Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.16 0.12 0.11 0.63 1.0 0.6 0.96 0.39 0.27 0.46
0.0 0.25 0.0 0.13 1.0 0.12 0.97 0.08 0.05 0.03
Spa_g02465 (HSP18.2)
0.01 0.31 0.03 0.14 1.0 0.17 1.0 0.01 0.07 0.06
0.01 0.05 0.0 0.33 1.0 0.39 0.89 0.17 0.03 0.01
0.05 0.04 0.27 0.02 0.98 0.01 1.0 0.08 0.2 0.07
0.0 0.15 0.0 0.06 1.0 0.1 0.97 0.01 0.03 0.01
0.17 0.19 0.04 0.03 0.94 0.03 1.0 0.13 0.26 0.32
0.26 0.41 0.2 0.28 0.85 0.31 1.0 0.25 0.22 0.28
0.01 0.13 0.0 0.11 1.0 0.14 0.76 0.0 0.01 0.03
0.17 0.2 0.09 0.09 1.0 0.09 0.87 0.08 0.08 0.18
Spa_g04086 (RLP20)
0.02 0.04 0.03 0.34 0.78 0.35 1.0 0.01 0.03 0.54
0.14 0.3 0.16 0.26 0.88 0.24 1.0 0.38 0.26 0.24
0.09 0.36 0.13 0.15 0.84 0.2 1.0 0.18 0.36 0.31
0.22 0.24 0.14 0.55 1.0 0.79 0.98 0.22 0.19 0.3
0.0 0.17 0.02 0.01 0.96 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0
Spa_g05728 (COI1)
0.06 0.36 0.12 0.11 0.76 0.13 1.0 0.17 0.19 0.33
Spa_g07024 (FAC1)
0.18 0.32 0.38 0.53 0.98 0.58 1.0 0.2 0.25 0.43
Spa_g07201 (VTC4)
0.09 0.19 0.2 0.4 1.0 0.42 0.99 0.12 0.14 0.25
0.0 0.07 0.02 0.02 1.0 0.02 0.79 0.0 0.06 0.1
Spa_g07618 (WOL)
0.34 0.28 0.15 0.21 0.97 0.24 1.0 0.23 0.26 0.22
0.06 0.07 0.21 0.22 0.72 0.32 1.0 0.33 0.3 0.26
0.02 0.21 0.18 0.06 1.0 0.09 0.8 0.06 0.28 0.02
0.0 0.17 0.0 0.03 0.95 0.05 1.0 0.05 0.01 0.03
0.02 0.15 0.09 0.17 0.77 0.24 1.0 0.07 0.29 0.1
Spa_g10596 (UGT85A7)
0.01 0.5 0.2 0.12 0.97 0.13 1.0 0.18 0.19 0.22
0.02 0.05 0.08 0.15 0.86 0.19 1.0 0.03 0.09 0.17
Spa_g11194 (PTR2)
0.06 0.13 0.17 0.3 0.86 0.43 1.0 0.05 0.13 0.33
Spa_g11601 (GDU5)
0.19 0.23 0.06 0.68 1.0 0.69 0.86 0.09 0.11 0.57
Spa_g11602 (GDU5)
0.1 0.24 0.11 0.69 0.95 0.74 1.0 0.05 0.11 0.34
0.01 0.26 0.31 0.12 0.97 0.16 1.0 0.0 0.02 0.01
0.08 0.28 0.1 0.19 0.92 0.18 1.0 0.28 0.21 0.28
0.03 0.18 0.02 0.25 1.0 0.21 0.98 0.01 0.07 0.03
Spa_g12172 (RUB1)
0.37 0.41 0.44 0.8 1.0 0.82 0.99 0.26 0.34 0.53
0.04 0.06 0.01 0.29 1.0 0.27 0.94 0.04 0.12 0.36
0.0 0.16 0.02 0.11 1.0 0.18 0.92 0.03 0.09 0.23
0.01 0.15 0.01 0.17 0.97 0.19 1.0 0.04 0.01 0.02
Spa_g13551 (TMK1)
0.0 0.05 0.02 0.0 0.94 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.26 0.02 0.05 1.0 0.09 0.89 0.15 0.09 0.21
