Heatmap: Cluster_190 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.89 0.36 0.1 0.12 0.06 -0.01 0.4 0.38 -0.02 0.15 0.5 0.87 0.76 -0.79 -1.31 -1.4 -0.98 -0.4 -0.25 -0.44 -1.88 0.02 -1.25 -0.0 -0.11 0.23
0.35 -0.06 0.17 0.23 -0.36 -0.5 -0.02 0.27 0.37 0.52 0.75 0.66 0.65 0.28 -0.4 -0.1 -0.51 -1.12 -0.98 -0.53 -3.34 -0.91 -0.72 0.12 0.4 0.38
0.54 -0.0 0.21 0.4 -0.27 -0.7 -0.04 0.43 0.01 0.5 0.64 0.7 0.7 -0.09 -0.99 -0.37 -0.5 -0.77 -0.76 -0.2 -1.14 -2.27 0.22 -0.2 0.17 0.37
1.05 -0.09 -0.27 0.62 0.36 -0.9 -0.28 0.29 0.09 0.21 0.73 0.16 0.3 -1.86 -1.64 -1.67 -1.34 -0.43 -0.64 -1.16 - 0.63 -0.43 0.46 1.37 0.2
0.73 0.17 -0.24 0.26 0.26 0.02 0.15 0.47 0.34 0.28 0.33 0.22 0.51 -1.19 -0.79 -0.5 -0.95 0.29 -0.39 -1.04 -4.54 0.63 -1.33 -1.02 0.85 0.2
1.1 1.13 0.4 0.98 0.69 -0.19 -0.09 0.47 0.0 0.21 0.25 0.26 0.75 -0.5 -1.4 -1.14 -1.1 -0.77 -0.92 -0.72 -7.75 -1.78 -1.67 -1.97 0.64 0.21
1.01 -0.06 -0.27 0.4 0.2 -0.33 0.08 -0.33 -0.05 0.34 0.9 0.68 0.71 -0.94 -1.19 -0.92 -1.2 -0.46 -1.3 -0.9 -4.84 -2.95 0.55 0.38 0.9 0.45
0.78 0.43 0.04 -0.08 0.07 -0.79 -0.25 -0.05 0.13 -0.01 0.39 0.58 0.65 -0.2 -1.22 -0.33 -0.43 -0.46 -0.08 -0.46 -5.65 -2.21 0.39 -0.0 1.18 0.02
0.05 0.49 0.39 0.77 0.84 0.5 0.43 0.59 0.11 0.07 0.07 -0.21 -0.21 0.22 -0.61 -0.45 -0.51 -0.0 -0.41 -0.24 -4.78 -2.47 -0.49 -1.25 0.38 0.1
0.79 -0.03 0.15 0.64 0.39 0.08 0.29 0.29 -0.07 -0.14 -0.14 -0.18 1.05 0.22 -0.85 -0.5 -1.34 -1.07 -1.06 -1.04 -3.41 -0.61 -0.47 -1.19 0.88 1.04
0.75 -0.06 -0.35 0.17 -0.21 -0.32 0.17 0.5 0.05 0.18 0.12 -0.05 0.78 0.21 -0.38 -0.17 -1.03 -0.11 -0.27 -0.72 -1.63 -0.35 0.01 -0.31 0.45 0.42
0.33 0.53 0.32 0.19 0.05 -0.23 -0.3 -0.06 -0.58 -0.14 0.13 0.55 0.61 -0.2 -0.33 -0.17 0.18 -0.07 0.06 0.07 -3.89 -1.73 -0.1 -0.04 0.68 -0.01
0.49 0.25 0.38 0.45 0.1 -0.44 0.01 0.27 -0.06 0.47 0.55 0.65 0.57 -1.33 -1.23 -1.82 -0.59 -0.18 -0.41 0.1 -4.31 -0.49 0.02 -0.18 0.44 0.45
0.41 -0.44 -0.66 0.08 -0.14 -0.36 -0.16 0.35 0.41 0.35 0.55 0.33 0.52 -0.11 -0.67 -0.04 -0.81 -0.12 -0.71 -1.12 -0.94 0.46 0.31 0.0 0.31 0.23
