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Heatmap: Cluster_86 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
-0.79 0.69 -0.3 0.57 0.05 -0.25 -0.88 -0.19 -0.46 -0.03 0.69 -0.08 -0.29 0.29 -0.03 0.03 0.27 0.2 0.4 -4.46 -0.61 -0.33 -0.2 0.73 -0.66 -0.23 -0.35 -0.26 -0.13 1.26 0.27 -0.66 -0.48 -0.36 0.44 0.19 -0.05
Zm00001d003203 (GRMZM2G080176)
 -1.16 1.3 0.48 0.78 0.09 -1.25 -0.98 -0.37 -1.81 -1.03 0.72 -0.59 -1.31 0.07 -1.24 0.35 0.67 0.15 1.0 -4.5 -0.9 -0.44 0.01 0.46 -0.45 -0.16 0.5 0.55 - 1.26 0.38 -2.31 0.04 0.75 -0.35 -0.23 -0.35
Zm00001d003222 (GRMZM2G139038)
 -1.17 -0.36 0.42 0.01 0.05 -0.42 -0.54 -0.02 -1.5 -0.64 1.19 -0.46 -1.5 0.48 -0.88 0.42 0.75 -0.04 0.19 -4.9 -0.64 -0.22 0.02 0.46 -0.64 0.4 -0.06 -0.09 -0.28 1.26 0.25 -0.4 -0.35 0.49 -0.19 0.13 0.52
Zm00001d003611 (GRMZM2G380361)
 -0.73 0.14 0.49 0.4 0.09 -0.47 -0.67 -0.13 -1.1 -0.62 0.29 -0.31 -0.55 -0.06 -1.02 0.63 0.95 0.23 0.78 -4.07 -0.33 0.15 0.33 0.54 -0.1 0.35 0.26 0.27 -1.09 0.97 0.05 -1.56 -0.4 0.17 -0.14 -0.04 -0.45
Zm00001d003710 (GRMZM2G401062)
 -1.8 0.52 0.79 0.18 0.01 -0.82 -0.91 0.09 -0.95 -0.2 -0.05 -0.66 -0.12 0.45 -0.8 0.55 1.07 0.02 -0.12 -5.68 -0.75 0.49 -0.61 0.33 -0.4 0.01 0.02 -0.05 0.5 1.8 0.53 -3.68 -0.76 0.27 -1.16 0.14 -1.06
-1.0 0.03 0.18 0.79 -0.1 -0.31 -0.02 0.06 -1.02 -0.56 0.92 -0.14 0.02 0.61 -0.6 0.04 0.85 0.2 1.03 -4.2 -0.76 -0.08 0.03 0.55 -0.48 -0.34 -0.04 0.08 -4.84 1.15 -0.3 -3.48 -0.54 0.05 -0.02 0.27 -0.05
Zm00001d004118 (GRMZM2G161087)
 -1.31 0.1 0.26 0.73 -0.4 -1.43 -1.38 -0.05 -1.68 -0.68 0.75 -0.97 -1.01 -0.65 -0.98 0.09 1.25 0.49 1.2 -1.6 -0.03 0.4 -0.43 1.49 -0.62 0.24 -0.29 -0.05 -2.9 1.38 0.54 -1.04 -0.77 0.02 -0.13 -0.37 -0.98
Zm00001d004140 (GRMZM2G013765)
 -1.37 0.13 -0.09 0.62 -0.37 -0.7 -0.08 0.01 -1.45 -1.08 0.05 -0.51 -0.58 -0.09 -0.99 0.13 1.06 -0.07 0.86 -4.03 -0.28 -0.1 0.58 0.99 -0.72 -0.01 0.05 0.2 -1.71 1.64 0.31 -2.31 -0.42 0.42 0.29 -0.04 -0.24
Zm00001d004215 (GRMZM2G353548)
 -0.52 0.22 0.58 -0.02 0.11 -0.25 -0.05 -0.0 -0.86 -0.03 0.63 -0.17 -0.93 0.29 -0.79 0.64 0.95 0.44 0.38 -0.81 -0.23 -0.08 -0.43 0.33 -0.35 -0.21 0.04 -0.14 -1.85 1.43 0.18 -1.44 -0.88 -0.03 -0.74 0.09 -0.49
Zm00001d004659 (GRMZM2G451357)