0.01 0.23 0.01 0.63 1.0 0.67 1.0 0.05 0.11 0.13
0.0 0.08 0.0 0.02 1.0 0.02 0.92 0.0 0.02 0.0
0.03 0.16 0.15 0.44 1.0 0.59 0.97 0.0 0.04 0.13
0.01 0.16 0.06 0.26 0.96 0.27 1.0 0.12 0.26 0.29
0.19 0.15 0.03 0.66 0.99 0.72 1.0 0.41 0.22 0.55
0.03 0.36 0.11 0.34 0.96 0.44 1.0 0.11 0.3 0.46
0.0 0.22 0.09 0.12 1.0 0.24 0.87 0.06 0.13 0.08
0.36 0.55 0.33 0.46 0.91 0.48 1.0 0.37 0.33 0.44
0.0 0.15 0.02 0.02 0.95 0.03 1.0 0.0 0.01 0.1
0.04 0.21 0.08 0.03 0.7 0.12 1.0 0.07 0.22 0.12
0.19 0.15 0.06 0.72 0.93 0.66 1.0 0.08 0.15 0.5
0.01 0.1 0.01 0.44 0.86 0.45 1.0 0.1 0.1 0.18
Spa_g15547 (NUDT2)
0.29 0.23 0.37 0.1 1.0 0.15 0.96 0.01 0.01 0.04
0.01 0.02 0.0 0.23 0.76 0.3 1.0 0.01 0.18 0.3
0.01 0.12 0.04 0.03 0.91 0.08 1.0 0.08 0.17 0.06
0.14 0.27 0.16 0.25 0.89 0.37 1.0 0.28 0.17 0.5
0.02 0.04 0.01 0.21 0.83 0.21 1.0 0.07 0.12 0.37
Spa_g16659 (TMK1)
0.01 0.08 0.07 0.01 0.77 0.07 1.0 0.01 0.02 0.02
0.0 0.09 0.0 0.07 1.0 0.1 0.79 0.01 0.01 0.05
Spa_g17340 (CBL9)
0.05 0.15 0.08 0.42 1.0 0.45 0.96 0.09 0.12 0.29
Spa_g17341 (CBL9)
0.08 0.27 0.07 0.22 1.0 0.22 0.92 0.19 0.14 0.3
0.02 0.3 0.03 0.13 0.92 0.2 1.0 0.03 0.13 0.02
0.08 0.52 0.04 0.46 1.0 0.45 0.92 0.11 0.09 0.25
0.0 0.21 0.13 0.09 0.88 0.11 1.0 0.01 0.01 0.07
Spa_g17920 (TH9)
0.06 0.18 0.06 0.42 1.0 0.46 0.89 0.04 0.06 0.14
0.04 0.43 0.06 0.47 0.92 0.54 1.0 0.0 0.12 0.14
0.01 0.12 0.01 0.26 1.0 0.28 1.0 0.02 0.09 0.27
Spa_g19059 (ARA12)
0.13 0.03 0.08 0.28 0.73 0.26 1.0 0.08 0.22 0.11
Spa_g19249 (CHX18)
0.1 0.35 0.13 0.55 1.0 0.63 0.99 0.05 0.03 0.34
0.0 0.04 0.0 0.0 0.78 0.0 1.0 0.0 0.01 0.03
0.22 0.16 0.14 0.43 1.0 0.45 1.0 0.22 0.22 0.27
0.0 0.04 0.0 0.0 0.94 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18
0.08 0.27 0.02 0.32 1.0 0.39 0.76 0.1 0.1 0.25
0.0 0.09 0.07 0.06 1.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.02
0.17 0.13 0.08 0.33 0.82 0.48 1.0 0.22 0.17 0.35
0.02 0.07 0.01 0.01 1.0 0.02 0.74 0.07 0.02 0.01
0.23 0.32 0.06 0.43 1.0 0.39 0.84 0.17 0.32 0.23
0.01 0.21 0.0 0.18 1.0 0.23 0.91 0.0 0.02 0.04
0.0 0.14 0.07 0.01 1.0 0.02 0.78 0.0 0.01 0.02
