Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
-7.35 -3.27 -3.16 -5.35 -2.13 -4.85 -3.21 -2.97 -3.19 3.19
-0.89 -4.49 -1.4 -1.51 -2.64 -2.2 -3.57 -1.47 -1.21 2.89
-3.88 -3.95 -6.29 -3.08 - -1.75 -2.38 -1.61 -3.65 3.14
-3.08 -4.13 -2.27 -4.14 -7.56 -5.34 -6.03 -1.79 -5.15 3.2
-7.44 -3.94 -2.9 -4.38 -6.41 -2.24 -4.35 -3.94 -6.48 3.23
- - -4.67 -5.5 -9.49 -6.4 -6.98 -5.87 -3.25 3.29
- -5.89 -2.12 - -2.22 - -1.4 -4.85 -3.12 3.17
Spa_g22392 (TT7)
-5.78 -6.78 -4.64 -3.55 -1.81 -3.19 -1.72 -5.08 -0.75 3.09
Spa_g23143 (UBQ11)
- - -3.97 - - - -4.31 - -3.98 3.3
Spa_g24440 (MAX1)
-6.53 -4.29 -5.75 -3.61 -3.73 -3.11 -3.62 -6.82 -8.84 3.26
Spa_g27231 (AAP5)
- - -10.27 -6.5 - -6.39 -7.04 - -3.5 3.3
Spa_g29522 (LBD15)
-5.54 -1.9 -3.22 -7.92 -4.07 -5.7 -4.04 -1.01 -1.52 3.11
-6.82 - -4.18 - - -8.87 - -7.6 -5.24 3.31
Spa_g30290 (AHL22)
-6.59 - -6.17 -8.75 -8.95 -7.83 -7.65 -7.26 -1.4 3.26
- - - - - -10.16 - - -7.02 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - -2.29 - 3.29
- - - - -2.92 - -1.57 - -3.27 3.24
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g32551 (EXP9)
- - -4.48 -4.52 - - - - - 3.31
- - -0.91 - - - - - - 3.24
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g32955 (CAM9)
- - - - - - -1.84 - -2.2 3.25
- - - - - -3.74 - - - 3.31
- -6.45 -4.59 -4.16 -4.87 -3.63 -7.49 -3.52 -4.9 3.27
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -0.86 -3.31 -2.63 -2.73 -2.06 -3.59 -1.77 3.07
Spa_g33301 (UBQ11)
- -3.02 - - - - - - - 3.3
-2.78 - - - -3.28 - - - - 3.29
- - - - - - - - - 3.32
- - -3.39 - -2.62 - -5.27 - -2.23 3.25
- - -2.31 - - - -2.41 - -1.41 3.21
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -3.86 3.31
- - - - - - - - - 3.32
-2.8 - -3.83 -2.05 -2.22 -2.85 -0.76 -4.25 -2.41 3.06
- - -2.27 -2.98 - - - - - 3.27
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-2.76 - -2.39 -3.79 -4.21 -2.56 -2.55 -2.11 -1.97 3.12
- - - - -3.76 - - - -3.57 3.3
Spa_g34006 (RPL23AB)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34223 (AAc1)
- - - - - - - - -1.62 3.27
Spa_g34299 (Hsp81.4)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34678 (LOS1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34832 (AAc1)
- -2.32 - - - - -2.62 - -2.37 3.24
Spa_g34924 (ACT11)
- - - - - - -0.25 - -1.54 3.14
- - - - - -3.71 - - -3.68 3.3
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35342 (RAC2)
- - - - - - - - -1.86 3.28
-7.32 - -2.38 -5.55 -7.85 -7.44 -5.31 - -5.31 3.28
Spa_g35408 (UBQ7)
- - -2.88 - - - -2.34 - -1.92 3.23
Spa_g35454 (UBQ11)
- -3.52 - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -2.27 -5.7 - - - - -4.67 3.28
Spa_g36042 (CRT1b)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - -2.03 - - - 3.29
Spa_g36575 (UBQ11)
