Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.68 0.34 0.47 -0.44 -0.27 -0.44 -0.23 -0.34 -0.12 -0.18
0.62 0.78 -0.57 -1.05 0.23 -0.63 0.1 -0.86 0.62 -0.72
0.26 0.21 0.04 -0.54 -0.12 -0.49 -0.11 0.4 0.67 -1.14
Spa_g00636 (RRP41)
0.33 0.02 0.29 -0.27 0.03 0.0 -0.1 -0.16 -0.15 -0.12
0.41 0.14 0.31 -0.57 -0.16 -0.52 -0.21 0.25 0.12 -0.13
Spa_g01482 (ARFC1)
0.36 -0.28 -0.06 -0.34 -0.13 -0.54 -0.08 0.66 0.4 -0.52
0.41 -0.11 0.32 -0.44 -0.12 -0.21 -0.13 -0.13 0.31 -0.13
Spa_g01526 (CAK2AT)
0.14 -0.02 0.51 -0.09 -0.21 -0.12 -0.24 0.24 -0.22 -0.18
0.26 0.32 0.32 -0.22 -0.52 -0.17 -0.39 0.19 0.1 -0.18
0.69 -0.41 0.05 -1.62 -0.85 -3.89 -0.7 1.14 0.54 0.46
0.82 0.43 0.19 -1.08 -0.12 -0.21 -0.21 -0.1 0.2 -0.87
Spa_g02487 (ELF4-L3)
0.84 0.3 0.16 -1.18 0.42 -1.26 -0.13 -0.53 0.13 -0.05
1.33 -0.34 1.14 -0.86 -2.09 -0.85 -2.02 0.7 -1.01 -0.37
0.49 -0.02 0.41 -0.48 -0.11 -0.48 -0.16 0.19 0.19 -0.41
0.43 -0.13 0.32 -0.28 -0.04 -0.23 0.03 -0.06 -0.02 -0.21
0.6 0.59 -0.14 -0.41 -0.08 -0.48 -0.08 0.0 -0.03 -0.45
1.26 0.26 0.73 -0.44 -1.53 -0.54 -1.64 0.39 -0.63 -0.5
Spa_g05928 (PTR5)
0.94 0.23 0.49 -0.68 -0.74 -0.8 -0.73 0.44 -0.14 -0.24
Spa_g06007 (CRF3)
1.17 0.62 0.55 -1.4 -0.23 -1.37 -0.35 0.11 -0.37 -1.0
Spa_g06081 (ATAIH)
0.81 0.44 0.36 -0.37 -0.57 -0.29 -0.52 0.21 0.07 -1.18
0.15 0.28 0.65 -0.25 -0.29 -0.27 -0.36 0.12 0.3 -0.93
0.57 -0.17 0.47 -0.5 -0.24 -0.55 -0.24 0.09 0.26 -0.17
0.22 0.11 0.37 -0.05 -0.06 -0.2 -0.2 0.05 -0.24 -0.13
Spa_g07302 (BIN3)
0.08 0.04 0.51 -0.11 -0.15 -0.1 -0.25 0.11 0.16 -0.52
Spa_g07593 (STA1)
0.55 0.06 0.28 -0.39 -0.12 -0.02 -0.28 -0.14 0.04 -0.23
Spa_g07686 (CP31)
0.74 0.72 -0.47 -0.65 -0.12 -0.35 -0.05 -0.24 0.4 -1.04
Spa_g07909 (DCA1)
0.92 0.44 0.26 -1.04 -0.03 -0.72 -0.05 -0.35 -0.01 -0.42
0.39 0.57 0.07 -1.09 0.18 -0.6 0.2 -0.25 0.26 -0.5
0.22 0.04 0.37 -0.15 -0.26 -0.13 -0.14 -0.04 0.27 -0.36