0.03 0.13 0.05 0.09 1.0 0.06 0.98 0.04 0.01 0.0
0.02 0.05 0.01 0.22 0.75 0.25 1.0 0.04 0.07 0.13
0.0 0.16 0.02 0.0 1.0 0.0 0.75 0.0 0.09 0.0
0.04 0.09 0.13 0.17 0.8 0.12 1.0 0.08 0.03 0.11
0.0 0.18 0.04 0.02 0.81 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0
0.02 0.09 0.11 0.3 0.81 0.25 1.0 0.03 0.12 0.34
0.05 0.12 0.06 0.36 1.0 0.44 0.99 0.05 0.17 0.28
0.25 0.44 0.29 0.37 0.88 0.41 1.0 0.38 0.3 0.2
0.03 0.14 0.05 0.26 1.0 0.24 0.84 0.01 0.02 0.01
Spa_g21875 (CYP709B1)
0.18 0.07 0.11 0.55 1.0 0.63 0.97 0.22 0.15 0.19
0.01 0.17 0.02 0.23 0.79 0.26 1.0 0.0 0.17 0.48
0.07 0.53 0.09 0.49 0.86 0.66 1.0 0.01 0.11 0.14
0.0 0.31 0.0 0.03 1.0 0.02 0.91 0.01 0.02 0.01
0.0 0.01 0.0 0.0 0.71 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Spa_g22201 (CRK25)
0.01 0.33 0.0 0.04 1.0 0.03 0.94 0.0 0.04 0.01
0.4 0.46 0.1 0.52 0.95 0.58 1.0 0.22 0.43 0.43
Spa_g22676 (PME31)
0.08 0.17 0.13 0.56 0.99 0.57 1.0 0.12 0.11 0.26
0.0 0.07 0.01 0.1 0.88 0.12 1.0 0.0 0.02 0.03
0.23 0.07 0.02 0.18 0.9 0.09 1.0 0.11 0.09 0.22
0.01 0.09 0.01 0.09 0.85 0.11 1.0 0.01 0.03 0.18
0.0 0.01 0.0 0.03 1.0 0.06 0.95 0.03 0.08 0.02
0.0 0.05 0.01 0.07 1.0 0.07 0.81 0.0 0.03 0.09
0.02 0.25 0.06 0.24 1.0 0.28 0.93 0.18 0.43 0.3
0.31 0.34 0.04 0.06 0.94 0.07 1.0 0.08 0.18 0.12
0.06 0.28 0.12 0.45 1.0 0.44 0.93 0.39 0.27 0.27
0.02 0.16 0.08 0.12 0.79 0.17 1.0 0.03 0.07 0.05
0.03 0.05 0.13 0.2 1.0 0.18 0.83 0.24 0.07 0.16
0.0 0.21 0.04 0.14 1.0 0.09 0.57 0.04 0.01 0.06
0.01 0.15 0.24 0.14 0.83 0.4 1.0 0.0 0.08 0.04
0.01 0.1 0.02 0.04 1.0 0.03 0.86 0.08 0.02 0.37
0.02 0.09 0.01 0.09 1.0 0.1 1.0 0.07 0.02 0.19
0.01 0.05 0.05 0.19 0.69 0.31 1.0 0.14 0.08 0.41
0.1 0.32 0.02 0.17 0.91 0.29 1.0 0.09 0.16 0.35
Spa_g24205 (PLA2-ALPHA)
0.05 0.17 0.07 0.56 0.91 0.68 1.0 0.01 0.05 0.12
0.04 0.03 0.04 0.23 0.88 0.19 1.0 0.17 0.18 0.08
0.11 0.35 0.27 0.31 0.89 0.32 1.0 0.27 0.3 0.22
0.07 0.13 0.02 0.53 0.89 0.61 1.0 0.04 0.12 0.17
0.03 0.07 0.04 0.49 0.89 0.57 1.0 0.02 0.05 0.39
0.23 0.37 0.28 0.65 0.96 0.75 1.0 0.2 0.44 0.56
0.03 0.16 0.38 0.13 0.9 0.18 1.0 0.04 0.08 0.04
0.01 0.09 0.0 0.13 1.0 0.1 0.98 0.0 0.0 0.02