 -0.41 0.51 0.65 0.4 0.25 -0.5 -0.51 0.02 -1.3 -0.96 -0.01 -0.64 -0.44 0.13 -1.04 0.64 1.05 0.15 0.72 -3.56 -1.03 0.12 -0.28 0.71 -0.35 0.42 0.36 0.44 - 1.13 -0.15 -3.93 -0.19 0.14 -0.03 0.09 -0.01
Zm00001d004925 (GRMZM2G403562)
 -0.09 0.44 0.58 0.49 0.12 -0.18 -0.68 -0.27 -1.35 -0.73 0.92 -0.26 -0.59 -0.17 -0.6 0.27 0.82 0.65 0.66 -3.41 -0.62 0.0 -0.18 0.64 -0.55 0.03 -0.04 -0.3 -1.12 1.14 0.33 -1.67 -0.76 -0.18 -0.29 0.27 -0.19
Zm00001d006030 (GRMZM2G041633)
 -1.28 0.08 0.05 0.28 -0.06 -0.7 -0.51 0.14 -1.14 -0.85 0.36 -0.4 -0.72 0.36 -0.94 0.59 0.95 -0.32 0.52 -4.74 -0.34 -0.08 0.25 0.74 -0.3 -0.04 0.33 0.0 -2.03 1.35 0.44 -2.02 -0.58 0.18 0.86 -0.07 0.18
Zm00001d006079 (GRMZM2G014917)
 -0.16 0.74 0.54 0.71 -0.05 -0.57 -0.31 -0.35 -1.36 -1.02 0.99 -0.5 0.14 -0.13 -0.7 0.02 0.73 0.14 0.76 -6.67 -0.94 0.05 0.39 0.69 -0.4 -0.02 0.35 0.07 - 0.87 0.1 -2.17 -0.57 -0.16 0.64 -0.2 -0.39
Zm00001d006428 (GRMZM2G181158)
 -1.02 -0.38 0.57 0.97 -0.17 0.04 -0.18 -0.56 -1.68 -0.97 1.25 -0.45 -0.8 0.13 -0.85 -0.04 0.67 0.46 1.07 -2.5 -1.54 0.18 0.55 0.82 -0.69 0.73 -0.08 -0.07 -2.17 1.0 -0.27 -3.11 -0.74 0.14 -0.71 0.17 -0.1
Zm00001d006472 (GRMZM2G336962)
 -0.35 -0.17 0.54 0.92 0.12 -0.1 -0.19 -0.32 -1.58 -0.94 0.64 -0.43 -0.31 0.56 -0.8 0.2 0.84 -0.14 0.23 -9.24 -0.74 0.03 -0.02 0.77 -0.7 0.31 0.16 -0.16 -3.3 1.73 -0.32 -2.51 -1.43 -0.31 -0.18 0.26 0.51
Zm00001d006762 (GRMZM2G146292)
 -0.85 0.57 1.39 1.09 0.2 -1.28 -1.04 -0.77 -1.41 -1.06 0.64 -0.82 -0.76 0.27 -1.14 0.46 0.4 0.49 0.92 -6.22 -1.26 -0.4 -0.88 0.34 -0.63 0.81 0.62 0.11 -1.99 0.74 0.48 -2.98 -0.83 0.71 0.09 -0.13 -0.44
Zm00001d007089 (GRMZM2G141258)
 -1.16 0.36 0.92 0.99 -0.12 -0.22 -0.35 -1.01 -0.92 -0.17 0.48 -0.34 -2.18 0.26 -0.53 -0.26 0.45 0.5 0.52 -2.75 -2.11 -0.5 0.42 0.64 -0.82 0.55 0.31 0.36 -3.01 0.76 0.35 -1.41 0.15 0.81 -1.01 0.38 -0.18
Zm00001d007121 (GRMZM2G171068)
 -0.32 -0.42 1.03 0.83 -0.01 -0.2 -0.38 -0.65 -1.62 -1.08 0.49 -0.93 -1.17 0.41 -1.2 0.32 0.49 0.88 0.61 0.03 -2.23 0.06 -0.22 0.42 -0.81 0.72 -0.24 -0.63 -1.5 1.61 0.17 -2.96 -1.7 0.23 -1.25 0.28 0.53
Zm00001d007698 (GRMZM2G052403)
 0.03 0.34 0.92 0.13 0.16 -0.5 -0.64 -0.44 -0.75 -0.31 0.41 -0.39 -1.03 0.15 -0.58 0.16 0.35 0.41 0.94 -2.7 -0.82 -0.57 -0.11 0.41 -0.65 -0.02 0.45 0.77 -2.07 0.43 -0.23 -0.75 0.44 0.55 -0.28 0.25 -0.13