- - - - - - - - -3.15 3.31
Spa_g36602 (CAM4)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -2.38 - - - - - - 3.29
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - -0.94 - - -1.23 3.18
- -2.22 - - - - -1.57 - - 3.24
- - - - - - - - - 3.32
-0.83 -0.71 -1.1 -1.32 -1.4 -2.54 -1.31 -2.72 -1.12 2.68
- - - - - - - - -5.23 3.32
-1.2 -3.13 -1.88 - -4.99 -3.17 -1.8 -3.69 -3.76 3.1
- - - - -2.08 - -1.77 - -1.98 3.2
- - - - - - - -3.17 - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - -6.04 - -4.41 -5.23 -1.67 - -5.24 3.26
- - -2.82 - - - - - - 3.3
Spa_g37793 (CAM3)
- -4.2 - - - - - - -1.84 3.27
- - - - - - - - -2.06 3.29
Spa_g37891 (MYB50)
-5.01 -6.6 -3.2 -4.06 -2.95 -3.13 -3.31 -2.99 -3.05 3.2
-3.03 -3.87 -1.17 -2.23 -3.8 -1.94 -3.77 -3.92 -4.12 3.11
-3.02 -7.82 -2.4 -3.3 -2.04 -1.89 -0.56 -6.01 -1.86 3.02
- - - - - - - - -1.8 3.28
- - - -3.88 - -1.88 - - -2.27 3.24
- - - - - - -4.16 - -3.24 3.3
Spa_g38123 (ALMT12)
- - - -2.89 - -4.76 - - -6.97 3.3
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38143 (RSL1)
-3.32 - -4.5 -0.86 -1.56 -1.02 -1.64 - -4.2 3.02
- - -3.38 - -2.09 - - - -1.79 3.23
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38226 (GST8)
- -4.98 -4.37 - - - - -3.72 -5.64 3.3
- - - - - - -4.78 - - 3.32
- -7.14 - - -7.38 - -5.85 - -4.6 3.31
Spa_g38300 (CCD1)
-4.46 -5.27 -0.91 -1.76 -3.13 -1.26 -2.94 -5.18 -5.15 3.07
- -1.95 - - - - - - - 3.28
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38553 (ACT11)
- - - - - -5.1 -4.54 - -2.46 3.28
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38610 (PHT1;7)
- - -5.25 - - - -7.53 - -8.53 3.32
Spa_g38611 (ATPT1)
- - -6.19 - -9.66 -11.42 -7.24 - -8.64 3.32
- - -4.85 -2.79 - -1.12 - -5.09 -4.81 3.22
Spa_g38795 (PAB8)
- - - - - - - - -3.35 3.31
- - - - -3.42 - -2.89 - -1.13 3.22
Spa_g38809 (YUC5)
- - -7.81 - - - - - -3.78 3.31
- - - - - - - - - 3.32
-2.45 -3.25 -2.72 -1.28 -1.14 -1.08 -1.22 -1.48 -1.03 2.79
- - - - - - - - - 3.32
- - - - -3.2 - -0.69 - - 3.21
Spa_g38915 (FER4)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38980 (LOV1)
-4.63 -0.62 -2.14 - -1.17 -3.5 -1.75 -3.95 -2.59 3.0
-3.91 -3.07 -2.48 -3.62 -2.64 -3.41 -2.05 -1.94 -1.52 3.08
- - - - - - -4.47 -4.99 -2.66 3.29
Spa_g39130 (XBCP3)
- - - - -5.34 - -4.79 - -3.4 3.3
Spa_g39156 (MEE24)
- - - -6.71 -3.53 - -2.6 -0.95 -5.11 3.2
Spa_g39161 (GIL1)
-5.23 - -5.37 - - - - -2.28 - 3.28
-7.84 - -1.86 -3.77 -2.28 -3.65 -1.13 -1.85 -3.41 3.09
- - - - -2.47 - - - - 3.3
- -2.95 -2.38 -3.09 -2.69 -2.95 -1.29 - - 3.15
-3.73 -3.3 -3.24 -3.22 -3.77 -3.93 -3.72 -1.72 -0.5 3.07
- - - - -2.33 -1.29 - -1.73 -1.44 3.12
- - - - - - - - - 3.32
- - -4.99 - - - - -4.25 -3.06 3.29
-3.35 - -3.39 -7.78 -8.57 -5.76 -8.56 -2.87 -8.57 3.27
- - -0.32 - - - - - - 3.2