0.02 0.01 0.08 0.17 0.54 0.21 1.0 0.0 0.14 0.18
0.02 0.42 0.05 0.01 0.94 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.15 0.02 0.02 0.7 0.03 1.0 0.05 0.09 0.01
0.0 0.25 0.02 0.05 0.68 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01
0.26 0.02 0.18 0.16 0.97 0.21 1.0 0.05 0.21 0.42
0.0 0.09 0.01 0.01 1.0 0.02 0.68 0.0 0.01 0.0
0.07 0.08 0.03 0.42 0.82 0.44 1.0 0.06 0.11 0.43
Spa_g25971 (MSL5)
0.05 0.11 0.05 0.28 0.86 0.37 1.0 0.03 0.13 0.05
0.09 0.19 0.07 0.33 0.91 0.44 1.0 0.06 0.18 0.23
0.06 0.16 0.22 0.25 0.78 0.33 1.0 0.13 0.27 0.29
Spa_g26391 (CLA)
0.06 0.08 0.05 0.19 0.72 0.25 1.0 0.07 0.17 0.12
Spa_g26536 (CYP704B1)
0.07 0.08 0.06 0.25 0.86 0.25 1.0 0.04 0.26 0.27
0.09 0.14 0.12 0.39 1.0 0.63 0.91 0.12 0.15 0.08
0.0 0.01 0.0 0.04 1.0 0.21 0.76 0.0 0.06 0.26
0.0 0.15 0.0 0.01 1.0 0.01 0.78 0.03 0.01 0.0
0.05 0.13 0.16 0.05 0.6 0.15 1.0 0.07 0.13 0.05
0.0 0.16 0.03 0.0 0.94 0.0 1.0 0.0 0.03 0.05
0.04 0.3 0.11 0.11 0.8 0.13 1.0 0.21 0.16 0.23
0.14 0.16 0.08 0.31 0.91 0.39 1.0 0.38 0.17 0.39
Spa_g28528 (CHX18)
0.1 0.34 0.06 0.41 1.0 0.55 0.98 0.03 0.02 0.23
0.0 0.03 0.04 0.0 0.82 0.03 1.0 0.0 0.02 0.0
Spa_g29726 (ATPT2)
0.01 0.1 0.04 0.36 0.93 0.51 1.0 0.01 0.1 0.13
Spa_g30276 (HSL1)
0.01 0.05 0.02 0.33 0.8 0.33 1.0 0.02 0.05 0.37
0.02 0.2 0.01 0.01 0.74 0.04 1.0 0.26 0.17 0.14
0.07 0.37 0.05 0.39 0.97 0.47 1.0 0.12 0.27 0.19
Spa_g31065 (TH9)
0.18 0.41 0.25 0.34 1.0 0.35 1.0 0.34 0.51 0.49
0.09 0.12 0.02 0.69 1.0 0.75 0.96 0.09 0.12 0.49
0.01 0.07 0.01 0.52 0.95 0.48 1.0 0.14 0.11 0.2
0.2 0.14 0.11 0.48 1.0 0.43 0.99 0.31 0.25 0.35
0.01 0.03 0.1 0.0 1.0 0.0 0.86 0.12 0.03 0.19
0.29 0.22 0.17 0.57 0.87 0.72 1.0 0.1 0.28 0.63
Spa_g39792 (HSL1)
0.0 0.03 0.01 0.24 0.84 0.22 1.0 0.02 0.05 0.3
0.2 0.2 0.25 0.38 0.9 0.49 1.0 0.08 0.12 0.34
0.04 0.05 0.03 0.38 0.94 0.32 1.0 0.07 0.16 0.31
0.1 0.39 0.06 0.48 1.0 0.79 0.96 0.04 0.02 0.09
Spa_g47682 (PHO1)
0.02 0.2 0.03 0.46 0.84 0.46 1.0 0.01 0.02 0.06
0.03 0.35 0.1 0.41 1.0 0.47 1.0 0.14 0.25 0.46
0.01 0.11 0.08 0.32 0.96 0.22 1.0 0.0 0.03 0.04
0.03 0.32 0.09 0.06 0.63 0.05 1.0 0.0 0.11 0.04
