Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
40.97 2.45 2.48 3.97 1.24 3.49 1.18 3.29 2.06 2.13
Spa_g01913 (XTR7)
251.33 0.0 0.05 4.08 0.03 0.48 0.05 4.89 0.0 2.82
Spa_g02235 (GLIP7)
71.3 0.0 0.24 1.04 0.0 0.0 0.0 2.53 0.11 0.13
13.07 0.6 4.48 0.17 0.01 0.36 0.0 0.31 0.13 0.0
312.77 0.0 0.78 2.03 0.05 0.11 0.27 4.71 2.98 0.0
35.43 0.67 0.81 4.94 0.24 2.01 0.15 0.9 0.67 0.39
21.77 0.24 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.81 0.09 0.1
119.33 0.0 7.73 6.73 0.07 2.38 0.0 5.62 1.54 0.32
4.99 0.0 0.73 0.0 0.0 0.04 0.0 0.45 0.31 0.09
7.99 1.36 0.0 0.51 0.0 0.09 0.0 0.51 0.0 0.0
4.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.09
Spa_g04040 (CRL)
4.32 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0
Spa_g04550 (LHCA1)
442.74 9.59 22.44 70.09 1.12 46.07 0.71 24.56 4.69 4.21
74.73 0.08 32.25 16.86 0.24 10.15 0.1 1.72 3.32 6.21
92.78 0.07 0.99 4.11 0.0 0.98 0.0 4.29 1.23 10.65
35.19 0.09 1.9 0.26 0.0 0.11 0.08 2.89 0.1 0.07
102.89 0.0 1.39 0.72 0.0 0.08 0.0 1.75 0.77 0.12
8.72 0.01 0.52 0.13 0.1 0.05 0.02 1.19 0.52 0.38
5.2 0.0 0.0 0.71 0.0 0.27 0.0 0.82 0.09 0.59
212.36 0.0 4.43 9.91 0.0 0.84 0.09 9.76 3.32 0.25
863.04 0.63 18.1 37.73 0.0 4.59 0.44 74.11 19.3 2.2
Spa_g08645 (XYL4)
75.42 0.01 19.8 0.62 0.0 0.29 0.0 1.55 0.16 0.05
533.14 0.07 64.27 21.4 0.11 10.18 0.17 34.9 4.15 8.89
38.11 0.0 0.0 0.74 0.0 0.23 0.0 0.46 0.03 0.0
20.33 0.0 0.0 1.1 0.0 0.22 0.02 0.6 0.11 0.08
26.72 1.46 0.21 0.69 0.0 0.36 0.02 0.33 0.14 1.37
51.45 0.0 1.75 0.23 0.02 0.06 0.01 3.15 0.05 0.16
9.97 0.03 0.23 0.37 0.0 0.1 0.0 0.79 0.12 0.07
10.06 0.49 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 0.39
11.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.13 0.0
Spa_g12325 (HEXO3)
87.92 0.05 5.1 8.92 0.11 2.87 0.14 13.46 5.08 2.19
Spa_g12976 (BRN2)
17.71 0.15 0.19 1.63 0.63 2.4 0.9 1.24 1.97 2.28
317.42 0.32 99.32 2.46 0.02 3.3 0.11 6.08 1.26 0.44
76.77 3.46 1.04 0.24 0.2 0.21 0.13 2.35 1.58 0.1
Spa_g15847 (GLP7)
2229.62 192.01 63.34 6.15 1.33 6.19 1.39 1.67 0.18 1.72
42.82 0.46 8.05 2.21 0.11 1.22 0.29 0.54 0.46 2.97
Spa_g17260 (FMA)
11.89 1.72 0.08 0.16 0.08 0.24 0.04 0.26 0.03 0.04
4.12 0.25 1.62 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.23 0.13
29.28 0.0 0.73 3.31 1.02 3.23 1.58 2.0 1.03 0.46
91.51 0.47 7.94 5.98 0.76 3.92 0.34 3.15 0.94 0.61
Spa_g25561 (EXP15)
445.04 0.17 126.76 32.09 1.57 21.85 0.87 35.16 9.41 13.71
8.28 0.01 1.88 0.07 0.31 0.07 0.15 0.78 0.2 0.1
Spa_g27478 (CYP703)
5.02 0.0 1.28 0.5 0.0 0.0 0.0 0.66 0.48 0.14
65.15 0.53 4.59 3.58 1.51 1.18 0.73 4.88 2.78 1.77
89.45 0.0 0.0 0.38 0.0 0.09 0.0 0.79 0.36 0.1
9.33 0.11 1.75 0.81 0.0 0.55 0.0 0.45 0.73 0.0
Spa_g28880 (EXPB3)
15.19 0.0 3.76 0.05 0.0 0.0 0.0 0.45 1.38 5.18
6.51 0.0 0.38 0.3 0.16 0.18 0.15 0.35 0.65 0.1
230.81 0.09 3.65 0.62 0.03 0.26 0.08 3.77 1.41 0.26
153.19 0.0 1.12 20.55 0.0 4.39 0.0 15.67 6.89 17.31
4.37 0.0 0.23 0.27 0.0 0.32 0.18 0.67 0.2 2.39
12.83 0.0 0.69 0.29 0.0 0.31 0.0 0.56 0.13 1.43
108.68 0.0 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.28
11.45 0.55 1.24 0.28 0.06 0.22 0.18 0.03 0.12 0.52
Spa_g38498 (EXP15)
207.01 0.01 58.29 3.44 0.17 2.13 0.15 12.85 6.6 8.54
Spa_g38499 (EXP15)
153.48 0.06 12.57 2.08 0.01 0.15 0.02 4.86 16.14 11.88
20.99 0.32 9.1 1.33 0.69 0.95 0.57 0.5 0.71 1.27
13.16 0.02 4.46 1.09 0.1 0.61 0.27 0.58 0.25 1.85
201.43 0.0 14.36 3.01 0.09 0.31 0.0 0.53 1.93 0.0
20.88 0.0 4.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
7.45 0.18 1.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.18 0.24
4.97 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
11.01 0.19 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
2.94 0.05 0.61 0.04 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.22
152.95 0.77 2.77 1.82 0.0 0.0 0.0 0.63 0.41 0.87
131.28 0.0 0.78 0.69 0.0 0.26 0.18 0.49 0.71 0.0
53.07 0.0 0.96 0.0 0.0 0.11 0.31 0.19 0.0 0.0
