Heatmap: Cluster_127 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.1 0.11 0.21 0.44 0.45 0.44 0.48 0.73 0.95 1.0 0.72 0.56 0.11 0.44 0.19 0.36 0.21 0.38 0.24 0.25 0.07 0.22 0.45 0.3 0.47 0.24
0.18 0.47 0.5 0.64 0.67 0.67 0.84 0.84 1.0 0.97 1.0 0.73 0.16 0.75 0.54 0.68 0.45 0.68 0.67 0.72 0.05 0.47 0.96 0.83 0.51 0.67
0.04 0.2 0.47 0.74 0.96 0.76 0.68 0.67 0.91 0.94 1.0 0.97 0.04 0.4 0.38 0.53 0.33 0.54 0.41 0.36 0.07 0.2 0.9 0.49 0.51 0.51
0.2 0.24 0.27 0.4 0.64 0.61 0.54 0.56 0.79 0.55 0.5 0.49 0.17 0.7 0.47 0.75 0.49 1.0 0.44 0.44 0.13 0.27 0.93 0.39 0.43 0.54
0.11 0.41 0.61 0.8 0.9 0.6 0.85 0.84 0.84 1.0 0.91 0.65 0.12 0.62 0.44 0.64 0.45 0.55 0.48 0.55 0.01 0.2 0.92 0.67 0.55 0.67
0.16 0.32 0.58 0.77 0.72 0.64 0.92 1.0 0.97 0.92 0.93 0.98 0.13 0.69 0.5 0.91 0.47 0.53 0.52 0.64 0.08 0.48 0.75 0.72 0.84 0.73
0.05 0.01 0.05 0.21 0.4 0.57 0.55 0.3 0.85 1.0 0.89 0.77 0.13 0.44 0.23 0.37 0.34 0.2 0.14 0.34 0.03 0.37 0.53 0.5 0.26 0.32
0.13 0.25 0.33 0.61 0.66 0.54 0.97 0.91 1.0 1.0 0.71 0.52 0.16 0.79 0.47 0.88 0.55 0.83 0.48 0.54 0.15 0.28 0.81 0.36 0.72 0.57
0.22 0.19 0.28 0.45 0.73 0.59 0.56 0.71 0.67 0.92 0.8 1.0 0.2 0.34 0.23 0.63 0.31 0.41 0.29 0.24 0.05 0.1 0.53 0.23 0.34 0.54
0.2 0.16 0.34 0.53 0.42 0.38 0.77 0.88 0.86 1.0 0.85 0.75 0.29 0.66 0.32 0.71 0.34 0.46 0.34 0.28 0.05 0.3 0.4 0.23 0.43 0.4
0.21 0.01 0.07 0.3 0.62 0.85 0.79 0.54 0.91 1.0 0.97 0.98 0.38 0.48 0.67 0.51 0.59 0.51 0.56 0.59 0.04 0.21 0.82 0.59 0.41 0.39
0.18 0.25 0.23 0.33 0.46 0.65 0.71 0.72 1.0 0.71 0.64 0.49 0.13 0.49 0.43 0.49 0.35 0.41 0.38 0.4 0.02 0.44 0.31 0.37 0.47 0.38
0.04 0.01 0.09 0.34 0.64 0.57 0.5 0.36 0.74 0.78 0.84 1.0 0.12 0.36 0.35 0.4 0.23 0.27 0.23 0.14 0.2 0.14 0.27 0.31 0.13 0.28
0.27 0.51 0.46 0.62 0.72 0.77 0.81 0.69 0.96 0.82 0.76 0.7 0.24 0.57 0.5 0.63 0.52 0.6 0.54 0.62 0.01 0.25 1.0 0.57 0.65 0.45
0.34 0.28 0.33 0.57 0.56 0.49 0.81 0.83 1.0 0.8 0.69 0.71 0.37 0.61 0.43 0.58 0.35 0.53 0.43 0.32 0.09 0.37 0.95 0.44 0.96 0.44
0.14 0.23 0.23 0.57 0.64 0.54 0.64 0.66 1.0 0.74 0.64 0.48 0.2 0.44 0.27 0.52 0.26 0.35 0.3 0.24 0.11 0.1 0.46 0.2 0.33 0.36
0.15 0.29 0.24 0.55 0.56 0.38 0.58 0.64 0.72 0.89 1.0 0.74 0.12 0.12 0.08 0.12 0.25 0.41 0.3 0.3 0.17 0.26 0.4 0.24 0.21 0.25
0.03 0.08 0.23 0.39 0.66 0.85 0.86 0.74 1.0 0.97 0.73 0.47 0.04 0.76 0.34 0.51 0.54 0.59 0.41 0.51 0.03 0.55 0.51 0.43 0.41 0.34
0.21 0.28 0.29 0.58 0.66 0.46 0.81 0.78 0.96 1.0 0.92 0.91 0.35 0.45 0.15 0.34 0.19 0.73 0.25 0.2 0.24 0.32 0.71 0.26 0.58 0.51