0.41 0.48 0.49 0.49 0.18 -0.07 -0.04 0.17 -0.06 -0.01 0.11 0.47 0.4 -0.95 -0.34 -0.52 -0.71 -0.26 -0.74 -0.72 -3.44 -0.2 0.21 -0.46 0.76 0.41
0.82 0.13 -0.1 0.09 -0.02 -0.25 0.06 0.13 0.14 -0.03 0.56 0.51 0.72 -0.84 -0.91 -0.58 -1.06 -0.01 -0.54 -0.78 -4.75 0.68 -0.07 -0.34 0.58 0.23
0.6 -0.2 -0.5 0.31 0.26 -0.04 0.11 0.16 0.12 0.13 0.52 0.43 0.53 0.07 -0.49 -0.5 -1.11 -0.16 -0.87 -0.97 -1.24 0.45 -0.31 -0.02 0.26 0.28
0.15 0.0 -0.01 0.16 -0.08 -0.49 0.13 0.25 0.33 0.35 0.45 0.34 0.05 -0.25 -0.06 -0.08 -0.07 0.19 -0.21 -0.3 -2.38 0.1 -0.24 -0.16 0.35 -0.21
0.5 0.0 0.1 0.35 0.08 -0.43 -0.03 0.04 -0.11 0.19 0.35 0.3 0.23 -0.4 -0.77 0.52 -0.4 -0.29 -0.32 -0.22 -3.15 -0.49 -0.25 0.0 0.65 0.52
0.58 0.16 -0.16 0.56 0.02 -0.78 -0.12 0.11 -0.27 0.06 0.63 0.15 0.35 -0.73 -1.62 0.43 -0.49 -0.4 -0.71 -0.52 -3.17 0.11 -0.68 0.28 0.93 0.7
0.37 0.29 0.2 0.65 0.58 0.4 0.1 0.56 -0.09 -0.19 0.49 0.09 0.33 -0.27 -1.82 -1.19 -1.06 -0.03 0.12 -0.9 -3.21 -1.18 0.33 -0.03 0.59 -0.12
0.53 -0.1 0.27 0.4 0.09 -0.09 0.07 0.21 -0.1 -0.1 0.04 0.16 0.76 -0.19 -0.56 -0.26 -0.52 -0.47 -0.89 -0.44 -1.57 0.46 -0.5 -0.35 0.47 0.6
0.16 -0.08 0.04 0.15 0.37 0.39 0.31 0.23 0.26 0.08 0.11 -0.05 0.12 -0.09 -0.15 -0.14 -0.23 -0.03 -0.05 -0.39 -1.78 -0.11 -0.05 -0.13 0.09 -0.12
0.32 0.13 0.4 0.55 0.55 0.15 0.28 0.44 0.09 0.06 0.38 0.52 0.06 -1.17 -0.95 -0.89 -0.44 -0.12 -0.56 -0.26 -2.41 -1.23 0.15 0.4 0.11 0.08
0.62 0.24 -0.13 0.55 0.76 0.39 0.2 0.47 -0.08 -0.05 0.2 0.16 0.65 -0.3 -0.66 -0.27 -0.45 -0.2 -0.51 -0.77 -2.35 -0.45 -0.33 -0.86 0.24 0.01
0.32 -0.16 -0.35 0.39 0.3 -0.26 0.1 0.3 0.07 0.09 0.2 0.03 0.24 0.21 -0.16 -0.03 -0.42 -0.04 -0.23 -0.76 -2.6 0.51 -0.66 -0.35 0.67 0.2
0.66 -0.21 -0.15 -0.27 -0.21 -0.16 0.1 0.06 -0.03 0.39 0.45 0.4 0.88 0.06 -0.5 -0.04 -0.59 -0.06 -0.62 -0.59 -2.13 -0.03 -0.45 -0.19 0.51 0.29
0.75 0.09 0.1 0.63 -0.01 -0.44 0.21 0.38 -0.15 -0.0 -0.01 0.03 1.13 0.11 -1.21 -0.07 -0.77 -0.06 -1.12 -1.18 -4.55 -0.13 -1.16 -1.29 1.04 0.64