0.66 0.3 0.36 -0.56 -0.27 -0.53 -0.38 0.05 -0.09 -0.05
0.24 -0.06 0.51 -0.12 -0.34 -0.09 -0.37 0.4 -0.21 -0.27
Spa_g08657 (PUR5)
0.72 -0.22 0.54 -0.03 -0.12 -0.03 -0.15 -0.54 -0.19 -0.52
Spa_g08810 (PAB8)
0.19 0.05 0.21 -0.46 -0.44 -0.21 -0.37 0.23 0.58 -0.17
0.44 0.71 0.26 -0.53 -0.02 -0.83 -0.26 -0.14 0.13 -0.46
0.49 0.31 0.29 -0.29 -0.29 -0.22 -0.47 -0.06 0.03 -0.1
Spa_g09241 (ACHT4)
1.12 -0.01 0.42 -0.92 -1.36 -1.47 -1.47 0.76 0.72 -0.92
Spa_g09350 (TRS120)
0.22 -0.21 0.48 -0.13 -0.33 -0.11 -0.09 0.14 -0.18 0.02
0.94 0.32 -0.14 -0.62 -0.72 -0.68 -0.17 0.85 -0.14 -1.18
Spa_g10084 (DCA1)
1.06 0.36 0.22 -0.82 -0.14 -0.62 -0.01 -0.35 -0.39 -0.33
Spa_g10171 (TIC110)
0.89 0.33 -0.07 -0.22 -0.08 -0.12 0.01 -0.47 -0.25 -0.64
Spa_g10243 (PIP1D)
0.54 -0.31 -1.11 -0.68 -0.85 -0.89 -0.79 0.95 0.74 0.45
Spa_g10311 (LEN1)
1.04 0.27 0.18 -0.87 -0.07 -0.89 -0.11 -0.06 0.08 -0.7
Spa_g10343 (MINE1)
0.5 -0.25 0.03 -0.66 0.02 -0.47 -0.16 0.58 0.22 -0.32
Spa_g10427 (CLPP4)
0.53 0.78 -0.16 -0.28 -0.05 -0.32 -0.13 -0.56 0.15 -0.61
0.18 0.01 0.54 -0.58 -0.5 -0.35 -0.48 0.19 0.64 -0.28
Spa_g10865 (RABE1b)
1.41 0.77 -0.46 -0.86 -0.48 -0.96 -0.46 -0.09 0.07 -1.3
Spa_g10963 (TOC132)
0.91 0.3 -0.28 -1.34 -0.38 -1.1 -0.1 0.75 0.4 -0.98
0.64 -0.41 0.15 -0.59 -0.13 -0.47 -0.1 0.4 0.35 -0.41
0.21 0.04 0.18 -0.29 -0.18 -0.33 -0.17 0.43 0.14 -0.23
Spa_g11282 (NRP2)
0.58 0.55 0.57 -1.08 -0.15 -0.91 -0.49 -0.09 0.23 -0.26
1.11 0.4 0.4 -0.5 -0.96 -0.84 -1.47 0.57 -0.24 -0.46
0.42 -0.01 -0.31 -0.64 -0.16 -0.59 -0.1 0.55 0.26 0.09
Spa_g11496 (BMY8)
1.21 1.0 -0.21 -1.08 -0.65 -1.52 -0.05 -0.17 -0.28 -0.54
0.34 -0.1 -0.22 -0.73 0.02 -0.5 0.09 0.44 0.67 -0.7
0.89 0.35 0.59 -0.76 -0.92 -0.97 -1.49 0.71 -0.06 -0.36
0.83 0.01 -0.83 -2.7 -3.73 -2.0 0.09 0.83 1.26 -0.1
0.41 0.34 0.2 -0.26 -0.28 -0.33 -0.38 0.12 0.16 -0.27
0.83 0.45 0.08 -0.37 -0.5 -0.66 -0.47 0.23 0.21 -0.66
Spa_g12220 (SAE2)