Zm00001d008390 (GRMZM2G056145)
 -1.62 -0.79 0.24 0.33 -0.2 -0.25 -0.82 -0.03 -1.36 -0.75 -0.3 -0.36 -0.67 0.59 -0.85 0.21 0.89 0.17 0.37 -2.86 -0.42 -0.16 0.17 1.11 -0.5 0.73 -0.0 0.26 -1.2 1.46 0.03 -1.15 -0.16 0.33 0.27 -0.07 0.15
Zm00001d008412 (GRMZM2G429169)
 -1.07 0.26 0.34 0.58 -0.26 -0.86 -0.06 0.46 -1.54 -0.99 0.88 -0.59 -0.48 -0.2 -1.01 0.05 1.41 0.2 0.55 -7.23 -0.74 0.37 -0.03 1.43 -0.44 -0.09 0.13 -0.03 - 1.19 -0.43 -3.6 -0.69 0.02 0.31 -0.11 -0.17
Zm00001d008429 (GRMZM2G334457)
 -0.36 0.2 0.64 0.79 -0.07 -0.25 -0.6 -0.34 -1.39 -0.75 0.39 -0.74 -1.16 0.17 -0.9 0.13 0.34 0.53 1.1 -2.95 -1.84 -0.58 0.3 0.62 -0.93 1.08 0.35 -0.02 -4.6 1.09 0.22 -3.56 -0.73 -0.12 0.78 0.21 0.05
Zm00001d008654 (GRMZM2G321420)
 -0.9 0.05 0.42 0.59 -0.18 -0.47 -0.49 -0.38 -1.3 -0.58 0.24 -0.66 -2.45 -0.33 -1.01 0.05 0.73 0.56 1.12 -2.94 -1.02 0.06 -0.27 0.65 -0.76 0.16 0.0 0.48 -2.76 1.76 0.42 -1.64 -0.04 0.35 0.2 0.17 -0.13
-0.92 -0.18 0.18 0.23 -0.02 -0.35 -0.5 -0.2 -1.47 -0.71 1.22 -0.55 -1.47 0.15 -0.32 0.08 0.77 -0.05 0.94 -2.65 -0.6 0.02 0.2 1.03 -0.62 0.54 0.09 -0.57 -1.17 0.59 0.36 0.05 -1.67 -0.67 0.91 0.03 0.05
Zm00001d009221 (GRMZM2G035395)
 -0.5 0.2 0.61 0.43 0.04 -0.31 -0.23 0.37 -1.21 -0.83 0.51 -0.5 -0.99 0.25 -0.89 0.47 0.7 0.01 0.52 -3.09 -0.66 -0.03 0.12 0.66 -0.26 0.39 0.32 -0.17 -2.07 1.23 0.18 -2.68 -1.15 -0.18 0.31 0.15 0.31
Zm00001d009750 (GRMZM2G018048)
 -1.47 -0.46 0.4 0.23 -0.19 0.02 -0.21 -0.1 -1.14 -0.45 0.34 -0.15 -1.37 0.31 -0.9 0.45 1.22 0.61 0.55 -2.76 -0.44 0.38 -0.3 0.87 -0.53 0.03 -0.16 0.24 -3.31 1.6 -0.21 -4.01 -0.34 0.01 -0.38 0.27 0.14
Zm00001d009751 (GRMZM2G018142)
 -1.56 -0.15 0.49 0.67 -0.34 0.05 -0.24 -1.02 -1.37 -0.39 1.09 -0.48 -1.3 -0.48 -0.87 -0.13 1.3 0.91 1.08 -2.88 -1.38 0.42 -0.19 1.19 -0.62 0.4 -0.09 -0.05 - 1.11 0.18 -1.12 -0.61 0.13 -1.4 0.3 -0.77
Zm00001d009873 (GRMZM2G177447)
 -1.67 0.43 0.52 1.28 -0.07 -0.58 -0.59 -0.5 -1.82 -1.26 0.61 -0.73 -1.4 0.32 -1.36 -0.01 1.05 0.57 0.71 -2.89 -1.07 -0.32 -0.08 0.93 -0.61 0.58 0.22 -0.07 - 1.44 0.34 -2.99 -0.08 0.79 -1.14 -0.03 -0.51
Zm00001d010546 (GRMZM2G390400)
 -0.59 0.54 0.87 0.72 0.2 -0.53 -0.41 -0.6 -1.17 -0.73 0.61 -0.46 -1.07 -0.16 -0.87 0.26 0.59 0.05 0.85 -2.47 -1.05 -0.32 0.41 0.38 -0.5 0.38 0.39 0.14 -1.96 1.19 0.05 -1.74 -0.63 0.32 0.03 0.13 -0.01