0.47 0.07 0.09 0.17 0.08 0.41 0.39 0.42 0.1 -0.14 -0.15 0.11 0.61 0.0 -0.53 -0.3 -0.5 -0.71 -0.7 -0.72 -2.58 0.2 -0.14 -0.44 0.65 0.35
0.61 0.17 0.08 0.45 0.22 -0.32 0.0 0.18 0.04 -0.25 0.28 0.47 0.62 -0.35 -0.55 -0.34 -0.68 -0.06 -0.37 -0.69 -2.6 0.8 -0.44 -1.07 0.54 0.02
0.45 0.03 -0.07 0.18 0.08 -0.15 0.04 0.17 -0.12 -0.05 0.12 0.07 0.65 -0.1 -0.34 0.07 -0.16 0.0 -0.18 -0.16 -1.48 -0.31 -0.2 0.01 0.28 0.17
0.24 0.02 -0.5 -0.45 -0.4 -0.45 0.02 0.18 0.23 0.33 0.57 0.48 0.59 0.13 -0.5 -0.13 -1.02 -0.83 -0.88 -1.11 -1.45 0.96 0.08 0.27 0.34 0.39
0.78 0.24 0.04 0.41 0.04 -0.56 -0.22 0.15 0.09 0.2 0.51 0.55 0.73 -0.82 -1.13 -1.13 -0.85 -0.74 -0.77 -0.84 -3.99 0.76 -0.66 0.28 0.73 0.36
0.83 0.58 0.33 0.43 0.29 -0.51 -0.08 -0.22 -0.81 0.08 0.51 0.84 0.98 -1.22 -2.32 -1.98 -2.55 -0.48 -0.58 -1.05 -3.28 -0.55 0.31 0.7 0.67 0.48
0.65 -0.23 -0.43 0.22 0.28 0.36 0.56 0.61 0.51 0.26 0.29 0.07 0.3 -0.4 -2.07 -0.93 -0.99 -0.72 -1.02 -0.65 -2.16 0.03 -0.55 -0.32 0.79 0.88
0.26 -0.06 -0.17 -0.08 -0.31 -0.59 0.15 0.31 0.34 0.39 0.43 0.47 0.5 -0.12 -0.53 -0.25 -0.44 0.26 -0.44 -0.45 -3.03 0.26 -0.08 -0.14 0.37 0.16
0.69 0.25 0.3 0.66 -0.02 -0.96 -0.42 -0.07 -0.32 -0.29 0.1 0.48 1.07 -0.67 -0.52 -0.66 -0.52 -0.14 -0.57 -0.33 -2.19 0.91 -0.83 -0.62 0.18 0.62
0.21 0.18 0.26 0.5 0.23 -0.33 -0.05 0.16 -0.52 -0.21 0.18 0.4 0.49 -0.44 -0.54 -0.53 -0.38 -0.16 -0.48 -0.48 -2.82 0.96 -0.54 -0.05 0.39 0.44
0.78 0.11 -0.11 0.39 0.2 -0.12 0.13 0.48 -0.13 0.35 0.14 -0.05 0.27 -0.38 -0.52 0.05 -0.95 0.07 -0.35 -0.66 -2.42 0.23 -0.32 -0.63 0.63 0.14
0.25 0.24 0.42 0.75 0.45 -0.03 0.37 0.51 0.41 0.25 0.34 0.06 -0.51 -0.88 -0.69 -0.53 -0.4 0.09 0.08 -0.33 -3.86 -1.12 0.07 -0.78 0.41 0.01
0.55 -0.04 0.13 0.34 0.08 -0.3 0.07 0.39 -0.19 -0.26 -0.14 -0.23 0.7 0.3 -0.3 0.1 -0.76 -0.32 -0.51 -0.59 -2.2 0.26 -0.42 -0.24 0.63 0.55
0.97 -0.35 -1.18 -0.02 0.0 -0.73 -0.36 0.02 0.12 0.51 1.01 0.54 0.72 -0.97 -1.21 -1.11 -0.95 -0.78 -0.65 -1.12 -2.85 1.11 -0.41 -0.71 1.14 0.41
0.4 0.34 0.53 0.17 0.1 0.33 0.41 0.6 0.21 0.08 0.13 0.07 0.32 -0.74 -0.86 -1.36 -1.2 -0.46 -0.98 -0.91 -1.91 -0.63 0.18 0.16 0.86 0.44