0.36 -0.32 0.34 -0.03 -0.04 -0.01 -0.19 0.04 -0.15 -0.15
1.16 0.51 -0.2 -0.6 -0.23 -0.54 -0.2 -0.17 -0.21 -0.65
0.67 -0.31 0.24 -0.66 -0.06 -0.5 0.02 0.03 0.27 -0.18
Spa_g12662 (PTAC10)
0.51 0.68 -0.08 -0.61 -0.08 -0.42 0.02 -0.14 0.29 -0.9
0.46 0.12 0.16 -0.19 -0.25 -0.29 -0.34 0.16 0.09 -0.13
0.53 -0.26 -1.0 -0.77 -0.88 -0.82 -0.81 1.02 0.78 0.28
0.42 0.35 0.24 -0.95 0.0 -0.79 -0.11 0.13 0.28 -0.2
0.11 -0.02 0.48 -0.55 -0.15 -0.05 -0.14 -0.05 0.33 -0.22
0.59 0.19 0.43 -0.75 -0.14 -0.32 -0.22 -0.03 -0.06 -0.13
1.06 0.37 -0.26 -0.38 -0.17 -0.33 0.03 -0.41 -0.32 -0.39
0.64 0.63 0.62 -0.41 -0.86 -0.62 -0.65 0.38 -0.73 -0.2
0.55 -0.73 0.18 -0.58 -0.07 -0.08 -0.55 0.52 0.13 0.03
0.72 0.52 -0.19 -0.79 -0.2 -0.71 0.02 0.21 0.27 -0.73
0.85 0.14 0.56 -0.66 -0.31 -0.52 -0.59 -0.03 0.03 -0.28
Spa_g16954 (DSK2)
0.25 -0.14 0.52 -0.15 -0.01 -0.02 -0.24 0.03 -0.31 -0.11
1.07 -0.1 0.32 -1.01 -1.34 -1.6 -1.46 0.9 0.85 -1.07
0.74 0.98 0.65 -0.82 -0.79 -2.13 -1.03 0.08 0.7 -2.01
0.96 0.61 0.21 -0.57 -0.22 -0.66 -0.17 -0.71 0.12 -0.69
Spa_g18284 (POK2)
0.78 0.05 0.74 -0.63 -0.19 -0.3 -0.19 0.13 -0.59 -0.73
0.46 0.24 0.15 -0.23 -0.59 -0.02 -0.44 0.12 -0.04 0.05
0.61 0.85 0.09 -0.6 -0.16 -0.69 -0.19 -0.33 0.32 -0.98
0.91 0.05 -0.16 -0.62 -0.16 -0.39 -0.04 0.28 0.02 -0.54
0.74 0.31 0.7 -0.66 -0.83 -0.65 -0.91 0.47 -0.4 -0.06
Spa_g19269 (CDF1)
0.92 0.21 -0.08 -0.48 0.06 -0.39 -0.09 -0.36 0.02 -0.42
0.52 -0.4 0.09 -0.64 -0.01 -0.61 0.08 0.38 0.33 -0.25
0.35 -1.03 0.2 -0.42 -0.35 0.02 -0.02 0.37 0.17 0.19
0.28 -0.08 0.5 -0.58 0.11 -0.33 0.04 0.11 -0.24 -0.11
0.11 -0.02 0.37 -0.12 -0.12 -0.1 -0.08 0.18 0.09 -0.45
0.63 -0.95 -0.76 -0.4 -0.81 -0.63 -0.54 0.79 0.82 0.24
0.26 -0.12 0.43 -0.23 0.03 -0.37 -0.16 0.01 -0.14 0.1
0.8 0.1 0.16 -0.58 -0.55 -0.5 -0.57 0.52 -0.33 0.16
0.61 0.01 -0.31 -0.4 -0.25 -0.37 -0.16 0.39 0.42 -0.43
Spa_g23841 (TOC120)
1.02 -0.01 -0.23 -0.92 -0.26 -0.82 -0.1 0.73 0.2 -1.13