0.07 0.24 0.4 0.62 0.73 0.85 0.94 0.93 0.97 0.94 0.99 1.0 0.07 0.63 0.71 0.88 0.53 0.7 0.56 0.37 0.06 0.34 0.82 0.71 0.64 0.51
0.04 0.13 0.25 0.42 0.54 0.47 0.64 0.72 0.86 1.0 0.95 0.72 0.11 0.49 0.26 0.47 0.38 0.35 0.26 0.48 0.01 0.35 0.42 0.64 0.46 0.32
0.09 0.07 0.19 0.4 0.48 0.44 0.81 0.83 1.0 0.85 0.68 0.52 0.11 0.39 0.25 0.39 0.23 0.45 0.31 0.31 0.06 0.53 0.43 0.25 0.41 0.38
0.21 0.31 0.52 0.65 0.89 0.87 0.92 0.88 0.97 1.0 0.99 0.69 0.23 0.39 0.55 0.45 0.41 0.61 0.69 0.52 0.03 0.39 0.89 0.56 0.62 0.43
0.19 0.26 0.3 0.65 0.64 0.53 0.85 0.86 1.0 0.85 0.73 0.56 0.17 0.6 0.44 0.75 0.4 0.61 0.47 0.46 0.1 0.2 0.68 0.39 0.79 0.59
0.14 0.21 0.25 0.45 0.5 0.52 0.69 0.66 0.91 0.83 0.74 0.61 0.18 0.56 0.45 0.56 0.43 0.66 0.43 0.39 0.08 0.4 1.0 0.38 0.47 0.45
0.3 0.34 0.46 0.71 0.62 0.51 0.87 0.84 0.9 0.78 0.69 0.5 0.29 0.63 0.63 0.74 0.47 0.61 0.4 0.42 0.19 0.25 1.0 0.35 0.65 0.49
0.15 0.31 0.38 0.53 0.6 0.66 0.93 0.72 0.89 0.67 0.52 0.41 0.16 0.85 0.63 0.86 0.47 0.93 0.6 0.48 0.13 0.61 1.0 0.58 0.64 0.51
0.15 0.31 0.15 0.62 0.51 0.46 0.63 0.62 0.76 0.6 0.62 0.44 0.22 0.35 0.18 0.29 0.21 0.22 0.31 0.17 0.08 0.12 0.59 0.15 1.0 0.26
0.26 0.44 0.25 0.54 0.48 0.41 0.48 0.57 0.8 0.8 1.0 0.96 0.2 0.36 0.24 0.38 0.23 0.31 0.24 0.25 0.09 0.39 0.41 0.54 0.58 0.26
0.43 0.64 0.73 0.88 0.94 0.8 0.86 0.95 0.99 1.0 1.0 0.92 0.39 0.55 0.52 0.48 0.55 0.6 0.61 0.56 0.02 0.24 0.86 0.62 0.58 0.49
0.13 0.48 0.52 0.69 0.85 0.95 0.93 0.81 0.96 0.83 0.82 0.77 0.17 0.39 0.42 0.31 0.42 0.65 0.52 0.39 0.08 0.42 1.0 0.45 0.55 0.48
0.04 0.13 0.23 0.48 0.52 0.52 0.56 0.52 1.0 0.82 0.73 0.59 0.04 0.45 0.33 0.42 0.32 0.33 0.21 0.2 0.05 0.24 0.51 0.39 0.37 0.28
0.08 0.08 0.15 0.35 0.51 0.47 0.72 0.88 0.98 1.0 0.7 0.48 0.07 0.22 0.16 0.27 0.29 0.29 0.23 0.44 0.02 0.26 0.63 0.36 0.36 0.34
0.29 0.29 0.39 0.61 0.57 0.45 0.91 0.92 0.94 0.97 0.73 0.56 0.27 0.83 0.65 0.97 0.66 0.96 0.71 0.64 0.33 0.45 1.0 0.55 0.77 0.5
0.09 0.01 0.06 0.24 0.41 0.25 0.32 0.38 0.73 0.9 1.0 0.78 0.09 0.13 0.15 0.18 0.14 0.46 0.25 0.19 0.16 0.08 0.48 0.13 0.19 0.16
0.06 0.16 0.29 0.37 0.5 0.56 0.65 0.59 1.0 0.83 0.71 0.65 0.06 0.64 0.51 0.51 0.53 0.46 0.43 0.38 0.08 0.3 0.55 0.42 0.34 0.29
0.07 0.03 0.07 0.18 0.35 0.58 1.0 0.8 0.92 0.9 0.84 0.61 0.19 0.4 0.21 0.4 0.4 0.45 0.34 0.4 0.06 0.39 0.47 0.43 0.39 0.35
0.26 0.29 0.39 0.57 0.71 0.69 0.89 0.85 0.92 0.94 0.79 0.67 0.2 0.76 0.59 0.85 0.63 0.77 0.64 0.65 0.09 0.39 1.0 0.51 0.71 0.69
0.04 0.09 0.27 0.37 0.45 0.42 0.56 0.6 0.81 0.69 0.53 0.42 0.03 0.64 0.31 0.53 0.46 0.52 0.29 0.44 0.29 0.17 1.0 0.27 0.27 0.35