0.82 0.4 0.46 0.41 0.21 0.11 0.3 0.27 0.12 -0.12 0.41 0.49 0.16 -0.64 -0.48 -0.72 -0.95 -0.23 -0.14 -0.36 -3.96 -1.12 0.12 -0.58 0.36 0.14
0.73 0.07 -0.06 0.07 -0.3 -0.79 -0.13 0.26 0.12 0.36 0.56 0.52 0.61 -0.31 -0.87 -0.76 -0.33 -0.05 -0.64 -0.6 -2.51 0.39 -0.55 0.25 0.62 0.12
0.04 0.16 0.46 0.63 0.54 0.39 0.39 0.35 -0.01 -0.28 -0.22 -0.12 0.12 -0.26 -0.04 -0.18 -0.13 0.1 -0.15 -0.4 -1.92 -1.08 -0.3 -0.65 0.54 -0.12
0.56 0.79 0.0 0.83 0.13 -0.43 -0.2 0.42 0.18 0.0 0.3 0.41 -0.15 -1.42 -1.3 -0.95 -1.71 -0.05 -0.72 -1.24 -3.43 -1.57 0.15 0.9 0.76 0.75
0.86 0.26 0.16 0.66 0.29 0.44 0.39 0.55 -0.03 0.08 0.28 0.36 0.9 0.08 -1.05 -0.64 -1.21 -0.84 -1.25 -1.05 -3.2 -0.11 -1.53 -1.07 0.43 0.32
0.47 0.25 0.36 0.71 0.5 0.36 0.09 0.2 -0.03 -0.12 -0.2 -0.02 -0.07 -0.12 -0.31 -0.27 -0.51 0.07 -0.13 -0.45 -3.03 -1.01 0.04 -0.05 0.23 0.19
0.8 0.04 -0.16 0.14 -0.61 -1.24 -0.07 0.33 -0.21 0.25 0.48 0.28 1.04 -0.19 -0.44 -0.85 -0.38 -0.11 -0.94 -0.61 -3.47 0.15 -1.95 -0.42 1.37 0.49
0.23 0.37 0.19 0.82 0.82 0.22 0.03 0.07 0.09 0.16 0.22 0.3 0.22 -0.16 -0.71 -0.41 -0.97 -0.49 -0.39 -0.37 -1.92 -1.16 -0.3 0.18 0.09 0.21
0.72 0.22 0.05 0.32 0.33 0.1 0.3 0.12 0.09 0.24 0.13 0.31 0.68 -0.46 -1.19 -0.72 -1.11 0.04 -0.32 -0.7 -3.16 0.1 -0.07 -0.29 0.55 -0.03
0.73 0.12 -0.49 0.45 0.65 -0.77 0.18 0.29 -0.02 0.36 0.49 0.46 0.88 -0.26 -0.79 -0.34 -0.94 -0.27 -0.86 -0.9 -1.77 -0.73 0.5 -0.52 0.24 -0.11
1.7 0.47 0.25 0.94 0.27 -0.45 -0.84 0.18 -0.44 0.08 0.52 0.59 0.93 -1.38 0.62 -1.44 -1.27 -1.27 -1.24 -2.64 -4.2 0.2 -1.29 -2.12 0.44 0.13
1.52 0.58 0.12 1.02 0.5 -1.53 -0.16 -0.46 -0.12 0.28 0.19 0.85 1.05 -4.39 -0.1 -1.67 -2.11 -0.56 -1.66 -2.87 -2.66 0.41 -0.78 -2.2 0.77 0.41
0.43 0.44 0.51 0.48 0.1 -0.26 -0.03 -0.13 -0.04 -0.02 0.12 0.49 0.05 -0.54 -1.28 -0.94 -1.27 -0.44 -0.68 -0.74 -2.81 0.09 0.57 0.8 0.58 0.35
0.7 0.09 -0.29 0.86 0.4 0.1 -0.0 0.5 0.01 0.52 0.6 0.26 0.22 -0.15 -0.62 -0.58 -0.7 -0.81 -0.69 -1.05 - 0.03 -0.78 -0.67 0.43 0.55
