Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00325 (CPA)	-2.67	0.13	-0.53	0.45	-0.0	0.34	0.2	0.87	-0.32	-0.6
Spa_g00346	-1.23	0.23	-0.15	0.11	0.06	0.22	0.15	0.07	0.24	-0.19
Spa_g00361	-0.25	0.09	0.16	0.28	-0.45	0.06	-0.3	0.15	0.13	-0.05
Spa_g00492	-0.37	0.59	-0.19	-0.73	-0.0	0.09	-0.43	0.26	0.56	-0.38
Spa_g00840	-0.15	0.09	0.58	-0.12	-0.4	-0.09	-0.3	0.13	0.24	-0.26
Spa_g01073	-0.71	-0.09	0.18	0.05	0.1	0.02	0.17	0.01	0.12	-0.05
Spa_g02744 (ATG8D)	-0.93	-0.07	0.15	-0.08	0.26	-0.02	0.26	-0.41	0.17	0.28
Spa_g02792	-1.45	0.03	0.23	0.23	0.14	0.31	0.06	0.23	-0.05	-0.44
Spa_g02894	-2.69	-1.51	-1.93	0.85	-0.22	1.32	0.24	0.54	-1.39	0.08
Spa_g03161	-0.43	0.03	-0.22	0.12	0.04	0.07	0.03	0.43	-0.32	0.07
Spa_g03573	-1.7	-2.24	-0.35	0.72	0.61	0.99	-0.11	0.91	-2.04	-1.07
Spa_g04557 (AtATG18a)	-1.13	0.14	0.31	-0.02	-0.09	0.21	0.0	-0.12	0.21	0.06
Spa_g04632	-1.06	-1.09	0.39	-0.46	-1.24	0.11	0.38	0.71	0.92	-0.55
Spa_g04682 (DDL)	-1.77	0.79	-1.58	0.95	0.08	1.03	0.4	-1.95	-0.05	-3.65
Spa_g04928 (NFU4)	-0.43	0.26	-0.1	0.04	-0.03	0.12	-0.05	0.37	0.06	-0.45
Spa_g05172 (RGLG2)	-0.59	0.07	0.06	0.21	-0.31	0.25	-0.07	0.14	0.06	-0.0
Spa_g05230	-0.79	0.33	-0.16	-0.31	-0.19	0.23	0.02	0.42	0.48	-0.57
Spa_g05463	-0.81	0.49	-0.23	-0.1	0.07	0.08	0.07	0.27	0.15	-0.36
Spa_g05550	-0.68	0.23	0.02	0.19	-0.13	0.29	-0.13	0.03	0.15	-0.21
Spa_g05745	-0.66	0.07	0.04	-0.07	0.3	0.09	0.22	-0.15	0.1	-0.13
Spa_g05986 (LSD1)	-0.06	0.34	-0.34	0.3	-0.09	0.18	-0.3	0.06	0.0	-0.28
Spa_g06261 (PEX2)	-0.47	-0.2	0.18	-0.01	-0.06	0.05	0.01	0.05	0.27	0.06
Spa_g06376	-0.45	0.09	-0.09	0.03	0.22	0.15	0.2	-0.23	0.05	-0.1
Spa_g06885 (KINESIN-13A)	-0.71	0.09	0.6	0.09	-0.55	0.3	-0.47	0.28	0.06	-0.22
Spa_g07840	-0.91	0.37	0.03	-0.07	0.25	0.22	0.13	-0.02	0.29	-0.87
Spa_g09109 (PUB44)	-1.09	-0.38	-0.22	0.43	0.13	0.55	0.12	0.55	-0.15	-0.88
Spa_g09201	-0.9	0.27	0.01	0.18	0.04	0.22	-0.0	0.01	-0.15	0.04
Spa_g10077	-1.14	-0.48	0.7	-0.05	-0.08	-0.02	0.16	0.18	-0.4	0.39
Spa_g10154 (ARI7)	-0.89	0.09	0.18	-0.09	0.12	0.01	0.16	0.08	0.1	-0.03
Spa_g10904	-1.05	0.09	-0.06	-0.3	0.04	-0.13	0.17	0.05	0.49	0.23
Spa_g10958 (SIR1)	-0.23	0.09	0.07	0.05	-0.1	0.12	-0.13	0.23	0.19	-0.42
Spa_g11428	-0.4	0.26	-0.49	0.05	0.07	0.11	0.14	0.17	0.19	-0.33
Spa_g11722 (Erv1)	-0.29	0.14	-0.06	0.1	-0.35	0.2	0.06	0.32	0.11	-0.44
Spa_g11902	-0.65	-0.06	0.02	-0.13	-0.03	0.01	0.04	0.12	0.25	0.26