0.12 0.12 0.28 0.44 0.62 0.52 0.72 0.59 1.0 0.89 0.84 0.63 0.19 0.51 0.31 0.55 0.28 0.29 0.26 0.22 0.08 0.27 0.39 0.34 0.21 0.24
0.02 0.04 0.33 0.76 0.84 0.68 0.59 0.74 0.91 1.0 0.91 0.73 0.01 0.3 0.31 0.25 0.31 0.61 0.33 0.33 0.03 0.12 0.63 0.4 0.48 0.57
0.02 0.03 0.08 0.13 0.3 0.47 0.64 0.35 0.88 0.67 0.48 0.32 0.02 0.51 0.6 0.58 0.78 1.0 0.41 0.4 0.14 0.46 1.0 0.62 0.47 0.4
0.13 0.29 0.43 0.55 0.7 0.72 0.9 0.92 1.0 0.86 0.64 0.55 0.14 0.67 0.48 0.69 0.49 0.72 0.44 0.49 0.06 0.29 0.76 0.29 0.58 0.46
0.11 0.22 0.33 0.46 0.51 0.75 0.69 0.71 1.0 0.85 0.72 0.62 0.17 0.4 0.38 0.42 0.38 0.44 0.35 0.36 0.03 0.68 0.49 0.4 0.51 0.36
0.06 0.39 0.36 0.64 0.66 0.69 0.7 0.66 1.0 0.77 0.8 0.66 0.05 0.5 0.51 0.52 0.41 0.63 0.64 0.39 0.11 0.49 0.98 0.43 0.49 0.39
0.22 0.25 0.3 0.53 0.49 0.53 0.77 0.78 0.9 0.82 0.55 0.38 0.24 0.6 0.5 0.68 0.43 1.0 0.57 0.42 0.17 0.54 0.94 0.42 0.63 0.58
0.09 0.14 0.38 0.45 0.63 0.75 0.73 0.55 0.93 0.66 0.63 0.49 0.15 0.28 0.36 0.26 0.33 0.46 0.47 0.43 0.1 0.34 1.0 0.44 0.32 0.3
0.09 0.11 0.37 0.52 0.53 0.53 0.59 0.68 0.84 0.71 0.67 0.57 0.14 0.44 0.45 0.41 0.37 0.47 0.47 0.36 0.06 0.35 1.0 0.38 0.53 0.31
0.36 0.48 0.43 0.59 0.69 0.61 0.65 0.75 0.86 0.86 0.87 0.77 0.35 0.34 0.41 0.29 0.44 0.59 0.42 0.33 0.06 0.26 1.0 0.53 0.55 0.46
0.2 0.37 0.42 0.47 0.67 0.79 0.97 0.7 1.0 0.9 0.91 0.8 0.22 0.42 0.24 0.43 0.27 0.43 0.39 0.3 0.01 0.64 0.49 0.41 0.81 0.37
0.07 0.25 0.27 0.52 0.6 0.42 0.57 0.53 0.68 0.55 0.68 0.59 0.05 0.24 0.26 0.28 0.2 0.43 0.34 0.27 0.05 0.26 1.0 0.4 0.54 0.37
0.09 0.26 0.27 0.52 0.57 0.49 0.72 0.87 1.0 0.9 0.81 0.6 0.09 0.49 0.43 0.52 0.48 0.54 0.47 0.54 0.08 0.43 0.83 0.74 0.64 0.59
0.11 0.44 0.53 0.62 0.74 0.65 0.74 0.79 0.93 0.8 0.82 0.71 0.17 0.6 0.63 0.8 0.53 0.86 0.75 0.47 0.21 0.55 1.0 0.53 0.68 0.58
0.03 0.17 0.33 0.76 0.66 0.84 0.84 0.78 0.83 0.88 1.0 0.95 0.03 0.65 0.64 0.77 0.52 0.38 0.64 0.4 0.04 0.06 0.83 0.7 0.51 0.38
0.0 0.02 0.2 0.52 0.71 0.83 0.7 0.54 1.0 0.74 0.75 0.56 0.01 0.26 0.17 0.21 0.16 0.3 0.26 0.3 0.05 0.16 0.58 0.32 0.39 0.28
0.02 0.19 0.33 0.37 0.45 0.5 0.71 0.72 1.0 0.96 0.84 0.63 0.04 0.44 0.56 0.44 0.55 0.59 0.51 0.6 0.03 0.32 0.48 0.41 0.38 0.29
0.04 0.23 0.33 0.66 0.59 0.41 0.66 0.7 0.92 1.0 0.98 0.84 0.11 0.36 0.17 0.35 0.24 0.3 0.12 0.13 0.1 0.26 0.48 0.74 0.47 0.28
0.14 0.22 0.24 0.48 0.58 0.57 0.55 0.64 0.65 0.79 1.0 0.73 0.1 0.3 0.13 0.26 0.19 0.25 0.24 0.13 0.04 0.3 0.31 0.35 0.22 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)