.09 8.27
Spa_g08716 (CYB-1)
101.22 14.5 47.52 73.08 18.41 75.67 20.5 34.02 44.53 61.0
198.62 4.0 48.97 124.22 10.43 113.38 9.26 26.82 38.59 87.23
Spa_g09227 (FRY1)
20.53 12.31 16.94 16.2 7.63 15.28 6.95 12.34 10.24 12.39
Spa_g09534 (ERG28)
75.87 10.2 30.4 45.41 7.33 39.5 7.62 21.98 15.43 37.84
Spa_g10341 (KDSB)
38.67 22.29 33.29 36.39 20.79 33.11 18.69 24.06 22.15 26.49
Spa_g10503 (CSI1)
24.83 4.74 12.07 17.08 4.86 19.3 4.78 6.46 8.16 12.46
9.32 0.69 3.68 5.22 0.75 4.65 0.62 3.54 2.38 2.74
16.05 5.31 12.82 12.49 2.7 10.52 3.39 4.74 3.35 8.02
Spa_g12014 (PI4K GAMMA 4)
80.55 3.58 28.44 50.53 10.34 54.38 10.65 21.09 11.84 28.98
99.68 9.59 43.94 78.38 16.58 77.95 16.35 36.98 35.75 76.97
Spa_g12279 (CPK13)
20.29 1.19 10.53 12.06 2.25 10.26 2.43 8.45 4.62 9.18
98.79 5.94 52.37 73.13 15.21 71.74 13.46 19.17 23.46 19.53
4.79 2.51 4.22 4.74 2.35 4.21 2.17 1.94 2.42 2.8
Spa_g17022 (IAA13)
99.23 3.18 6.08 51.18 6.44 44.49 4.21 10.53 4.92 27.36
Spa_g18814 (TON1B)
12.63 3.99 8.37 8.91 3.36 9.68 3.97 4.2 4.64 6.47
12.48 2.0 5.75 8.54 2.0 7.53 1.29 3.91 2.52 6.48
Spa_g20294 (ACT7)
92.53 1.82 36.34 52.94 10.29 57.71 10.65 29.7 27.97 55.97
41.38 1.64 13.93 25.14 1.17 18.48 3.49 13.26 9.37 14.87
23.12 4.61 13.77 16.36 5.29 17.21 5.34 5.09 4.19 7.9
Spa_g21406 (IAA8)
243.23 6.64 26.76 175.8 17.43 147.22 13.44 26.99 24.32 49.34
Spa_g21483 (VH1)
12.15 0.06 1.88 9.3 0.65 8.69 0.81 2.78 2.48 3.97
8.17 3.45 6.68 6.14 2.12 5.94 2.01 3.33 3.15 4.35
Spa_g23417 (B5 #4)
214.49 58.05 130.83 169.71 47.32 149.82 44.75 56.59 68.98 95.87
Spa_g24819 (TUB8)
83.78 5.98 31.51 61.95 14.74 56.24 13.55 44.0 31.28 30.86
Spa_g24882 (sks4)
47.18 0.14 3.98 24.58 0.28 21.58 0.32 3.89 3.13 13.93
120.08 0.54 6.23 52.58 1.36 35.5 0.79 25.79 12.34 28.01
Spa_g25448 (EXP3)
16.41 0.08 0.55 7.71 0.39 6.92 0.32 1.57 2.17 5.76
34.9 1.39 17.61 20.18 5.57 18.47 7.05 10.24 6.19 15.16
74.27 0.82 16.36 30.96 1.8 21.74 1.43 21.13 13.01 17.27
41.16 22.07 29.97 34.84 16.43 32.93 14.94 24.55 18.48 24.01
Spa_g29956 (IXR1)
19.6 0.3 4.21 11.94 0.78 11.66 0.99 6.88 4.11 7.29
37.52 1.73 15.55 30.68 4.88 27.73 4.05 12.18 9.86 15.19
Spa_g30612 (HIK)
45.29 1.12 21.54 34.72 1.89 35.96 1.4 7.58 5.87 15.71
27.53 2.11 13.03 20.17 3.9 17.44 2.71 9.37 10.23 9.09
36.79 12.74 22.89 29.18 12.33 26.48 12.07 16.86 19.04 24.02
23.84 2.0 14.39 15.26 3.41 15.25 4.1 6.76 6.95 13.34
Spa_g41747 (MAP70-4)
40.23 2.4 18.41 24.19 4.66 20.81 4.6 16.22 15.0 18.05
Spa_g46238 (PI4K GAMMA 4)
15.22 1.23 7.22 10.49 1.79 10.52 2.0 3.8 2.04 7.18
Spa_g47009 (TUA6)
50.15 0.29 15.34 29.27 2.34 23.14 1.85 15.31 14.21 17.72
25.24 0.56 6.77 18.0 1.79 16.52 1.27 6.15 4.14 5.77
Spa_g48283 (IXR1)
103.96 2.03 26.76 63.07 3.23 49.0 3.62 28.37 16.8 32.16
10.74 0.0 4.15 4.44 0.19 4.68 0.18 2.93 2.53 3.75
41.62 4.5 20.19 33.18 4.64 30.76 4.64 18.19 9.99 15.85
94.58 2.95 43.23 83.25 14.02 105.84 16.06 22.29 50.54 77.82
Spa_g54886 (TON1B)
16.01 3.36 9.68 11.76 4.59 10.87 3.5 6.02 6.5 6.77
22.69 0.29 7.7 12.43 1.8 11.5 1.92 6.86 6.15 8.02
Spa_g56589 (ATB2)
49.28 28.15 36.08 45.46 24.45 45.3 21.71 31.68 31.14 34.74
Spa_g57352 (ATH-A)
72.49 1.89 21.25 42.12 2.54 38.02 2.7 26.46 18.83 27.83

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)