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Heatmap: Cluster_136 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
- - 3.12 - - - - -0.1 -1.92 -3.57
- - 3.24 - - - - -0.88 - -
- - 3.28 - - - - -2.01 - -4.23
- - 3.23 - - - - -0.7 - -
- - 3.21 - - - - -1.02 -1.83 -
- - 3.26 - - - - -1.51 -3.32 -
- - 3.26 - - - - -2.03 -3.19 -3.8
- - 3.29 - -6.18 - - -4.01 -7.17 -2.85
- - 3.28 - -5.4 - -5.76 -3.48 -4.76 -3.41
- - 3.32 - -6.94 - - - - -4.9
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - -7.12 - - -2.62 -3.16 -4.57
Spa_g43188 (RPS15A)
 - - 3.28 - -7.21 - - -2.61 -3.47 -4.33
- - 3.26 - - - - -1.91 -2.88 -6.41
Spa_g43203 (ROC1)
 - - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - - - -4.14
- - 3.31 - - - - -4.73 -5.15 -5.3
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g43228 (AML1)
 - - 3.28 - -6.5 - - -3.26 -3.83 -3.06
- - 3.32 - - - - - - -
- -7.01 3.29 - -7.05 - - -3.21 -7.05 -3.78
Spa_g43251 (SAG24)
 - -6.13 3.27 - - - -6.44 -3.44 -4.4 -2.46
- - 3.29 - - - -5.59 -4.15 -3.01 -4.95
- - 3.29 - - - - -3.13 - -3.77
Spa_g43318 (OLI7)
 - - 3.28 - - - -8.19 -2.76 -2.87 -5.37
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.25 - -8.67 - -7.56 -2.68 -3.42 -2.25
- - 3.29 - -8.35 - -7.38 -3.03 -4.15 -5.47
Spa_g43401 (CSY4)
 - - 3.3 - - - - -4.38 -6.26 -3.6
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - -3.01 -4.41 -3.74
Spa_g43538 (TXR1)
 - - 3.32 - - - - - - -
Spa_g43543 (STV1)
 - - 3.26 - - - - -2.03 -3.8 -3.09
- - 3.27 - - - - -2.66 -4.87 -2.9
- - 3.29 - - - -7.19 -2.97 -5.21 -3.6
- - 3.29 - - - - -3.56 -4.32 -3.71
- - 3.28 - - - - -2.67 -4.83 -3.55
Spa_g43578 (CAM9)
 - - 3.21 - - - -4.62 -0.94 - -2.42
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - -2.12 - -
Spa_g43647 (ERDJ3B)
 - - 3.3 - - - - -3.6 -3.46 -
- - 3.29 - - - -2.87 -3.35 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.23 - - - - -2.89 -3.69 -1.35
- - 3.31 - - - - - - -3.44
- - 3.27 - - - - -2.03 -4.92 -4.56
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.26 - -6.5 - - -2.74 -3.29 -2.66
- - 3.26 - - - - -2.06 -3.52 -3.76
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44056 (Y14)
 - - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - - - - -2.49 -3.98 -4.53
- - 3.31 - - - - - -3.68 -
- - 3.28 - -5.42 - - -4.06 -2.72 -3.81
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44126 (PPAN)
 - - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.73 - -
- - 3.26 - -5.4 - - -2.83 -3.1 -3.11
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g44311 (ING1)
 - - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - -3.15 -3.74 -4.15
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -3.17 -5.37 -5.15
- - 3.3 - - - - -5.08 -4.37 -4.02
Spa_g44363 (RPN5B)
 - - 3.31 - - - - -3.98 -5.44 -
Spa_g44368 (EBP1)
 - - 3.3 - - - - -4.03 -4.71 -3.78
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.29 - - - - - - -2.34
- -8.5 3.28 - -6.96 - -6.12 -3.02 -4.56 -3.85
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.31 - - - - -3.33 - -
- - 3.32 - - - - - -5.19 -
Spa_g44628 (EHD1)
 - - 3.29 - - - -5.92 -4.23 -4.05 -3.89
- - 3.31 - -6.62 - - -4.0 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.23 - - - -6.76 -1.41 -3.54 -2.92
- - 3.29 - - - - -3.4 -3.62 -6.32
Spa_g44740 (PFL)
 - - 3.28 - - - -5.72 -2.82 -6.05 -3.3
Spa_g44761 (RPL16A)
 - - 3.27 - - - - -2.99 -3.24 -2.95
- - 3.26 - -6.6 - - -2.42 -2.56 -4.19
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - -7.41 - - -3.9 -3.73 -2.86
- - 3.29 - - - - -4.01 -4.26 -3.15
Spa_g45014 (EMB2296)
 - -7.1 3.27 - -6.36 - -6.39 -3.97 -3.87 -2.37
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g45066 (BPM3)
 - - 3.29 - - - - -2.65 - -4.65
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - -3.41 -3.56 - -
Spa_g45231 (RPL23AB)
 - - 3.28 - - - - -2.54 -4.02 -5.53
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.28 - - - - -4.05 -2.22 -
- - 3.28 - - - - -2.28 -3.81 -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g46287 (EMB1401)
 - - 3.29 - - - - -3.77 - -2.59
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - - - - -2.44 -3.06 -4.08
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.3 - - - - -2.54 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.27 - - - - -2.79 -2.86 -3.98
- - 3.26 - - - -3.84 - -2.58 -2.37
- - 3.28 - - - - -3.05 -2.93 -5.4
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- -4.48 3.27 - - - - -3.3 -3.14 -3.09
Spa_g48215 (FKBP15-1)
 - - 3.24 - - - - -0.94 - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g48807 (ADF2)
 - - 3.29 - - - - -4.31 -3.16 -3.96
- - 3.32 - - - - - - -8.6
- - 3.32 - - - - - - -5.01
- - 3.32 - - - - - - -5.81
- - 3.31 - - - - - - -3.15
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g49381 (AGL16)
 - -5.19 3.32 - - - - - -7.9 -
- - 3.31 - - - - - - -3.8
- - 3.29 - -8.58 - -7.03 -3.92 -3.34 -4.27
- - 3.3 - - - - -2.75 - -
Spa_g49526 (PAE1)
 - - 3.28 - - - - -2.36 -4.54 -4.19
- - 3.32 - - - - - - -
Spa_g49900 (PPa6)
 - - 3.31 - - - - - - -3.2
- -5.71 3.28 - - - - -2.8 -4.75 -3.72
- -5.96 3.26 - - - -6.25 -2.33 -3.21 -3.43
Spa_g50131 (E2FB)
 - - 3.3 - - - - -3.07 -4.75 -
-1.61 - 3.25 - - - - -4.13 -2.9 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.