Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00155	0.48	0.4	0.35	0.52	0.44	0.5	0.46	0.76	1.0	0.44
Spa_g00488	0.08	0.63	0.14	0.06	0.91	0.18	0.47	1.0	0.43	0.19
Spa_g00878 (WRKY56)	0.1	0.01	0.02	0.09	0.35	0.12	0.38	1.0	0.36	0.06
Spa_g01109	0.23	0.44	0.32	0.48	0.26	0.45	0.25	1.0	0.88	0.28
Spa_g01144 (ACR4)	0.3	0.35	0.39	0.5	1.0	0.64	0.99	0.79	0.68	0.63
Spa_g02063	0.48	0.56	0.44	0.8	0.82	0.85	1.0	0.8	0.9	0.96
Spa_g02327	0.25	0.06	0.08	0.36	0.23	0.23	0.13	1.0	0.38	0.15
Spa_g02399	0.31	0.51	0.4	0.46	1.0	0.52	0.99	0.61	0.65	0.62
Spa_g03255	0.23	0.15	0.25	0.64	0.62	0.38	0.67	1.0	0.51	0.46
Spa_g04360	0.33	0.21	0.15	0.66	0.71	0.65	0.7	1.0	0.44	0.64
Spa_g04698 (PLD)	0.42	0.2	0.29	0.63	0.86	0.62	0.88	1.0	0.72	0.77
Spa_g05265	0.22	0.07	0.57	0.3	0.31	0.26	0.29	1.0	0.64	0.36
Spa_g05291	0.55	0.61	0.45	0.69	0.63	0.81	0.7	1.0	0.83	0.66
Spa_g05927 (CAD6)	0.07	0.0	0.0	0.07	0.58	0.05	0.73	1.0	0.28	0.0
Spa_g05954	0.18	0.12	0.42	0.51	0.44	0.6	0.59	1.0	0.75	0.55
Spa_g06503	0.23	0.3	0.42	0.37	0.47	0.42	0.55	1.0	0.57	0.27
Spa_g06887 (IQD3)	0.54	0.07	0.31	0.37	0.44	0.44	0.5	1.0	0.7	0.42
Spa_g07697 (PLC2)	0.25	0.23	0.39	0.45	0.37	0.46	0.41	1.0	0.63	0.45
Spa_g08141	0.08	0.03	0.03	0.15	0.79	0.15	0.68	1.0	0.4	0.16
Spa_g08210 (GRF7)	0.61	0.49	0.5	0.58	0.91	0.74	0.87	1.0	0.98	0.45
Spa_g09533	0.84	0.1	0.27	0.37	0.21	0.4	0.14	1.0	0.54	0.0
Spa_g10139	0.27	0.16	0.27	0.26	0.34	0.38	0.57	1.0	0.92	0.26
Spa_g10210 (TET7)	0.91	0.07	0.37	0.63	0.65	0.73	0.62	0.96	1.0	0.5
Spa_g10832	0.17	0.09	0.4	0.59	0.96	0.53	1.0	0.45	0.72	0.61
Spa_g11071	0.23	0.16	0.64	0.24	0.51	0.25	0.49	1.0	0.44	0.42
Spa_g11286	0.27	0.19	0.33	0.37	0.42	0.39	0.46	1.0	0.41	0.34
Spa_g11826	0.64	0.28	0.4	0.24	0.27	0.26	0.3	1.0	0.62	0.18
Spa_g13156	0.48	0.53	0.55	0.48	0.72	0.5	0.81	0.91	1.0	0.6
Spa_g13909 (SK13)	0.62	0.46	0.41	0.52	0.47	0.59	0.52	0.98	1.0	0.54
Spa_g13969	0.27	0.53	0.39	0.5	1.0	0.54	0.82	0.59	0.56	0.6
Spa_g14259	0.19	0.15	0.14	0.2	0.56	0.42	0.69	1.0	0.26	0.35
Spa_g14648	0.48	0.48	0.84	0.57	0.72	0.63	0.61	1.0	0.72	0.56
Spa_g14901 (LFR)	0.52	0.65	0.67	0.56	0.86	0.6	0.87	1.0	0.98	0.74
Spa_g16261	0.19	0.09	0.01	0.58	0.68	0.6	0.94	1.0	0.14	0.21
Spa_g16850 (STT3B)	0.66	0.67	0.58	0.55	0.66	0.7	0.75	0.83	1.0	0.65
Spa_g18023	0.3	0.55	0.54	0.47	0.78	0.6	0.77	1.0	0.93	0.55
Spa_g18710	0.34	0.17	0.11	0.16	0.63	0.41	0.78	1.0	0.19	0.37
Spa_g19179	0.24	0.3	0.38	0.45	0.85	0.46	1.0	0.96	0.81	0.22
Spa_g19318 (HWI1)	0.12	0.17	0.2	0.13	0.8	0.29	0.41	1.0	0.43	0.38
Spa_g19402	0.39	0.23	0.16	0.6	0.57	0.6	0.68	1.0	0.76	0.44
Spa_g20063	0.15	0.12	0.06	0.07	0.68	0.08	0.48	1.0	0.25	0.67
Spa_g20439 (GRP2)	0.75	0.65	0.64	0.57	0.66	0.54	0.75	0.81	1.0	0.73
Spa_g21202 (ADNT1)	0.74	0.53	0.56	0.59	0.75	0.59	0.79	1.0	0.84	0.82
