Heatmap: Cluster_137 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g04036	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.78	-	-
Spa_g35739 (HON5)	-	-8.82	3.32	-	-	-	-10.43	-	-	-5.4
Spa_g43141 (NDPK1)	-	-	3.25	-	-	-	-	-2.51	-4.27	-1.88
Spa_g43151	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.73
Spa_g43191	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43217	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43237 (ARF3)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.29	-	-
Spa_g43247	-	-4.75	3.27	-	-	-	-	-2.53	-2.93	-
Spa_g43253	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43264	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43275	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.04	-	-4.15
Spa_g43283 (ELF5A-3)	-	-	3.3	-	-	-	-7.97	-3.78	-4.39	-5.81
Spa_g43301	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.68	-	-
Spa_g43317	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-4.26
Spa_g43336	-	-	3.32	-	-	-	-	-6.08	-	-5.0
Spa_g43344 (PUX4)	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.65	-	-
Spa_g43347	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43355	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.91	-	-
Spa_g43369	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.39	-6.26	-
Spa_g43378 (PAB2)	-	-	3.29	-	-	-	-7.18	-2.96	-4.37	-5.26
Spa_g43379	-	-	3.28	-	-	-	-	-3.25	-5.45	-2.91
Spa_g43384	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.29	-5.17	-3.82
Spa_g43389 (J2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.6	-3.65	-6.43
Spa_g43392	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-6.43
Spa_g43394	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.78	-5.25	-
Spa_g43397	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.04	-5.92	-
Spa_g43404 (ALG3)	-	-	3.32	-	-	-	-	-6.29	-6.17	-
Spa_g43405	-	-	3.31	-	-	-	-	-6.2	-4.5	-4.8
Spa_g43414 (AGO5)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.01
Spa_g43418 (TOP1)	-	-	3.31	-	-8.27	-	-	-3.83	-5.98	-5.96
Spa_g43419	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.35	-4.82	-3.64
Spa_g43428	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.32	-	-3.71
Spa_g43476	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43514	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.77	-3.56	-
Spa_g43527 (PDF2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43536	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.22
Spa_g43558	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43591 (PBF1)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43597	-	-	3.27	-	-	-	-	-2.7	-2.54	-4.18
Spa_g43604	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43608	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.48	-	-
Spa_g43630	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43638	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.85	-	-
Spa_g43648 (ATS9)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.37	-4.84	-4.49
Spa_g43649 (SUF4)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.24	-	-
Spa_g43653	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43674	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.84	-5.52	-
Spa_g43680 (RPT1A)	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.76	-4.63	-
Spa_g43684	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.47	-	-
Spa_g43696	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.45	-	-5.57
Spa_g43698 (EIF2 GAMMA)	-	-	3.32	-5.47	-	-	-	-	-	-6.08
Spa_g43699	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.22	-	-
Spa_g43700	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.63	-3.78	-4.76
Spa_g43707 (EIF3B)	-	-	3.29	-	-	-	-5.36	-3.84	-3.55	-6.5
Spa_g43714	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.82	-5.16	-3.92
Spa_g43723	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.71	-4.5	-5.29
Spa_g43726 (MCM2)	-	-	3.31	-	-	-	-6.27	-5.16	-7.63	-6.43
Spa_g43728 (RB)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.35	-	-
Spa_g43809 (NRPE8B)	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-4.17	-
Spa_g43832 (PBC2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-	-2.92
Spa_g43833	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43868	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.25	-6.43	-3.75
Spa_g43870	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.47	-3.33	-
Spa_g43874 (UBC35)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.07	-5.49	-5.29
Spa_g43878	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.36	-	-
Spa_g43882 (ECR)	-	-	3.29	-	-	-	-5.75	-4.06	-2.93	-
Spa_g43894	-	-	3.3	-	-5.65	-	-	-3.3	-5.47	-
Spa_g43900	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.56	-	-6.22
Spa_g43930	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.07	-4.36	-
Spa_g43934	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.39	-	-5.05
Spa_g43949	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.16	-	-
Spa_g43953	-	-	3.3	-	-	-	-6.34	-2.98	-5.79	-6.31
Spa_g43954	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.22	-4.52	-
Spa_g43983	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-3.61
Spa_g44053	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.02	-3.35	-
Spa_g44110	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.14	-5.59	-
Spa_g44113	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.74	-4.9	-4.2
Spa_g44144	-	-	3.29	-	-4.92	-	-	-3.84	-	-3.59
Spa_g44155	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.86	-	-
Spa_g44157 (RIN1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.38	-6.07	-4.72
Spa_g44169 (BGT)	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.1	-	-
Spa_g44174	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.15	-4.03	-
Spa_g44179	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.91	-3.57	-6.04
Spa_g44262 (SKIP)	-	-	3.28	-	-	-	-	-	-2.43	-3.47
Spa_g44288 (NRPD5)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-4.55	-
Spa_g44289 (GSTF3)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.35	-6.21	-3.85
Spa_g44371	-	-	3.29	-	-	-	-	-4.2	-	-2.86
Spa_g44377 (ERF1-3)	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.41	-3.29	-
Spa_g44383 (ATKRS-1)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.97	-5.85	-
Spa_g44400 (ADK1)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44406	-	-	3.32	-	-	-	-	-6.28	-	-
Spa_g44413	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.38	-4.26	-5.04
Spa_g44520 (FER4)	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.14	-3.57	-5.94
Spa_g44521	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44537 (SCE1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.3	-4.14	-5.51