65.12 0.0 28.29 12.45 0.14 6.75 0.15 1.3 3.58 6.1
19.21 0.51 5.81 1.4 0.45 0.71 0.61 2.74 1.83 1.23
30.0 0.05 0.33 0.08 0.0 0.0 0.0 0.24 0.04 0.23
19.02 0.02 3.18 1.07 0.2 0.39 0.07 0.74 0.26 0.12
85.28 0.0 21.86 2.18 0.0 0.18 0.0 0.04 1.64 0.0
4.79 0.0 0.98 0.05 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02
60.56 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
79.14 0.08 6.49 0.31 0.0 0.0 0.0 0.13 0.74 0.6
58.9 0.83 4.51 5.69 4.9 4.84 4.57 5.97 2.3 5.93
30.73 0.04 1.58 0.68 0.0 0.57 0.01 1.81 1.08 0.42
60.43 0.16 8.08 3.89 0.11 2.9 0.04 1.57 1.02 0.26
4.11 0.0 0.55 0.03 0.0 0.05 0.01 0.0 0.02 0.05
20.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
34.84 0.06 0.07 0.14 0.0 0.01 0.01 1.22 1.0 0.01
36.04 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
Spa_g50595 (CDR1)
3.34 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
9.4 0.0 0.52 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
41.57 0.0 0.0 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52
17.48 0.0 3.69 1.26 0.0 0.28 0.06 2.35 2.34 0.85
13.81 0.0 0.81 0.18 0.0 0.03 0.0 0.11 0.0 0.0
Spa_g50726 (GLIP7)
147.53 0.02 1.44 6.51 0.0 0.43 0.04 6.93 1.09 0.3
3.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
17.01 0.67 5.89 0.89 0.86 1.0 1.09 0.62 1.59 1.58
6.28 0.0 0.98 0.51 0.0 0.46 0.0 0.47 0.32 0.0
5.16 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.37 0.0 1.05 0.1 0.0 0.03 0.0 0.06 0.44 0.2
3.59 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.03
5.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
3.95 0.0 0.0 0.04 0.22 0.09 0.04 0.0 0.04 0.23
5.71 0.23 0.67 0.16 0.0 0.06 0.03 0.02 0.03 0.0
5.71 0.45 1.06 0.03 0.02 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02
66.75 0.0 7.72 0.33 0.26 0.0 0.17 0.21 0.06 0.73
310.92 0.35 36.14 0.07 0.0 0.17 0.05 0.42 0.0 0.64
4.84 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
104.98 0.06 1.42 0.82 0.03 0.34 0.13 2.48 0.94 0.28
3.4 0.0 0.6 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
5.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63
81.03 0.0 21.3 0.61 0.0 0.17 0.0 1.17 0.17 0.21
30.27 0.08 3.57 2.2 0.07 2.26 0.08 0.54 0.08 1.33
67.09 0.03 3.9 0.23 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.07
6.68 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.08 0.0
4.78 0.0 0.31 0.15 0.0 0.07 0.0 0.56 0.04 1.4
27.79 0.1 0.49 0.09 0.11 0.05 0.16 0.01 0.27 0.13
28.59 0.01 0.06 2.42 0.0 1.17 0.0 0.22 0.71 0.03
6.68 0.0 0.24 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.01 0.04
5.82 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.95 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
3.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
77.71 1.6 0.32 0.0 0.0 0.52 0.09 0.0 0.0 0.72
Spa_g52088 (LAC6)
31.16 0.0 0.3 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.05
Spa_g52110 (GLIP7)
2.28 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g52268 (GLP7)
339.52 0.19 0.2 0.56 0.02 0.13 0.0 0.16 0.07 0.1
8.01 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
8.99 0.0 0.11 0.16 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 1.89
119.31 0.0 25.94 2.29 0.03 0.0 0.0 0.41 1.32 0.15
145.26 1.07 18.21 10.04 0.25 10.29 0.22 1.84 1.52 6.05
5.17 0.0 0.73 0.1 0.0 0.0 0.19 0.12 0.0 0.0
Spa_g54039 (EXP1)
217.69 0.05 1.45 3.68 0.08 0.85 0.0 0.7 0.05 0.45
49.01 0.35 3.99 2.86 0.35 1.27 0.05 0.79 0.52 0.19
17.27 0.45 0.29 0.8 0.01 0.43 0.01 0.21 0.1 0.17
89.61 0.0 5.12 0.0 0.0 0.21 0.0 0.18 0.2 0.0
58.29 0.02 0.59 2.1 0.01 0.72 0.0 3.54 0.77 6.52
17.74 0.0 1.27 0.77 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
234.03 0.44 17.41 5.86 0.23 0.29 0.0 0.87 1.7 0.3
39.15 0.0 0.0 0.93 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05
Spa_g56852 (FAO3)
19.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 1.07 0.71 0.0
42.23 0.0 19.9 7.02 0.17 3.38 0.04 0.34 0.57 1.88

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)