Spa_g11986 (FBP7)	-0.73	-0.13	0.15	0.09	-0.07	0.06	0.05	0.11	0.18	0.1
Spa_g12137	-0.2	-0.09	0.21	0.03	-0.28	0.03	-0.02	0.3	0.17	-0.28
Spa_g12140 (RAR1)	-0.19	0.14	-0.04	-0.01	-0.02	0.12	-0.13	0.08	0.29	-0.34
Spa_g12177	-1.13	0.14	0.25	-0.1	0.05	-0.05	0.06	-0.03	0.17	0.24
Spa_g12977	-0.07	0.16	-0.03	0.04	-0.03	0.15	-0.15	-0.03	0.27	-0.4
Spa_g14198	-1.61	-0.33	0.59	-0.05	-0.08	-0.11	0.04	0.25	-0.09	0.47
Spa_g14375	-1.17	-0.24	-0.08	-0.05	-0.02	-0.09	0.23	0.11	0.5	0.27
Spa_g14390	-0.62	-0.17	0.17	-0.01	-0.33	0.3	0.01	0.34	0.2	-0.15
Spa_g14499	-0.05	0.19	0.0	0.03	-0.32	0.25	-0.38	0.31	0.28	-0.6
Spa_g14880	-0.44	-0.06	0.07	-0.06	0.01	-0.05	-0.03	0.3	0.26	-0.12
Spa_g15229 (AlaAT1)	-0.51	0.12	0.01	0.18	-0.2	0.07	-0.0	0.33	0.19	-0.4
Spa_g16501	-0.65	0.35	0.18	0.09	0.06	0.03	-0.04	0.06	0.01	-0.3
Spa_g16716 (PFT1)	-0.53	-0.04	0.09	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.1	-0.06
Spa_g16806 (ARFB1B)	-0.44	-0.01	-0.14	0.05	-0.09	0.09	0.01	0.18	0.12	0.14
Spa_g17369 (PRMT11)	-0.83	0.04	0.36	0.08	-0.15	0.07	0.22	-0.19	0.17	-0.07
Spa_g17635	-0.48	0.14	0.2	0.1	-0.37	0.07	-0.19	0.08	0.3	-0.02
Spa_g17891	-0.94	0.47	-0.38	0.03	0.08	0.06	-0.08	0.29	0.25	-0.26
Spa_g18051 (ELC)	-0.56	0.04	-0.09	-0.09	-0.01	0.03	0.03	0.11	0.3	0.09
Spa_g18696	-0.67	0.13	0.23	-0.1	0.18	-0.13	0.17	0.14	-0.05	-0.1
Spa_g18855 (BRCC36A)	-0.31	0.09	0.08	-0.06	-0.06	0.05	0.0	0.23	0.14	-0.26
Spa_g18961	-1.41	0.26	-0.08	0.2	-0.0	0.25	0.21	0.0	-0.16	0.13
Spa_g20422	-0.98	0.49	-0.42	0.45	-0.03	0.52	0.0	-0.1	0.07	-0.76
Spa_g22562	-0.43	-0.12	0.38	-0.04	-0.33	0.3	-0.01	-0.06	0.19	-0.08
Spa_g24274	-1.32	0.13	-0.07	0.07	0.26	0.19	0.26	-0.39	0.17	0.12
Spa_g24541	-0.35	-0.88	0.62	-0.16	0.08	-0.03	-0.01	0.2	-0.11	0.18
Spa_g24563	0.08	-0.22	0.07	0.03	-0.1	0.04	-0.14	0.16	0.22	-0.21
Spa_g25018	-0.47	-0.17	-0.1	-0.19	-0.13	-0.02	-0.13	0.47	0.14	0.37
Spa_g25476 (ATG8D)	-1.56	0.23	-0.28	-0.36	0.4	-0.13	0.38	-0.32	0.18	0.5
Spa_g26739	-0.08	-0.03	-0.06	0.2	-0.41	0.27	-0.3	0.26	0.11	-0.12
Spa_g28672	-1.48	-0.1	0.28	-0.14	0.33	-0.1	0.32	0.06	0.07	0.07
Spa_g29334	-0.61	0.67	-0.18	0.17	-0.09	0.24	-0.27	0.3	-0.15	-0.57
Spa_g29452	-0.89	-0.2	0.2	-0.06	0.05	0.05	0.15	-0.04	0.21	0.22
Spa_g30052	-0.92	0.01	-0.27	-0.13	0.29	-0.25	0.24	0.06	0.27	0.3
Spa_g30709	0.03	0.22	-0.08	0.09	-0.44	0.27	-0.31	0.06	0.37	-0.47
Spa_g31118	-0.85	0.0	0.41	-0.14	-0.12	-0.09	0.05	0.33	-0.03	0.1
