Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
-4.87 -3.58 -5.42 -6.49 -2.85 -6.42 -3.78 -3.6 -2.33 3.22
- - -1.31 - - - -4.57 -3.79 -2.49 3.22
- - - - - -3.32 -0.53 - -2.48 3.17
- - - - - - - -1.97 -1.71 3.24
-5.68 - - -5.71 - -6.71 - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -1.62 3.27
Spa_g32272 (HTB4)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33110 (CYP82F1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -2.38 3.29
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33295 (UBQ11)
- -2.67 - - -3.74 - - - -0.86 3.2
- - -4.21 - - - - - - 3.31
Spa_g33333 (AAC2)
- - - - - - - - -3.83 3.31
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33350 (ACT11)
- - - - -4.36 - -1.8 - -1.78 3.23
Spa_g33411 (UBQ11)
- -4.5 - - - - - - - 3.32
- -3.26 - - - - - - - 3.31
- - - - - - -2.98 - -4.62 3.3
- - - - - - -2.41 - -1.38 3.24
Spa_g33510 (UBQ11)
- - - - -1.16 - -1.11 - - 3.18
- -4.66 - - - -4.9 -5.14 - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34142 (ARA3)
- - - - - - - - - 3.32
- - -2.83 - - -2.83 - - - 3.28
- - - - - - - - - 3.32
- -3.68 -3.03 -2.72 -4.74 - -3.16 - - 3.25
- -3.95 - - -3.43 - - - - 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-3.32 -3.25 -2.5 -3.31 -3.85 -3.96 -3.27 -3.83 -2.91 3.18
Spa_g34847 (ALDH2B)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34945 (RAB1C)
- - - - - - - - -2.8 3.3
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35046 (ROP1)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35058 (UBQ11)
- - -1.83 - - - -3.09 -4.19 -4.39 3.25
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35232 (UBQ11)
- - - - -4.5 - -2.57 - - 3.29
- -2.74 - - -2.13 - -2.93 - - 3.25
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35434 (ACT11)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35439 (TUB4)
- -4.75 - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35518 (HSP70)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -0.66 3.23
- - -2.79 - -1.07 - - - -1.8 3.18
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35887 (UBQ11)
- -2.27 -3.13 - -1.54 -3.73 -5.05 - -3.16 3.19
- - - - - - -5.0 - -3.38 3.3
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g36051 (RAC3)
- - - - - - - - -1.82 3.28
Spa_g36122 (ACT11)
- - - - - - -1.57 - - 3.27
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-1.51 -4.42 -5.01 -4.6 -3.79 -3.46 - -1.75 -6.04 3.18
Spa_g36690 (ARA5)
- - - - - - -2.63 - - 3.3
- - - -2.4 -2.59 - - - -2.37 3.24
- - -2.46 - - - -1.34 - - 3.24
- -4.16 -3.08 -3.43 - - - -4.33 -1.84 3.23
- - -1.71 -4.05 - - -2.26 - - 3.24
-3.29 -2.48 -2.51 -3.85 -2.82 - -2.61 -1.84 - 3.15
-3.89 - - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37222 (AAC3)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -2.32 3.29
- -2.54 -4.54 -2.61 -2.46 -3.56 -1.35 -4.25 -4.57 3.15
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38201 (Hsp81.4)
- - - - -16.55 - -21.67 - -11.96 3.32
- - - - -3.49 - - - - 3.31
- -2.17 - -3.29 - - -3.33 - -2.23 3.23
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -2.96 -3.93 - -5.4 - -2.17 - -1.19 3.19
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38681 (ACT11)
- - - - - - - - - 3.32
- -2.47 -6.03 - -2.8 -5.88 -2.93 - -3.31 3.23
- - - - - - -2.32 - - 3.29
- -1.41 -3.3 - -4.71 - -1.29 - -4.4 3.17
Spa_g39093 (UBQ11)
- - -4.13 - -3.33 - -1.23 - -2.58 3.21
- - - - - - - - -1.97 3.28
Spa_g39373 (TUA3)
- - -4.19 - - - - - - 3.31
- - - - -4.62 - -3.42 - - 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -5.14 - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -1.3 3.26
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39633 (TUB5)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -3.68 - - -4.21 - -5.3 - -5.18 3.3
Spa_g39872 (ECA2)
- - - - - - - - -1.6 3.27
- - - - - - -3.69 - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- -4.51 - - -2.6 - - - - 3.29
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40116 (ACT8)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40277 (IMS2)
- - -3.4 - - - - - - 3.31
Spa_g40281 (ATH12)
- - - - - - - - - 3.32
- - - -1.1 - -1.42 - - -2.89 3.17
- - - - - - -2.68 - - 3.3
- - - - - - -4.3 - -0.7 3.22
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -1.91 3.28
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40679 (UBQ11)
- - - - - - - - -1.14 3.25
Spa_g40759 (UBQ11)
- - - - - - -2.36 - - 3.29
- - - - - - - - -3.76 3.31
- - - - -2.54 - -1.07 - - 3.23
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40857 (B5 #4)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40916 (ACT7)
- - - - -3.34 - - - -2.21 3.28
- - - - - - - -2.81 - 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - -3.27 - - - - 3.31
- -1.85 -1.95 -2.1 -1.15 -3.86 -3.06 - - 3.1
- -3.21 - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41510 (UBQ11)
- - - - - - - - -4.9 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -3.17 - -2.54 - -1.51 -4.75 -2.96 3.2
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41987 (RAB18)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -4.82 -6.96 -4.81 -5.95 - -3.99 -4.2 3.29
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42855 (ISU1)
- -1.55 - - - - - - - 3.27
-4.47 - -2.12 - -4.71 -4.51 -1.89 -1.68 - 3.18
- - - - - - - - - 3.32
-2.75 - -1.43 -4.82 -2.73 -1.79 -1.92 - -1.99 3.09
-10.38 -9.36 -6.54 -10.41 -5.74 -2.62 -4.82 - -10.43 3.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.