0.66 0.79 -0.45 -0.99 0.18 -0.8 0.01 -0.79 0.64 -0.73
0.91 -0.04 -0.25 -1.1 -0.15 -1.05 -0.07 0.3 0.33 0.03
0.71 -0.41 -0.15 -0.48 -0.15 -0.47 -0.06 0.17 0.37 -0.01
0.58 0.24 -1.16 -1.12 -1.31 -2.36 -0.6 1.26 0.52 0.42
1.48 0.29 -0.17 -0.72 -1.49 -0.66 -1.66 0.66 -0.63 -0.05
0.51 -0.23 0.34 -0.22 -0.2 -0.11 -0.13 0.12 -0.04 -0.29
Spa_g26437 (ISE2)
0.37 0.41 0.04 -0.65 0.13 -0.45 0.26 -0.18 0.19 -0.6
Spa_g26590 (UVR2)
1.18 0.4 0.86 -1.07 -1.37 -1.26 -1.82 0.96 -0.88 -0.88
0.4 0.15 0.42 -0.54 -0.22 -0.5 -0.33 0.4 -0.01 -0.19
Spa_g27897 (CARB)
0.46 0.01 0.16 -0.8 -0.36 -0.61 -0.14 0.58 0.6 -0.82
1.65 0.39 0.87 -1.23 -3.24 -1.55 -3.05 0.85 -0.65 -1.85
1.56 0.28 1.48 -4.31 -0.68 -2.95 -0.49 -0.68 -0.68 -1.8
0.92 0.43 0.15 -1.06 0.14 -1.16 0.03 -0.15 0.33 -1.18
1.45 -0.58 0.14 -2.22 -1.79 -1.98 -1.65 0.91 1.28 -3.18
0.24 0.59 0.54 -0.65 -0.28 -0.52 -0.33 0.2 0.37 -1.11
Spa_g30071 (LOS1)
0.62 -0.53 0.21 -0.57 -0.13 -0.39 0.12 -0.22 0.46 -0.08
0.83 0.24 0.25 0.01 -0.48 -0.07 -0.66 0.25 -0.36 -0.82
0.96 -2.05 0.07 -1.37 -0.41 -1.49 -0.7 0.99 0.82 -0.15
1.0 -1.92 0.44 -0.65 -0.59 -0.8 -0.52 0.53 0.44 0.01
0.46 0.41 0.07 -0.98 0.07 -0.76 0.24 0.11 -0.04 -0.19
Spa_g32878 (PAB8)
0.24 -0.07 0.37 -0.56 -0.59 -0.18 -0.59 0.33 0.59 -0.13
0.43 -0.07 0.06 0.02 -0.22 -0.24 -0.47 0.12 0.08 0.11
0.64 0.49 0.11 -0.91 -0.57 -0.56 -0.76 0.71 -0.12 -0.11
0.2 0.28 0.43 -0.4 -0.34 -0.21 -0.3 0.08 0.52 -0.78
Spa_g38911 (BEN1)
0.36 -0.07 0.09 -0.14 -0.23 -0.09 -0.15 -0.0 0.18 -0.04
Spa_g39527 (emb2726)
1.28 0.31 0.53 -1.41 -0.33 -1.33 -0.38 0.14 -0.09 -0.95
Spa_g40577 (DCA1)
0.81 0.53 0.05 -0.8 0.11 -0.69 -0.12 -0.64 -0.14 0.02
1.14 -0.66 1.0 -1.63 -0.96 -1.34 -0.92 -0.47 1.08 -0.83
1.8 0.4 0.68 -3.43 -2.3 -1.03 -1.33 0.06 0.46 -
Spa_g45418 (PPa6)
1.22 0.27 0.15 -0.4 -0.55 -0.49 -0.92 0.4 -0.24 -1.01
1.11 - 1.19 -1.38 -1.56 - -0.63 0.91 1.21 -