Spa_g35069	-0.59	-0.07	0.26	-0.03	-0.1	0.02	-0.05	0.3	0.02	0.06
Spa_g38626 (CID7)	-0.73	-0.22	0.26	0.07	-0.18	0.23	0.18	-0.13	0.22	0.04
Spa_g41671	-0.79	-0.52	0.09	-0.06	0.09	0.29	0.3	-0.25	0.6	-0.29
Spa_g42076	-0.72	0.24	-0.19	0.17	-0.41	0.05	0.19	0.41	0.2	-0.32
Spa_g43037	-1.41	-0.34	0.52	-0.27	-0.1	0.26	0.21	0.3	0.59	-0.88
Spa_g45410	-0.71	0.18	0.37	-0.02	-0.22	0.11	-0.01	0.04	0.09	-0.08
Spa_g47663	-0.39	-0.04	0.1	0.02	-0.11	0.21	0.05	0.1	0.25	-0.31
Spa_g48262	-0.82	0.31	0.52	-0.3	-0.31	0.06	-0.35	0.33	0.44	-0.5
Spa_g48269	-1.06	-0.2	0.3	-0.24	0.01	0.27	-0.17	0.36	0.03	0.23
Spa_g48279	-0.6	0.07	0.01	-0.17	0.05	-0.11	0.17	-0.02	0.16	0.26
Spa_g49181	-0.82	0.53	0.51	-0.33	-0.74	-0.04	-0.36	0.58	0.59	-1.25
Spa_g50392	-1.18	0.35	0.02	0.01	-0.03	0.22	-0.04	0.12	0.05	0.03
Spa_g50498	-2.75	-0.25	0.49	-0.32	0.1	-0.01	0.28	0.3	0.3	0.09
Spa_g51437	-0.09	0.13	-0.06	0.13	-0.38	0.36	-0.37	0.16	0.21	-0.29
Spa_g51660	0.04	0.18	0.33	0.31	-0.29	-0.54	-0.09	-0.15	0.21	-0.25
Spa_g51874	-1.48	-0.38	0.71	0.67	-1.59	0.65	-1.43	1.11	-0.08	-1.93
Spa_g52469 (ATG8D)	-1.19	-0.07	0.03	0.01	-0.07	0.17	0.03	-0.05	0.28	0.38
Spa_g53304	-0.3	-0.45	0.2	0.32	-0.06	0.79	-0.4	-0.59	0.1	-0.17
Spa_g53541	-0.41	0.3	0.06	0.37	-0.32	0.27	-0.34	0.22	-0.06	-0.38
Spa_g53885	-0.72	-0.18	0.27	0.1	-0.12	0.11	0.14	-0.2	0.25	0.09
Spa_g53981	-0.95	-0.21	0.34	-0.01	-0.19	-0.06	-0.06	0.49	0.13	0.1
Spa_g54260	-2.71	-0.05	-0.39	0.59	0.11	0.55	0.27	0.64	-0.53	-0.68
Spa_g54544	-0.85	-0.08	0.11	-0.1	0.03	0.08	0.03	0.31	0.54	-0.53
Spa_g54598	-0.69	0.31	-0.14	-0.06	-0.41	0.32	-0.5	0.18	0.56	-0.07
Spa_g54829	-0.93	-0.12	0.22	0.12	-0.13	0.18	-0.07	-0.03	0.37	0.05
Spa_g55236	-0.07	0.08	0.2	0.1	-0.96	0.31	-0.38	0.68	0.61	-3.12
Spa_g55988	-0.78	0.45	0.19	0.28	0.17	-0.06	-0.4	0.52	-0.23	-0.8
Spa_g56091	-	-0.75	-0.8	-0.41	-2.17	0.82	-0.47	1.35	0.85	0.02
Spa_g56161	-0.28	0.13	0.18	0.21	-0.36	0.1	-0.35	0.14	-0.15	0.21
Spa_g56285	-0.21	0.09	0.29	0.14	-0.73	-0.68	0.17	0.42	0.3	-0.28
Spa_g56301	-0.92	0.14	0.05	0.13	-0.24	0.27	-0.18	0.07	0.35	-0.04
Spa_g56527	-0.6	-0.39	0.17	0.12	-0.19	0.42	0.19	-0.02	0.05	0.0
Spa_g57302	-1.04	-0.04	0.06	-0.07	0.15	-0.05	0.1	0.02	0.28	0.24
Spa_g57338 (WIN1)	-0.04	-0.07	0.33	0.18	-0.32	0.45	-0.28	0.18	0.03	-0.9
Spa_g57343	-0.45	-0.12	0.14	-0.29	0.01	0.13	0.22	0.01	0.35	-0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.