0.87 0.54 0.11 0.21 0.36 0.33 0.54 0.19 0.05 0.07 -0.17 -0.2 -0.15 -0.44 -0.37 -0.37 -0.33 0.04 0.07 -0.13 -6.57 -1.29 -0.22 0.06 0.4 -0.19
0.87 0.35 0.23 0.55 0.04 -0.52 -0.27 0.25 -0.35 0.18 0.6 0.67 1.0 -0.83 -1.37 -0.88 -0.93 -0.95 -1.31 -1.08 -1.81 -2.41 0.7 0.25 0.37 0.59
0.71 0.05 0.05 0.44 -0.05 -0.59 -0.14 0.51 0.03 -0.06 -0.09 -0.14 0.96 0.39 -1.4 -0.23 -2.0 -1.74 -2.06 -1.96 -1.75 -0.56 -0.32 -1.28 1.56 1.31
1.11 0.13 -0.19 0.37 -0.08 -0.06 0.33 0.73 0.7 0.22 0.37 0.51 0.49 -2.53 -1.49 -2.44 -1.23 -0.48 -1.02 -0.93 -1.31 0.03 -0.62 -0.15 0.8 0.32
0.27 -0.08 -0.19 0.43 0.18 0.01 -0.01 0.12 -0.1 0.22 0.52 0.17 -0.02 -0.29 -0.38 0.33 -0.69 0.0 0.03 -0.45 -2.85 -0.67 -0.37 0.43 0.67 0.08
0.82 0.32 -0.21 0.09 0.11 -0.05 0.01 0.47 0.45 0.1 0.45 0.38 0.79 -0.27 -1.17 -1.53 -1.68 -0.24 -0.59 -1.22 -2.27 -0.2 -0.56 0.27 0.49 0.64
0.63 0.65 0.72 0.36 0.48 0.2 0.33 0.41 0.08 0.08 0.11 0.07 0.5 -0.24 -0.4 -0.55 -0.57 0.18 0.19 -0.19 -4.66 -1.54 -0.8 -1.74 -0.05 -0.25
0.6 -0.29 -0.39 -0.05 0.13 -0.23 0.08 0.33 0.37 0.31 0.45 0.26 0.59 -0.04 -0.41 -0.23 -0.51 -0.12 -0.71 -0.66 -1.0 -1.13 0.24 -0.24 0.37 0.45
0.53 0.46 0.39 0.71 0.23 -0.55 -0.1 0.27 -0.22 -0.04 0.28 0.37 0.76 -1.09 -1.68 -1.34 -0.75 -0.53 -0.99 -0.7 -2.92 0.35 -0.55 0.03 1.03 0.57
0.67 -0.1 -0.74 0.37 0.71 0.56 0.57 0.5 0.43 0.07 0.2 -0.3 0.5 -0.27 -0.92 -0.87 -0.98 -0.01 0.04 -0.74 -3.95 0.0 -1.4 -0.57 0.76 -0.05
0.22 -0.24 -0.22 -0.04 0.16 -0.22 0.18 0.2 0.06 0.21 0.29 0.39 0.52 -0.04 -0.48 -0.18 -0.76 -0.15 -0.34 -0.44 -2.05 -0.06 0.05 0.18 0.47 0.47
0.66 0.02 -0.24 0.09 -0.05 0.29 0.33 0.46 0.45 0.33 0.27 0.11 0.45 -0.09 -0.34 -0.01 -1.07 -1.01 -0.81 -1.04 -2.61 -0.68 0.5 -0.48 0.61 0.25
-0.03 0.07 -0.01 0.7 0.78 0.5 0.15 0.26 0.1 0.03 0.19 0.39 0.12 -0.73 -1.03 -0.68 -0.53 -0.26 -0.38 -0.45 -3.64 0.32 -0.15 -0.2 0.35 0.21
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0.9 0.01 0.25 0.63 0.41 0.37 0.29 0.79 0.45 0.15 0.03 -0.19 0.92 -1.03 -0.95 -0.45 -1.14 -0.54 -0.62 -0.82 -3.01 -0.4 -0.92 -0.89 0.45 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.