Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g01127 (LAP3)
1.97 0.13 164.18 2.57 0.5 3.18 0.3 1.6 1.03 1.27
3.57 4.72 82.8 5.36 6.3 4.63 6.47 4.98 5.33 5.92
0.83 0.0 38.33 0.91 0.19 0.61 0.29 0.34 1.0 0.0
0.25 0.1 663.57 0.73 0.57 0.89 0.85 1.88 3.04 1.1
0.29 0.5 53.95 0.56 0.0 0.51 0.16 0.63 0.91 0.0
0.93 0.0 24.98 0.04 0.08 0.13 0.04 0.25 0.04 0.0
0.69 0.23 25.9 0.65 0.29 0.8 0.24 0.28 0.14 0.7
Spa_g33866 (QRT3)
0.0 0.0 316.3 0.0 0.35 0.0 0.0 0.13 0.1 0.66
Spa_g34247 (LAP6)
0.64 0.2 185.46 0.43 0.66 0.52 0.07 2.14 0.44 0.33
0.0 0.0 574.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 1.41
0.0 0.0 1092.23 0.0 0.23 0.0 0.05 0.0 0.06 1.75
0.0 0.08 927.17 0.19 0.18 0.04 0.33 0.05 0.41 2.61
0.0 0.0 147.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.83
0.05 0.26 65.75 0.03 0.45 0.04 0.3 0.2 0.67 0.73
0.0 0.0 588.73 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.63
Spa_g42225 (CYP703)
0.0 0.02 354.09 0.01 0.15 0.04 0.13 0.0 0.01 0.95
0.15 0.0 15.45 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 9.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g43106 (QRT3)
0.0 0.04 331.62 0.0 0.13 0.04 0.06 0.0 0.12 0.59
0.0 0.0 45.16 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 43.39 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 16.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.34 0.0 139.57 0.0 0.0 0.08 0.0 1.34 0.75 1.4
0.0 0.0 21.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 4.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 34.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.18
0.0 0.0 5.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 18.82 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 18.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.0 0.0 42.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.04 0.11 216.71 1.07 0.21 0.28 0.0 0.0 1.52 4.99
0.0 0.0 16.61 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 136.24 0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.29 0.0
0.14 0.13 20.85 0.18 0.12 0.21 0.06 0.19 0.44 0.0
0.0 0.0 23.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 12.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 6.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 36.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.03 14.24 0.12 0.0 0.0 0.03 0.1 0.51 0.46
0.0 0.0 10.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.19 0.0 89.11 1.01 0.0 0.39 0.0 0.75 0.31 0.83
0.0 0.0 107.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.15
0.0 0.0 10.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 208.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.66 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 8.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.0 0.0 42.36 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 16.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.5 0.0 35.63 0.18 0.36 0.49 0.31 0.35 0.23 0.13
0.0 0.0 8.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 17.39 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 6.93 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.04 0.05 15.05 0.04 0.22 0.03 0.04 0.13 0.29 0.23
0.0 0.0 5.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 38.83 0.67 0.05 0.19 0.0 0.01 0.32 0.36
0.0 0.0 5.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 216.86 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.35
0.0 0.13 24.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 58.79 0.0 0.02 0.01 0.0 0.07 0.05 0.07
0.06 0.0 9.63 0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.28 1.17 952.43 0.4 0.86 0.5 0.47 0.74 1.19 2.19
0.0 0.0 6.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 17.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0
0.0 0.0 6.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 76.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.0 0.0 3.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 9.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g46998 (FXG1)
0.0 0.0 72.53 0.06 0.07 0.04 0.13 0.0 0.01 0.19
Spa_g47039 (ACOS5)
2.28 2.17 390.94 2.09 1.54 2.08 1.62 5.88 2.67 2.33
0.0 0.0 6.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g47069 (LPR1)
0.06 0.0 10.81 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.02
1.28 0.16 36.79 0.69 0.45 0.63 0.59 1.17 0.77 1.43
Spa_g47228 (NFD4)
0.0 0.0 13.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 16.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 49.83 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 9.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 10.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.0 0.0 702.61 1.36 0.19 1.32 0.0 3.49 1.22 3.73
3.37 0.0 430.44 0.45 0.15 0.0 0.0 1.1 0.06 1.93
0.0 0.0 4.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.0 0.0 14.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g47867 (AMS)
0.22 0.0 117.08 0.01 0.03 0.0 0.01 0.13 0.02 0.21
Spa_g47968 (OPT4)
0.0 0.0 14.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.71 1.12 30.77 0.42 0.34 0.19 0.9 0.93 0.85 0.67
0.0 0.0 5.24 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.06
Spa_g48377 (DRL1)
0.22 0.14 647.18 0.18 0.09 0.23 0.16 0.13 0.17 1.25
Spa_g48386 (HA11)
0.0 0.0 3.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 4.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 476.79 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 1.24
0.02 0.0 47.07 0.0 0.02 0.03 0.0 0.04 0.01 0.02
0.0 0.0 8.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.05
0.0 0.0 11.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 3.72 0.03 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0
Spa_g48932 (LPR1)
0.15 0.0 7.13 0.0 0.0 0.07 0.0 0.18 0.06 0.07
0.0 0.0 9.88 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04
0.0 0.0 10.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 7.92 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 26.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 6.01 0.0 0.14 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 2.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g49243 (MYB4)
0.0 0.0 24.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07
Spa_g49364 (DSO)
0.08 0.0 20.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.31 0.0 0.0
0.47 0.0 27.62 0.74 0.24 0.67 0.2 0.28 0.46 0.64
0.0 0.0 33.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33
0.03 0.0 117.19 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.12
0.01 0.01 37.31 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.66 0.0 104.89 0.13 0.25 0.0 0.54 0.71 0.07 0.17
0.0 0.0 8.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.21 0.56 35.8 0.16 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.69
Spa_g50892 (ARA12)
0.25 0.01 12.26 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.13 0.03
3.12 0.08 60.6 0.55 0.07 0.08 0.0 0.2 0.0 0.35
Spa_g52121 (INT2)
0.4 0.05 15.98 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.33 0.28
0.73 0.0 30.04 0.28 0.0 1.09 0.0 0.28 0.0 0.25
1.32 0.0 128.86 0.55 0.0 0.53 0.0 0.0 0.04 0.46
0.0 0.0 21.29 0.55 0.17 0.53 0.17 0.07 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)