Spa_g44574	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-4.76	-3.56
Spa_g44578	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44602	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.55	-	-3.22
Spa_g44606	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44607	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-4.76	-
Spa_g44619	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.67	-	-
Spa_g44620	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.8	-5.26	-3.46
Spa_g44646 (GTE3)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.2	-4.98	-6.52
Spa_g44744	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44748 (UBC7)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44756	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.69	-4.06	-5.5
Spa_g44778	-	-	3.31	-	-6.48	-	-	-	-	-4.32
Spa_g44811 (TBP2)	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-4.52	-4.17
Spa_g44825	-	-	3.28	-	-	-	-	-3.52	-3.13	-3.77
Spa_g44836 (PS1)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44837 (DGL1)	-	-	3.27	-	-	-	-	-2.51	-3.8	-3.59
Spa_g44838	-	-	3.29	-	-	-	-6.35	-2.78	-5.53	-3.82
Spa_g44843	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.45	-	-3.31
Spa_g45043	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.03	-4.49	-5.29
Spa_g45054	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45064 (CBF5)	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.37	-5.25	-4.0
Spa_g45073 (POK2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45244	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.41	-3.21	-
Spa_g45253	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.6	-5.58	-5.87
Spa_g45290	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.57	-5.99	-5.79
Spa_g45296	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.54	-	-
Spa_g45312	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.89	-3.99	-5.23
Spa_g45322	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45326	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.57	-	-
Spa_g45328 (TPR16)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.0	-	-4.36
Spa_g45494	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-4.16
Spa_g45605	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.93	-	-5.74
Spa_g45639 (EIF3G2)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.07	-	-5.32
Spa_g45651	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45666	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.32	-	-
Spa_g45667	-	-	3.32	-	-	-	-	-6.26	-9.14	-
Spa_g45678 (OM64)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.97	-4.84	-5.49
Spa_g45704	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.98	-4.13	-4.21
Spa_g45713	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.21	-3.77	-
Spa_g46240 (ACLB-1)	-	-	3.27	-	-	-	-	-2.88	-4.25	-2.93
Spa_g46260	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46305 (PAB2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.28	-	-5.82
Spa_g46329	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46365 (EIF3C)	-	-	3.29	-	-	-	-6.2	-3.66	-3.92	-4.97
Spa_g46564	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.17	-5.05	-5.85
Spa_g46652	-	-	3.31	-	-	-	-4.84	-5.06	-6.91	-5.55
Spa_g46721	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46826 (FIB1)	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.72	-	-
Spa_g46883	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.34	-5.81	-3.59
Spa_g46904	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.33	-4.79	-4.16
Spa_g46905	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46999	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.67	-3.37	-4.14
Spa_g47004	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.82	-3.37	-3.76
Spa_g47034	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.87
Spa_g47049	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.76	-	-
Spa_g47056 (OVA9)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.24	-4.7	-5.36
Spa_g47386	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47414	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47511	-	-2.76	3.3	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47517 (RPN1A)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.35	-	-
Spa_g47520	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47536 (MAP2B)	-	-	3.3	-6.01	-	-	-	-3.83	-6.03	-4.22
Spa_g47586	-	-	3.3	-	-	-	-	-5.06	-	-3.38
Spa_g47591 (TEJ)	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-3.61	-
Spa_g47615	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-3.35
Spa_g47631	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.67	-3.55	-
Spa_g47648	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47893	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47964	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.53	-	-5.2
Spa_g47979	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.2	-	-3.03
Spa_g48028	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48073 (EIF3A)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.6	-4.9	-7.14
Spa_g48076	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.12	-3.81	-5.6
Spa_g48109	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48122	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-4.94	-
Spa_g48204	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.86	-4.73	-
Spa_g48221 (XI-1)	-	-	3.3	-	-	-	-8.0	-3.31	-4.61	-4.91
Spa_g48225	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48366 (PDF1)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.6	-6.29	-6.08
Spa_g48463	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48513	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.68	-3.55	-
Spa_g48527 (CUM2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.72	-7.93	-7.59
Spa_g48670 (eIFiso4G1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.95	-4.31	-6.67
Spa_g48692	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.84	-	-
Spa_g48983 (MRPL11)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49024	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.92	-	-
Spa_g49128 (ckl10)	-	-	3.28	-	-6.46	-	-6.49	-2.58	-6.26	-4.04
Spa_g49269 (U1-70K)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49329 (IMPA-2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.49	-	-3.61
Spa_g49759 (Hsp81.4)	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.68	-	-
Spa_g49804	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49818 (BPM5)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.15	-5.61	-5.39
Spa_g49870 (ACO2)	-	-	3.27	-	-	-	-	-2.58	-4.28	-2.79
Spa_g49890	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.73	-6.61	-6.27
Spa_g49940	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.