Zm00001d010716 (GRMZM2G060213)
 -0.77 -0.34 0.64 0.49 0.11 0.09 0.07 -0.25 -1.19 -0.65 0.3 -0.16 -1.08 0.38 -0.85 0.25 0.45 0.33 0.56 -2.34 -0.74 -0.11 0.27 0.31 -0.4 0.63 0.17 -0.05 -1.69 1.47 0.05 -2.05 -0.99 0.12 0.17 0.13 0.1
Zm00001d010967 (GRMZM2G089406)
 -0.56 -0.35 0.87 0.76 0.21 -0.44 -0.6 -0.21 -1.65 -1.15 0.19 -0.47 -0.41 0.78 -0.92 0.42 0.76 0.33 0.3 -1.44 -0.75 0.32 -0.25 0.55 -0.32 0.5 -0.05 0.06 -2.14 1.59 -0.48 -1.74 -0.9 -0.36 -0.09 0.05 0.2
Zm00001d011089 (GRMZM2G013100)
 -1.47 -0.46 0.11 0.34 -0.12 -0.55 -0.81 -0.04 -1.47 -0.88 -0.04 -0.49 -0.73 0.04 -0.91 0.43 1.2 0.15 0.59 -5.57 0.03 0.5 -0.29 1.22 -0.32 0.14 0.06 0.13 -1.76 1.76 0.41 -1.52 -1.21 0.11 -0.13 0.09 -0.1
Zm00001d011140 (GRMZM2G464754)
 -0.18 0.62 0.93 0.91 0.15 -0.6 -0.87 -1.93 -1.91 -1.3 1.2 -0.99 -1.05 0.39 -1.0 -0.07 0.72 1.01 0.66 -3.45 -1.93 0.75 -0.24 0.47 -0.39 0.67 0.21 -0.06 -2.28 1.0 0.16 -1.18 -0.57 0.19 -0.86 -0.07 -1.15
Zm00001d011233 (GRMZM2G470292)
 -0.31 0.47 0.43 0.53 0.04 -0.48 -0.56 0.21 -1.19 -0.91 -0.14 -0.63 -0.55 -0.12 -0.85 0.41 1.13 0.37 0.61 -2.16 -0.09 0.29 -0.32 0.91 -0.16 -0.07 0.16 0.06 -2.64 1.22 0.05 -3.73 -0.68 -0.2 0.27 0.1 -0.04
Zm00001d011309 (GRMZM2G425377)
 -0.62 -0.01 0.7 0.17 0.04 -0.36 -0.52 -0.15 -0.84 -0.44 -0.01 -0.45 -1.29 -0.12 -0.87 0.65 0.7 0.24 0.4 -2.17 -0.23 -0.4 0.06 0.68 -0.4 0.39 0.16 0.26 -1.09 1.02 0.07 -1.21 -0.42 0.24 0.73 0.25 0.01
Zm00001d011447 (GRMZM2G034025)
 -0.66 0.22 0.56 0.8 0.02 -0.73 -0.59 -0.62 -1.81 -1.25 1.06 -0.6 -0.86 0.11 -1.03 -0.23 0.51 0.82 0.97 -4.01 -1.0 0.2 -0.08 0.68 -0.5 1.02 0.27 0.03 -1.87 0.99 -0.19 -2.16 -0.56 0.2 0.59 -0.12 -0.61
Zm00001d011492 (GRMZM2G104047)
 -0.98 0.37 0.09 0.27 -0.11 -0.47 -0.27 0.05 -1.37 -0.92 1.02 -0.31 -0.18 -0.19 -0.61 0.21 0.92 0.27 0.85 -3.63 -0.64 0.21 0.35 0.88 -0.27 0.03 -0.18 0.17 -1.23 0.69 -0.01 -1.57 -0.35 0.08 0.09 0.05 0.04
Zm00001d011517 (GRMZM2G130586)
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Zm00001d044283 (GRMZM2G349570)
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Zm00001d052193 (GRMZM2G308193)
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 -1.46 0.01 0.24 0.68 -0.49 -0.95 -0.86 -0.24 -2.01 -1.37 0.98 -0.82 -1.52 0.13 -1.32 0.12 0.78 0.15 0.48 -5.95 -0.39 0.22 0.12 1.11 -0.47 0.46 0.03 0.84 -2.56 1.27 0.55 -2.11 0.34 0.64 -0.3 -0.29 0.07