1.49 -0.06 0.18 -0.24 -1.52 -0.31 -1.79 0.54 -0.21 -1.0
0.34 0.35 -0.04 -0.88 0.23 -0.84 0.19 0.16 0.1 -0.18
0.56 0.3 0.43 -0.74 -0.13 -0.54 -0.6 0.0 0.42 -0.43
1.6 -0.55 1.4 -1.73 -2.82 -2.52 - 1.38 -1.2 -
1.49 0.28 -0.05 -1.0 -1.68 -0.8 -3.41 0.87 0.04 -0.58
Spa_g50308 (UVR2)
1.74 0.73 0.6 -1.46 -2.72 -1.23 -3.39 0.8 -0.93 -2.39
0.97 0.03 0.79 -0.38 -0.65 -0.5 -0.62 0.22 -0.56 -0.55
0.97 0.76 0.32 -0.69 -0.23 -0.74 -0.31 -0.3 -0.15 -0.98
1.15 -0.31 0.92 -0.68 -0.61 -1.03 -0.53 -0.19 0.44 -1.41
1.07 0.96 0.7 -1.74 -1.39 -1.48 -0.89 0.1 -0.76 0.14
1.13 0.3 0.75 -0.44 -0.9 -0.62 -0.82 0.63 -0.92 -1.54
1.68 -0.25 -0.34 -2.53 -1.02 -0.97 -2.26 -0.01 1.34 -2.04
0.56 -0.07 0.41 -0.52 -0.46 -0.37 -0.23 0.15 0.12 0.01
1.48 -0.81 0.61 -1.77 -0.45 -1.05 -0.32 -1.53 0.87 -0.64
0.63 0.73 0.35 -1.09 -0.06 -0.9 0.03 -0.51 0.15 -0.48
1.19 -0.74 0.98 -2.48 -0.72 -1.32 -0.66 0.28 0.6 -0.76
Spa_g52602 (CARB)
0.68 0.07 0.42 -0.63 -0.01 -0.47 -0.27 0.32 0.06 -0.93
Spa_g52603 (CARB)
0.5 -0.3 0.03 -0.73 -0.41 -0.55 0.0 0.72 0.56 -0.75
1.89 1.07 -1.24 - -0.68 - 0.09 0.41 -0.8 -2.47
1.36 0.52 -0.27 -0.85 -0.36 -0.64 -0.22 -0.34 0.12 -1.15
0.14 0.35 0.36 -0.2 -0.39 -0.25 -0.31 0.09 0.36 -0.49
0.33 0.06 0.23 -0.5 -0.28 -0.39 -0.27 0.3 0.52 -0.43
Spa_g54113 (DCA1)
0.97 0.59 -0.16 -0.96 -0.09 -0.83 0.04 -0.25 -0.27 -0.11
Spa_g54235 (LEN1)
0.9 0.48 0.21 -0.82 -0.22 -0.85 -0.2 0.09 0.03 -0.61
Spa_g54625 (TIM44-2)
0.42 -0.37 0.07 -0.33 -0.02 -0.1 -0.06 0.23 0.0 -0.0
0.45 -0.11 0.22 -0.42 -0.46 -0.45 -0.51 0.4 0.64 -0.39
1.52 -0.24 0.08 -0.25 -1.42 -0.89 -2.59 0.74 -0.25 -0.34
0.58 0.16 0.24 -0.76 0.02 -0.35 -0.28 -0.36 0.38 -0.13
0.36 0.12 0.38 -0.43 -0.14 -0.28 -0.02 -0.21 0.29 -0.35
Spa_g56216 (SMC5)
0.09 0.0 0.36 -0.07 0.01 -0.01 -0.08 0.02 0.14 -0.63
Spa_g57339 (WIN1)
0.18 0.13 0.38 -0.32 -0.12 -0.17 -0.08 0.15 0.1 -0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.