Spa_g22020	0.25	0.07	0.64	0.31	0.34	0.32	0.34	1.0	0.56	0.34
Spa_g23372	0.22	0.08	0.29	0.3	0.41	0.44	0.63	1.0	0.55	0.47
Spa_g25361	0.29	0.07	0.07	0.29	0.48	0.5	0.53	1.0	0.2	0.33
Spa_g25362	0.38	0.04	0.05	0.41	0.67	0.59	0.91	1.0	0.17	0.37
Spa_g25459	0.59	0.28	0.69	0.38	0.62	0.58	0.48	1.0	0.99	0.63
Spa_g26461 (ADNT1)	0.55	0.44	0.46	0.41	0.6	0.41	0.62	1.0	0.74	0.58
Spa_g27265	0.2	0.32	0.12	0.43	0.75	0.5	1.0	0.59	0.56	0.35
Spa_g27426	0.1	0.06	0.09	0.23	0.53	0.07	0.33	1.0	0.26	0.36
Spa_g27729	0.07	0.18	0.16	0.25	0.77	0.31	0.92	1.0	0.91	0.26
Spa_g30039	0.01	0.0	0.02	0.46	0.52	0.4	0.92	1.0	0.8	0.16
Spa_g31138 (TRFL6)	0.66	0.6	0.66	0.71	0.84	0.69	0.87	1.0	0.82	0.7
Spa_g31418	0.79	0.02	0.21	0.62	0.18	0.63	0.44	1.0	0.57	0.55
Spa_g37414	0.27	0.24	0.42	0.65	0.5	0.59	0.55	1.0	0.66	0.47
Spa_g37856	0.2	0.1	0.46	0.6	0.93	0.57	1.0	0.5	0.82	0.66
Spa_g40370	0.0	0.11	0.0	0.05	0.39	0.07	0.4	1.0	0.23	0.18
Spa_g41489	0.6	0.66	0.48	0.87	0.9	0.95	1.0	0.97	0.99	0.94
Spa_g42563	0.67	0.15	0.44	0.34	0.38	0.34	0.51	1.0	0.7	0.11
Spa_g44189	0.23	0.28	0.35	0.28	0.29	0.32	0.34	1.0	0.61	0.42
Spa_g45622	0.47	0.29	0.62	0.56	0.64	0.56	0.55	1.0	0.77	0.65
Spa_g45787 (GRF7)	0.54	0.47	0.23	0.39	0.74	0.65	1.0	0.92	0.72	0.3
Spa_g45922	0.51	0.6	0.56	0.75	0.77	0.91	1.0	0.7	0.7	0.74
Spa_g46503 (SAT5)	0.54	0.38	0.48	0.57	0.81	0.56	0.79	1.0	0.89	0.54
Spa_g46645	0.44	0.03	0.25	0.07	0.17	0.0	0.25	1.0	0.37	0.03
Spa_g47518	0.29	0.46	0.51	0.45	0.93	0.47	0.81	0.89	1.0	0.6
Spa_g48434	0.53	0.59	0.52	0.33	0.79	0.71	0.67	1.0	0.72	0.68
Spa_g48652	0.08	0.0	0.09	0.6	0.48	0.49	0.62	1.0	0.56	0.11
Spa_g50033 (RTE1)	0.71	0.03	0.22	0.6	0.37	0.69	0.36	1.0	0.6	0.54
Spa_g50149	0.59	0.24	0.37	0.64	0.63	0.75	0.58	1.0	0.9	0.61
Spa_g50207	0.15	0.32	0.31	0.36	0.31	0.46	0.53	1.0	0.65	0.42
Spa_g50850	0.32	0.54	0.1	0.09	0.61	0.06	0.38	1.0	0.43	0.18
Spa_g52414	0.38	0.33	0.63	0.51	0.63	0.47	0.71	1.0	0.85	0.34
Spa_g53607 (GRF7)	0.58	0.48	0.46	0.58	0.94	0.73	0.95	0.84	1.0	0.43
Spa_g54144	0.27	0.24	0.54	0.34	0.5	0.42	0.5	1.0	0.75	0.43
Spa_g54247	0.29	0.48	0.36	0.38	0.78	0.45	0.73	0.92	1.0	0.41
Spa_g54372	0.33	0.12	0.09	0.22	0.72	0.5	1.0	0.98	0.48	0.36
Spa_g54416 (ATB2)	0.41	0.51	0.39	0.31	0.74	0.29	0.61	1.0	0.48	0.58
Spa_g54497 (CBL2)	0.45	0.22	0.38	0.42	0.58	0.46	0.56	1.0	0.71	0.2
Spa_g54696	0.54	0.11	0.18	0.48	0.64	0.48	0.76	0.82	1.0	0.63
Spa_g54866	0.66	0.41	0.47	0.79	0.6	0.73	0.49	1.0	0.87	0.67
Spa_g55099 (TLP3)	0.35	0.1	0.38	0.47	0.52	0.47	0.56	1.0	0.54	0.4
Spa_g55148	0.22	0.56	0.64	0.53	0.8	0.77	1.0	0.96	0.94	0.66
Spa_g56432	0.71	0.53	0.6	0.61	0.72	0.65	0.74	0.7	1.0	0.72
Spa_g56437	0.19	0.07	0.37	0.34	0.7	0.27	0.17	1.0	0.78	0.33
Spa_g56758	0.35	0.47	0.54	0.57	0.54	0.55	0.62	1.0	0.74	0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)