Zm00001d052307 (GRMZM2G091583)
 -0.67 -0.23 0.69 0.76 0.12 0.04 0.07 -0.38 -1.24 -0.38 0.5 -0.27 -0.85 -0.01 -0.79 0.17 0.53 0.58 1.04 -2.27 -1.3 -0.24 0.35 0.29 -0.57 0.77 0.14 0.3 -1.63 0.78 -0.23 -1.51 -0.18 0.34 -0.43 0.05 -0.41
Zm00001d052666 (GRMZM2G153150)
 -1.29 -0.44 0.31 -0.16 0.08 -0.86 -1.2 -1.64 -2.18 -2.27 0.22 -0.84 -1.32 0.83 -2.16 0.55 0.57 0.86 0.55 -3.45 -0.7 0.27 -1.31 -0.24 -0.35 0.22 -0.46 0.44 -1.34 2.48 0.19 0.47 0.19 0.99 -1.02 -0.31 -1.22
Zm00001d052888 (GRMZM2G083309)
 -1.03 -0.1 0.32 0.24 -0.05 -1.45 -0.37 -0.66 -0.89 0.09 1.31 0.06 -1.14 0.55 -0.86 0.31 0.59 0.33 0.71 -5.15 -1.01 0.27 0.23 0.51 -0.36 0.35 -0.42 0.23 -1.38 1.1 0.23 -2.04 -0.26 0.41 -0.46 0.24 -0.23
Zm00001d053038 (GRMZM2G180811)
 -0.66 0.3 0.82 -0.45 0.31 -0.74 -0.84 -0.45 -0.86 -0.37 0.73 -0.45 -1.48 0.61 -0.67 0.6 0.4 0.32 0.87 -4.06 -0.39 -0.18 -0.1 0.63 -0.4 0.59 0.38 -0.01 -1.32 1.19 0.28 -1.07 -0.76 0.06 0.17 -0.16 -0.71
Zm00001d053251 (GRMZM2G422464)
 -0.87 0.14 1.03 0.93 -0.21 -1.98 -2.3 -0.99 -1.48 -1.19 -0.9 -1.52 -1.3 0.41 -1.33 0.31 0.72 0.36 1.01 -6.97 -2.06 -0.46 -1.85 0.48 -1.19 0.02 0.34 1.5 -3.72 1.58 0.38 -2.56 1.2 1.01 -0.3 -0.08 -0.31
Zm00001d053316 (GRMZM2G147026)
 -0.27 0.25 0.76 0.49 0.25 -0.88 -0.68 -0.36 -1.1 -0.73 0.48 -0.44 -0.62 0.34 -0.31 0.52 0.55 0.03 0.38 -6.91 -0.39 -0.77 -0.01 0.16 -0.56 0.41 0.17 0.32 -0.68 0.87 -0.03 0.1 0.18 0.82 -0.91 0.12 -0.44
Zm00001d053559 (GRMZM2G049329)
 -0.86 0.1 0.25 0.06 -0.13 0.44 0.19 0.23 -0.47 0.3 0.47 0.05 -1.8 0.14 -0.72 0.52 0.97 0.14 0.72 -4.66 -0.51 0.27 0.19 0.17 -0.29 0.29 0.23 -0.76 -4.33 1.58 -0.28 -3.62 -1.56 -0.38 -0.34 0.39 -0.22
Zm00001d053894 (GRMZM2G092627)
 -0.84 0.94 0.9 0.7 0.14 -0.84 -0.74 -0.51 -1.34 -0.66 0.87 -0.58 -1.55 0.13 -1.06 0.54 0.55 0.29 0.65 -6.7 -1.08 -0.26 -0.4 0.29 -0.37 0.26 0.62 0.88 - 0.73 0.64 -4.43 0.28 0.47 -0.68 0.08 -0.43
Zm00001d054070 (GRMZM2G054162)
 -0.6 0.32 0.86 0.51 0.04 -0.65 -0.64 -0.47 -1.1 -0.33 1.4 -0.63 -0.77 0.08 -0.78 0.19 0.62 0.26 0.99 -2.38 -1.1 -0.6 0.02 0.62 -0.78 0.38 0.55 0.21 -4.55 0.97 0.24 -2.81 -0.26 0.37 -0.83 -0.1 -0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.