Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - -2.49 - - 3.3
- - - -3.69 -1.58 - -2.78 - - 3.24
Spa_g32071 (ROC1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g32911 (ACT11)
- - - - - - - - - 3.32
-5.23 -1.73 -2.89 - -2.44 - -3.23 -2.45 -3.65 3.17
Spa_g33051 (UBQ11)
- -2.42 - - - - - - -3.53 3.28
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33233 (HSP70)
- - - - - - - - - 3.32
-2.9 -0.64 -3.77 -4.37 -3.08 -4.01 -3.22 -3.47 -2.76 3.1
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -2.76 3.3
- - - - -5.46 - -5.5 - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33642 (UBQ11)
- -4.36 - - -3.83 - -5.66 - -4.39 3.29
- -5.63 - - - - -5.92 - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33970 (SAR1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34403 (CYP82F1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34585 (UBQ11)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35074 (PAB8)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35524 (ACT11)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g35678 (PFD3)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g36953 (ARA5)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37158 (CYP709B1)
- -4.89 -4.22 - -5.96 -6.14 -4.49 - - 3.3
Spa_g37212 (ACT11)
- -1.09 - - -3.21 - -1.41 - -2.06 3.14
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -4.57 - -2.67 -4.68 -4.67 - -2.88 -4.56 3.25
-6.26 - -2.64 - -8.53 - - -5.84 -0.89 3.21
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-6.69 - - - - - - -3.99 -5.83 3.31
Spa_g37942 (TRX1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -5.2 - - - - - - - 3.32
- - - -7.3 - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g38587 (ARFA1F)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -0.37 - - - - - - 3.21
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39017 (XSP1)
- -8.74 -4.36 -6.5 - -8.67 - -9.92 -7.41 3.31
Spa_g39054 (CAM4)
- - - - -4.17 - - - -2.88 3.29
Spa_g39068 (CEN2)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39078 (FER1)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39384 (RAB6)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39471 (TUB5)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39520 (WAKL10)
-5.64 -1.56 -2.15 - -5.18 - -5.94 - -5.95 3.23
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- -3.78 - - -2.71 -3.9 -4.19 - -5.69 3.27
Spa_g40201 (CHIA)
- - -3.03 -3.92 -1.71 -2.38 -1.79 -5.62 -5.45 3.17
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40311 (ACP5)
- - -1.94 - - - - - -7.24 3.28
- - - - - - - - - 3.32
- -3.15 - - -3.43 - -1.59 - -3.15 3.23
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40736 (HEXO2)
-5.14 -3.4 - - - - - - - 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -3.41 - - - - -3.6 - 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-3.33 - -3.15 -3.58 - - - - -0.92 3.2
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - -4.05 -2.05 -2.46 3.25
- - -1.32 - - - - -2.94 - 3.24
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42094 (XCP1)
- - - - - - - - - 3.32
- -3.15 - - -5.42 - -5.23 - -3.15 3.28
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g42190 (HSP70)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - -5.08 - -5.06 - -1.89 3.27
- -4.04 - - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.