0.01 0.24 0.03 0.14 0.79 0.18 1.0 0.01 0.15 0.44
0.04 0.13 0.05 0.14 0.98 0.19 1.0 0.02 0.03 0.06
0.04 0.06 0.07 0.53 0.96 0.37 1.0 0.03 0.06 0.4
0.05 0.08 0.04 0.42 1.0 0.26 0.97 0.02 0.13 0.43
0.08 0.05 0.02 0.3 1.0 0.47 0.96 0.0 0.14 0.29
Spa_g50756 (RGLG2)
0.03 0.08 0.02 0.49 0.85 0.54 1.0 0.03 0.11 0.25
Spa_g51020 (CEN2)
0.02 0.35 0.04 0.02 1.0 0.02 0.92 0.01 0.04 0.07
0.02 0.22 0.02 0.23 1.0 0.14 0.98 0.05 0.08 0.18
Spa_g51392 (RGLG2)
0.01 0.16 0.03 0.02 0.93 0.03 1.0 0.09 0.08 0.11
0.1 0.06 0.04 0.38 0.85 0.4 1.0 0.07 0.05 0.05
0.05 0.3 0.08 0.19 1.0 0.22 0.91 0.07 0.23 0.43
0.08 0.28 0.36 0.05 0.9 0.03 1.0 0.06 0.07 0.15
0.07 0.34 0.02 0.67 0.99 0.67 1.0 0.09 0.12 0.35
0.28 0.39 0.21 0.31 0.87 0.29 1.0 0.2 0.27 0.32
0.16 0.18 0.18 0.4 0.75 0.42 1.0 0.12 0.12 0.25
0.0 0.12 0.05 0.05 0.94 0.08 1.0 0.0 0.04 0.11
0.03 0.13 0.05 0.04 0.85 0.05 1.0 0.18 0.12 0.15
0.0 0.12 0.03 0.12 0.97 0.1 1.0 0.01 0.03 0.08
0.02 0.13 0.04 0.15 0.99 0.15 1.0 0.03 0.06 0.12
0.0 0.12 0.04 0.07 1.0 0.1 0.63 0.0 0.01 0.0
Spa_g54256 (TH9)
0.07 0.21 0.05 0.34 1.0 0.36 0.87 0.04 0.09 0.17
Spa_g54524 (TMO6)
0.36 0.22 0.03 0.64 0.98 0.75 1.0 0.32 0.41 0.42
Spa_g54602 (HSP18.2)
0.01 0.15 0.02 0.19 1.0 0.24 0.92 0.02 0.07 0.05
0.02 0.17 0.11 0.08 1.0 0.15 0.93 0.02 0.21 0.1
Spa_g55044 (PHT3)
0.0 0.08 0.04 0.31 0.92 0.42 1.0 0.01 0.08 0.02
0.01 0.11 0.01 0.08 0.87 0.09 1.0 0.0 0.03 0.08
Spa_g55684 (RAB7A)
0.05 0.08 0.03 0.7 1.0 0.64 0.96 0.03 0.06 0.18
0.01 0.2 0.04 0.24 0.97 0.18 1.0 0.03 0.08 0.05
0.0 0.32 0.01 0.02 0.95 0.05 1.0 0.0 0.01 0.0
0.36 0.58 0.11 0.45 0.89 0.54 1.0 0.3 0.48 0.44
0.01 0.16 0.01 0.34 1.0 0.37 0.89 0.03 0.07 0.06
0.01 0.13 0.03 0.03 0.89 0.03 1.0 0.0 0.01 0.0
0.08 0.21 0.07 0.16 0.82 0.17 1.0 0.04 0.17 0.05
0.05 0.1 0.04 0.44 0.92 0.39 1.0 0.02 0.15 0.6
0.04 0.1 0.02 0.31 1.0 0.23 0.83 0.06 0.11 0.47
0.03 0.17 0.02 0.11 0.94 0.01 1.0 0.06 0.02 0.03
Spa_g57053 (CHX20)
0.08 0.32 0.08 0.45 1.0 0.58 0.93 0.04 0.03 0.24
0.02 0.06 0.04 0.41 0.9 0.55 1.0 0.0 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.05 0.8 0.01 1.0 0.0 0.08 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)