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39600 (RAP2.11)
- - - - - - - -5.9 - 3.32
Spa_g39632 (TUB7)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39730 (AAc1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39765 (scpl50)
-1.67 -3.92 -1.25 -3.37 -1.71 -3.93 -1.65 -3.31 -0.94 2.96
- -3.74 - - -2.39 - -2.9 - - 3.26
Spa_g39798 (ERD8)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39868 (CYP707A3)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - -4.92 - - 3.32
Spa_g39913 (SKOR)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39931 (GRP4)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39938 (CHX19)
-4.13 -5.24 -2.6 -4.4 -5.14 -4.97 -4.81 -3.79 -3.34 3.24
Spa_g39980 (HSP83)
- - - - -2.64 - -3.42 - -3.04 3.27
-4.78 - -4.6 -2.22 -2.6 -4.8 -3.81 - - 3.24
- -6.22 -4.23 -3.96 -5.27 -4.67 - - -6.26 3.29
-2.12 -3.77 -0.88 - - - - -1.41 -2.16 3.1
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40818 (CAM9)
- - - - -3.32 - -1.38 - - 3.25
Spa_g40918 (ACT8)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -6.11 -8.25 -6.1 -7.24 -3.48 -5.28 -6.49 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- -7.25 - -4.99 -1.9 -3.72 -3.36 - -4.59 3.24
- - -2.48 - -4.77 - -2.64 - -2.49 3.24
- - - - - - - - -3.22 3.31
Spa_g41194 (PFL)
- -3.81 -1.09 - - - - -2.73 -2.91 3.2
Spa_g41351 (ARFA1F)
- - - - -3.17 - - - -0.89 3.22
- - - - -3.71 - -2.76 - - 3.29
-4.62 -4.86 -1.0 -3.7 -2.67 -2.73 -2.84 -1.75 -1.15 3.03
- -6.06 -4.05 - -1.47 - -1.76 -3.46 -2.83 3.18
Spa_g41479 (RSL2)
-6.26 - -2.3 - - - -5.53 -5.73 -5.8 3.28
- -3.92 - - -2.15 - - - - 3.28
- - - - - - - - -3.5 3.31
Spa_g41634 (ACT11)
- -2.7 - - -4.59 - -2.23 - - 3.26
-4.25 -4.33 -4.72 - - - -3.11 -0.85 -1.67 3.15
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -6.01 -3.56 -7.64 -7.81 -7.41 -5.75 -4.2 -3.1 3.28
- -2.21 - - - - - - - 3.29
Spa_g42044 (RAP2.11)
-4.03 -5.49 -4.01 -4.35 - - - -5.92 -3.76 3.28
- - - -3.41 - -2.83 - - - 3.29
- - - - -3.89 - - - - 3.31
-5.87 -3.11 -1.18 - -1.62 - -0.71 -3.06 -1.97 3.02
-7.67 -6.49 -0.91 -7.65 -1.71 -5.12 -2.32 -8.19 -3.16 3.14
- - - - - - -1.06 - - 3.25
- -1.84 - - -2.39 - -4.45 - - 3.25
- - - -1.37 - -1.1 -5.4 - - 3.19
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42635 (TOR2)
- - - - - - - - - 3.32
- - -5.23 - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-0.63 -1.98 -0.47 -2.22 -1.27 -2.09 -1.15 -0.45 -1.16 2.56
-2.28 -7.05 -2.17 -1.78 -3.23 -1.83 -3.82 -5.0 -2.09 3.1
-6.2 - -0.91 -4.24 - - - - - 3.23
Spa_g49106 (GSTL1)
-2.58 -2.01 0.13 -3.35 -3.96 -3.84 -5.1 -3.6 -4.64 3.02
-1.99 -3.73 -3.23 -0.6 -2.26 -0.81 -2.49 -2.26 -1.17 2.87
Spa_g54509 (ALMT12)
- - - -4.05 - -2.99 - - - 3.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.